FuNGI

A0A1V6QD55

Protein Details

Accession

A0A1V6QD55

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
319-338	SVPSPRPKAKRKSPTSPAPS	Hydrophilic
530-552	TEDQRASRKREELKRQLEAKSKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
324-330	RPKAKRK
374-401	PEPASPAPKKKPRGGLGVIGGKKKKDPE
439-456	ASAKPKRTGKLGVIGGKA
535-560	ASRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 9.5, cyto_nucl 6.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MPSSWQRLHVSHRGLPPLLFQYTWTQQGYEIYLTDLTCVWAERLFYEDIAKRAEEEAATIDPGEDPEQLKVLLEKIGQSLQEGKESTVLSCGTQTDSLEITTTTKLPAPLKPLIWPLKLSKEPLSAVKSCILIPLLKEQADMELRQRSLLSQIKQKDYVLGRLFDKLESLGAELGSVFPSAAGLRTSRKGSTRSEAGRFVKGIAPFDEEAWLAEVGSSTGTGFGIHLFHEILESGKIEGLKSINHQGEWWHQLQRSAQKHTREATPFEEEVAVSPKKQSTGPRPQHHAEEGESTANSDPDGFERQETPPHLKRQHVQESVPSPRPKAKRKSPTSPAPSEEDEATASDTDPEPELAPKLAPRKSRISSSSPEPEPEPASPAPKKKPRGGLGVIGGKKKKDPEPEPVSSSPKPNQQLKSPEEKASNDKVRSTSPAPASAPASAKPKRTGKLGVIGGKAKTKGSQQPQYEPPSSTSQTVVASSEQASPVKPRPAQKDNAPEPTAQQTIKQEESPILKPAAERASANPPAEPETEDQRASRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.5
3	0.47
4	0.43
5	0.38
6	0.31
7	0.28
8	0.29
9	0.32
10	0.37
11	0.33
12	0.28
13	0.27
14	0.29
15	0.3
16	0.24
17	0.21
18	0.17
19	0.18
20	0.17
21	0.17
22	0.14
23	0.13
24	0.12
25	0.12
26	0.11
27	0.11
28	0.12
29	0.12
30	0.15
31	0.15
32	0.15
33	0.2
34	0.23
35	0.23
36	0.25
37	0.25
38	0.23
39	0.23
40	0.24
41	0.18
42	0.15
43	0.16
44	0.15
45	0.15
46	0.13
47	0.12
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.12
53	0.13
54	0.14
55	0.14
56	0.14
57	0.13
58	0.13
59	0.14
60	0.13
61	0.14
62	0.15
63	0.17
64	0.17
65	0.17
66	0.22
67	0.21
68	0.25
69	0.24
70	0.22
71	0.24
72	0.25
73	0.23
74	0.2
75	0.2
76	0.15
77	0.16
78	0.16
79	0.14
80	0.15
81	0.15
82	0.14
83	0.14
84	0.14
85	0.13
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.12
91	0.13
92	0.17
93	0.2
94	0.22
95	0.26
96	0.29
97	0.3
98	0.32
99	0.38
100	0.4
101	0.4
102	0.39
103	0.37
104	0.42
105	0.44
106	0.44
107	0.4
108	0.38
109	0.38
110	0.4
111	0.42
112	0.34
113	0.33
114	0.32
115	0.29
116	0.25
117	0.25
118	0.2
119	0.16
120	0.16
121	0.2
122	0.21
123	0.2
124	0.2
125	0.18
126	0.21
127	0.22
128	0.22
129	0.2
130	0.22
131	0.22
132	0.22
133	0.22
134	0.18
135	0.24
136	0.29
137	0.29
138	0.32
139	0.38
140	0.41
141	0.43
142	0.43
143	0.42
144	0.37
145	0.42
146	0.37
147	0.34
148	0.3
149	0.32
150	0.32
151	0.26
152	0.24
153	0.16
154	0.14
155	0.11
156	0.11
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.05
165	0.04
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.07
171	0.1
172	0.14
173	0.16
174	0.18
175	0.22
176	0.25
177	0.28
178	0.32
179	0.37
180	0.39
181	0.4
182	0.46
183	0.44
184	0.43
185	0.39
186	0.35
187	0.31
188	0.27
189	0.26
190	0.19
191	0.2
192	0.18
193	0.18
194	0.17
195	0.13
196	0.12
197	0.12
198	0.11
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.03
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.05
222	0.06
223	0.07
224	0.06
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.1
229	0.16
230	0.16
231	0.16
232	0.16
233	0.17
234	0.2
235	0.24
236	0.24
237	0.21
238	0.21
239	0.23
240	0.27
241	0.34
242	0.34
243	0.38
244	0.41
245	0.41
246	0.44
247	0.45
248	0.47
249	0.41
250	0.39
251	0.35
252	0.34
253	0.3
254	0.27
255	0.24
256	0.18
257	0.16
258	0.18
259	0.15
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.12
264	0.15
265	0.2
266	0.25
267	0.35
268	0.45
269	0.49
270	0.54
271	0.55
272	0.55
273	0.51
274	0.44
275	0.34
276	0.27
277	0.23
278	0.18
279	0.15
280	0.14
281	0.12
282	0.1
283	0.09
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.12
291	0.13
292	0.17
293	0.19
294	0.25
295	0.27
296	0.35
297	0.38
298	0.39
299	0.43
300	0.48
301	0.55
302	0.51
303	0.46
304	0.43
305	0.46
306	0.49
307	0.52
308	0.44
309	0.36
310	0.4
311	0.47
312	0.51
313	0.55
314	0.59
315	0.62
316	0.69
317	0.77
318	0.78
319	0.8
320	0.79
321	0.74
322	0.66
323	0.59
324	0.53
325	0.45
326	0.37
327	0.28
328	0.21
329	0.17
330	0.15
331	0.11
332	0.09
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.12
344	0.18
345	0.22
346	0.26
347	0.29
348	0.36
349	0.39
350	0.44
351	0.45
352	0.44
353	0.44
354	0.47
355	0.5
356	0.43
357	0.42
358	0.37
359	0.35
360	0.32
361	0.28
362	0.26
363	0.2
364	0.25
365	0.29
366	0.34
367	0.41
368	0.47
369	0.53
370	0.54
371	0.62
372	0.6
373	0.64
374	0.6
375	0.56
376	0.53
377	0.55
378	0.52
379	0.48
380	0.45
381	0.38
382	0.37
383	0.38
384	0.38
385	0.39
386	0.4
387	0.45
388	0.52
389	0.56
390	0.59
391	0.58
392	0.59
393	0.51
394	0.53
395	0.47
396	0.46
397	0.49
398	0.5
399	0.5
400	0.51
401	0.57
402	0.57
403	0.63
404	0.59
405	0.57
406	0.53
407	0.53
408	0.51
409	0.52
410	0.55
411	0.47
412	0.46
413	0.43
414	0.41
415	0.44
416	0.4
417	0.38
418	0.33
419	0.36
420	0.34
421	0.34
422	0.34
423	0.31
424	0.3
425	0.26
426	0.32
427	0.31
428	0.34
429	0.4
430	0.45
431	0.45
432	0.48
433	0.5
434	0.46
435	0.51
436	0.52
437	0.5
438	0.47
439	0.47
440	0.44
441	0.43
442	0.4
443	0.32
444	0.29
445	0.29
446	0.35
447	0.41
448	0.48
449	0.48
450	0.55
451	0.62
452	0.66
453	0.63
454	0.56
455	0.5
456	0.48
457	0.46
458	0.39
459	0.33
460	0.28
461	0.26
462	0.25
463	0.23
464	0.16
465	0.16
466	0.16
467	0.17
468	0.17
469	0.17
470	0.17
471	0.21
472	0.26
473	0.33
474	0.36
475	0.42
476	0.49
477	0.55
478	0.61
479	0.64
480	0.69
481	0.68
482	0.72
483	0.67
484	0.58
485	0.54
486	0.53
487	0.49
488	0.38
489	0.35
490	0.33
491	0.37
492	0.39
493	0.37
494	0.33
495	0.34
496	0.39
497	0.37
498	0.34
499	0.3
500	0.28
501	0.27
502	0.31
503	0.31
504	0.28
505	0.26
506	0.27
507	0.34
508	0.39
509	0.4
510	0.35
511	0.31
512	0.33
513	0.33
514	0.32
515	0.26
516	0.28
517	0.31
518	0.31
519	0.31
520	0.36
521	0.43
522	0.46
523	0.5
524	0.51
525	0.57
526	0.66
527	0.76
528	0.77
529	0.79
530	0.82
531	0.81
532	0.81
533	0.81
534	0.75
535	0.7
536	0.69
537	0.68
538	0.66
539	0.7
540	0.73

A0A1V6QD55

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer