Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I4YCT1

Protein Details
Accession I4YCT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-82DKLIHRKLYHRIFKPKNDDLBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003892  CUE  
IPR041545  DUF5601  
IPR009060  UBA-like_sf  
IPR003123  VPS9  
IPR045046  Vps9-like  
IPR037191  VPS9_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG wse:WALSEDRAFT_68701  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02845  CUE  
PF18151  DUF5601  
PF02204  VPS9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51140  CUE  
PS51205  VPS9  
CDD cd14279  CUE  
Amino Acid Sequences MSSFNSVESIHKYTHSFLSGFSKRDFTSNQQVKLITDFLSFIREEMEKTGQFGDLDSALLSMDKLIHRKLYHRIFKPKNDDLAKDQVLEQRVRIFSWIELKQLDLDFGLGETFNLATEQLQSINKYHCPQDKTLVILNTSIILTDILNKSPATTSADSLLPLFIYTLLQTNPSHLISNIEYIQRFTNNEQLSGEVGYYFYTLTAAVSFINNLDHKALSNIEKEDFERHVEEAISQLPSTPPASPDKPPTTPQLNIANESKQLFQKTTQGIGKIGKLLGEVVEEGVDKLTSSASANDLHSDAHRGEEGAEEAHFVRSRSEHFEQSRQQFNRSLETLIQVFPHMEPGVCELVLKAEHGNLERAVDQCLDISNSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.26
4 0.25
5 0.34
6 0.36
7 0.38
8 0.37
9 0.37
10 0.34
11 0.39
12 0.41
13 0.38
14 0.44
15 0.48
16 0.5
17 0.49
18 0.49
19 0.45
20 0.44
21 0.38
22 0.29
23 0.21
24 0.19
25 0.16
26 0.18
27 0.16
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.17
33 0.22
34 0.2
35 0.21
36 0.23
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.18
41 0.12
42 0.12
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.05
49 0.08
50 0.1
51 0.13
52 0.15
53 0.21
54 0.23
55 0.27
56 0.37
57 0.44
58 0.51
59 0.57
60 0.66
61 0.69
62 0.76
63 0.81
64 0.78
65 0.77
66 0.71
67 0.66
68 0.61
69 0.61
70 0.53
71 0.45
72 0.41
73 0.36
74 0.36
75 0.33
76 0.28
77 0.26
78 0.25
79 0.24
80 0.23
81 0.2
82 0.18
83 0.25
84 0.25
85 0.21
86 0.21
87 0.21
88 0.22
89 0.21
90 0.19
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.06
105 0.07
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.14
110 0.17
111 0.2
112 0.21
113 0.26
114 0.29
115 0.32
116 0.33
117 0.37
118 0.35
119 0.35
120 0.37
121 0.33
122 0.27
123 0.24
124 0.22
125 0.16
126 0.14
127 0.11
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.13
163 0.11
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.19
174 0.17
175 0.18
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.18
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.12
220 0.1
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.16
229 0.19
230 0.21
231 0.29
232 0.33
233 0.35
234 0.37
235 0.41
236 0.4
237 0.38
238 0.4
239 0.42
240 0.38
241 0.38
242 0.38
243 0.34
244 0.31
245 0.31
246 0.29
247 0.23
248 0.23
249 0.22
250 0.21
251 0.27
252 0.27
253 0.31
254 0.31
255 0.29
256 0.3
257 0.31
258 0.3
259 0.25
260 0.23
261 0.17
262 0.15
263 0.14
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.14
299 0.15
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.2
304 0.27
305 0.3
306 0.35
307 0.39
308 0.47
309 0.53
310 0.58
311 0.65
312 0.59
313 0.59
314 0.57
315 0.54
316 0.53
317 0.46
318 0.42
319 0.33
320 0.35
321 0.33
322 0.27
323 0.25
324 0.19
325 0.18
326 0.16
327 0.19
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.17
332 0.19
333 0.17
334 0.17
335 0.13
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.13
340 0.12
341 0.16
342 0.18
343 0.21
344 0.18
345 0.2
346 0.22
347 0.21
348 0.22
349 0.19
350 0.18
351 0.15
352 0.17