Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6PYW1

Protein Details
Accession A0A1V6PYW1    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-164LIGRHKRKRAEGEESRPRRKEGRREKKSRRAAEDDGEEGGSSRRRERKKREDQPDTDEEBasic
180-199MDQAMKKPAKRRFRKQDGIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-155GRHKRKRAEGEESRPRRKEGRREKKSRRAAEDDGEEGGSSRRRERKKR
184-194MKKPAKRRFRK
435-440KKASRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEHQAAVFAASPDLEVPDKVASPIAGDDEVDAKPAEPAAEFEDNADDAAEQGGNDEDDDDNHSDDESILSEVDEAQFENFDPENVDVEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRAEGEESRPRRKEGRREKKSRRAAEDDGEEGGSSRRRERKKREDQPDTDEETLDPETRRRRALDRAMDQAMKKPAKRRFRKQDGIDLESMADAEIEDMRKRMTHAAQMDAISRQEGKPAMHKLKLLPEVTMLLNRNQYINALVDPEINLLEAVRFFLEPLDDGAMPAYNIQRDLLTCLTKLPINKDALIASGIGKVIVFYTKSKRTERRIKEVAEKLLAEWTRPILQRSDDYSKRVFQQADYDPTKVVKRTAPTAEMVAAEARAREMLPPRLANRARVDRTQVSYTVVPRQTAVRESQFARPLGASGEDRFRKMQARQVAAKKASRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.11
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.14
16 0.12
17 0.11
18 0.12
19 0.14
20 0.13
21 0.14
22 0.13
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.08
28 0.1
29 0.15
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.16
37 0.1
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.12
78 0.14
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.19
94 0.27
95 0.33
96 0.41
97 0.5
98 0.58
99 0.66
100 0.74
101 0.75
102 0.76
103 0.75
104 0.77
105 0.8
106 0.8
107 0.82
108 0.74
109 0.7
110 0.68
111 0.67
112 0.68
113 0.69
114 0.71
115 0.73
116 0.82
117 0.89
118 0.91
119 0.93
120 0.9
121 0.86
122 0.82
123 0.76
124 0.7
125 0.62
126 0.53
127 0.44
128 0.35
129 0.27
130 0.2
131 0.18
132 0.16
133 0.14
134 0.2
135 0.27
136 0.36
137 0.46
138 0.57
139 0.66
140 0.74
141 0.83
142 0.87
143 0.89
144 0.85
145 0.82
146 0.78
147 0.72
148 0.61
149 0.5
150 0.39
151 0.32
152 0.28
153 0.22
154 0.16
155 0.16
156 0.21
157 0.24
158 0.26
159 0.27
160 0.3
161 0.36
162 0.45
163 0.49
164 0.47
165 0.49
166 0.49
167 0.49
168 0.45
169 0.42
170 0.41
171 0.36
172 0.34
173 0.37
174 0.43
175 0.51
176 0.6
177 0.66
178 0.69
179 0.76
180 0.83
181 0.78
182 0.8
183 0.75
184 0.69
185 0.59
186 0.48
187 0.38
188 0.28
189 0.24
190 0.14
191 0.08
192 0.04
193 0.03
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.11
202 0.12
203 0.16
204 0.18
205 0.19
206 0.21
207 0.21
208 0.21
209 0.18
210 0.16
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.1
217 0.15
218 0.23
219 0.26
220 0.27
221 0.28
222 0.28
223 0.33
224 0.38
225 0.33
226 0.26
227 0.22
228 0.22
229 0.21
230 0.23
231 0.18
232 0.14
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.14
238 0.11
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.16
280 0.17
281 0.19
282 0.22
283 0.23
284 0.24
285 0.24
286 0.23
287 0.22
288 0.2
289 0.16
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.1
300 0.18
301 0.25
302 0.31
303 0.39
304 0.47
305 0.55
306 0.65
307 0.69
308 0.72
309 0.72
310 0.72
311 0.73
312 0.72
313 0.67
314 0.59
315 0.51
316 0.42
317 0.41
318 0.37
319 0.28
320 0.22
321 0.2
322 0.22
323 0.23
324 0.25
325 0.21
326 0.23
327 0.27
328 0.33
329 0.39
330 0.37
331 0.4
332 0.42
333 0.42
334 0.43
335 0.44
336 0.38
337 0.31
338 0.36
339 0.38
340 0.43
341 0.43
342 0.41
343 0.36
344 0.38
345 0.4
346 0.33
347 0.3
348 0.27
349 0.28
350 0.33
351 0.37
352 0.37
353 0.35
354 0.35
355 0.32
356 0.28
357 0.25
358 0.19
359 0.15
360 0.12
361 0.11
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.12
366 0.17
367 0.23
368 0.28
369 0.33
370 0.34
371 0.44
372 0.46
373 0.49
374 0.52
375 0.55
376 0.55
377 0.54
378 0.6
379 0.56
380 0.59
381 0.56
382 0.48
383 0.43
384 0.42
385 0.41
386 0.42
387 0.38
388 0.34
389 0.31
390 0.34
391 0.33
392 0.33
393 0.36
394 0.32
395 0.35
396 0.38
397 0.44
398 0.47
399 0.44
400 0.42
401 0.36
402 0.31
403 0.28
404 0.29
405 0.24
406 0.21
407 0.31
408 0.31
409 0.34
410 0.35
411 0.36
412 0.4
413 0.41
414 0.46
415 0.46
416 0.51
417 0.57
418 0.64
419 0.7
420 0.69