Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6QY00

Protein Details
Accession A0A1V6QY00    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
947-1005RSRSPIRSRSYSRSRSPPPRRGSPRTDSRHHRRRSPSYSSYGYSSRSRSPNRNRGHNRNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
892-981RRKFSRSPPPASIRGNGGRSRYGRGPYAGPSSPPRRHGGGRPTERHDIYRPQTASRSRSPIRSRSYSRSRSPPPRRGSPRTDSRHHRRRS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034201  RNPS1_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
PS50102  RRM  
CDD cd19511  RecA-like_CDC48_r2-like  
cd12365  RRM_RNPS1  
Amino Acid Sequences MSDPRSFTARPLSKQQARKDFKDAFRVYLSSSSLAALRLQTESICTLRQGDGPPQTAIAWYASENIQSTVMQISRTMQECYDIKIGEKVSITRAEGPLEDIDVVTLEDCSDPDKIAKHGSISESDRSHWEWALDEKLLRCGCLTTGLTFELELRGQPRSFRVVNIHSQNPRSSHTLFQFTESSKVSLGPVTERKEEKSSGIAVQSTGLGGLSRQIDDINESLSDFNIDPRKPAMPPFYENSRGILLYGPKGTGKTSLLEQIEKAGWKQTFKVGMSTLGRSINEGELKLRNIFQEAARSNPSVIIIDQLEFIAPKRTSIESQSLASVLCENLDAIRNTSILVVAATRHPNQVDDALRTPHRLGTEIEIQVPTAQDRAEILHAIRGPVSAGLTDELVELVAEKTHGYVGADLFALLQLVCRKARQRQLLDQNSTAIPATPVDPYSWHHGGSIDDELTISLEIQETDILLSLQEIRPTAMREVFLETPKVRWSDIGGQHDIKKRLQQAVERPLKYPQRMRRLNVNSKKGVLLYGPPGCSKTLTVKALATEAGLNFLAVKGAEILSMYVGESERSLREIFRKARAARPSIIFFDEIDAIAARRSSSSGGVNVLTTLLNEMDGIEELRNVLVIAATNKPDVLDPALMRPGRLDNILYIGPPDFEARREILRIWAHKSVVNPDVDMDNLASLTEGYSGAEIVSICETAGDAALDEEEETQQEQDVQWKHFEYALGQVRRQITDTVIEETEHAHVLYIVRNPEATAHPEASPGVHHKDDAIAIVQKPDPDPDLPLVAEPDLAVAVEPSKKFQELTFTSSQQIVVEKLTKNVTESHIREIFGGFGEIEYLDLPINKAFMTNRGTAYILYYDPADAEAAIAHMHEAQLDGAILNVSIVLPRRKFSRSPPPASIRGNGGRSRYGRGPYAGPSSPPRRHGGGRPTERHDIYRPQTASRSRSPIRSRSYSRSRSPPPRRGSPRTDSRHHRRRSPSYSSYGYSSRSRSPNRNRGHNRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.76
4 0.77
5 0.77
6 0.77
7 0.75
8 0.73
9 0.75
10 0.67
11 0.61
12 0.57
13 0.53
14 0.47
15 0.42
16 0.38
17 0.28
18 0.26
19 0.22
20 0.19
21 0.19
22 0.18
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.13
28 0.15
29 0.17
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.18
34 0.2
35 0.24
36 0.25
37 0.3
38 0.34
39 0.36
40 0.36
41 0.34
42 0.32
43 0.29
44 0.26
45 0.2
46 0.14
47 0.12
48 0.14
49 0.13
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.16
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.17
61 0.21
62 0.23
63 0.24
64 0.2
65 0.25
66 0.25
67 0.3
68 0.31
69 0.26
70 0.25
71 0.29
72 0.29
73 0.26
74 0.27
75 0.24
76 0.24
77 0.27
78 0.28
79 0.29
80 0.29
81 0.28
82 0.26
83 0.27
84 0.23
85 0.21
86 0.19
87 0.13
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.11
100 0.14
101 0.16
102 0.2
103 0.22
104 0.22
105 0.25
106 0.27
107 0.3
108 0.32
109 0.36
110 0.33
111 0.33
112 0.34
113 0.33
114 0.33
115 0.29
116 0.25
117 0.21
118 0.23
119 0.25
120 0.24
121 0.24
122 0.22
123 0.28
124 0.28
125 0.26
126 0.23
127 0.2
128 0.18
129 0.22
130 0.22
131 0.16
132 0.18
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.18
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.16
142 0.16
143 0.18
144 0.21
145 0.25
146 0.26
147 0.28
148 0.33
149 0.34
150 0.42
151 0.47
152 0.51
153 0.5
154 0.53
155 0.53
156 0.49
157 0.47
158 0.44
159 0.4
160 0.39
161 0.38
162 0.43
163 0.39
164 0.4
165 0.41
166 0.37
167 0.39
168 0.34
169 0.3
170 0.22
171 0.22
172 0.2
173 0.17
174 0.17
175 0.19
176 0.24
177 0.27
178 0.33
179 0.34
180 0.37
181 0.4
182 0.4
183 0.36
184 0.33
185 0.31
186 0.27
187 0.27
188 0.24
189 0.2
190 0.19
191 0.17
192 0.13
193 0.1
194 0.08
195 0.05
196 0.05
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.11
211 0.09
212 0.14
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.22
217 0.25
218 0.24
219 0.29
220 0.31
221 0.29
222 0.33
223 0.36
224 0.4
225 0.43
226 0.43
227 0.4
228 0.34
229 0.3
230 0.26
231 0.25
232 0.2
233 0.18
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.17
240 0.16
241 0.14
242 0.15
243 0.21
244 0.22
245 0.22
246 0.21
247 0.21
248 0.22
249 0.21
250 0.2
251 0.2
252 0.19
253 0.2
254 0.21
255 0.24
256 0.27
257 0.27
258 0.3
259 0.24
260 0.28
261 0.29
262 0.29
263 0.27
264 0.23
265 0.23
266 0.21
267 0.21
268 0.19
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.2
276 0.17
277 0.17
278 0.19
279 0.17
280 0.23
281 0.22
282 0.24
283 0.26
284 0.26
285 0.24
286 0.23
287 0.23
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.13
299 0.12
300 0.13
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.22
305 0.27
306 0.22
307 0.23
308 0.23
309 0.21
310 0.19
311 0.17
312 0.14
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.09
331 0.13
332 0.14
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.17
337 0.21
338 0.2
339 0.2
340 0.21
341 0.23
342 0.24
343 0.25
344 0.24
345 0.21
346 0.2
347 0.18
348 0.17
349 0.18
350 0.23
351 0.22
352 0.23
353 0.2
354 0.2
355 0.19
356 0.18
357 0.14
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.08
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.04
401 0.05
402 0.06
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.15
407 0.22
408 0.3
409 0.37
410 0.41
411 0.48
412 0.58
413 0.64
414 0.64
415 0.58
416 0.52
417 0.43
418 0.39
419 0.29
420 0.19
421 0.11
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.1
429 0.16
430 0.17
431 0.16
432 0.15
433 0.16
434 0.16
435 0.17
436 0.17
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.1
462 0.11
463 0.11
464 0.11
465 0.11
466 0.14
467 0.16
468 0.16
469 0.17
470 0.16
471 0.16
472 0.18
473 0.18
474 0.14
475 0.12
476 0.15
477 0.2
478 0.25
479 0.28
480 0.28
481 0.29
482 0.34
483 0.39
484 0.38
485 0.31
486 0.3
487 0.29
488 0.31
489 0.32
490 0.32
491 0.35
492 0.43
493 0.5
494 0.47
495 0.44
496 0.46
497 0.48
498 0.47
499 0.48
500 0.46
501 0.48
502 0.52
503 0.54
504 0.58
505 0.62
506 0.69
507 0.69
508 0.68
509 0.58
510 0.54
511 0.53
512 0.42
513 0.34
514 0.23
515 0.17
516 0.15
517 0.16
518 0.16
519 0.15
520 0.16
521 0.16
522 0.16
523 0.15
524 0.15
525 0.18
526 0.19
527 0.2
528 0.19
529 0.19
530 0.19
531 0.18
532 0.13
533 0.09
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.03
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.08
559 0.09
560 0.13
561 0.2
562 0.23
563 0.28
564 0.35
565 0.36
566 0.43
567 0.47
568 0.47
569 0.43
570 0.43
571 0.39
572 0.34
573 0.33
574 0.26
575 0.21
576 0.19
577 0.15
578 0.12
579 0.1
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.08
589 0.09
590 0.1
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.1
595 0.1
596 0.08
597 0.07
598 0.06
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.04
612 0.04
613 0.03
614 0.04
615 0.06
616 0.08
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.1
624 0.11
625 0.1
626 0.12
627 0.18
628 0.17
629 0.17
630 0.17
631 0.17
632 0.16
633 0.16
634 0.15
635 0.09
636 0.12
637 0.12
638 0.11
639 0.1
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.08
645 0.09
646 0.11
647 0.12
648 0.14
649 0.15
650 0.14
651 0.19
652 0.24
653 0.26
654 0.28
655 0.3
656 0.3
657 0.31
658 0.32
659 0.3
660 0.29
661 0.26
662 0.22
663 0.19
664 0.19
665 0.17
666 0.16
667 0.11
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.05
679 0.04
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.06
684 0.06
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.04
689 0.05
690 0.04
691 0.03
692 0.03
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.07
704 0.13
705 0.16
706 0.18
707 0.2
708 0.21
709 0.21
710 0.22
711 0.22
712 0.16
713 0.22
714 0.29
715 0.29
716 0.28
717 0.32
718 0.33
719 0.33
720 0.34
721 0.26
722 0.18
723 0.21
724 0.22
725 0.21
726 0.19
727 0.19
728 0.17
729 0.17
730 0.17
731 0.13
732 0.11
733 0.08
734 0.08
735 0.09
736 0.11
737 0.14
738 0.14
739 0.14
740 0.14
741 0.14
742 0.16
743 0.17
744 0.19
745 0.19
746 0.19
747 0.19
748 0.2
749 0.2
750 0.18
751 0.18
752 0.18
753 0.19
754 0.18
755 0.18
756 0.17
757 0.19
758 0.19
759 0.17
760 0.16
761 0.14
762 0.14
763 0.17
764 0.18
765 0.18
766 0.18
767 0.18
768 0.18
769 0.16
770 0.18
771 0.17
772 0.18
773 0.17
774 0.16
775 0.16
776 0.13
777 0.13
778 0.1
779 0.08
780 0.06
781 0.06
782 0.05
783 0.04
784 0.06
785 0.1
786 0.1
787 0.13
788 0.15
789 0.16
790 0.17
791 0.17
792 0.25
793 0.24
794 0.31
795 0.34
796 0.33
797 0.34
798 0.34
799 0.34
800 0.25
801 0.23
802 0.17
803 0.15
804 0.19
805 0.18
806 0.21
807 0.23
808 0.23
809 0.23
810 0.25
811 0.27
812 0.3
813 0.32
814 0.36
815 0.36
816 0.36
817 0.36
818 0.33
819 0.29
820 0.2
821 0.19
822 0.11
823 0.08
824 0.08
825 0.07
826 0.07
827 0.06
828 0.06
829 0.06
830 0.07
831 0.08
832 0.07
833 0.08
834 0.08
835 0.1
836 0.1
837 0.15
838 0.2
839 0.22
840 0.23
841 0.24
842 0.25
843 0.23
844 0.25
845 0.21
846 0.17
847 0.14
848 0.13
849 0.11
850 0.11
851 0.11
852 0.09
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.06
857 0.05
858 0.05
859 0.05
860 0.05
861 0.05
862 0.05
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.05
868 0.05
869 0.05
870 0.05
871 0.04
872 0.04
873 0.04
874 0.06
875 0.1
876 0.17
877 0.18
878 0.21
879 0.26
880 0.31
881 0.35
882 0.43
883 0.5
884 0.53
885 0.6
886 0.66
887 0.69
888 0.72
889 0.72
890 0.66
891 0.62
892 0.59
893 0.57
894 0.52
895 0.48
896 0.48
897 0.46
898 0.49
899 0.47
900 0.44
901 0.42
902 0.41
903 0.41
904 0.38
905 0.43
906 0.38
907 0.36
908 0.41
909 0.46
910 0.49
911 0.51
912 0.51
913 0.49
914 0.53
915 0.58
916 0.6
917 0.62
918 0.66
919 0.69
920 0.71
921 0.74
922 0.71
923 0.67
924 0.62
925 0.61
926 0.56
927 0.59
928 0.54
929 0.5
930 0.55
931 0.58
932 0.58
933 0.56
934 0.61
935 0.55
936 0.64
937 0.67
938 0.68
939 0.7
940 0.72
941 0.72
942 0.73
943 0.79
944 0.78
945 0.78
946 0.79
947 0.81
948 0.83
949 0.86
950 0.86
951 0.84
952 0.86
953 0.87
954 0.86
955 0.84
956 0.83
957 0.83
958 0.82
959 0.83
960 0.83
961 0.84
962 0.85
963 0.84
964 0.84
965 0.84
966 0.86
967 0.85
968 0.84
969 0.81
970 0.79
971 0.76
972 0.69
973 0.64
974 0.57
975 0.52
976 0.48
977 0.45
978 0.46
979 0.5
980 0.55
981 0.61
982 0.69
983 0.74
984 0.78
985 0.84