FuNGI

A0A1V6QQ29

Protein Details

Accession

A0A1V6QQ29

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-445	RRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRS

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSNKYPKIVSPVIEEQAQVVDGEEIPIDITRPNPNGEEQDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPADEQEMMMEIYKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKENDQKKEELHKMLAQQHATKTGEQLVREEVVQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPGWENLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPNHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSRPRGCRLCGQTGHKAEECLGRPKEKSGEFDEKQHAAPLKPFIWLHVAVLREYLAVELRVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNLPAMGSYLTKDGSVELKNAQIILQGLAKQEDAIFARRRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRSSPQRDLTAGSHGGEPAPPMELITPGRGHLNKETRELTHSMVINRGAVYRANMENKSAAAVLKSKLMKGNQDAGDSETPATDGEDVSSELPGQTSPGVLGKRKADVAEQEVTEAGTPGRDSPLPVPPVPEKPKQDETQEDTVKLWEPGYADRYYEQKFGVDPKDLEFRHQVAREYAIGLCWVLRYYFQGCPSWTWYYPRHYAPFAADFVDIADMDVQFEKGTIFKPFEQLMGVLPASSNHALPKVFHPLMENPDSEIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVILLPFIDETRLLNAMAKVYPLLTEDEKSRNSHGQEVLLLSDRNPLYQDLVANFYSKKPGPPQYPLKEDVSGGLAGIVERSDTYIPHSSLVSPLEAHGMPGVDDDRSLTVLYTIPKTSHVHKSMLLRGVKLPTPMLDSNDIRATQARSQNSGRSFGGAPFQGRGRGGRMNYSSDRPNPFAAHLDPKFNSGPQGGPGGPGGAPMVPPGWVPPGQGYGGYARGPPPPPRGGMSHQYPPQYPPQHGYQQPGDYYGQQNNQYNQGGQYNNGHQSGYGQQDYRGGRGGNRGGRGRGGQNRDHYSHNQGGGGYNRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.48
3	0.52
4	0.52
5	0.47
6	0.44
7	0.45
8	0.44
9	0.4
10	0.38
11	0.3
12	0.27
13	0.25
14	0.17
15	0.12
16	0.1
17	0.09
18	0.1
19	0.09
20	0.07
21	0.08
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.11
26	0.17
27	0.19
28	0.22
29	0.24
30	0.28
31	0.33
32	0.34
33	0.36
34	0.32
35	0.35
36	0.33
37	0.33
38	0.29
39	0.24
40	0.22
41	0.18
42	0.15
43	0.1
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.11
48	0.13
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.36
54	0.42
55	0.47
56	0.47
57	0.5
58	0.51
59	0.54
60	0.46
61	0.41
62	0.36
63	0.31
64	0.28
65	0.22
66	0.17
67	0.13
68	0.15
69	0.13
70	0.12
71	0.12
72	0.15
73	0.15
74	0.19
75	0.24
76	0.3
77	0.38
78	0.47
79	0.48
80	0.47
81	0.49
82	0.47
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.8
105	0.77
106	0.73
107	0.75
108	0.74
109	0.71
110	0.72
111	0.69
112	0.66
113	0.71
114	0.68
115	0.6
116	0.55
117	0.49
118	0.42
119	0.46
120	0.48
121	0.44
122	0.44
123	0.46
124	0.48
125	0.53
126	0.55
127	0.49
128	0.46
129	0.43
130	0.46
131	0.43
132	0.37
133	0.33
134	0.35
135	0.34
136	0.3
137	0.3
138	0.26
139	0.25
140	0.25
141	0.27
142	0.2
143	0.19
144	0.2
145	0.19
146	0.17
147	0.17
148	0.21
149	0.19
150	0.2
151	0.22
152	0.23
153	0.23
154	0.21
155	0.22
156	0.19
157	0.17
158	0.15
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.2
175	0.27
176	0.26
177	0.29
178	0.29
179	0.3
180	0.34
181	0.31
182	0.28
183	0.22
184	0.23
185	0.2
186	0.19
187	0.15
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.28
206	0.29
207	0.31
208	0.35
209	0.41
210	0.48
211	0.53
212	0.59
213	0.59
214	0.64
215	0.65
216	0.62
217	0.64
218	0.56
219	0.48
220	0.38
221	0.31
222	0.26
223	0.25
224	0.21
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.05
238	0.06
239	0.08
240	0.1
241	0.11
242	0.15
243	0.15
244	0.16
245	0.18
246	0.19
247	0.18
248	0.2
249	0.2
250	0.18
251	0.21
252	0.23
