FuNGI

A0A1V6PCJ4

Protein Details

Accession

A0A1V6PCJ4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
406-438	PDVVLIKKNYARKKKPKNRAWRLRRMAREHEEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-432	KNYARKKKPKNRAWRLRRMA

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSMDLDTPVYMTGMQQEAAPIATILCCNCGAPIDGTTSAGALCQDCVRLTVDVSQGIQREATLHTCRDCERWLQPPNSWVVANPESKELLAICLRKLTGLNKVRIIDASFIWTEPHSRRVKVKITIQQEAFEGTIVQQTFEVEYVVANQQCTDCAKSYTHHSWRASLQVRQKVPHKRTFLYLEQLILKNGVHKDTLNIKEAKNGIDFYFAHRNQAEKMLDFLCSVAPCKYVKSSELISEDIHTAKKSYKFSFSVEIVPLCRDDIVALPIKLARQLGNISPLTICHRVGTAVNLMDPQTLQTAELPTGTYWRSPFKSLADVTELKEFIIMDIELVGKSNGRYHLAEATVARASDLGSNDTTYFTRTHLGGVLHVGDSCLGYHLTDTNFNDPNFDAIESSNQYKDQIPDVVLIKKNYARKKKPKNRAWRLRRMAREHEEEALAAASGAAQSRKQEQEQARLEADFEMFLRDVEEDQELRGTLDLYKNRNRPQKPGGDEMDEDSDSDDEVPKINMDELLDDFDELNMNEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.12
4	0.12
5	0.13
6	0.13
7	0.08
8	0.07
9	0.08
10	0.1
11	0.09
12	0.11
13	0.11
14	0.11
15	0.11
16	0.12
17	0.13
18	0.14
19	0.15
20	0.17
21	0.17
22	0.18
23	0.18
24	0.16
25	0.14
26	0.12
27	0.12
28	0.08
29	0.09
30	0.09
31	0.11
32	0.11
33	0.12
34	0.14
35	0.14
36	0.15
37	0.18
38	0.19
39	0.2
40	0.21
41	0.23
42	0.22
43	0.21
44	0.2
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.21
49	0.21
50	0.23
51	0.25
52	0.27
53	0.29
54	0.31
55	0.31
56	0.31
57	0.33
58	0.39
59	0.46
60	0.47
61	0.48
62	0.48
63	0.5
64	0.46
65	0.41
66	0.33
67	0.32
68	0.33
69	0.34
70	0.31
71	0.29
72	0.27
73	0.26
74	0.27
75	0.19
76	0.17
77	0.19
78	0.19
79	0.18
80	0.2
81	0.2
82	0.2
83	0.23
84	0.22
85	0.27
86	0.33
87	0.36
88	0.38
89	0.4
90	0.39
91	0.38
92	0.37
93	0.29
94	0.22
95	0.21
96	0.17
97	0.16
98	0.16
99	0.15
100	0.18
101	0.18
102	0.27
103	0.27
104	0.3
105	0.36
106	0.42
107	0.5
108	0.52
109	0.58
110	0.57
111	0.59
112	0.63
113	0.59
114	0.52
115	0.45
116	0.39
117	0.3
118	0.22
119	0.16
120	0.09
121	0.12
122	0.11
123	0.11
124	0.09
125	0.09
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.06
130	0.06
131	0.08
132	0.11
133	0.12
134	0.11
135	0.11
136	0.11
137	0.13
138	0.15
139	0.15
140	0.13
141	0.15
142	0.16
143	0.17
144	0.25
145	0.33
146	0.38
147	0.43
148	0.43
149	0.43
150	0.44
151	0.51
152	0.47
153	0.44
154	0.45
155	0.45
156	0.47
157	0.48
158	0.54
159	0.56
160	0.59
161	0.61
162	0.59
163	0.52
164	0.55
165	0.57
166	0.52
167	0.48
168	0.42
169	0.35
170	0.34
171	0.32
172	0.28
173	0.22
174	0.19
175	0.17
176	0.18
177	0.17
178	0.14
179	0.13
180	0.16
181	0.24
182	0.27
183	0.27
184	0.29
185	0.28
186	0.32
187	0.33
188	0.31
189	0.24
190	0.23
191	0.18
192	0.19
193	0.19
194	0.2
195	0.28
196	0.26
197	0.28
198	0.27
199	0.28
200	0.25
201	0.32
202	0.27
203	0.18
204	0.2
205	0.17
206	0.17
207	0.16
208	0.15
209	0.1
210	0.09
211	0.1
212	0.08
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.13
217	0.13
218	0.14
219	0.15
220	0.16
221	0.18
222	0.2
223	0.19
224	0.17
225	0.17
226	0.17
227	0.15
228	0.15
229	0.11
230	0.1
231	0.13
232	0.18
233	0.21
234	0.22
235	0.26
236	0.28
237	0.29
238	0.33
239	0.3
240	0.28
241	0.25
242	0.23
243	0.19
244	0.17
245	0.15
246	0.11
247	0.1
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.11
258	0.11
259	0.09
260	0.08
261	0.1
262	0.1
263	0.15
264	0.15
265	0.14
266	0.13
267	0.14
268	0.17
269	0.17
270	0.16
271	0.11
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.13
276	0.11
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.15
298	0.16
299	0.18
300	0.2
301	0.2
302	0.25
303	0.24
304	0.24
305	0.25
306	0.24
307	0.24
308	0.25
309	0.23
310	0.17
311	0.17
312	0.15
313	0.1
314	0.1
315	0.09
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.05
323	0.06
324	0.09
325	0.1
326	0.13
327	0.14
328	0.15
329	0.18
330	0.18
331	0.19
332	0.16
333	0.17
334	0.15
335	0.14
336	0.12
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.11
341	0.11
342	0.1
343	0.12
344	0.12
345	0.13
346	0.13
347	0.12
348	0.12
349	0.11
350	0.13
351	0.12
352	0.13
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.14
357	0.14
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.06
368	0.08
369	0.1
370	0.14
371	0.16
372	0.21
373	0.25
374	0.24
375	0.26
376	0.24
377	0.24
378	0.2
379	0.18
380	0.14
381	0.1
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.17
386	0.16
387	0.18
388	0.2
389	0.21
390	0.2
391	0.19
392	0.18
393	0.2
394	0.23
395	0.28
396	0.29
397	0.28
398	0.29
399	0.32
400	0.38
401	0.45
402	0.53
403	0.57
404	0.64
405	0.75
406	0.82
407	0.89
408	0.91
409	0.93
410	0.94
411	0.94
412	0.94
413	0.93
414	0.93
415	0.91
416	0.91
417	0.87
418	0.85
419	0.82
420	0.78
421	0.69
422	0.62
423	0.53
424	0.43
425	0.36
426	0.26
427	0.18
428	0.11
429	0.08
430	0.05
431	0.05
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.11
436	0.17
437	0.22
438	0.24
439	0.32
440	0.36
441	0.46
442	0.5
443	0.52
444	0.48
445	0.44
446	0.43
447	0.35
448	0.3
449	0.2
450	0.15
451	0.13
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.14
459	0.12
460	0.13
461	0.14
462	0.14
463	0.13
464	0.13
465	0.12
466	0.13
467	0.2
468	0.25
469	0.31
470	0.4
471	0.48
472	0.56
473	0.66
474	0.66
475	0.67
476	0.71
477	0.74
478	0.71
479	0.71
480	0.67
481	0.62
482	0.6
483	0.54
484	0.5
485	0.4
486	0.34
487	0.27
488	0.22
489	0.17
490	0.16
491	0.15
492	0.1
493	0.12
494	0.13
495	0.12
496	0.13
497	0.14
498	0.14
499	0.13
500	0.15
501	0.15
502	0.18
503	0.17
504	0.17
505	0.16
506	0.14
507	0.16

A0A1V6PCJ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer