Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YGZ4

Protein Details
Accession I4YGZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-50VASPESKKGRGRPRKTDKDKKGSLSPTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-44SKKGRGRPRKTDKDKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 13.166, cyto_nucl 12.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG wse:WALSEDRAFT_35662  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MQQQKRPRSSTPGELSFPGTPQTVASPESKKGRGRPRKTDKDKKGSLSPTLPQNELEPAQPQQQQKKPEEDDDDEIEDDWMEDDDFERERVQSKKAKEDLGVLLQHFSSEQLQRYEVYRRAALNKNTIRKLCNQTLNQSVSQNVSIIVSGFSKVFVGEIVEKAREVQEAWGQSGPLSADQIREAHRLYQKDKGAYRKPFVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.54
3 0.46
4 0.4
5 0.32
6 0.24
7 0.19
8 0.17
9 0.18
10 0.15
11 0.16
12 0.2
13 0.21
14 0.27
15 0.33
16 0.38
17 0.41
18 0.48
19 0.57
20 0.63
21 0.69
22 0.74
23 0.79
24 0.85
25 0.9
26 0.92
27 0.92
28 0.91
29 0.88
30 0.83
31 0.8
32 0.73
33 0.68
34 0.61
35 0.55
36 0.52
37 0.49
38 0.44
39 0.36
40 0.33
41 0.3
42 0.27
43 0.24
44 0.18
45 0.17
46 0.21
47 0.26
48 0.29
49 0.35
50 0.39
51 0.45
52 0.47
53 0.53
54 0.51
55 0.51
56 0.52
57 0.46
58 0.45
59 0.4
60 0.37
61 0.29
62 0.26
63 0.21
64 0.15
65 0.11
66 0.08
67 0.06
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.11
77 0.13
78 0.18
79 0.22
80 0.24
81 0.32
82 0.35
83 0.36
84 0.32
85 0.34
86 0.3
87 0.28
88 0.26
89 0.18
90 0.16
91 0.14
92 0.13
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.2
103 0.21
104 0.21
105 0.22
106 0.22
107 0.28
108 0.34
109 0.35
110 0.4
111 0.43
112 0.47
113 0.5
114 0.5
115 0.46
116 0.47
117 0.51
118 0.49
119 0.51
120 0.46
121 0.46
122 0.51
123 0.52
124 0.46
125 0.4
126 0.34
127 0.27
128 0.25
129 0.2
130 0.14
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.07
144 0.08
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.16
155 0.18
156 0.2
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.19
161 0.17
162 0.13
163 0.14
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.17
168 0.19
169 0.22
170 0.23
171 0.27
172 0.33
173 0.38
174 0.4
175 0.45
176 0.48
177 0.53
178 0.58
179 0.6
180 0.64
181 0.66