Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6QN27

Protein Details
Accession A0A1V6QN27    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-54TRSASRDSTRPAKRQRQNKSQDAPDHADHydrophilic
330-349CPMWRRCQKCRERGHDEQQCHydrophilic
528-552FPGNGNRRRSPSPRARNPPPPRGGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
441-462RRTGRPAPPPPRSRGNAGRPGS
486-491RGRPAP
510-578TGRGSSRGPPSAPRARPQFPGNGNRRRSPSPRARNPPPPRGGGGGRGRGPSRGPGRARGSRGGGRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MANSSDEEADSRTASVGAQRAKNPRSTRSASRDSTRPAKRQRQNKSQDAPDHADFVPRGGAFTATPLEVDSDATSSSGSSDSDSDSDSASSANDTANPHAGSTAPAISWNQGKKKAIRTTLGGKRAEPMESNTEKSEQFDAVNDKYWRSRSDSVSSAGSETRARKQPRIQEDLEEGEIDSKSESDDSDSLDSEADDSILLNIGSKENGMDEGEDYDPERLMPENGLQNGTTAASTSNGVELASGSQSKEDAFRRFALKYPTAPTSLVDLNKKDLETQSLYVYFDRNIHDLDLKLPVSCIECQTEGHMADICPTKECSHCGSWDKHASVVCPMWRRCQKCRERGHDEQQCTSKLRSHASEVPCDMCGHEHLESECDFLWKFPSRDLHSNQVSVSISCANCSSAKHLVGDCPDPYLKLSTSSFTTKGLDPEMITNLNTADGPRRTGRPAPPPPRSRGNAGRPGSRGAEWSRSSSDDENDMMSRVSRGRGRPAPVHRGNNSRGNIKFGNNVGTGRGSSRGPPSAPRARPQFPGNGNRRRSPSPRARNPPPPRGGGGGRGRGPSRGPGRARGSRGGGRGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.2
4 0.25
5 0.3
6 0.36
7 0.45
8 0.49
9 0.57
10 0.58
11 0.59
12 0.61
13 0.62
14 0.66
15 0.65
16 0.71
17 0.68
18 0.69
19 0.69
20 0.68
21 0.71
22 0.71
23 0.71
24 0.73
25 0.77
26 0.8
27 0.83
28 0.86
29 0.87
30 0.87
31 0.88
32 0.86
33 0.84
34 0.83
35 0.8
36 0.77
37 0.67
38 0.61
39 0.51
40 0.47
41 0.38
42 0.31
43 0.28
44 0.21
45 0.21
46 0.17
47 0.18
48 0.13
49 0.15
50 0.16
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.11
69 0.11
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.11
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.12
82 0.14
83 0.19
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.14
95 0.2
96 0.25
97 0.29
98 0.35
99 0.4
100 0.44
101 0.53
102 0.59
103 0.59
104 0.56
105 0.55
106 0.59
107 0.62
108 0.64
109 0.56
110 0.48
111 0.46
112 0.44
113 0.4
114 0.32
115 0.28
116 0.29
117 0.3
118 0.32
119 0.3
120 0.31
121 0.29
122 0.3
123 0.28
124 0.2
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.21
129 0.27
130 0.26
131 0.26
132 0.28
133 0.31
134 0.3
135 0.32
136 0.37
137 0.35
138 0.4
139 0.41
140 0.39
141 0.38
142 0.36
143 0.3
144 0.24
145 0.21
146 0.2
147 0.2
148 0.25
149 0.32
150 0.35
151 0.4
152 0.47
153 0.54
154 0.58
155 0.62
156 0.56
157 0.52
158 0.51
159 0.48
160 0.41
161 0.33
162 0.24
163 0.19
164 0.17
165 0.13
166 0.1
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.1
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.1
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.11
236 0.14
237 0.16
238 0.18
239 0.2
240 0.23
241 0.24
242 0.27
243 0.28
244 0.27
245 0.27
246 0.28
247 0.27
248 0.26
249 0.26
250 0.23
251 0.2
252 0.21
253 0.21
254 0.2
255 0.19
256 0.2
257 0.21
258 0.2
259 0.18
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.14
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.1
295 0.12
296 0.15
297 0.14
298 0.12
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.18
304 0.17
305 0.21
306 0.25
307 0.26
308 0.3
309 0.35
310 0.33
311 0.31
312 0.3
313 0.27
314 0.24
315 0.24
316 0.23
317 0.24
318 0.25
319 0.31
320 0.38
321 0.42
322 0.47
323 0.55
324 0.6
325 0.63
326 0.72
327 0.72
328 0.74
329 0.77
330 0.81
331 0.78
332 0.72
333 0.66
334 0.6
335 0.53
336 0.47
337 0.4
338 0.34
339 0.3
340 0.31
341 0.28
342 0.3
343 0.34
344 0.34
345 0.36
346 0.33
347 0.31
348 0.28
349 0.26
350 0.21
351 0.15
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.14
365 0.17
366 0.17
367 0.2
368 0.27
369 0.31
370 0.39
371 0.42
372 0.46
373 0.43
374 0.44
375 0.4
376 0.36
377 0.31
378 0.24
379 0.22
380 0.18
381 0.15
382 0.15
383 0.15
384 0.13
385 0.14
386 0.15
387 0.18
388 0.18
389 0.19
390 0.21
391 0.21
392 0.22
393 0.24
394 0.26
395 0.22
396 0.2
397 0.19
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.16
402 0.16
403 0.17
404 0.16
405 0.19
406 0.22
407 0.22
408 0.21
409 0.23
410 0.21
411 0.22
412 0.21
413 0.19
414 0.16
415 0.18
416 0.19
417 0.17
418 0.16
419 0.14
420 0.12
421 0.12
422 0.11
423 0.1
424 0.14
425 0.14
426 0.18
427 0.2
428 0.23
429 0.27
430 0.34
431 0.4
432 0.44
433 0.54
434 0.6
435 0.67
436 0.71
437 0.72
438 0.74
439 0.7
440 0.68
441 0.67
442 0.66
443 0.66
444 0.63
445 0.64
446 0.57
447 0.57
448 0.52
449 0.42
450 0.37
451 0.31
452 0.35
453 0.31
454 0.33
455 0.32
456 0.31
457 0.35
458 0.33
459 0.31
460 0.26
461 0.25
462 0.23
463 0.21
464 0.2
465 0.17
466 0.14
467 0.15
468 0.14
469 0.18
470 0.21
471 0.24
472 0.33
473 0.39
474 0.44
475 0.51
476 0.57
477 0.63
478 0.66
479 0.71
480 0.68
481 0.69
482 0.69
483 0.69
484 0.64
485 0.61
486 0.53
487 0.52
488 0.49
489 0.44
490 0.44
491 0.37
492 0.39
493 0.33
494 0.32
495 0.28
496 0.26
497 0.24
498 0.21
499 0.21
500 0.17
501 0.19
502 0.24
503 0.27
504 0.27
505 0.31
506 0.39
507 0.46
508 0.5
509 0.54
510 0.57
511 0.56
512 0.6
513 0.59
514 0.6
515 0.58
516 0.64
517 0.66
518 0.67
519 0.69
520 0.7
521 0.73
522 0.71
523 0.69
524 0.69
525 0.71
526 0.72
527 0.77
528 0.8
529 0.83
530 0.86
531 0.9
532 0.9
533 0.85
534 0.78
535 0.71
536 0.67
537 0.61
538 0.59
539 0.58
540 0.55
541 0.53
542 0.53
543 0.5
544 0.47
545 0.46
546 0.46
547 0.45
548 0.46
549 0.46
550 0.5
551 0.58
552 0.63
553 0.67
554 0.64
555 0.64
556 0.61
557 0.65
558 0.64