FuNGI

A0A1V6QGG6

Protein Details

Accession

A0A1V6QGG6

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
336-355	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
446-465	TSAQAKRTGAKNKRGRNGNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
340-345	RRKKRK
458-459	KR

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKQWIDKKNASTFQLFHRSQNDPLIHDTGADDRVLHQISGPAPAPSSSRTATKPLRNLHDLQSEFGDSARQNEGEAANYGIYYDDSNYDYMQHLRELGTGSGDTYFVEAKQEKPKGKANKGVKLEDALRQVSLDDREGDSQSAFGGPSLYGSEYGDMRSTASSYVRKPTYQDQQNVPDAIAGFKPDMDPRLREALEALEDEAFVQDGDDDDVFGELTANAEEIDEGDWEDSLFDHDDEDEGWESDATEKAPVQMDSTEAMDEKLPEATDANTLEPGEMPEHDQPAPDIAPTDQGWMNEFAKFKKDAKAGKAPVPAAPTIAPSQTMASTVFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDKVEALYALDEEDEYDDSMSMVSGMTGATGMTDMSAASEAPSLVDANGNEIHSRSNFNSVMDDFLSSWDPNTSAQAKRTGAKNKRGRNGNEAIGIRNLDEVRSGLGPARFRSGKVPGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.6
3	0.6
4	0.53
5	0.49
6	0.49
7	0.49
8	0.48
9	0.54
10	0.48
11	0.4
12	0.43
13	0.41
14	0.34
15	0.31
16	0.29
17	0.23
18	0.22
19	0.19
20	0.15
21	0.13
22	0.19
23	0.19
24	0.18
25	0.15
26	0.18
27	0.19
28	0.23
29	0.23
30	0.18
31	0.17
32	0.18
33	0.2
34	0.18
35	0.22
36	0.19
37	0.23
38	0.25
39	0.33
40	0.41
41	0.47
42	0.53
43	0.56
44	0.62
45	0.62
46	0.63
47	0.62
48	0.62
49	0.55
50	0.49
51	0.43
52	0.36
53	0.31
54	0.27
55	0.24
56	0.15
57	0.18
58	0.19
59	0.17
60	0.16
61	0.19
62	0.19
63	0.17
64	0.18
65	0.16
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.09
70	0.09
71	0.08
72	0.08
73	0.09
74	0.1
75	0.11
76	0.11
77	0.12
78	0.13
79	0.15
80	0.15
81	0.14
82	0.14
83	0.14
84	0.15
85	0.16
86	0.14
87	0.14
88	0.12
89	0.12
90	0.11
91	0.11
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.07
96	0.13
97	0.13
98	0.18
99	0.27
100	0.34
101	0.37
102	0.41
103	0.5
104	0.54
105	0.6
106	0.65
107	0.65
108	0.66
109	0.69
110	0.67
111	0.59
112	0.53
113	0.48
114	0.44
115	0.39
116	0.31
117	0.25
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.19
122	0.16
123	0.14
124	0.14
125	0.16
126	0.17
127	0.18
128	0.14
129	0.13
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.07
134	0.06
135	0.05
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.09
142	0.08
143	0.09
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.09
150	0.12
151	0.15
152	0.17
153	0.24
154	0.25
155	0.26
156	0.29
157	0.34
158	0.41
159	0.45
160	0.48
161	0.46
162	0.5
163	0.52
164	0.5
165	0.42
166	0.33
167	0.26
168	0.21
169	0.16
170	0.11
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.12
176	0.13
177	0.14
178	0.16
179	0.22
180	0.22
181	0.21
182	0.2
183	0.18
184	0.17
185	0.16
186	0.14
187	0.08
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.04
193	0.04
194	0.03
195	0.03
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.03
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.03
209	0.04
210	0.03
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.07
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.09
268	0.1
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.11
273	0.13
274	0.13
275	0.09
276	0.09
277	0.07
278	0.1
279	0.1
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.16
285	0.16
286	0.16
287	0.17
288	0.16
289	0.18
290	0.21
291	0.21
292	0.25
293	0.3
294	0.32
295	0.38
296	0.47
297	0.47
298	0.49
299	0.52
300	0.46
301	0.42
302	0.39
303	0.33
304	0.25
305	0.21
306	0.18
307	0.14
308	0.14
309	0.12
310	0.1
311	0.11
312	0.1
313	0.11
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.1
323	0.12
324	0.18
325	0.26
326	0.36
327	0.43
328	0.47
329	0.57
330	0.63
331	0.71
332	0.76
333	0.78
334	0.78
335	0.8
336	0.81
337	0.72
338	0.64
339	0.54
340	0.43
341	0.35
342	0.25
343	0.17
344	0.13
345	0.12
346	0.11
347	0.11
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.17
352	0.17
353	0.18
354	0.19
355	0.19
356	0.21
357	0.28
358	0.27
359	0.24
360	0.24
361	0.24
362	0.22
363	0.21
364	0.23
365	0.15
366	0.15
367	0.13
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.1
372	0.07
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.04
394	0.03
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.1
406	0.09
407	0.12
408	0.14
409	0.15
410	0.15
411	0.15
412	0.17
413	0.16
414	0.21
415	0.19
416	0.24
417	0.24
418	0.25
419	0.28
420	0.26
421	0.28
422	0.24
423	0.23
424	0.16
425	0.17
426	0.19
427	0.16
428	0.16
429	0.14
430	0.14
431	0.14
432	0.19
433	0.22
434	0.24
435	0.27
436	0.34
437	0.35
438	0.4
439	0.47
440	0.52
441	0.56
442	0.63
443	0.69
444	0.72
445	0.78
446	0.82
447	0.8
448	0.78
449	0.75
450	0.7
451	0.68
452	0.6
453	0.53
454	0.47
455	0.42
456	0.33
457	0.31
458	0.26
459	0.18
460	0.18
461	0.16
462	0.16
463	0.16
464	0.16
465	0.17
466	0.21
467	0.24
468	0.25
469	0.33
470	0.32
471	0.33
472	0.38
473	0.43

A0A1V6QGG6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer