FuNGI

A0A1V6PBV3

Protein Details

Accession

A0A1V6PBV3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-108	KVAVKEVRRLRRRHTKIKDPYDWMC	Hydrophilic
112-134	ARNKKTRLVKKTLSRAHRRRVQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-129	KTRLVKKTLSRAHR

Subcellular Location(s)

cyto 10, mito 8, cyto_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

TVLDIITPVAVQQKRRNWSATDDQKLIQKIEGGLQTGGLYQADPQRIEATCQELMGVIQSAIEESTPWAKPSAWSNPDFGDECKVAVKEVRRLRRRHTKIKDPYDWMCYSEARNKKTRLVKKTLSRAHRRRVQQVVEDGPQGMWRLAKWARDRDGAYEKGITPSLKIQDPQMPGTLAETVERKAEAFRIAFFPEPPPADLSDTDSFQYPQQIEFPAVAAQEIQEAVRGAKAGKAPGEDGIPNSLWHKLIEIPVNLETVVQLFNACINTGYNPSHFQRSITVVLRKQGKSDYQLAKSFRPVALLNTLGKFSETVVARRISYAAETNGLLPRSHLGGRKGISTDHAIHIIIDRIKTAWGKGKPVVSLLMLDVSGAYDNVSHERLLHNLKKRRLGHFFPWVRAFLTNRSTRIRIPQGSPISPILYLIYNADLVENCANGVSSNGWVDDVCFMTKGDSERETIKKLRAACRKADQWAEKHASVDLRMVRLRFHRSELEPEPGVGPENLRFESGSNLTEPELHNSAKIFPISGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.54
3	0.57
4	0.52
5	0.57
6	0.61
7	0.62
8	0.61
9	0.57
10	0.55
11	0.57
12	0.57
13	0.5
14	0.4
15	0.33
16	0.27
17	0.3
18	0.3
19	0.26
20	0.23
21	0.22
22	0.21
23	0.18
24	0.18
25	0.12
26	0.09
27	0.1
28	0.16
29	0.2
30	0.2
31	0.21
32	0.24
33	0.25
34	0.28
35	0.27
36	0.26
37	0.23
38	0.23
39	0.21
40	0.17
41	0.17
42	0.15
43	0.13
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.06
51	0.07
52	0.13
53	0.14
54	0.15
55	0.16
56	0.16
57	0.19
58	0.26
59	0.34
60	0.34
61	0.35
62	0.37
63	0.37
64	0.4
65	0.39
66	0.33
67	0.28
68	0.23
69	0.22
70	0.23
71	0.21
72	0.18
73	0.22
74	0.25
75	0.29
76	0.38
77	0.48
78	0.53
79	0.58
80	0.67
81	0.73
82	0.78
83	0.8
84	0.81
85	0.81
86	0.83
87	0.89
88	0.87
89	0.82
90	0.76
91	0.73
92	0.64
93	0.55
94	0.46
95	0.38
96	0.34
97	0.37
98	0.4
99	0.38
100	0.45
101	0.46
102	0.52
103	0.6
104	0.66
105	0.66
106	0.68
107	0.71
108	0.72
109	0.8
110	0.8
111	0.8
112	0.82
113	0.82
114	0.83
115	0.82
116	0.79
117	0.77
118	0.78
119	0.73
120	0.68
121	0.65
122	0.6
123	0.54
124	0.48
125	0.4
126	0.31
127	0.27
128	0.22
129	0.16
130	0.11
131	0.09
132	0.14
133	0.17
134	0.23
135	0.28
136	0.35
137	0.38
138	0.43
139	0.44
140	0.43
141	0.47
142	0.43
143	0.38
144	0.33
145	0.3
146	0.27
147	0.28
148	0.22
149	0.17
150	0.19
151	0.21
152	0.2
153	0.2
154	0.21
155	0.26
156	0.28
157	0.28
158	0.25
159	0.22
160	0.2
161	0.21
162	0.19
163	0.13
164	0.12
165	0.11
166	0.1
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.09
171	0.11
172	0.13
173	0.12
174	0.13
175	0.14
176	0.16
177	0.16
178	0.17
179	0.17
180	0.17
181	0.18
182	0.17
183	0.16
184	0.16
185	0.17
186	0.16
187	0.2
188	0.18
189	0.18
190	0.18
191	0.17
192	0.16
193	0.15
194	0.18
195	0.13
196	0.12
197	0.13
198	0.13
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.1
203	0.09
204	0.09
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.08
217	0.1
218	0.1
219	0.11
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.14
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.12
236	0.15
237	0.14
238	0.15
239	0.15
240	0.15
241	0.14
242	0.12
243	0.09
244	0.07
245	0.07
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.09
256	0.1
257	0.1
258	0.13
259	0.14
260	0.18
261	0.18
262	0.18
263	0.17
264	0.2
265	0.23
266	0.24
267	0.28
268	0.25
269	0.29
270	0.36
271	0.34
272	0.32
273	0.3
274	0.29
275	0.28
276	0.36
277	0.37
278	0.34
279	0.39
280	0.4
281	0.38
282	0.38
283	0.36
284	0.28
285	0.25
286	0.21
287	0.18
288	0.18
289	0.19
290	0.18
291	0.16
292	0.16
293	0.13
294	0.13
295	0.11
296	0.09
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.15
301	0.17
302	0.17
303	0.17
304	0.17
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.12
312	0.14
313	0.15
314	0.13
315	0.11
316	0.12
317	0.13
318	0.15
319	0.17
320	0.17
321	0.21
322	0.22
323	0.24
324	0.24
325	0.22
326	0.21
327	0.21
328	0.22
329	0.18
330	0.18
331	0.16
332	0.15
333	0.16
334	0.17
335	0.15
336	0.12
337	0.11
338	0.11
339	0.13
340	0.13
341	0.15
342	0.19
343	0.2
344	0.24
345	0.28
346	0.3
347	0.28
348	0.29
349	0.28
350	0.2
351	0.19
352	0.15
353	0.12
354	0.09
355	0.08
356	0.07
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.08
364	0.09
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.14
369	0.21
370	0.28
371	0.35
372	0.43
373	0.48
374	0.57
375	0.61
376	0.65
377	0.65
378	0.65
379	0.63
380	0.65
381	0.64
382	0.6
383	0.58
384	0.51
385	0.44
386	0.41
387	0.36
388	0.31
389	0.34
390	0.34
391	0.35
392	0.39
393	0.4
394	0.39
395	0.46
396	0.48
397	0.46
398	0.44
399	0.49
400	0.51
401	0.5
402	0.5
403	0.43
404	0.35
405	0.3
406	0.27
407	0.19
408	0.14
409	0.13
410	0.11
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.08
416	0.1
417	0.11
418	0.1
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.1
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.14
438	0.16
439	0.18
440	0.18
441	0.19
442	0.26
443	0.3
444	0.34
445	0.36
446	0.39
447	0.39
448	0.45
449	0.52
450	0.56
451	0.57
452	0.59
453	0.64
454	0.64
455	0.67
456	0.69
457	0.67
458	0.61
459	0.65
460	0.64
461	0.56
462	0.51
463	0.47
464	0.4
465	0.34
466	0.36
467	0.29
468	0.28
469	0.3
470	0.3
471	0.32
472	0.36
473	0.43
474	0.4
475	0.42
476	0.44
477	0.44
478	0.52
479	0.52
480	0.52
481	0.45
482	0.43
483	0.39
484	0.32
485	0.3
486	0.22
487	0.2
488	0.18
489	0.22
490	0.21
491	0.21
492	0.21
493	0.2
494	0.25
495	0.25
496	0.22
497	0.19
498	0.2
499	0.19
500	0.23
501	0.24
502	0.24
503	0.25
504	0.24
505	0.24
506	0.24
507	0.26
508	0.26
509	0.25

A0A1V6PBV3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer