FuNGI

A0A1V6PMY3

Protein Details

Accession

A0A1V6PMY3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
370-394	EAEAEYKKRLKHKRQERKEARGGGP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
376-396	KKRLKHKRQERKEARGGGPGR
453-477	RADRGRGRGNDRGRGGRGRGGGGRG

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSDPQNPVNGSVDSGDALPSEKPSLIDTPPVADTPDDGSDFYNTPVGAVTPLTKSNDINAPKTTTESIPASGPAPVIPGLGLVSSTDQSTSESAKQESDIPAVKQEGDISTETATTHTTAQQGPSNEAQNTAATSEVMDVDVNHTQTATENVQKENEQQEEEEEHPEWEVDSDPYESSSDSSSSDSSDSDDEDYPILSPEEQARILMMAEGGSDDEGEGKGKSGGLIRSANEVVEDVLPIPDIKITPDTKIVLLGNIKTVIDNAVLIEANTSGEYQVLESGSLLCNENREVIGVVAETLGRVENPLYTVMYSTAEEAQQRGVNRDMPVYYVEDQSTFVFTQPLKGLKGSDASNFHDEEVAEDEIEFSDDEAEAEYKKRLKHKRQERKEARGGGPGRFTRETPGPSKLSHTELNYNDEGGEDGYTPLARPKNLHEMMSAREAPIEGNERLHGFRADRGRGRGNDRGRGGRGRGGGGRGGSYERDQDRRPPHQQSGSSNYGQLAAAHQPQPSGYGQPAYPQPQPQPQPQPQPQQPAYGMAQPFTGYPQYAPQQGQYPQSSVPTQFPFQLPFQPQAFPQQGAFPSIPQGAHINPQFFLAALQQQQQFQQQQQQQYQQPQQFQQAPAQGQAQNPTMNFDQVKAQLDLLRNLSNQNQGPPPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.13
3	0.1
4	0.11
5	0.1
6	0.12
7	0.13
8	0.13
9	0.14
10	0.17
11	0.21
12	0.21
13	0.26
14	0.24
15	0.25
16	0.26
17	0.26
18	0.24
19	0.2
20	0.19
21	0.18
22	0.2
23	0.18
24	0.17
25	0.17
26	0.19
27	0.2
28	0.2
29	0.18
30	0.15
31	0.14
32	0.14
33	0.13
34	0.11
35	0.12
36	0.13
37	0.13
38	0.17
39	0.21
40	0.22
41	0.22
42	0.26
43	0.33
44	0.34
45	0.35
46	0.35
47	0.36
48	0.35
49	0.38
50	0.36
51	0.29
52	0.3
53	0.28
54	0.26
55	0.23
56	0.24
57	0.21
58	0.19
59	0.18
60	0.13
61	0.13
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.07
68	0.07
69	0.06
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.08
75	0.1
76	0.12
77	0.15
78	0.18
79	0.2
80	0.21
81	0.22
82	0.23
83	0.25
84	0.25
85	0.26
86	0.26
87	0.23
88	0.26
89	0.26
90	0.25
91	0.21
92	0.21
93	0.17
94	0.17
95	0.17
96	0.14
97	0.14
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.12
102	0.11
103	0.11
104	0.12
105	0.15
106	0.16
107	0.19
108	0.23
109	0.23
110	0.26
111	0.28
112	0.3
113	0.27
114	0.27
115	0.25
116	0.21
117	0.2
118	0.17
119	0.13
120	0.09
121	0.09
122	0.09
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.06
127	0.09
128	0.12
129	0.12
130	0.11
131	0.11
132	0.11
133	0.11
134	0.15
135	0.15
136	0.18
137	0.2
138	0.22
139	0.24
140	0.25
141	0.29
142	0.3
143	0.29
144	0.25
145	0.23
146	0.24
147	0.26
148	0.26
149	0.25
150	0.2
151	0.18
152	0.17
153	0.16
154	0.14
155	0.11
156	0.1
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.09
161	0.11
162	0.11
163	0.1
164	0.1
165	0.11
166	0.1
167	0.1
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.11
176	0.13
177	0.13
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.1
182	0.11
183	0.1
184	0.07
185	0.08
186	0.09
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.07
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.03
202	0.04
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.1
211	0.11
212	0.14
213	0.16
214	0.16
215	0.2
216	0.2
217	0.19
218	0.15
219	0.15
220	0.12
221	0.1
222	0.09
223	0.06
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.11
232	0.12
233	0.13
234	0.16
235	0.17
236	0.16
237	0.18
238	0.17
239	0.15
240	0.15
241	0.14
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.07
249	0.07
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.03
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.12
308	0.13
309	0.14
310	0.15
311	0.16
312	0.14
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.14
317	0.12
318	0.12
319	0.11
320	0.12
321	0.11
322	0.12
323	0.1
324	0.08
325	0.1
326	0.09
327	0.12
328	0.13
329	0.15
330	0.14
331	0.14
332	0.14
333	0.13
334	0.16
335	0.14
336	0.16
337	0.17
338	0.19
339	0.2
340	0.2
341	0.19
342	0.17
343	0.16
344	0.14
345	0.14
346	0.11
347	0.09
348	0.08
349	0.09
350	0.07
351	0.08
352	0.07
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.06
361	0.09
362	0.12
363	0.15
364	0.24
365	0.34
366	0.44
367	0.54
368	0.65
369	0.74
370	0.81
371	0.89
372	0.9
373	0.89
374	0.87
375	0.84
376	0.74
377	0.71
378	0.63
379	0.54
380	0.51
381	0.42
382	0.39
383	0.33
384	0.31
385	0.27
386	0.29
387	0.3
388	0.27
389	0.31
390	0.28
391	0.28
392	0.31
393	0.3
394	0.3
395	0.29
396	0.28
397	0.3
398	0.3
399	0.34
400	0.3
401	0.28
402	0.23
403	0.2
404	0.18
405	0.11
406	0.1
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.1
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.18
417	0.28
418	0.3
419	0.31
420	0.28
421	0.28
422	0.3
423	0.34
424	0.3
425	0.19
426	0.18
427	0.17
428	0.15
429	0.16
430	0.18
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.16
435	0.16
436	0.17
437	0.17
438	0.13
439	0.18
440	0.24
441	0.29
442	0.31
443	0.35
444	0.4
445	0.43
446	0.48
447	0.51
448	0.49
449	0.51
450	0.51
451	0.51
452	0.48
453	0.49
454	0.45
455	0.41
456	0.38
457	0.33
458	0.31
459	0.28
460	0.26
461	0.22
462	0.2
463	0.17
464	0.17
465	0.15
466	0.15
467	0.19
468	0.21
469	0.25
470	0.26
471	0.34
472	0.41
473	0.48
474	0.55
475	0.55
476	0.59
477	0.62
478	0.65
479	0.63
480	0.62
481	0.59
482	0.52
483	0.46
484	0.39
485	0.33
486	0.28
487	0.21
488	0.16
489	0.14
490	0.18
491	0.19
492	0.19
493	0.18
494	0.18
495	0.2
496	0.19
497	0.18
498	0.14
499	0.15
500	0.14
501	0.18
502	0.23
503	0.25
504	0.27
505	0.3
506	0.33
507	0.4
508	0.44
509	0.49
510	0.54
511	0.57
512	0.64
513	0.68
514	0.73
515	0.7
516	0.75
517	0.68
518	0.64
519	0.57
520	0.51
521	0.45
522	0.41
523	0.36
524	0.27
525	0.25
526	0.2
527	0.19
528	0.17
529	0.17
530	0.11
531	0.12
532	0.17
533	0.19
534	0.24
535	0.25
536	0.24
537	0.29
538	0.32
539	0.38
540	0.34
541	0.33
542	0.3
543	0.33
544	0.33
545	0.29
546	0.31
547	0.29
548	0.28
549	0.29
550	0.3
551	0.3
552	0.29
553	0.35
554	0.33
555	0.34
556	0.34
557	0.32
558	0.31
559	0.36
560	0.37
561	0.31
562	0.29
563	0.29
564	0.28
565	0.31
566	0.3
567	0.22
568	0.23
569	0.24
570	0.23
571	0.19
572	0.21
573	0.18
574	0.25
575	0.28
576	0.26
577	0.24
578	0.25
579	0.23
580	0.2
581	0.2
582	0.15
583	0.17
584	0.18
585	0.23
586	0.24
587	0.26
588	0.28
589	0.35
590	0.36
591	0.35
592	0.42
593	0.42
594	0.49
595	0.54
596	0.6
597	0.6
598	0.65
599	0.7
600	0.67
601	0.67
602	0.63
603	0.64
604	0.62
605	0.57
606	0.55
607	0.52
608	0.48
609	0.45
610	0.46
611	0.4
612	0.36
613	0.39
614	0.36
615	0.32
616	0.3
617	0.32
618	0.29
619	0.31
620	0.29
621	0.25
622	0.28
623	0.29
624	0.33
625	0.29
626	0.3
627	0.29
628	0.32
629	0.35
630	0.33
631	0.33
632	0.3
633	0.32
634	0.34
635	0.37
636	0.36
637	0.38

A0A1V6PMY3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer