FuNGI

A0A1V6PQ78

Protein Details

Accession

A0A1V6PQ78

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
472-493	IAKTRAQGRKENRQKDDKNAPV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 21, cyto 3.5, cyto_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

DRATARVVKKFITNLSFRDVPIDRNAPAEVNRQLIYTHVNGEVSPYLETPFRTDLVLNSHREFGHLGFPGLCGIVRPRGWWPSMRTDIEEAVKTCPNCQVAQGSRKSLEREEAQHMVTKGERPFQRWGIDLIGRLPTTPNGNRWIITAIDYATGWPVSRAVPDATEEVLAEFLYRDIYAHYGAFAELISDNGPNLLSGAVRHLVALIQARHHTTTPYHPRTNGKVENFNGLVGRMLTKYLMGKPTRLWDEYLTQAVFAARVREHAVSKRSPYYLVYGVHPRVSSDESHPSDTHPQEDREEQIRHLSDARSKANELLLVHAIKKRQIRDTAVTKTSFKPGDWVLVRNEAKKKYENTWFGPYKVLESHPLGTYALAEPQGRVLRNLVNGARLLDANVGDDPRLWASPAGRSALRRAGMKINRPEELRRVLDEVEPPPPTYADLSTFTRAEWQEFKRTGTRREFVGEDVIAEHLIAKTRAQGRKENRQKDDKNAPVLGLPDADEWNSEANDYESEDDTDSVASSGQESTEDAHQEPTPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.46
3	0.46
4	0.41
5	0.43
6	0.38
7	0.34
8	0.38
9	0.39
10	0.32
11	0.32
12	0.33
13	0.29
14	0.3
15	0.34
16	0.29
17	0.29
18	0.29
19	0.27
20	0.26
21	0.25
22	0.26
23	0.21
24	0.21
25	0.18
26	0.18
27	0.18
28	0.21
29	0.21
30	0.18
31	0.17
32	0.15
33	0.15
34	0.16
35	0.17
36	0.18
37	0.19
38	0.19
39	0.19
40	0.19
41	0.2
42	0.27
43	0.32
44	0.32
45	0.32
46	0.35
47	0.33
48	0.34
49	0.33
50	0.26
51	0.26
52	0.23
53	0.23
54	0.19
55	0.19
56	0.19
57	0.17
58	0.15
59	0.1
60	0.11
61	0.17
62	0.17
63	0.19
64	0.23
65	0.28
66	0.3
67	0.35
68	0.37
69	0.4
70	0.47
71	0.47
72	0.45
73	0.43
74	0.44
75	0.42
76	0.4
77	0.32
78	0.28
79	0.31
80	0.28
81	0.27
82	0.28
83	0.27
84	0.24
85	0.25
86	0.29
87	0.33
88	0.41
89	0.44
90	0.43
91	0.44
92	0.47
93	0.48
94	0.42
95	0.41
96	0.37
97	0.37
98	0.38
99	0.38
100	0.36
101	0.37
102	0.35
103	0.31
104	0.28
105	0.29
106	0.25
107	0.3
108	0.31
109	0.31
110	0.37
111	0.4
112	0.4
113	0.36
114	0.36
115	0.33
116	0.33
117	0.29
118	0.25
119	0.24
120	0.21
121	0.2
122	0.19
123	0.16
124	0.21
125	0.23
126	0.24
127	0.26
128	0.27
129	0.27
130	0.27
131	0.27
132	0.21
133	0.21
134	0.18
135	0.13
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.08
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.08
146	0.1
147	0.09
148	0.1
149	0.11
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.11
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.06
158	0.05
159	0.04
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.04
181	0.05
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.06
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.12
193	0.1
194	0.11
195	0.13
196	0.14
197	0.16
198	0.16
199	0.16
200	0.14
201	0.23
202	0.32
203	0.38
204	0.39
205	0.41
206	0.45
207	0.49
208	0.56
209	0.52
210	0.45
211	0.45
212	0.44
213	0.45
214	0.4
215	0.35
216	0.27
217	0.21
218	0.17
219	0.11
220	0.11
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.08
226	0.11
227	0.17
228	0.16
229	0.18
230	0.19
231	0.24
232	0.27
233	0.26
234	0.24
235	0.2
236	0.22
237	0.22
238	0.23
239	0.17
240	0.14
241	0.13
242	0.12
243	0.1
244	0.08
245	0.09
246	0.06
247	0.08
248	0.1
249	0.11
250	0.13
251	0.17
252	0.21
253	0.21
254	0.24
255	0.25
256	0.24
257	0.23
258	0.22
259	0.21
260	0.21
261	0.2
262	0.2
263	0.22
264	0.22
265	0.23
266	0.22
267	0.18
268	0.17
269	0.17
270	0.16
271	0.15
272	0.22
273	0.23
274	0.26
275	0.26
276	0.26
277	0.31
278	0.3
279	0.31
280	0.25
281	0.25
282	0.24
283	0.26
284	0.27
285	0.26
286	0.26
287	0.23
288	0.25
289	0.24
290	0.23
291	0.23
292	0.22
293	0.21
294	0.25
295	0.27
296	0.23
297	0.23
298	0.24
299	0.22
300	0.23
301	0.18
302	0.16
303	0.16
304	0.15
305	0.16
306	0.17
307	0.17
308	0.19
309	0.23
310	0.24
311	0.27
312	0.31
313	0.35
314	0.39
315	0.46
316	0.47
317	0.47
318	0.46
319	0.43
320	0.4
321	0.4
322	0.35
323	0.27
324	0.24
325	0.21
326	0.27
327	0.26
328	0.27
329	0.23
330	0.31
331	0.33
332	0.35
333	0.4
334	0.36
335	0.38
336	0.41
337	0.42
338	0.4
339	0.47
340	0.48
341	0.46
342	0.52
343	0.51
344	0.47
345	0.47
346	0.41
347	0.34
348	0.3
349	0.27
350	0.21
351	0.22
352	0.23
353	0.2
354	0.21
355	0.18
356	0.16
357	0.16
358	0.12
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.14
364	0.18
365	0.17
366	0.17
367	0.18
368	0.19
369	0.2
370	0.25
371	0.21
372	0.19
373	0.19
374	0.19
375	0.18
376	0.15
377	0.14
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.16
392	0.18
393	0.19
394	0.2
395	0.21
396	0.25
397	0.29
398	0.3
399	0.28
400	0.29
401	0.35
402	0.4
403	0.47
404	0.52
405	0.5
406	0.51
407	0.52
408	0.53
409	0.5
410	0.5
411	0.44
412	0.38
413	0.37
414	0.34
415	0.34
416	0.35
417	0.31
418	0.29
419	0.27
420	0.26
421	0.24
422	0.23
423	0.21
424	0.19
425	0.18
426	0.16
427	0.19
428	0.22
429	0.24
430	0.24
431	0.23
432	0.27
433	0.27
434	0.27
435	0.31
436	0.32
437	0.37
438	0.39
439	0.43
440	0.45
441	0.5
442	0.54
443	0.56
444	0.54
445	0.48
446	0.5
447	0.48
448	0.41
449	0.41
450	0.32
451	0.24
452	0.22
453	0.2
454	0.15
455	0.14
456	0.12
457	0.08
458	0.11
459	0.11
460	0.1
461	0.17
462	0.25
463	0.32
464	0.35
465	0.44
466	0.5
467	0.61
468	0.71
469	0.74
470	0.74
471	0.79
472	0.81
473	0.81
474	0.83
475	0.79
476	0.76
477	0.67
478	0.59
479	0.5
480	0.46
481	0.38
482	0.27
483	0.21
484	0.16
485	0.16
486	0.15
487	0.14
488	0.13
489	0.15
490	0.14
491	0.13
492	0.11
493	0.12
494	0.13
495	0.14
496	0.15
497	0.14
498	0.16
499	0.17
500	0.16
501	0.15
502	0.15
503	0.13
504	0.11
505	0.1
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.08
510	0.09
511	0.09
512	0.11
513	0.15
514	0.18
515	0.18
516	0.21

A0A1V6PQ78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer