FuNGI

A0A1V6RCH9

Protein Details

Accession

A0A1V6RCH9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
112-137	YQEVDEKMDKRRRARREAREKAEQEE	Basic
170-191	VGDLTGKNRRDKQNARQRHYAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-131	KRRRARREARE

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, nucl 8, pero 7, cyto_mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13432 TPR_16 PF14559 TPR_19

Amino Acid Sequences

MASGQKNFLDQGAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQAALTKRAQLLGAAAPTAYGATTREKGGKEEDKEEEDERFQDPDNEVGLFAYGQFDQEDDEADRIYQEVDEKMDKRRRARREAREKAEQEEYERNNPKIQHQFADLKRTLASVSEEDWANLPEVGDLTGKNRRDKQNARQRHYAVPDSVIAGARDSAQYGTTIAEDGTETAIDQGESADGTMTNFADIGAARDKVLKVRLDQAALGSSGDKSGTATNIDPKGYLTSLTQSEAKAGEVEVGDIKRVRTLLESVTKTNPKHAPGWIALARLEELAGRIVAARTLIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNEGHNAKVIAANAIKNNDRSTRLWTEAMRLETDTRAKKNVLRQAILHIPQSVQIWKEAVNLEDDPADARLLLAKAVEIIPLSIELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSYEIWIAAARLQEQMGTFAKVNVMKRAIQSLARENAMLKREEWITEAEKCESEGAVLTCGGIIQETLGWGLDEDDDRKDIWMDDAKASIARGNYETARAIYAYALRVFVNRRSIWLAAADLERNHGTKEALWQVLEKAVEACPQSEELWLLLAKEKWQSEDIDGARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADAKKTDQARELLATARREAGTDRVWTKSVSFERQLGNIDDALDLVNQGLQLFPKADKLWMIKGQIYEAQNKFPQAREAYGTGTRACPKSVALWLLASRLEEKAGAVVRARSVLDRARLAVPKSAELWTESVRVERRANNIAQAKVLMARAIQEVPTSGLLWSESIWYLEPRAQRKARSLEAIKKVENDPILFITVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVLDSDYGDGWAWYYKFLMQHGTEEKRADVVSKCISMEPKHGEIWQSIAKDPANAYKTTEEILKLVANTIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.21
4	0.2
5	0.19
6	0.13
7	0.09
8	0.07
9	0.08
10	0.08
11	0.08
12	0.08
13	0.09
14	0.1
15	0.11
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.2
20	0.23
21	0.25
22	0.29
23	0.3
24	0.29
25	0.32
26	0.34
27	0.32
28	0.38
29	0.37
30	0.32
31	0.31
32	0.28
33	0.26
34	0.3
35	0.31
36	0.28
37	0.26
38	0.3
39	0.29
40	0.3
41	0.29
42	0.23
43	0.22
44	0.19
45	0.2
46	0.16
47	0.15
48	0.13
49	0.13
50	0.12
51	0.09
52	0.06
53	0.07
54	0.12
55	0.14
56	0.18
57	0.23
58	0.24
59	0.27
60	0.35
61	0.42
62	0.41
63	0.46
64	0.48
65	0.47
66	0.49
67	0.48
68	0.43
69	0.36
70	0.33
71	0.29
72	0.26
73	0.22
74	0.23
75	0.23
76	0.22
77	0.22
78	0.2
79	0.18
80	0.16
81	0.16
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.07
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.09
91	0.11
92	0.11
93	0.12
94	0.11
95	0.11
96	0.12
97	0.1
98	0.11
99	0.09
100	0.1
101	0.1
102	0.13
103	0.19
104	0.21
105	0.31
106	0.39
107	0.44
108	0.52
109	0.6
110	0.66
111	0.72
112	0.8
113	0.82
114	0.85
115	0.89
116	0.87
117	0.88
118	0.81
119	0.75
120	0.73
121	0.63
122	0.57
123	0.55
124	0.52
125	0.51
126	0.55
127	0.51
128	0.48
129	0.48
130	0.51
131	0.52
132	0.51
133	0.45
134	0.45
135	0.52
136	0.51
137	0.59
138	0.51
139	0.43
140	0.4
141	0.37
142	0.31
143	0.24
144	0.23
145	0.15
146	0.16
147	0.18
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.17
152	0.15
153	0.13
154	0.11
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.12
161	0.19
162	0.23
163	0.29
164	0.37
165	0.45
166	0.54
167	0.63
168	0.69
169	0.73
170	0.8
171	0.8
172	0.81
173	0.77
174	0.75
175	0.72
176	0.66
177	0.57
178	0.48
179	0.42
180	0.34
181	0.32
182	0.25
183	0.19
184	0.14
185	0.13
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.07
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.04
213	0.05
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.08
222	0.1
223	0.1
224	0.11
225	0.13
226	0.14
227	0.17
228	0.22
229	0.21
230	0.21
231	0.27
232	0.29
233	0.28
234	0.28
235	0.25
236	0.22
237	0.2
238	0.18
239	0.12
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.1
248	0.11
249	0.17
250	0.19
251	0.19
252	0.18
253	0.18
254	0.19
255	0.18
256	0.17
257	0.12
258	0.13
259	0.14
260	0.16
261	0.17
262	0.15
263	0.16
264	0.15
265	0.15
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.11
280	0.13
281	0.17
282	0.23
283	0.26
284	0.27
285	0.33
286	0.38
287	0.36
288	0.42
289	0.41
290	0.36
291	0.36
292	0.36
293	0.34
294	0.29
295	0.35
296	0.3
297	0.27
298	0.24
299	0.22
300	0.2
301	0.15
302	0.14
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.09
319	0.12
320	0.18
321	0.18
322	0.17
323	0.18
324	0.2
325	0.2
326	0.23
327	0.22
328	0.17
329	0.23
330	0.23
331	0.24
332	0.23
333	0.22
334	0.19
335	0.18
336	0.18
337	0.17
338	0.17
339	0.17
340	0.16
341	0.16
342	0.15
343	0.17
344	0.16
345	0.12
346	0.12
347	0.13
348	0.13
349	0.16
350	0.17
351	0.17
352	0.19
353	0.2
354	0.22
355	0.22
356	0.27
357	0.28
358	0.3
359	0.31
360	0.29
361	0.3
362	0.3
363	0.3
364	0.24
365	0.21
366	0.19
367	0.19
368	0.24
369	0.24
370	0.22
371	0.23
372	0.24
373	0.27
374	0.34
375	0.39
376	0.37
377	0.34
378	0.33
379	0.36
380	0.4
381	0.38
382	0.32
383	0.25
384	0.2
385	0.21
386	0.21
387	0.18
388	0.12
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.06
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.03
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.04
428	0.05
429	0.05
430	0.07
431	0.11
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.13
437	0.19
438	0.22
439	0.19
440	0.19
441	0.21
442	0.22
443	0.22
444	0.2
445	0.16
446	0.13
447	0.15
448	0.15
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.1
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.09
466	0.11
467	0.14
468	0.14
469	0.15
470	0.16
471	0.16
472	0.16
473	0.19
474	0.18
475	0.17
476	0.19
477	0.21
478	0.21
479	0.2
480	0.2
481	0.18
482	0.21
483	0.21
484	0.19
485	0.14
486	0.14
487	0.15
488	0.15
489	0.15
490	0.14
491	0.14
492	0.16
493	0.17
494	0.16
495	0.15
496	0.15
497	0.14
498	0.11
499	0.09
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.03
509	0.03
510	0.02
511	0.02
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.04
518	0.04
519	0.05
520	0.06
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.12
529	0.13
530	0.13
531	0.14
532	0.14
533	0.14
534	0.14
535	0.13
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.11
540	0.11
541	0.12
542	0.13
543	0.11
544	0.11
545	0.1
546	0.09
547	0.08
548	0.09
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.09
553	0.11
554	0.13
555	0.16
556	0.21
557	0.19
558	0.21
559	0.23
560	0.23
561	0.22
562	0.2
563	0.17
564	0.13
565	0.14
566	0.13
567	0.1
568	0.12
569	0.12
570	0.12
571	0.12
572	0.11
573	0.1
574	0.1
575	0.15
576	0.17
577	0.17
578	0.17
579	0.17
580	0.17
581	0.19
582	0.18
583	0.13
584	0.1
585	0.09
586	0.12
587	0.12
588	0.12
589	0.1
590	0.11
591	0.12
592	0.11
593	0.11
594	0.08
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.1
599	0.1
600	0.11
601	0.15
602	0.15
603	0.16
604	0.17
605	0.18
606	0.17
607	0.23
608	0.23
609	0.26
610	0.26
611	0.24
612	0.24
613	0.23
614	0.22
615	0.17
616	0.19
617	0.15
618	0.24
619	0.29
620	0.36
621	0.4
622	0.42
623	0.41
624	0.42
625	0.39
626	0.31
627	0.26
628	0.18
629	0.16
630	0.13
631	0.11
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.07
636	0.1
637	0.09
638	0.11
639	0.12
640	0.14
641	0.19
642	0.22
643	0.23
644	0.24
645	0.25
646	0.24
647	0.24
648	0.24
649	0.23
650	0.26
651	0.25
652	0.22
653	0.23
654	0.21
655	0.2
656	0.2
657	0.2
658	0.19
659	0.22
660	0.23
661	0.23
662	0.24
663	0.24
664	0.23
665	0.27
666	0.29
667	0.29
668	0.3
669	0.31
670	0.32
671	0.34
672	0.36
673	0.29
674	0.26
675	0.21
676	0.19
677	0.15
678	0.13
679	0.12
680	0.09
681	0.07
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.06
689	0.08
690	0.08
691	0.12
692	0.12
693	0.13
694	0.17
695	0.2
696	0.25
697	0.28
698	0.3
699	0.29
700	0.29
701	0.3
702	0.31
703	0.3
704	0.33
705	0.3
706	0.32
707	0.31
708	0.34
709	0.33
710	0.3
711	0.34
712	0.28
713	0.29
714	0.27
715	0.27
716	0.28
717	0.29
718	0.29
719	0.24
720	0.25
721	0.28
722	0.26
723	0.25
724	0.22
725	0.2
726	0.22
727	0.25
728	0.23
729	0.19
730	0.2
731	0.2
732	0.21
733	0.2
734	0.18
735	0.15
736	0.13
737	0.13
738	0.11
739	0.1
740	0.13
741	0.13
742	0.14
743	0.14
744	0.15
745	0.15
746	0.17
747	0.18
748	0.15
749	0.17
750	0.2
751	0.23
752	0.23
753	0.25
754	0.29
755	0.32
756	0.33
757	0.34
758	0.31
759	0.29
760	0.29
761	0.28
762	0.23
763	0.21
764	0.23
765	0.2
766	0.21
767	0.19
768	0.22
769	0.24
770	0.28
771	0.31
772	0.32
773	0.36
774	0.4
775	0.4
776	0.44
777	0.46
778	0.43
779	0.39
780	0.35
781	0.3
782	0.26
783	0.25
784	0.17
785	0.11
786	0.12
787	0.13
788	0.14
789	0.13
790	0.11
791	0.12
792	0.13
793	0.14
794	0.13
795	0.1
796	0.1
797	0.1
798	0.1
799	0.1
800	0.1
801	0.09
802	0.09
803	0.11
804	0.11
805	0.13
806	0.17
807	0.23
808	0.26
809	0.35
810	0.39
811	0.43
812	0.5
813	0.56
814	0.57
815	0.6
816	0.63
817	0.63
818	0.67
819	0.69
820	0.62
821	0.59
822	0.55
823	0.51
824	0.46
825	0.38
826	0.31
827	0.26
828	0.26
829	0.22
830	0.2
831	0.19
832	0.17
833	0.16
834	0.14
835	0.13
836	0.12
837	0.16
838	0.22
839	0.23
840	0.24
841	0.3
842	0.33
843	0.34
844	0.35
845	0.38
846	0.42
847	0.42
848	0.42
849	0.37
850	0.34
851	0.36
852	0.35
853	0.3
854	0.22
855	0.19
856	0.17
857	0.17
858	0.17
859	0.14
860	0.14
861	0.12
862	0.1
863	0.09
864	0.12
865	0.12
866	0.11
867	0.12
868	0.15
869	0.17
870	0.19
871	0.25
872	0.22
873	0.29
874	0.36
875	0.41
876	0.42
877	0.41
878	0.4
879	0.36
880	0.35
881	0.32
882	0.26
883	0.27
884	0.28
885	0.29
886	0.29
887	0.3
888	0.35
889	0.34
890	0.39
891	0.4
892	0.38
893	0.38
894	0.4
895	0.39
896	0.34
897	0.37
898	0.34
899	0.3
900	0.28
901	0.3
902	0.28
903	0.29
904	0.3
905	0.33
906	0.31
907	0.29
908	0.32
909	0.3
910	0.31
911	0.3
912	0.31
913	0.24
914	0.21
915	0.23
916	0.21
917	0.19

A0A1V6RCH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer