FuNGI

A0A1V6PRT2

Protein Details

Accession

A0A1V6PRT2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
286-312	ELLKAKRETKSPKQDKKQDNKAAKPET	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022801 Ribosomal_S4/S9 IPR018079 Ribosomal_S4_CS IPR002942 S4_RNA-bd IPR036986 S4_RNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0015935 C:small ribosomal subunit GO:0019843 F:rRNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome
Pfam	View protein in Pfam PF01479 S4
PROSITE	View protein in PROSITE PS00632 RIBOSOMAL_S4 PS50889 S4
CDD	cd00165 S4

Amino Acid Sequences

MRNRASNTLSKGKIRQSWSKYNLYNMSRFRSPATMNRTFFQQKWSAKAVSRAYHGEQVREGQWKRMFSRRIKSVIPMNTVDLAADDGSLVSAGRGSGLTKEEKSRYPTRQTPYTNMTFAPLERRLDVAIFRAMFASSARQARQFVIHGAVTVNGQKMRHPSYLLNPGDLFQVEPDRVMFATGTPKNKFERRESRLAQKPAEEAEAETEKAEAEEPEELKSPKETLKALMARAKSVMSNDKDTLPAKRKQELRGFQKAVRRVLSRSGSESSNILTQSLEVQFSHLTELLKAKRETKSPKQDKKQDNKAAKPETDDSLAFEADEPAASDKLSAAFEQVTLGKDVDVSELSNEEFDTLKRALTQMRDNPIDNTKPYATPWQPRDYMSAFAFIPRYLEVNQNICAAVYLRHPVARPGSAEVPTPFGESIATPAYGWYLRRRW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.66
3	0.65
4	0.71
5	0.71
6	0.74
7	0.68
8	0.69
9	0.71
10	0.66
11	0.66
12	0.61
13	0.61
14	0.55
15	0.53
16	0.48
17	0.45
18	0.44
19	0.44
20	0.48
21	0.51
22	0.5
23	0.5
24	0.54
25	0.53
26	0.5
27	0.48
28	0.48
29	0.43
30	0.47
31	0.51
32	0.47
33	0.45
34	0.53
35	0.52
36	0.48
37	0.48
38	0.47
39	0.45
40	0.48
41	0.46
42	0.41
43	0.36
44	0.35
45	0.35
46	0.39
47	0.37
48	0.38
49	0.41
50	0.44
51	0.46
52	0.52
53	0.56
54	0.55
55	0.64
56	0.63
57	0.64
58	0.6
59	0.61
60	0.61
61	0.59
62	0.56
63	0.47
64	0.42
65	0.38
66	0.35
67	0.3
68	0.21
69	0.16
70	0.11
71	0.09
72	0.06
73	0.05
74	0.05
75	0.05
76	0.04
77	0.03
78	0.04
79	0.04
80	0.04
81	0.05
82	0.05
83	0.08
84	0.11
85	0.15
86	0.17
87	0.23
88	0.26
89	0.3
90	0.37
91	0.43
92	0.47
93	0.52
94	0.58
95	0.59
96	0.64
97	0.64
98	0.63
99	0.62
100	0.58
101	0.51
102	0.43
103	0.39
104	0.31
105	0.27
106	0.28
107	0.25
108	0.22
109	0.21
110	0.22
111	0.2
112	0.2
113	0.2
114	0.16
115	0.16
116	0.15
117	0.14
118	0.14
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.13
123	0.13
124	0.16
125	0.17
126	0.19
127	0.21
128	0.21
129	0.24
130	0.22
131	0.19
132	0.19
133	0.18
134	0.16
135	0.15
136	0.14
137	0.12
138	0.12
139	0.12
140	0.11
141	0.12
142	0.13
143	0.18
144	0.23
145	0.23
146	0.24
147	0.24
148	0.29
149	0.38
150	0.37
151	0.33
152	0.28
153	0.27
154	0.26
155	0.23
156	0.17
157	0.08
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.14
168	0.18
169	0.23
170	0.23
171	0.26
172	0.3
173	0.35
174	0.39
175	0.4
176	0.47
177	0.48
178	0.56
179	0.57
180	0.62
181	0.66
182	0.66
183	0.58
184	0.49
185	0.44
186	0.36
187	0.33
188	0.24
189	0.15
190	0.14
191	0.14
192	0.12
193	0.11
194	0.1
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.05
199	0.05
200	0.07
201	0.07
202	0.09
203	0.11
204	0.11
205	0.11
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.2
213	0.21
214	0.23
215	0.26
216	0.24
217	0.22
218	0.22
219	0.21
220	0.15
221	0.15
222	0.2
223	0.17
224	0.21
225	0.21
226	0.21
227	0.23
228	0.24
229	0.28
230	0.27
231	0.31
232	0.31
233	0.36
234	0.4
235	0.45
236	0.54
237	0.56
238	0.58
239	0.62
240	0.62
241	0.59
242	0.61
243	0.59
244	0.53
245	0.49
246	0.43
247	0.35
248	0.39
249	0.39
250	0.34
251	0.33
252	0.31
253	0.27
254	0.26
255	0.25
256	0.19
257	0.17
258	0.16
259	0.12
260	0.1
261	0.09
262	0.11
263	0.12
264	0.11
265	0.09
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.12
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.16
274	0.18
275	0.24
276	0.25
277	0.29
278	0.31
279	0.38
280	0.46
281	0.51
282	0.59
283	0.64
284	0.73
285	0.78
286	0.85
287	0.88
288	0.89
289	0.9
290	0.88
291	0.86
292	0.84
293	0.83
294	0.79
295	0.69
296	0.64
297	0.55
298	0.48
299	0.42
300	0.34
301	0.27
302	0.23
303	0.22
304	0.17
305	0.14
306	0.12
307	0.09
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.09
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.12
326	0.1
327	0.1
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.09
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.12
341	0.11
342	0.12
343	0.12
344	0.14
345	0.17
346	0.22
347	0.3
348	0.33
349	0.4
350	0.43
351	0.43
352	0.45
353	0.48
354	0.47
355	0.4
356	0.39
357	0.34
358	0.31
359	0.33
360	0.39
361	0.38
362	0.43
363	0.48
364	0.5
365	0.5
366	0.51
367	0.54
368	0.46
369	0.45
370	0.37
371	0.34
372	0.26
373	0.27
374	0.26
375	0.2
376	0.2
377	0.15
378	0.17
379	0.16
380	0.22
381	0.24
382	0.26
383	0.28
384	0.28
385	0.27
386	0.24
387	0.23
388	0.18
389	0.15
390	0.15
391	0.17
392	0.18
393	0.21
394	0.22
395	0.26
396	0.3
397	0.32
398	0.31
399	0.32
400	0.35
401	0.33
402	0.37
403	0.33
404	0.32
405	0.29
406	0.29
407	0.24
408	0.19
409	0.18
410	0.15
411	0.17
412	0.16
413	0.15
414	0.12
415	0.13
416	0.16
417	0.18
418	0.2

A0A1V6PRT2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer