Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YDJ6

Protein Details
Accession I4YDJ6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
601-624GGPPTTRRRGRPPGSKNKTTRNSTHydrophilic
757-797DTCYKCNKKGHWASNCPNPAKAPAKRKTYTRKSTQKRQKRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
608-614RRGRPPG
777-797KAPAKRKTYTRKSTQKRQKRS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000380  Topo_IA  
IPR003601  Topo_IA_2  
IPR023406  Topo_IA_AS  
IPR013497  Topo_IA_cen  
IPR013824  Topo_IA_cen_sub1  
IPR013825  Topo_IA_cen_sub2  
IPR013826  Topo_IA_cen_sub3  
IPR023405  Topo_IA_core_domain  
IPR003602  Topo_IA_DNA-bd_dom  
IPR006171  TOPRIM_domain  
IPR034144  TOPRIM_TopoIII  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
IPR010666  Znf_GRF  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006265  P:DNA topological change  
KEGG wse:WALSEDRAFT_51054  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01131  Topoisom_bac  
PF01751  Toprim  
PF00098  zf-CCHC  
PF06839  zf-GRF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00396  TOPOISOMERASE_I_PROK  
PS50880  TOPRIM  
PS50158  ZF_CCHC  
PS51999  ZF_GRF  
CDD cd00186  TOP1Ac  
cd03362  TOPRIM_TopoIA_TopoIII  
Amino Acid Sequences MAIKYLCVAEKPSISKSITQILSSGSYNSRNTSSKFIKNYDFNYKMTGYNGRQVSFTVTAVAGHLTASDFGKDYRKWHSCDPLQLFDGRVEVSTAGNMSAIEQNLKNEARSSSHLMIWTDCDREGEHIGAEIMSICRKANPRIEVSRAKFSAIIPNQIHNAARHPAELDMKQVRAVEARIELDLRIGAAFTRLMTMNLSKQIAELDVHTGPCQFPTLGFVVDQYQRIKDFISEAFWYIFVSIIHRDDDGKDSNVVFHWQRDRLFDPDLSFILYEQCAINPSARVTKIAEKLYQKGFLSYPRTETDQYDPSFDFHSLIDKQANDGVWGSYARSLTDSGFDKPREGKKNDKAHPPIHPTAHASGLTGNDKRVYEYITRRFLASCSRDAKGKNTNAEVEIAGEIFKASGSVLLEKNYLNVFPYDKWSSHTIPNFTVGQVFTPSVCELREGKTTPPNLLTEADLVSLMDKHGIGTDATIAEHIHKIIDREYVMEHKQGNTKYLVPSTLGVALVEGYNKMNLEKSVSKPQLRRENEERMNRIGEGLVEKTDVLIESIDQYKDIYIRSARQFQVLVESGNNDEDDYDDGFGGGGNGGGGNDSDDHDGGPPTTRRRGRPPGSKNKTTRNSTANSNYQMTVFEPSKTNTPKEGQVRCKCDLSAKRFVTQQGANKGRAFWKCPNTSKSAQCNFWSWEDSLNVGNANTHQNQDDDYNLINDDELIADDDASCKNPQRAPPRESSSGATRATSRKATSNSSTSTKNGDTCYKCNKKGHWASNCPNPAKAPAKRKTYTRKSTQKRQKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.39
4 0.44
5 0.39
6 0.36
7 0.33
8 0.3
9 0.31
10 0.27
11 0.27
12 0.22
13 0.25
14 0.27
15 0.29
16 0.32
17 0.33
18 0.35
19 0.42
20 0.45
21 0.48
22 0.53
23 0.55
24 0.58
25 0.6
26 0.64
27 0.65
28 0.61
29 0.54
30 0.53
31 0.49
32 0.43
33 0.4
34 0.42
35 0.34
36 0.39
37 0.41
38 0.37
39 0.35
40 0.34
41 0.36
42 0.3
43 0.27
44 0.21
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.12
58 0.19
59 0.21
60 0.24
61 0.32
62 0.38
63 0.41
64 0.48
65 0.56
66 0.55
67 0.63
68 0.65
69 0.6
70 0.56
71 0.53
72 0.47
73 0.38
74 0.34
75 0.24
76 0.18
77 0.14
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.12
87 0.12
88 0.15
89 0.15
90 0.16
91 0.22
92 0.23
93 0.22
94 0.21
95 0.23
96 0.23
97 0.27
98 0.33
99 0.3
100 0.32
101 0.34
102 0.33
103 0.32
104 0.32
105 0.3
106 0.24
107 0.22
108 0.21
109 0.18
110 0.2
111 0.22
112 0.18
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.14
124 0.18
125 0.24
126 0.31
127 0.36
128 0.42
129 0.47
130 0.54
131 0.59
132 0.6
133 0.62
134 0.55
135 0.51
136 0.45
137 0.4
138 0.43
139 0.36
140 0.4
141 0.32
142 0.34
143 0.35
144 0.35
145 0.36
146 0.26
147 0.28
148 0.24
149 0.23
150 0.21
151 0.2
152 0.21
153 0.24
154 0.23
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.26
159 0.26
160 0.24
161 0.21
162 0.21
163 0.17
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.12
171 0.1
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.18
185 0.19
186 0.17
187 0.16
188 0.17
189 0.16
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.1
201 0.08
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.16
209 0.19
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.15
216 0.16
217 0.14
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.11
225 0.11
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.13
234 0.17
235 0.18
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.19
242 0.16
243 0.18
244 0.21
245 0.24
246 0.25
247 0.29
248 0.31
249 0.3
250 0.32
251 0.29
252 0.26
253 0.24
254 0.23
255 0.19
256 0.16
257 0.13
258 0.12
259 0.1
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.11
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.17
272 0.24
273 0.28
274 0.3
275 0.34
276 0.32
277 0.36
278 0.37
279 0.39
280 0.32
281 0.29
282 0.27
283 0.28
284 0.31
285 0.28
286 0.28
287 0.26
288 0.29
289 0.29
290 0.3
291 0.29
292 0.29
293 0.28
294 0.28
295 0.27
296 0.24
297 0.24
298 0.22
299 0.18
300 0.12
301 0.15
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.14
306 0.15
307 0.16
308 0.16
309 0.12
310 0.12
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.14
323 0.14
324 0.19
325 0.19
326 0.2
327 0.25
328 0.33
329 0.38
330 0.4
331 0.47
332 0.51
333 0.61
334 0.65
335 0.69
336 0.67
337 0.63
338 0.66
339 0.64
340 0.59
341 0.5
342 0.45
343 0.38
344 0.34
345 0.32
346 0.25
347 0.18
348 0.14
349 0.15
350 0.17
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.17
359 0.24
360 0.3
361 0.32
362 0.33
363 0.32
364 0.32
365 0.3
366 0.32
367 0.28
368 0.27
369 0.25
370 0.25
371 0.28
372 0.29
373 0.33
374 0.33
375 0.35
376 0.32
377 0.31
378 0.31
379 0.29
380 0.29
381 0.24
382 0.16
383 0.12
384 0.09
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.04
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.14
407 0.15
408 0.15
409 0.17
410 0.21
411 0.23
412 0.26
413 0.29
414 0.26
415 0.25
416 0.27
417 0.25
418 0.21
419 0.2
420 0.15
421 0.12
422 0.11
423 0.1
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.12
432 0.16
433 0.16
434 0.19
435 0.24
436 0.25
437 0.24
438 0.25
439 0.23
440 0.21
441 0.2
442 0.18
443 0.13
444 0.12
445 0.11
446 0.09
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.11
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.16
475 0.16
476 0.19
477 0.19
478 0.18
479 0.24
480 0.24
481 0.25
482 0.23
483 0.24
484 0.23
485 0.23
486 0.21
487 0.17
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.12
492 0.09
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.06
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.12
505 0.16
506 0.2
507 0.29
508 0.35
509 0.41
510 0.44
511 0.52
512 0.58
513 0.58
514 0.61
515 0.58
516 0.62
517 0.65
518 0.69
519 0.63
520 0.56
521 0.53
522 0.45
523 0.39
524 0.29
525 0.22
526 0.16
527 0.14
528 0.11
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.08
534 0.06
535 0.05
536 0.05
537 0.07
538 0.1
539 0.1
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.13
546 0.12
547 0.19
548 0.23
549 0.3
550 0.3
551 0.32
552 0.32
553 0.28
554 0.32
555 0.27
556 0.23
557 0.17
558 0.17
559 0.16
560 0.16
561 0.16
562 0.09
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.05
574 0.04
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.04
581 0.05
582 0.06
583 0.08
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.1
588 0.09
589 0.14
590 0.17
591 0.2
592 0.3
593 0.35
594 0.39
595 0.48
596 0.59
597 0.63
598 0.7
599 0.76
600 0.78
601 0.82
602 0.86
603 0.84
604 0.84
605 0.83
606 0.79
607 0.74
608 0.69
609 0.63
610 0.61
611 0.62
612 0.58
613 0.53
614 0.49
615 0.43
616 0.38
617 0.35
618 0.29
619 0.26
620 0.21
621 0.18
622 0.18
623 0.2
624 0.28
625 0.31
626 0.32
627 0.32
628 0.34
629 0.4
630 0.47
631 0.54
632 0.57
633 0.62
634 0.65
635 0.64
636 0.63
637 0.56
638 0.56
639 0.56
640 0.53
641 0.55
642 0.51
643 0.51
644 0.52
645 0.53
646 0.5
647 0.47
648 0.47
649 0.47
650 0.49
651 0.49
652 0.47
653 0.48
654 0.48
655 0.47
656 0.46
657 0.44
658 0.49
659 0.54
660 0.61
661 0.62
662 0.63
663 0.65
664 0.68
665 0.7
666 0.67
667 0.63
668 0.58
669 0.58
670 0.54
671 0.51
672 0.45
673 0.36
674 0.32
675 0.28
676 0.27
677 0.23
678 0.21
679 0.18
680 0.14
681 0.15
682 0.13
683 0.18
684 0.18
685 0.19
686 0.19
687 0.19
688 0.21
689 0.22
690 0.21
691 0.17
692 0.16
693 0.16
694 0.15
695 0.15
696 0.13
697 0.11
698 0.1
699 0.08
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.1
706 0.1
707 0.12
708 0.14
709 0.16
710 0.22
711 0.27
712 0.35
713 0.44
714 0.53
715 0.56
716 0.64
717 0.67
718 0.67
719 0.65
720 0.61
721 0.57
722 0.55
723 0.5
724 0.42
725 0.39
726 0.39
727 0.42
728 0.42
729 0.38
730 0.39
731 0.43
732 0.48
733 0.49
734 0.51
735 0.5
736 0.49
737 0.5
738 0.44
739 0.46
740 0.42
741 0.4
742 0.38
743 0.43
744 0.44
745 0.48
746 0.57
747 0.6
748 0.64
749 0.68
750 0.7
751 0.72
752 0.76
753 0.8
754 0.79
755 0.8
756 0.79
757 0.82
758 0.85
759 0.76
760 0.69
761 0.61
762 0.59
763 0.58
764 0.6
765 0.6
766 0.6
767 0.67
768 0.69
769 0.77
770 0.79
771 0.81
772 0.82
773 0.83
774 0.85
775 0.86
776 0.92
777 0.93