Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6Q4P9

Protein Details
Accession A0A1V6Q4P9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-370LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-178KAKKAKVSPKESPKK
349-361GFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.833, mito 7.5, cyto_mito 7.333, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKISSKASAKTPKSANTIPPQLIASVAAFLAENFPQTAATFTKELSQSGNKSDNKNVSSLLDLFQASAVKAASTSSEESDVEMGDAKSSSSSSSSSSSSSSDSSSSDSSSSDSDADDEDDDKSPVAPVPAKKTSGVKRKAESSSESSSSSSDPSSESEDDSPKAKKAKVSPKESPKKATKEDSSSSSSSPSSDSSSDSASSSSSDSSSSSESSSSESDSSSSSDSSSSDSDSSDSEDEKKSKVALKAAKKTPLPESDSDSDSDSSSDTSNTLEAAPVVVEKTVTFEAPSSSASPAPFNGQGKKKHTGARPTPLALLSELPHDHPSNDYMSYAYADRAFADLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDITGGKSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.62
4 0.61
5 0.65
6 0.58
7 0.54
8 0.48
9 0.4
10 0.35
11 0.28
12 0.19
13 0.12
14 0.11
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.13
26 0.12
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.2
31 0.21
32 0.21
33 0.24
34 0.29
35 0.28
36 0.34
37 0.42
38 0.41
39 0.44
40 0.5
41 0.53
42 0.48
43 0.47
44 0.42
45 0.34
46 0.33
47 0.3
48 0.24
49 0.19
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.11
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.13
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.13
115 0.15
116 0.22
117 0.26
118 0.27
119 0.28
120 0.35
121 0.42
122 0.48
123 0.53
124 0.51
125 0.51
126 0.56
127 0.57
128 0.53
129 0.49
130 0.44
131 0.41
132 0.37
133 0.35
134 0.29
135 0.27
136 0.24
137 0.21
138 0.15
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.17
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.21
152 0.21
153 0.23
154 0.31
155 0.41
156 0.47
157 0.54
158 0.59
159 0.66
160 0.75
161 0.73
162 0.72
163 0.69
164 0.66
165 0.63
166 0.61
167 0.55
168 0.51
169 0.5
170 0.47
171 0.44
172 0.38
173 0.34
174 0.29
175 0.24
176 0.19
177 0.18
178 0.14
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.18
228 0.18
229 0.22
230 0.24
231 0.29
232 0.33
233 0.41
234 0.49
235 0.54
236 0.58
237 0.54
238 0.54
239 0.52
240 0.5
241 0.46
242 0.39
243 0.4
244 0.37
245 0.37
246 0.35
247 0.31
248 0.25
249 0.21
250 0.19
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.11
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.18
284 0.21
285 0.23
286 0.3
287 0.35
288 0.42
289 0.47
290 0.52
291 0.54
292 0.56
293 0.6
294 0.63
295 0.64
296 0.66
297 0.65
298 0.61
299 0.58
300 0.51
301 0.45
302 0.35
303 0.29
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.18
308 0.21
309 0.21
310 0.2
311 0.2
312 0.21
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.12
328 0.11
329 0.14
330 0.18
331 0.18
332 0.17
333 0.18
334 0.19
335 0.24
336 0.31
337 0.38
338 0.45
339 0.56
340 0.66
341 0.76
342 0.85
343 0.86
344 0.9
345 0.91
346 0.9
347 0.9
348 0.89
349 0.88
350 0.88
351 0.82
352 0.72
353 0.61
354 0.57
355 0.48
356 0.42
357 0.34
358 0.26
359 0.23