Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YDJ0

Protein Details
Accession I4YDJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
449-469ASFTRKPRSKWYELRFPRITKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG wse:WALSEDRAFT_60137  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MDCNSNSYTKLTLHDTMAAWHWYMPKIYSKMADLDLSADAIDELPLDATPFQCIQLIQSRPGVQLEIPSCIKGQSLRHALDVNQGCEQLMAETKYDGERVQIHIIDQDIIKIFSKSKVDSTSDRAGIVPIIREALGLPSKSYPPGFPDGEFNDSLTSSEPTRGITSGIFEAEMVAFDRRKNKIDEYYRIRELLQSCKGNNKLSNFEAMNSNSSLESVDENLNDCSKRHLAVVFFDILHLDGRDLTDEPLSNRREILEEVVRKVPQFSMLSQVDKIDIRNSNKAMHSLQRIYASNIANCQEGLVLKPSYGTYNCSRLRWVKIKRDYIPGLGDTADFVIIGARHDPQRGRELLVLPHVLTTFTVALKAKQTDMRKLRKRSGINQWDVRDHYHALFEVSYGLVRSELEDLNLEAKCRAGESPSLPYTYSFERGLKIPTILFQRPILFELTGASFTRKPRSKWYELRFPRITK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.29
4 0.31
5 0.29
6 0.23
7 0.22
8 0.24
9 0.21
10 0.23
11 0.23
12 0.28
13 0.3
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.33
18 0.34
19 0.32
20 0.24
21 0.23
22 0.2
23 0.18
24 0.15
25 0.11
26 0.09
27 0.08
28 0.07
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.15
42 0.23
43 0.25
44 0.26
45 0.3
46 0.31
47 0.31
48 0.32
49 0.3
50 0.22
51 0.26
52 0.24
53 0.25
54 0.24
55 0.23
56 0.23
57 0.21
58 0.22
59 0.2
60 0.23
61 0.26
62 0.33
63 0.33
64 0.35
65 0.37
66 0.36
67 0.41
68 0.41
69 0.34
70 0.29
71 0.27
72 0.25
73 0.23
74 0.23
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.14
86 0.17
87 0.21
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.19
93 0.16
94 0.15
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.16
101 0.2
102 0.19
103 0.23
104 0.26
105 0.3
106 0.32
107 0.37
108 0.39
109 0.37
110 0.36
111 0.31
112 0.27
113 0.24
114 0.22
115 0.16
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.11
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.19
129 0.15
130 0.16
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.25
135 0.26
136 0.28
137 0.28
138 0.24
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.14
143 0.12
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.16
165 0.19
166 0.22
167 0.25
168 0.28
169 0.35
170 0.42
171 0.49
172 0.51
173 0.54
174 0.53
175 0.51
176 0.47
177 0.41
178 0.37
179 0.35
180 0.33
181 0.3
182 0.29
183 0.35
184 0.38
185 0.38
186 0.39
187 0.35
188 0.33
189 0.31
190 0.34
191 0.28
192 0.26
193 0.25
194 0.23
195 0.21
196 0.17
197 0.17
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.16
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.22
246 0.24
247 0.24
248 0.23
249 0.23
250 0.19
251 0.17
252 0.17
253 0.14
254 0.19
255 0.2
256 0.22
257 0.21
258 0.21
259 0.18
260 0.17
261 0.17
262 0.15
263 0.19
264 0.21
265 0.26
266 0.27
267 0.29
268 0.3
269 0.32
270 0.29
271 0.28
272 0.3
273 0.27
274 0.28
275 0.28
276 0.28
277 0.28
278 0.31
279 0.28
280 0.23
281 0.24
282 0.23
283 0.19
284 0.18
285 0.16
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.13
295 0.13
296 0.17
297 0.16
298 0.25
299 0.28
300 0.28
301 0.32
302 0.34
303 0.41
304 0.47
305 0.52
306 0.53
307 0.6
308 0.68
309 0.67
310 0.7
311 0.65
312 0.58
313 0.52
314 0.43
315 0.34
316 0.26
317 0.22
318 0.14
319 0.12
320 0.09
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.09
328 0.11
329 0.14
330 0.16
331 0.18
332 0.25
333 0.26
334 0.27
335 0.29
336 0.3
337 0.29
338 0.31
339 0.29
340 0.23
341 0.22
342 0.2
343 0.16
344 0.13
345 0.13
346 0.1
347 0.09
348 0.12
349 0.12
350 0.14
351 0.18
352 0.19
353 0.2
354 0.26
355 0.3
356 0.37
357 0.46
358 0.55
359 0.6
360 0.67
361 0.72
362 0.75
363 0.78
364 0.77
365 0.78
366 0.78
367 0.77
368 0.77
369 0.71
370 0.68
371 0.63
372 0.57
373 0.49
374 0.41
375 0.33
376 0.28
377 0.25
378 0.21
379 0.19
380 0.16
381 0.13
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.13
394 0.16
395 0.17
396 0.16
397 0.13
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.13
402 0.12
403 0.17
404 0.2
405 0.28
406 0.29
407 0.3
408 0.3
409 0.3
410 0.31
411 0.3
412 0.3
413 0.25
414 0.25
415 0.26
416 0.27
417 0.3
418 0.29
419 0.27
420 0.24
421 0.26
422 0.31
423 0.32
424 0.33
425 0.32
426 0.33
427 0.33
428 0.34
429 0.32
430 0.24
431 0.21
432 0.21
433 0.2
434 0.18
435 0.18
436 0.2
437 0.21
438 0.25
439 0.36
440 0.4
441 0.42
442 0.51
443 0.59
444 0.66
445 0.72
446 0.77
447 0.78
448 0.8
449 0.86