FuNGI

I4YJL0

Protein Details

Accession

I4YJL0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-32	PANFSRPVKLNRKDPNHLLRPV	Hydrophilic
61-85	IPPINDKNKRFFKRKTKQVFMADED	Hydrophilic
335-363	EERKKQEQDREQQRREREKKEQQDKDQAT	Basic
456-477	NELIQHFKKRFKAQPKNRETIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	wse:WALSEDRAFT_59119 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MRLNSNSSVDPANFSRPVKLNRKDPNHLLRPVPDIDPNTGKVKLDEQDRPILIDPQTNQVIPPINDKNKRFFKRKTKQVFMADEDAMQLRRTERLPWILEDSDGSQKWHGQLDGKPSDQSYIMLVFNENHGLDFKVQPTNRFYKFNQQPKYDTLSMEEADQAYSKGVDDVWFMRNRSRPVASTSNQSDPEIDNKQSIHQRLEGMMNQQPAQSRQANRRMQVDRGAVKEETFDGLFDEMEYDEEFQDDDEQVIQDNQDDDELKELEDRIKKEMHQANIGHVEQTTNLDDFEEDIKPFKQKSTSEKEMKKFLRRYDKSNADAYESDNSDDDDDEEEEERKKQEQDREQQRREREKKEQQDKDQATNLAKSIKREQSPASLAAHEVARRATSPYAKQRSSSPSTKRSRTDLEDKPDNKKLKVKRESSSPSATPPNSADGQVLQDDEIIAFLRGKSVTTNELIQHFKKRFKAQPKNRETIGGVLKKVASRTPDGKLQLKEGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.37
3	0.41
4	0.5
5	0.56
6	0.61
7	0.64
8	0.7
9	0.78
10	0.78
11	0.81
12	0.82
13	0.8
14	0.77
15	0.72
16	0.65
17	0.61
18	0.56
19	0.49
20	0.44
21	0.38
22	0.39
23	0.38
24	0.38
25	0.37
26	0.36
27	0.33
28	0.29
29	0.32
30	0.31
31	0.35
32	0.38
33	0.38
34	0.44
35	0.44
36	0.45
37	0.42
38	0.41
39	0.35
40	0.34
41	0.31
42	0.3
43	0.32
44	0.29
45	0.27
46	0.26
47	0.31
48	0.27
49	0.33
50	0.36
51	0.43
52	0.51
53	0.55
54	0.61
55	0.65
56	0.73
57	0.73
58	0.74
59	0.76
60	0.79
61	0.87
62	0.87
63	0.86
64	0.86
65	0.86
66	0.82
67	0.76
68	0.7
69	0.6
70	0.49
71	0.41
72	0.34
73	0.26
74	0.2
75	0.16
76	0.12
77	0.15
78	0.16
79	0.18
80	0.22
81	0.29
82	0.31
83	0.32
84	0.36
85	0.33
86	0.33
87	0.3
88	0.28
89	0.27
90	0.25
91	0.24
92	0.2
93	0.21
94	0.23
95	0.24
96	0.22
97	0.21
98	0.23
99	0.31
100	0.35
101	0.35
102	0.34
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.24
107	0.17
108	0.14
109	0.13
110	0.12
111	0.13
112	0.12
113	0.12
114	0.14
115	0.12
116	0.1
117	0.1
118	0.11
119	0.12
120	0.14
121	0.15
122	0.21
123	0.22
124	0.25
125	0.3
126	0.37
127	0.38
128	0.41
129	0.41
130	0.44
131	0.53
132	0.59
133	0.61
134	0.57
135	0.58
136	0.57
137	0.62
138	0.53
139	0.44
140	0.38
141	0.33
142	0.29
143	0.26
144	0.22
145	0.15
146	0.13
147	0.13
148	0.1
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.1
157	0.14
158	0.17
159	0.18
160	0.23
161	0.27
162	0.3
163	0.32
164	0.32
165	0.29
166	0.33
167	0.39
168	0.36
169	0.38
170	0.39
171	0.4
172	0.38
173	0.37
174	0.32
175	0.26
176	0.29
177	0.26
178	0.22
179	0.19
180	0.18
181	0.23
182	0.27
183	0.28
184	0.25
185	0.23
186	0.24
187	0.23
188	0.26
189	0.23
190	0.21
191	0.22
192	0.21
193	0.19
194	0.19
195	0.19
196	0.18
197	0.21
198	0.23
199	0.24
200	0.31
201	0.4
202	0.43
203	0.44
204	0.5
205	0.48
206	0.45
207	0.47
208	0.44
209	0.37
210	0.34
211	0.35
212	0.27
213	0.25
214	0.23
215	0.18
216	0.14
217	0.11
218	0.09
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.04
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.12
252	0.15
253	0.17
254	0.17
255	0.19
256	0.19
257	0.27
258	0.32
259	0.29
260	0.32
261	0.31
262	0.32
263	0.35
264	0.34
265	0.26
266	0.21
267	0.19
268	0.13
269	0.15
270	0.13
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.09
276	0.1
277	0.09
278	0.08
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.14
283	0.15
284	0.18
285	0.21
286	0.29
287	0.37
288	0.45
289	0.52
290	0.59
291	0.6
292	0.64
293	0.66
294	0.67
295	0.63
296	0.62
297	0.65
298	0.6
299	0.63
300	0.63
301	0.65
302	0.59
303	0.59
304	0.52
305	0.44
306	0.42
307	0.38
308	0.32
309	0.25
310	0.22
311	0.17
312	0.17
313	0.14
314	0.13
315	0.12
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.11
321	0.12
322	0.13
323	0.14
324	0.15
325	0.19
326	0.24
327	0.32
328	0.4
329	0.49
330	0.59
331	0.68
332	0.73
333	0.76
334	0.8
335	0.82
336	0.81
337	0.78
338	0.77
339	0.77
340	0.81
341	0.85
342	0.84
343	0.81
344	0.83
345	0.79
346	0.73
347	0.68
348	0.61
349	0.52
350	0.44
351	0.38
352	0.35
353	0.32
354	0.31
355	0.35
356	0.39
357	0.39
358	0.41
359	0.42
360	0.42
361	0.44
362	0.42
363	0.36
364	0.29
365	0.27
366	0.25
367	0.25
368	0.18
369	0.16
370	0.14
371	0.12
372	0.13
373	0.15
374	0.18
375	0.21
376	0.29
377	0.38
378	0.46
379	0.46
380	0.47
381	0.51
382	0.55
383	0.56
384	0.57
385	0.55
386	0.57
387	0.65
388	0.71
389	0.68
390	0.66
391	0.66
392	0.65
393	0.66
394	0.64
395	0.64
396	0.67
397	0.66
398	0.67
399	0.69
400	0.66
401	0.61
402	0.61
403	0.61
404	0.62
405	0.68
406	0.68
407	0.65
408	0.7
409	0.74
410	0.72
411	0.7
412	0.61
413	0.57
414	0.58
415	0.53
416	0.46
417	0.4
418	0.38
419	0.32
420	0.31
421	0.26
422	0.19
423	0.22
424	0.19
425	0.18
426	0.13
427	0.12
428	0.12
429	0.1
430	0.1
431	0.08
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.1
436	0.1
437	0.11
438	0.13
439	0.15
440	0.18
441	0.2
442	0.24
443	0.24
444	0.29
445	0.34
446	0.35
447	0.42
448	0.44
449	0.49
450	0.53
451	0.59
452	0.64
453	0.7
454	0.78
455	0.79
456	0.85
457	0.87
458	0.87
459	0.79
460	0.74
461	0.65
462	0.62
463	0.61
464	0.55
465	0.47
466	0.42
467	0.43
468	0.4
469	0.4
470	0.36
471	0.31
472	0.32
473	0.37
474	0.39
475	0.44
476	0.48
477	0.53
478	0.52

I4YJL0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer