Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3BDL0

Protein Details
Accession G3BDL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-277TGADPNIIKRKPKKEEKKQKKTRRGKITNTHMKGIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-268IKRKPKKEEKKQKKTRRGK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG cten:CANTEDRAFT_116379  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd07977  TFIIE_beta_winged_helix  
Amino Acid Sequences MSDLSSQLSAFKNKIRSGPYVPTPRQAINKASDLNPVSNEVPVREARDVTTASSNKRPPDTVNEAIKRQRTALRNMPGSHLSTQLHLAVEHIKQNDKPIKVKDLQEYLSFDITQTLLPLLKEIDRLKYDHKSDTFEYVSLHNIRSSEDLLNFLRVQPTFKGIPVKELKDGWANYLQSINELEAENKILVLRTKKENAPRLVWANFGGNLNTIDEDFKYMWTRAKIPNPDDLYQDLVDQGLKPTGADPNIIKRKPKKEEKKQKKTRRGKITNTHMKGILRDYSQFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.46
4 0.48
5 0.53
6 0.56
7 0.6
8 0.59
9 0.59
10 0.58
11 0.57
12 0.58
13 0.54
14 0.5
15 0.45
16 0.48
17 0.46
18 0.43
19 0.45
20 0.4
21 0.37
22 0.33
23 0.32
24 0.27
25 0.26
26 0.25
27 0.19
28 0.2
29 0.2
30 0.23
31 0.21
32 0.21
33 0.2
34 0.23
35 0.23
36 0.21
37 0.28
38 0.27
39 0.29
40 0.37
41 0.4
42 0.4
43 0.42
44 0.42
45 0.37
46 0.42
47 0.46
48 0.46
49 0.51
50 0.51
51 0.53
52 0.57
53 0.58
54 0.5
55 0.45
56 0.45
57 0.4
58 0.43
59 0.47
60 0.49
61 0.51
62 0.51
63 0.52
64 0.47
65 0.45
66 0.39
67 0.34
68 0.26
69 0.21
70 0.22
71 0.19
72 0.17
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.18
81 0.26
82 0.32
83 0.31
84 0.35
85 0.35
86 0.4
87 0.43
88 0.47
89 0.44
90 0.42
91 0.41
92 0.38
93 0.37
94 0.32
95 0.28
96 0.24
97 0.18
98 0.15
99 0.13
100 0.1
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.11
109 0.12
110 0.15
111 0.16
112 0.18
113 0.21
114 0.26
115 0.28
116 0.29
117 0.29
118 0.29
119 0.29
120 0.32
121 0.29
122 0.23
123 0.22
124 0.18
125 0.2
126 0.17
127 0.16
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.12
134 0.11
135 0.13
136 0.13
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.14
143 0.11
144 0.15
145 0.13
146 0.15
147 0.21
148 0.19
149 0.26
150 0.29
151 0.3
152 0.29
153 0.29
154 0.29
155 0.28
156 0.28
157 0.23
158 0.24
159 0.22
160 0.2
161 0.22
162 0.2
163 0.15
164 0.16
165 0.13
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.1
176 0.14
177 0.17
178 0.21
179 0.26
180 0.31
181 0.39
182 0.46
183 0.48
184 0.47
185 0.48
186 0.48
187 0.44
188 0.41
189 0.34
190 0.28
191 0.25
192 0.22
193 0.18
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.14
205 0.15
206 0.19
207 0.21
208 0.26
209 0.3
210 0.39
211 0.45
212 0.44
213 0.52
214 0.53
215 0.52
216 0.49
217 0.44
218 0.39
219 0.31
220 0.29
221 0.2
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.18
234 0.28
235 0.38
236 0.41
237 0.48
238 0.52
239 0.62
240 0.69
241 0.78
242 0.79
243 0.81
244 0.89
245 0.92
246 0.95
247 0.96
248 0.97
249 0.97
250 0.96
251 0.95
252 0.95
253 0.94
254 0.93
255 0.92
256 0.92
257 0.92
258 0.86
259 0.8
260 0.73
261 0.64
262 0.57
263 0.51
264 0.45
265 0.37