Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YDY7

Protein Details
Accession I4YDY7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-29NDDSVNKKQRKYRKDGSVVNFKTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG wse:WALSEDRAFT_63917  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MKRPVDNDDSVNKKQRKYRKDGSVVNFKTFSPPEGPGIFITCVRGKEKQALNDILDILNEICDRHFPDLKVQSKKAEVIKETDNKEETPEVAENDIKAQLAQELSEMNDKKKVDNSAKRFVNHQTNTQCLIYLEVRKPFDPIAIVKAYLNEVIETGKMRTKYIQRLTPISHLSHATEAAFEALCGMICQSHLSKGDEEGKGRKYRIELGKRSHNTLKRDDIIQTVVDSINSPHKIDLSNPDRWVIVEIFKGVAGVSVVSEYDKYRKFNPFSLIEAKNKGEDKRDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.7
3 0.71
4 0.73
5 0.76
6 0.77
7 0.81
8 0.84
9 0.84
10 0.85
11 0.78
12 0.74
13 0.65
14 0.54
15 0.51
16 0.42
17 0.37
18 0.3
19 0.29
20 0.28
21 0.28
22 0.29
23 0.23
24 0.26
25 0.24
26 0.2
27 0.22
28 0.2
29 0.22
30 0.24
31 0.27
32 0.27
33 0.34
34 0.4
35 0.42
36 0.46
37 0.47
38 0.45
39 0.43
40 0.41
41 0.32
42 0.26
43 0.21
44 0.14
45 0.11
46 0.1
47 0.08
48 0.07
49 0.09
50 0.12
51 0.16
52 0.2
53 0.19
54 0.28
55 0.37
56 0.45
57 0.5
58 0.5
59 0.49
60 0.48
61 0.52
62 0.48
63 0.44
64 0.38
65 0.35
66 0.4
67 0.43
68 0.43
69 0.42
70 0.39
71 0.33
72 0.34
73 0.31
74 0.24
75 0.21
76 0.19
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.11
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.23
99 0.29
100 0.33
101 0.41
102 0.47
103 0.52
104 0.55
105 0.54
106 0.54
107 0.52
108 0.53
109 0.45
110 0.46
111 0.4
112 0.38
113 0.4
114 0.37
115 0.32
116 0.22
117 0.23
118 0.17
119 0.19
120 0.19
121 0.21
122 0.22
123 0.22
124 0.23
125 0.2
126 0.19
127 0.16
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.15
147 0.2
148 0.28
149 0.33
150 0.37
151 0.37
152 0.41
153 0.43
154 0.43
155 0.41
156 0.33
157 0.29
158 0.25
159 0.23
160 0.2
161 0.18
162 0.13
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.06
176 0.06
177 0.09
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.18
182 0.25
183 0.25
184 0.28
185 0.3
186 0.33
187 0.36
188 0.36
189 0.35
190 0.3
191 0.37
192 0.44
193 0.49
194 0.5
195 0.53
196 0.63
197 0.63
198 0.67
199 0.67
200 0.63
201 0.58
202 0.58
203 0.58
204 0.5
205 0.5
206 0.45
207 0.39
208 0.34
209 0.3
210 0.24
211 0.18
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.18
217 0.18
218 0.19
219 0.18
220 0.19
221 0.2
222 0.22
223 0.31
224 0.28
225 0.33
226 0.33
227 0.34
228 0.33
229 0.32
230 0.33
231 0.24
232 0.21
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.15
238 0.11
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.17
249 0.21
250 0.25
251 0.31
252 0.4
253 0.44
254 0.49
255 0.54
256 0.5
257 0.51
258 0.56
259 0.56
260 0.52
261 0.53
262 0.49
263 0.48
264 0.49
265 0.46
266 0.46