Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YHK3

Protein Details
Accession I4YHK3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MGRRKIQIKPLKDDRNRSVTFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033896  MADS_MEF2-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG wse:WALSEDRAFT_59614  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00265  MADS_MEF2_like  
Amino Acid Sequences MGRRKIQIKPLKDDRNRSVTFLKRKTGLFKKAHELGVLCSADVAVIVFGHNGKLYEFSSGNIEKILMKYTEHEGESERRCPRDFNDDNESEQDFNEFEEERVKEEPEVQVKATTETPTPVKSEPVKEDIIKEDIKPRIEIGDLDDKPSSMPSTHAGPSSSSLPPPPRSPKPVSPFDPSKYSPYPPLSFLPGYPHSPNTQAQHDQMMNWQYAQMHAHAVSQHQQQQTRPQQSTNQFLSPSNTPVVQSHSPQASQSMLQTPNVSSVPNMGSMPWYNSMPPIAWPTPAPGLSASMLMDPFQFPLDGLSTSPSDGQSGFQWPIPPKEATNQNNSTTAAGSEGELSANSGTTLEVPNSKEPIQSPRSTKRARTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.81
3 0.75
4 0.7
5 0.68
6 0.67
7 0.69
8 0.66
9 0.64
10 0.59
11 0.61
12 0.66
13 0.67
14 0.68
15 0.65
16 0.63
17 0.66
18 0.67
19 0.65
20 0.58
21 0.49
22 0.42
23 0.43
24 0.37
25 0.28
26 0.21
27 0.19
28 0.16
29 0.15
30 0.12
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.05
35 0.06
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.1
41 0.11
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.2
46 0.21
47 0.21
48 0.18
49 0.19
50 0.16
51 0.17
52 0.19
53 0.14
54 0.13
55 0.16
56 0.2
57 0.24
58 0.22
59 0.22
60 0.23
61 0.29
62 0.33
63 0.38
64 0.38
65 0.37
66 0.38
67 0.39
68 0.39
69 0.42
70 0.42
71 0.41
72 0.45
73 0.43
74 0.45
75 0.45
76 0.43
77 0.32
78 0.28
79 0.23
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.1
84 0.09
85 0.14
86 0.15
87 0.16
88 0.18
89 0.18
90 0.17
91 0.19
92 0.23
93 0.22
94 0.23
95 0.22
96 0.23
97 0.22
98 0.24
99 0.23
100 0.2
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.17
105 0.2
106 0.18
107 0.21
108 0.24
109 0.28
110 0.29
111 0.31
112 0.32
113 0.3
114 0.31
115 0.29
116 0.29
117 0.25
118 0.23
119 0.26
120 0.27
121 0.27
122 0.26
123 0.23
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.17
128 0.22
129 0.21
130 0.23
131 0.23
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.18
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.18
146 0.17
147 0.14
148 0.16
149 0.19
150 0.21
151 0.26
152 0.31
153 0.32
154 0.39
155 0.44
156 0.49
157 0.52
158 0.57
159 0.55
160 0.55
161 0.55
162 0.5
163 0.5
164 0.43
165 0.42
166 0.37
167 0.34
168 0.33
169 0.32
170 0.31
171 0.28
172 0.28
173 0.26
174 0.24
175 0.23
176 0.23
177 0.21
178 0.23
179 0.21
180 0.22
181 0.19
182 0.22
183 0.25
184 0.22
185 0.24
186 0.23
187 0.23
188 0.25
189 0.24
190 0.22
191 0.22
192 0.21
193 0.17
194 0.15
195 0.15
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.14
206 0.17
207 0.22
208 0.24
209 0.26
210 0.27
211 0.36
212 0.44
213 0.48
214 0.45
215 0.42
216 0.46
217 0.49
218 0.55
219 0.48
220 0.41
221 0.35
222 0.34
223 0.35
224 0.29
225 0.27
226 0.21
227 0.18
228 0.16
229 0.16
230 0.22
231 0.2
232 0.2
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.23
238 0.18
239 0.16
240 0.16
241 0.18
242 0.17
243 0.18
244 0.19
245 0.18
246 0.2
247 0.19
248 0.18
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.13
261 0.14
262 0.15
263 0.13
264 0.14
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.2
270 0.22
271 0.22
272 0.21
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.13
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.16
301 0.17
302 0.17
303 0.23
304 0.25
305 0.29
306 0.32
307 0.32
308 0.29
309 0.36
310 0.44
311 0.43
312 0.5
313 0.5
314 0.49
315 0.5
316 0.49
317 0.42
318 0.33
319 0.28
320 0.2
321 0.16
322 0.13
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.15
337 0.19
338 0.23
339 0.28
340 0.28
341 0.3
342 0.31
343 0.38
344 0.41
345 0.45
346 0.49
347 0.54
348 0.64
349 0.67