Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YGM4

Protein Details
Accession I4YGM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-156MVLECLSREHRKRRRSRQSSHSDSDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-145RKRRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG wse:WALSEDRAFT_50484  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
Amino Acid Sequences METDGAREQALSLAKTLKQDGLDYQYIHLYAALQLFKQTSFNDASILFTKSQCDIRLILRWFPDLIAGLFDPDEFVRLPLGISTYISKIPHTIDQVIVANLEKNYSPYLSVEEDEPIKDLKTTLMNNARTMVLECLSREHRKRRRSRQSSHSDSDAYTDMILDTCLAIIFAEKTSMDRNALSIFVSQPNTVLLPIAEPTLVKQGRYTALARLYETHGDTTQALEIHKGLVEGSITDIDSVEPLKDTVRLLNKVEEPDVLLNYGLWLLAHNRSAGLQALSSHPKTPLDETKLLESLGNTDKIAEQEYLEILVLARNRDDKDIRRGLLERLIGNVLGAFKNESISKNMAKIDDEYKSQRRNKSYTQYLTNLLENDHTRTDVKESIKARIKLVLYLQISTDLDWSSIMRSLEPLINTTLMLEKGVILGKLEQHNAALNILARQLKDTYSAQHYCAFPGFILSANLARKCINDSHLSNSWLVALARTSMVAVSPSIRSHLLRVLLDVYMVDGDFFSAEIASLLGSQALHLDFIETLPKIPNDIPLASIKDFMLRQLRRSEHRKRELSILKGIAAAENLTRTEEAWLATREAGAVVEEAVDDTNNGYEKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.28
4 0.27
5 0.25
6 0.26
7 0.29
8 0.31
9 0.33
10 0.31
11 0.3
12 0.29
13 0.27
14 0.26
15 0.21
16 0.15
17 0.14
18 0.17
19 0.17
20 0.15
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.21
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.23
32 0.23
33 0.25
34 0.22
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.26
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.26
43 0.34
44 0.35
45 0.37
46 0.35
47 0.35
48 0.33
49 0.3
50 0.28
51 0.21
52 0.18
53 0.16
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.14
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.18
76 0.2
77 0.23
78 0.25
79 0.25
80 0.22
81 0.25
82 0.26
83 0.24
84 0.22
85 0.18
86 0.16
87 0.14
88 0.15
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.16
99 0.17
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.15
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.17
109 0.18
110 0.25
111 0.33
112 0.35
113 0.35
114 0.36
115 0.34
116 0.29
117 0.29
118 0.22
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.17
123 0.22
124 0.3
125 0.36
126 0.45
127 0.53
128 0.62
129 0.73
130 0.79
131 0.85
132 0.87
133 0.89
134 0.89
135 0.9
136 0.89
137 0.82
138 0.75
139 0.65
140 0.55
141 0.48
142 0.38
143 0.28
144 0.19
145 0.14
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.12
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.2
192 0.23
193 0.23
194 0.18
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.22
199 0.23
200 0.22
201 0.22
202 0.2
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.11
234 0.16
235 0.19
236 0.2
237 0.24
238 0.26
239 0.26
240 0.26
241 0.21
242 0.18
243 0.16
244 0.15
245 0.11
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.03
252 0.04
253 0.05
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.06
263 0.07
264 0.1
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.15
270 0.16
271 0.19
272 0.22
273 0.24
274 0.27
275 0.27
276 0.28
277 0.28
278 0.27
279 0.23
280 0.17
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.13
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.04
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.09
302 0.1
303 0.13
304 0.17
305 0.19
306 0.27
307 0.31
308 0.31
309 0.31
310 0.31
311 0.3
312 0.31
313 0.29
314 0.21
315 0.17
316 0.17
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.09
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.14
330 0.15
331 0.17
332 0.19
333 0.18
334 0.18
335 0.19
336 0.19
337 0.18
338 0.2
339 0.23
340 0.28
341 0.36
342 0.41
343 0.45
344 0.48
345 0.52
346 0.56
347 0.59
348 0.62
349 0.59
350 0.58
351 0.54
352 0.52
353 0.48
354 0.42
355 0.34
356 0.25
357 0.23
358 0.19
359 0.18
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.17
365 0.19
366 0.2
367 0.24
368 0.25
369 0.32
370 0.4
371 0.4
372 0.38
373 0.38
374 0.37
375 0.32
376 0.33
377 0.31
378 0.24
379 0.23
380 0.22
381 0.2
382 0.19
383 0.17
384 0.17
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.07
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.11
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.12
413 0.15
414 0.16
415 0.15
416 0.14
417 0.16
418 0.16
419 0.15
420 0.12
421 0.1
422 0.09
423 0.12
424 0.14
425 0.12
426 0.13
427 0.14
428 0.13
429 0.17
430 0.17
431 0.18
432 0.24
433 0.26
434 0.26
435 0.3
436 0.3
437 0.27
438 0.27
439 0.23
440 0.16
441 0.16
442 0.14
443 0.1
444 0.11
445 0.1
446 0.13
447 0.17
448 0.18
449 0.17
450 0.17
451 0.17
452 0.2
453 0.22
454 0.22
455 0.24
456 0.26
457 0.32
458 0.36
459 0.37
460 0.33
461 0.3
462 0.27
463 0.22
464 0.2
465 0.14
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.1
477 0.1
478 0.12
479 0.14
480 0.15
481 0.16
482 0.2
483 0.22
484 0.21
485 0.22
486 0.21
487 0.19
488 0.19
489 0.16
490 0.12
491 0.09
492 0.08
493 0.07
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.08
514 0.07
515 0.08
516 0.12
517 0.1
518 0.12
519 0.15
520 0.15
521 0.17
522 0.18
523 0.23
524 0.23
525 0.23
526 0.24
527 0.25
528 0.3
529 0.27
530 0.28
531 0.23
532 0.24
533 0.23
534 0.26
535 0.32
536 0.29
537 0.33
538 0.41
539 0.47
540 0.51
541 0.61
542 0.67
543 0.68
544 0.76
545 0.78
546 0.72
547 0.76
548 0.76
549 0.72
550 0.69
551 0.6
552 0.5
553 0.46
554 0.43
555 0.33
556 0.25
557 0.21
558 0.14
559 0.14
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.13
564 0.15
565 0.15
566 0.15
567 0.18
568 0.19
569 0.19
570 0.2
571 0.19
572 0.17
573 0.16
574 0.15
575 0.11
576 0.09
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.09
586 0.11