253	0.24
254	0.25
255	0.27
256	0.25
257	0.27
258	0.34
259	0.36
260	0.42
261	0.45
262	0.49
263	0.55
264	0.57
265	0.59
266	0.52
267	0.46
268	0.39
269	0.39
270	0.36
271	0.35
272	0.34
273	0.33
274	0.33
275	0.36
276	0.41
277	0.37
278	0.38
279	0.37
280	0.44
281	0.42
282	0.47
283	0.49
284	0.44
285	0.41
286	0.41
287	0.36
288	0.27
289	0.29
290	0.27
291	0.23
292	0.24
293	0.24
294	0.21
295	0.23
296	0.22
297	0.2
298	0.18
299	0.19
300	0.15
301	0.16
302	0.14
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.09
310	0.12
311	0.16
312	0.17
313	0.18
314	0.2
315	0.21
316	0.22
317	0.25
318	0.24
319	0.2
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.19
324	0.19
325	0.13
326	0.11
327	0.1
328	0.09
329	0.08
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.08
345	0.12
346	0.15
347	0.16
348	0.15
349	0.16
350	0.16
351	0.15
352	0.15
353	0.1
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.1
395	0.13
396	0.17
397	0.17
398	0.24
399	0.25
400	0.28
401	0.32
402	0.41
403	0.45
404	0.52
405	0.58
406	0.57
407	0.64
408	0.68
409	0.72
410	0.72
411	0.69
412	0.68
413	0.69
414	0.69
415	0.66
416	0.68
417	0.66
418	0.66
419	0.68
420	0.61
421	0.55
422	0.51
423	0.55
424	0.53
425	0.52
426	0.51
427	0.5
428	0.53
429	0.6
430	0.69
431	0.72
432	0.75
433	0.77
434	0.79
435	0.75
436	0.71
437	0.64
438	0.55
439	0.48
440	0.39
441	0.29
442	0.2
443	0.16
444	0.14
445	0.11
446	0.1
447	0.06
448	0.06
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.07
453	0.08
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.12
458	0.13
459	0.15
460	0.2
461	0.26
462	0.26
463	0.3
464	0.31
465	0.29
466	0.31
467	0.31
468	0.25
469	0.22
470	0.22
471	0.19
472	0.19
473	0.19
474	0.16
475	0.15
476	0.14
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.1
481	0.12
482	0.16
483	0.16
484	0.16
485	0.16
486	0.15
487	0.15
488	0.12
489	0.1
490	0.07
491	0.09
492	0.09
493	0.13
494	0.13
495	0.14
496	0.17
497	0.18
498	0.2
499	0.21
500	0.27
501	0.24
502	0.24
503	0.24
504	0.24
505	0.23
506	0.2
507	0.18
508	0.1
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.05
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.07
528	0.09
529	0.1
530	0.13
531	0.14
532	0.15
533	0.16
534	0.16
535	0.15
536	0.15
537	0.18
538	0.18
539	0.17
540	0.15
541	0.15
542	0.14
543	0.13
544	0.11
545	0.06
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.09
553	0.15
554	0.18
555	0.18
556	0.21
557	0.22
558	0.3
559	0.34
560	0.38
561	0.36
562	0.39
563	0.45
564	0.44
565	0.45
566	0.42
567	0.43
568	0.45
569	0.43
570	0.38
571	0.32
572	0.31
573	0.28
574	0.23
575	0.17
576	0.1
577	0.09
578	0.11
579	0.14
580	0.13
581	0.13
582	0.14
583	0.18
584	0.18
585	0.19
586	0.17
587	0.14
588	0.15
589	0.19
590	0.2
591	0.19
592	0.18
593	0.18
594	0.26
595	0.25
596	0.27
597	0.26
598	0.25
599	0.28
600	0.29
601	0.28
602	0.22
603	0.24
604	0.22
605	0.2
606	0.18
607	0.12
608	0.11
609	0.09
610	0.08
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.05
615	0.08
616	0.11
617	0.14
618	0.16
619	0.18
620	0.19
621	0.21
622	0.25
623	0.27
624	0.25
625	0.27
626	0.28
627	0.32
628	0.36
629	0.38
630	0.36
631	0.33
632	0.33
633	0.31
634	0.3
635	0.25
636	0.21
637	0.17
638	0.14
639	0.13
640	0.12
641	0.09
642	0.07
643	0.07
644	0.05
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.07
653	0.09
654	0.11
655	0.12
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.16
660	0.15
661	0.13
662	0.13
663	0.12
664	0.09
665	0.08
666	0.08
667	0.11
668	0.11
669	0.1
670	0.09
671	0.11
672	0.11
673	0.13
674	0.16
675	0.21
676	0.21
677	0.21
678	0.23
679	0.24
680	0.3
681	0.31
682	0.28
683	0.21
684	0.23
685	0.22
686	0.19
687	0.16
688	0.11
689	0.1
690	0.1
691	0.1
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.09
696	0.09
697	0.1
698	0.14
699	0.14
700	0.14
701	0.16
702	0.15
703	0.17
704	0.18
705	0.17
706	0.15
707	0.14
708	0.14
709	0.16
710	0.17
711	0.15
712	0.14
713	0.13
714	0.11
715	0.11
716	0.1
717	0.06
718	0.05
719	0.07
720	0.08
721	0.08
722	0.1
723	0.11
724	0.12
725	0.12
726	0.12
727	0.1
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.11
732	0.11
733	0.12
734	0.15
735	0.2
736	0.22
737	0.24
738	0.26
739	0.29
740	0.29
741	0.33
742	0.32
743	0.28
744	0.27
745	0.26
746	0.24
747	0.21
748	0.19
749	0.14
750	0.19
751	0.17
752	0.16
753	0.17
754	0.16
755	0.16
756	0.17
757	0.19
758	0.14
759	0.17
760	0.17
761	0.18
762	0.18
763	0.16
764	0.2
765	0.19
766	0.22
767	0.26
768	0.34
769	0.38
770	0.46
771	0.55
772	0.57
773	0.62
774	0.61
775	0.58
776	0.5
777	0.45
778	0.37
779	0.29
780	0.22
781	0.16
782	0.12
783	0.09
784	0.07
785	0.08
786	0.06
787	0.04
788	0.04
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.12
793	0.17
794	0.18
795	0.19
796	0.19
797	0.18
798	0.2
799	0.21
800	0.17
801	0.12
802	0.12
803	0.14
804	0.14
805	0.13
806	0.12
807	0.1
808	0.09
809	0.11
810	0.11
811	0.07
812	0.07
813	0.08
814	0.08
815	0.09
816	0.09
817	0.08
818	0.08
819	0.1
820	0.13
821	0.15
822	0.15
823	0.15
824	0.19
825	0.22
826	0.27
827	0.34
828	0.35
829	0.35
830	0.38
831	0.44
832	0.46
833	0.51
834	0.47
835	0.39
836	0.39
837	0.41
838	0.39
839	0.34
840	0.28
841	0.22
842	0.27
843	0.26
844	0.26
845	0.28
846	0.27
847	0.29
848	0.32
849	0.31
850	0.25
851	0.27
852	0.28
853	0.29
854	0.34
855	0.34
856	0.35
857	0.38
858	0.44
859	0.44
860	0.44
861	0.37
862	0.34
863	0.32
864	0.29
865	0.31
866	0.26
867	0.25
868	0.23
869	0.24
870	0.24
871	0.24
872	0.24
873	0.23
874	0.27
875	0.27
876	0.32
877	0.34
878	0.38
879	0.4
880	0.43
881	0.45
882	0.46
883	0.5
884	0.45
885	0.46
886	0.4
887	0.39
888	0.39
889	0.36
890	0.39
891	0.36
892	0.39
893	0.37
894	0.39
895	0.38
896	0.34
897	0.34
898	0.26
899	0.25
900	0.21
901	0.25
902	0.21
903	0.2
904	0.19
905	0.18
906	0.15
907	0.14
908	0.13
909	0.09
910	0.09
911	0.09
912	0.09
913	0.08
914	0.08
915	0.09
916	0.13
917	0.13
918	0.14
919	0.15
920	0.18
921	0.18
922	0.18
923	0.18
924	0.16
925	0.18
926	0.18
927	0.17
928	0.17
929	0.22
930	0.26
931	0.31
932	0.36
933	0.37
934	0.39
935	0.4
936	0.44
937	0.45
938	0.49
939	0.49
940	0.5
941	0.51
942	0.53
943	0.51
944	0.5
945	0.53
946	0.51
947	0.47
948	0.42
949	0.45
950	0.5
951	0.52
952	0.55
953	0.51
954	0.51
955	0.49
956	0.48
957	0.42
958	0.37
959	0.39
960	0.39
961	0.38
962	0.4
963	0.45
964	0.44
965	0.49
966	0.47
967	0.44
968	0.4
969	0.4
970	0.35
971	0.31
972	0.35
973	0.35
974	0.38
975	0.37
976	0.34
977	0.28
978	0.3
979	0.33
980	0.34
981	0.31
982	0.27
983	0.27
984	0.34
985	0.36
986	0.35
987	0.33
988	0.28
989	0.27
990	0.34
991	0.42
992	0.41
993	0.46
994	0.49
995	0.46
996	0.49
997	0.51
998	0.52
999	0.52
1000	0.53
1001	0.53
1002	0.58
1003	0.63
1004	0.61
1005	0.63
1006	0.58
1007	0.57
1008	0.57
1009	0.52
1010	0.45
1011	0.38
1012	0.4

A0A1V6QQ29

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer