FuNGI

A0A1V6NRJ6

Protein Details

Accession

A0A1V6NRJ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-45	SLPRQWRHAKIIPLKKPNKENYTI	Hydrophilic
573-593	CQIYKLMRRLRRNGNRIKIHW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 8.5, cyto_mito 6.5, cyto 3.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MTWPTVKYRVLELFQASLAEGSLPRQWRHAKIIPLKKPNKENYTIAKAWRPISLLATLGKILESVVAERISHAVETHGLLPTSHFGARKQRSAEQALLLLQEQIYTAWRGRRVLSLISFDVKGAYNGVCKERLLQRMKARGIPEGLLRWIEAFCSERTANIQINGQVSEVQSLPQAGLPQGSPLSPILFLFFNADLVQRQIDSQGGAVAFVDDFTAWVTGSTAQSNREGIEAIINGALDWERRSGATFEAEKTAIIHFAPKMRKSDHEAFIIKGQTVVPGNHVKILGVLMDTRLKYKEHIARAASKGLEAAMELRRLRGLSPATARQLFTSTVAPVVDYASNVWMHACKDKAMGPINRVQRVGAQAIVGTFLTVATSVAEAEAHIATARQRFWRRAVKMWTDMHTLPETNPLRRGTDRIRKFRRYHRSPLYRVADALKHIDMETLETINPFTLAPWEERMQPDMDQPQDVQTRAGLYMQIAVSSSARNELVGFGVAIEKQPPRYRKLRLKTLSVTLGARAEQNPLSAELAAMAHALKMVVGIKDYRITLLTSNKAAALTLRNPRRQSGQELVCQIYKLMRRLRRNGNRIKIHWIRTSEDNKLSSLAKEQARTATQEDALQQERVPRMKSTTLNIARSQAVPCSQLPENIGRHAKRVDAALPGKHTRLLYDRLTWKEATVLAQLRTGMARLNGYLNQINVAETDQCDCGQARETLQHFLFRCRKWTAHRTELLQCTQAHRGNISFALGGKQPSDDQNWTPNLEAVRASI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.3
3	0.24
4	0.17
5	0.15
6	0.12
7	0.1
8	0.1
9	0.15
10	0.2
11	0.21
12	0.29
13	0.35
14	0.4
15	0.48
16	0.53
17	0.57
18	0.62
19	0.72
20	0.74
21	0.79
22	0.82
23	0.81
24	0.84
25	0.84
26	0.82
27	0.78
28	0.75
29	0.73
30	0.74
31	0.69
32	0.64
33	0.61
34	0.58
35	0.53
36	0.49
37	0.42
38	0.35
39	0.34
40	0.3
41	0.26
42	0.22
43	0.22
44	0.19
45	0.17
46	0.15
47	0.12
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.11
53	0.12
54	0.12
55	0.13
56	0.14
57	0.13
58	0.13
59	0.12
60	0.1
61	0.11
62	0.13
63	0.14
64	0.15
65	0.14
66	0.14
67	0.15
68	0.16
69	0.18
70	0.19
71	0.18
72	0.2
73	0.31
74	0.37
75	0.42
76	0.45
77	0.48
78	0.52
79	0.56
80	0.55
81	0.46
82	0.42
83	0.37
84	0.33
85	0.27
86	0.21
87	0.16
88	0.12
89	0.1
90	0.08
91	0.09
92	0.1
93	0.14
94	0.18
95	0.21
96	0.23
97	0.25
98	0.29
99	0.3
100	0.34
101	0.34
102	0.34
103	0.32
104	0.33
105	0.31
106	0.26
107	0.25
108	0.2
109	0.17
110	0.14
111	0.13
112	0.14
113	0.17
114	0.2
115	0.19
116	0.19
117	0.24
118	0.3
119	0.38
120	0.4
121	0.45
122	0.5
123	0.58
124	0.61
125	0.6
126	0.55
127	0.51
128	0.47
129	0.41
130	0.36
131	0.29
132	0.28
133	0.23
134	0.21
135	0.18
136	0.16
137	0.14
138	0.12
139	0.12
140	0.11
141	0.16
142	0.16
143	0.15
144	0.19
145	0.23
146	0.23
147	0.22
148	0.25
149	0.22
150	0.24
151	0.23
152	0.2
153	0.18
154	0.16
155	0.16
156	0.13
157	0.11
158	0.1
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.08
164	0.09
165	0.09
166	0.1
167	0.11
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.11
178	0.11
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.1
183	0.11
184	0.11
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.08
190	0.08
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.07
207	0.08
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.15
212	0.15
213	0.15
214	0.14
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.1
219	0.09
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.16
234	0.17
235	0.17
236	0.19
237	0.19
238	0.17
239	0.17
240	0.16
241	0.12
242	0.1
243	0.11
244	0.1
245	0.16
246	0.22
247	0.24
248	0.28
249	0.29
250	0.32
251	0.38
252	0.46
253	0.43
254	0.44
255	0.43
256	0.4
257	0.41
258	0.39
259	0.3
260	0.23
261	0.19
262	0.15
263	0.15
264	0.14
265	0.14
266	0.17
267	0.18
268	0.19
269	0.19
270	0.16
271	0.15
272	0.15
273	0.11
274	0.07
275	0.07
276	0.06
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.21
284	0.27
285	0.28
286	0.33
287	0.34
288	0.38
289	0.4
290	0.42
291	0.34
292	0.27
293	0.23
294	0.18
295	0.15
296	0.09
297	0.1
298	0.09
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.13
304	0.14
305	0.15
306	0.15
307	0.15
308	0.19
309	0.22
310	0.25
311	0.26
312	0.26
313	0.22
314	0.22
315	0.19
316	0.17
317	0.15
318	0.11
319	0.11
320	0.11
321	0.1
322	0.08
323	0.09
324	0.07
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.08
333	0.1
334	0.11
335	0.1
336	0.11
337	0.14
338	0.18
339	0.24
340	0.25
341	0.25
342	0.31
343	0.35
344	0.36
345	0.33
346	0.29
347	0.24
348	0.25
349	0.23
350	0.17
351	0.12
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.08
356	0.05
357	0.04
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.06
374	0.08
375	0.1
376	0.15
377	0.18
378	0.21
379	0.28
380	0.36
381	0.38
382	0.43
383	0.48
384	0.46
385	0.5
386	0.5
387	0.46
388	0.41
389	0.38
390	0.33
391	0.28
392	0.23
393	0.17
394	0.24
395	0.23
396	0.2
397	0.24
398	0.23
399	0.25
400	0.25
401	0.3
402	0.29
403	0.38
404	0.45
405	0.51
406	0.59
407	0.65
408	0.7
409	0.75
410	0.77
411	0.75
412	0.76
413	0.76
414	0.77
415	0.72
416	0.76
417	0.7
418	0.6
419	0.53
420	0.46
421	0.37
422	0.29
423	0.27
424	0.17
425	0.13
426	0.13
427	0.13
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.07
441	0.08
442	0.11
443	0.13
444	0.15
445	0.16
446	0.17
447	0.17
448	0.16
449	0.19
450	0.19
451	0.19
452	0.17
453	0.17
454	0.2
455	0.21
456	0.21
457	0.18
458	0.14
459	0.14
460	0.14
461	0.14
462	0.09
463	0.07
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.05
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.08
485	0.09
486	0.13
487	0.2
488	0.23
489	0.28
490	0.34
491	0.44
492	0.51
493	0.59
494	0.65
495	0.64
496	0.67
497	0.66
498	0.64
499	0.57
500	0.49
501	0.41
502	0.31
503	0.28
504	0.21
505	0.19
506	0.15
507	0.15
508	0.13
509	0.13
510	0.13
511	0.13
512	0.13
513	0.11
514	0.1
515	0.08
516	0.08
517	0.07
518	0.06
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.03
524	0.04
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.1
534	0.11
535	0.14
536	0.19
537	0.21
538	0.2
539	0.2
540	0.2
541	0.19
542	0.18
543	0.16
544	0.15
545	0.19
546	0.27
547	0.34
548	0.4
549	0.41
550	0.43
551	0.48
552	0.47
553	0.48
554	0.48
555	0.46
556	0.44
557	0.46
558	0.46
559	0.41
560	0.37
561	0.31
562	0.27
563	0.26
564	0.28
565	0.33
566	0.39
567	0.46
568	0.55
569	0.66
570	0.71
571	0.76
572	0.8
573	0.82
574	0.82
575	0.77
576	0.78
577	0.74
578	0.7
579	0.66
580	0.59
581	0.53
582	0.53
583	0.55
584	0.52
585	0.5
586	0.45
587	0.39
588	0.38
589	0.36
590	0.28
591	0.27
592	0.28
593	0.26
594	0.26
595	0.27
596	0.3
597	0.3
598	0.32
599	0.3
600	0.27
601	0.24
602	0.24
603	0.24
604	0.24
605	0.24
606	0.22
607	0.21
608	0.23
609	0.27
610	0.29
611	0.3
612	0.28
613	0.3
614	0.35
615	0.38
616	0.37
617	0.42
618	0.46
619	0.48
620	0.47
621	0.46
622	0.41
623	0.4
624	0.37
625	0.29
626	0.24
627	0.23
628	0.21
629	0.24
630	0.23
631	0.23
632	0.25
633	0.28
634	0.29
635	0.33
636	0.41
637	0.36
638	0.4
639	0.39
640	0.38
641	0.33
642	0.33
643	0.28
644	0.29
645	0.33
646	0.32
647	0.37
648	0.38
649	0.37
650	0.38
651	0.36
652	0.31
653	0.32
654	0.34
655	0.31
656	0.36
657	0.43
658	0.44
659	0.47
660	0.44
661	0.39
662	0.36
663	0.34
664	0.28
665	0.27
666	0.27
667	0.24
668	0.26
669	0.25
670	0.23
671	0.23
672	0.2
673	0.16
674	0.13
675	0.14
676	0.13
677	0.17
678	0.18
679	0.21
680	0.23
681	0.21
682	0.21
683	0.2
684	0.19
685	0.16
686	0.16
687	0.13
688	0.12
689	0.14
690	0.14
691	0.13
692	0.15
693	0.15
694	0.15
695	0.17
696	0.18
697	0.18
698	0.25
699	0.27
700	0.32
701	0.32
702	0.37
703	0.35
704	0.43
705	0.49
706	0.44
707	0.48
708	0.48
709	0.53
710	0.56
711	0.65
712	0.64
713	0.65
714	0.69
715	0.69
716	0.71
717	0.72
718	0.66
719	0.61
720	0.53
721	0.48
722	0.5
723	0.49
724	0.42
725	0.37
726	0.35
727	0.33
728	0.33
729	0.3
730	0.23
731	0.19
732	0.2
733	0.2
734	0.2
735	0.18
736	0.19
737	0.2
738	0.23
739	0.28
740	0.29
741	0.31
742	0.37
743	0.4
744	0.4
745	0.39
746	0.38
747	0.33
748	0.3

A0A1V6NRJ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer