FuNGI

A0A1V6QS39

Protein Details

Accession

A0A1V6QS39

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-24	ISKPASHTQKMKRPPPPFGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 10.5, cyto_mito 7, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MATAISKPASHTQKMKRPPPPFGQAAANGVKGQHLSSSPTSAAKRLPTGASVNATSNFTNGVAHVANSTTKGPLNRTRNQLQRPMDQSSRSGRPVTRTAATDQAHRAGKKAPEPYVKTTSYILKKYSKCPPSLIVHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDLIEELLRGGVQFYEGCLIVRVIDHKSVSAQARKASTTPSNENNTPFSLHNYNEHVTPSAFVPYPKQNQLTSATQGTKADGTPIANQQTDGPAIGEQTDDKSSNTSQKNYPVKPRVFTTVLHPTARTLQAELTLLVTTPDPRANKAPAQPNSSTSSATPGSNQPDRAHVAKRQKMLVEPEDLLECESKMIQALAPPLFLDPVHSMEAAQELFKHLESPLHCDPPPLPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTASGPGGAAKAAAVDDAGGVAPFEPRFSRFKTLETIRMQHEEKAKREHEMKLKQELAKRQQQEQERERRRAIEQRQAEEHAKEESRRQQLAAQQAQAQLAAQQQNRHIMAQPNGVSQGQQSSPVVRNQTPHATSSPLVGNIMPQAVPMTMTASGSGSPPRPPSALQHAHPNVMSHSMAPSRSQQGPSRHGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNVTPTQRMGHGSPTHSMGQTPVMNQGMAATPQMNGGMPFTPQQQMMLQHRQQALLQAQQQGHLQHNQFTPQQLAQLQANAHAQQNIQSHQHQMLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQNHQGVPKATQPGQQAYQAQLMRAQYAQMQIVKQQQQGQHPQMQGQQAQPHQGNQQLTNQQQQQMLMAAAQASGGQMGPNGQPMNQAQRYTQLYQQRLLRMRHDMSTRYMAQYGPPNQYPSNIAQQYGPGLEKTAKAWVSEVMRRERDGGQQQQQQRAALQAQQMQAQGSMHSMGGMNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.77
3	0.78
4	0.78
5	0.81
6	0.8
7	0.78
8	0.72
9	0.66
10	0.63
11	0.55
12	0.55
13	0.49
14	0.42
15	0.34
16	0.3
17	0.28
18	0.22
19	0.2
20	0.17
21	0.15
22	0.19
23	0.21
24	0.25
25	0.25
26	0.3
27	0.31
28	0.31
29	0.34
30	0.33
31	0.34
32	0.34
33	0.34
34	0.32
35	0.34
36	0.34
37	0.34
38	0.31
39	0.31
40	0.29
41	0.3
42	0.26
43	0.23
44	0.2
45	0.16
46	0.15
47	0.12
48	0.14
49	0.12
50	0.12
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.15
55	0.16
56	0.15
57	0.18
58	0.2
59	0.27
60	0.35
61	0.42
62	0.48
63	0.55
64	0.61
65	0.68
66	0.72
67	0.74
68	0.71
69	0.71
70	0.69
71	0.68
72	0.64
73	0.57
74	0.55
75	0.53
76	0.54
77	0.48
78	0.48
79	0.43
80	0.44
81	0.48
82	0.48
83	0.44
84	0.41
85	0.41
86	0.45
87	0.43
88	0.42
89	0.39
90	0.41
91	0.43
92	0.4
93	0.39
94	0.37
95	0.41
96	0.43
97	0.46
98	0.47
99	0.51
100	0.57
101	0.62
102	0.63
103	0.58
104	0.53
105	0.5
106	0.5
107	0.48
108	0.47
109	0.45
110	0.47
111	0.5
112	0.55
113	0.62
114	0.6
115	0.55
116	0.55
117	0.56
118	0.53
119	0.57
120	0.56
121	0.51
122	0.52
123	0.52
124	0.5
125	0.48
126	0.44
127	0.41
128	0.36
129	0.33
130	0.3
131	0.3
132	0.36
133	0.33
134	0.37
135	0.36
136	0.4
137	0.37
138	0.34
139	0.33
140	0.28
141	0.27
142	0.22
143	0.19
144	0.15
145	0.15
146	0.18
147	0.19
148	0.17
149	0.18
150	0.16
151	0.16
152	0.15
153	0.15
154	0.14
155	0.12
156	0.11
157	0.1
158	0.11
159	0.1
160	0.11
161	0.11
162	0.1
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.06
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.09
179	0.11
180	0.12
181	0.15
182	0.15
183	0.15
184	0.16
185	0.21
186	0.26
187	0.29
188	0.29
189	0.3
190	0.33
191	0.34
192	0.33
193	0.34
194	0.34
195	0.35
196	0.38
197	0.41
198	0.45
199	0.46
200	0.48
201	0.45
202	0.4
203	0.36
204	0.31
205	0.29
206	0.27
207	0.25
208	0.27
209	0.29
210	0.28
211	0.27
212	0.27
213	0.24
214	0.2
215	0.2
216	0.16
217	0.15
218	0.15
219	0.14
220	0.18
221	0.24
222	0.3
223	0.34
224	0.36
225	0.33
226	0.36
227	0.4
228	0.39
229	0.35
230	0.34
231	0.31
232	0.29
233	0.29
234	0.27
235	0.23
236	0.19
237	0.18
238	0.14
239	0.14
240	0.16
241	0.2
242	0.22
243	0.21
244	0.21
245	0.2
246	0.2
247	0.19
248	0.16
249	0.12
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.09
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.14
260	0.16
261	0.24
262	0.27
263	0.29
264	0.29
265	0.38
266	0.47
267	0.49
268	0.57
269	0.58
270	0.57
271	0.56
272	0.56
273	0.53
274	0.46
275	0.42
276	0.38
277	0.39
278	0.4
279	0.38
280	0.35
281	0.3
282	0.33
283	0.34
284	0.28
285	0.19
286	0.15
287	0.16
288	0.17
289	0.15
290	0.12
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.13
298	0.13
299	0.15
300	0.19
301	0.22
302	0.27
303	0.32
304	0.4
305	0.41
306	0.46
307	0.44
308	0.44
309	0.44
310	0.41
311	0.35
312	0.26
313	0.25
314	0.21
315	0.2
316	0.19
317	0.18
318	0.23
319	0.25
320	0.27
321	0.24
322	0.26
323	0.29
324	0.3
325	0.3
326	0.31
327	0.38
328	0.41
329	0.43
330	0.43
331	0.41
332	0.41
333	0.43
334	0.39
335	0.32
336	0.27
337	0.25
338	0.23
339	0.21
340	0.19
341	0.13
342	0.1
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.09
357	0.1
358	0.08
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.12
365	0.1
366	0.09
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.11
374	0.11
375	0.18
376	0.2
377	0.23
378	0.23
379	0.24
380	0.25
381	0.32
382	0.39
383	0.41
384	0.47
385	0.51
386	0.61
387	0.69
388	0.77
389	0.7
390	0.71
391	0.72
392	0.7
393	0.65
394	0.57
395	0.49
396	0.4
397	0.36
398	0.26
399	0.16
400	0.08
401	0.05
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.04
411	0.05
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.03
432	0.02
433	0.02
434	0.03
435	0.03
436	0.02
437	0.02
438	0.03
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.08
444	0.11
445	0.14
446	0.2
447	0.2
448	0.22
449	0.27
450	0.3
451	0.35
452	0.35
453	0.35
454	0.31
455	0.34
456	0.33
457	0.3
458	0.36
459	0.33
460	0.33
461	0.38
462	0.37
463	0.36
464	0.39
465	0.41
466	0.42
467	0.45
468	0.45
469	0.45
470	0.49
471	0.49
472	0.5
473	0.51
474	0.49
475	0.49
476	0.47
477	0.45
478	0.47
479	0.5
480	0.55
481	0.56
482	0.6
483	0.6
484	0.62
485	0.58
486	0.55
487	0.52
488	0.53
489	0.5
490	0.48
491	0.46
492	0.44
493	0.45
494	0.46
495	0.44
496	0.36
497	0.31
498	0.25
499	0.22
500	0.19
501	0.22
502	0.26
503	0.3
504	0.3
505	0.29
506	0.3
507	0.32
508	0.4
509	0.38
510	0.32
511	0.28
512	0.29
513	0.28
514	0.25
515	0.2
516	0.13
517	0.13
518	0.17
519	0.16
520	0.17
521	0.18
522	0.23
523	0.23
524	0.23
525	0.22
526	0.22
527	0.22
528	0.25
529	0.25
530	0.21
531	0.22
532	0.21
533	0.18
534	0.14
535	0.15
536	0.1
537	0.11
538	0.11
539	0.13
540	0.15
541	0.18
542	0.22
543	0.2
544	0.22
545	0.23
546	0.29
547	0.27
548	0.27
549	0.25
550	0.24
551	0.23
552	0.23
553	0.21
554	0.15
555	0.14
556	0.12
557	0.11
558	0.1
559	0.1
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.1
574	0.1
575	0.12
576	0.14
577	0.15
578	0.16
579	0.17
580	0.2
581	0.28
582	0.33
583	0.31
584	0.39
585	0.39
586	0.4
587	0.39
588	0.35
589	0.26
590	0.23
591	0.22
592	0.12
593	0.13
594	0.13
595	0.14
596	0.14
597	0.17
598	0.19
599	0.22
600	0.25
601	0.3
602	0.35
603	0.4
604	0.43
605	0.45
606	0.42
607	0.43
608	0.42
609	0.37
610	0.39
611	0.38
612	0.34
613	0.3
614	0.29
615	0.25
616	0.23
617	0.22
618	0.16
619	0.11
620	0.11
621	0.12
622	0.13
623	0.13
624	0.14
625	0.17
626	0.14
627	0.16
628	0.19
629	0.24
630	0.26
631	0.27
632	0.27
633	0.26
634	0.29
635	0.28
636	0.32
637	0.29
638	0.28
639	0.28
640	0.29
641	0.28
642	0.25
643	0.24
644	0.18
645	0.19
646	0.18
647	0.17
648	0.18
649	0.17
650	0.16
651	0.16
652	0.16
653	0.12
654	0.11
655	0.11
656	0.08
657	0.07
658	0.08
659	0.09
660	0.08
661	0.07
662	0.08
663	0.07
664	0.08
665	0.09
666	0.11
667	0.13
668	0.12
669	0.14
670	0.15
671	0.21
672	0.27
673	0.35
674	0.35
675	0.4
676	0.41
677	0.4
678	0.38
679	0.37
680	0.33
681	0.29
682	0.31
683	0.3
684	0.29
685	0.29
686	0.31
687	0.28
688	0.28
689	0.29
690	0.27
691	0.27
692	0.28
693	0.3
694	0.29
695	0.29
696	0.29
697	0.23
698	0.25
699	0.21
700	0.22
701	0.19
702	0.21
703	0.19
704	0.19
705	0.21
706	0.19
707	0.19
708	0.18
709	0.17
710	0.2
711	0.23
712	0.23
713	0.25
714	0.25
715	0.26
716	0.27
717	0.31
718	0.28
719	0.3
720	0.36
721	0.4
722	0.44
723	0.49
724	0.53
725	0.56
726	0.59
727	0.61
728	0.6
729	0.6
730	0.63
731	0.63
732	0.65
733	0.66
734	0.69
735	0.71
736	0.71
737	0.69
738	0.69
739	0.7
740	0.67
741	0.62
742	0.57
743	0.53
744	0.46
745	0.42
746	0.4
747	0.36
748	0.33
749	0.35
750	0.36
751	0.37
752	0.38
753	0.39
754	0.36
755	0.33
756	0.38
757	0.33
758	0.3
759	0.28
760	0.26
761	0.23
762	0.21
763	0.19
764	0.15
765	0.17
766	0.2
767	0.19
768	0.19
769	0.22
770	0.3
771	0.34
772	0.35
773	0.39
774	0.4
775	0.45
776	0.54
777	0.56
778	0.54
779	0.5
780	0.5
781	0.5
782	0.5
783	0.46
784	0.41
785	0.42
786	0.37
787	0.43
788	0.41
789	0.39
790	0.37
791	0.39
792	0.37
793	0.33
794	0.39
795	0.39
796	0.41
797	0.46
798	0.46
799	0.45
800	0.44
801	0.42
802	0.35
803	0.29
804	0.26
805	0.18
806	0.15
807	0.11
808	0.08
809	0.08
810	0.07
811	0.05
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.07
817	0.08
818	0.13
819	0.13
820	0.13
821	0.17
822	0.2
823	0.3
824	0.32
825	0.33
826	0.29
827	0.36
828	0.41
829	0.4
830	0.43
831	0.43
832	0.42
833	0.46
834	0.51
835	0.53
836	0.54
837	0.55
838	0.54
839	0.54
840	0.53
841	0.54
842	0.53
843	0.48
844	0.46
845	0.49
846	0.47
847	0.41
848	0.4
849	0.34
850	0.33
851	0.39
852	0.4
853	0.39
854	0.4
855	0.42
856	0.41
857	0.43
858	0.42
859	0.37
860	0.42
861	0.36
862	0.34
863	0.3
864	0.31
865	0.31
866	0.3
867	0.27
868	0.17
869	0.18
870	0.19
871	0.2
872	0.2
873	0.25
874	0.23
875	0.23
876	0.23
877	0.26
878	0.31
879	0.35
880	0.4
881	0.42
882	0.44
883	0.44
884	0.47
885	0.45
886	0.48
887	0.52
888	0.54
889	0.55
890	0.6
891	0.65
892	0.7
893	0.7
894	0.62
895	0.54
896	0.5
897	0.43
898	0.39
899	0.38
900	0.35
901	0.34
902	0.35
903	0.35
904	0.31
905	0.29
906	0.25
907	0.2
908	0.16
909	0.16
910	0.12
911	0.12

A0A1V6QS39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer