Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6PDG4

Protein Details
Accession A0A1V6PDG4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-71FGTPKTPRNGVKPKKPTPKRIKEEASPPQPRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-77TPRNGVKPKKPTPKRIKEEASPPQPRRQSSRLK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 7, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
Amino Acid Sequences MVSESTHELSEFEKQRLANIAERDALLKQLNLKAQSNGIFGTPKTPRNGVKPKKPTPKRIKEEASPPQPRRQSSRLKGIAAESEVLKRKAEDDYEAAKEAERAKRMRRTDEFTQNDMFVAGQKLSGLSLVGVDVITKGVAEPYVRTFDDEDIKKTTDKDLKALREEMSGLRLWEAWGPQRIKITPERVYTMTFHPSESKPLIFAGDKMGHLGILDASQEKPATGDEEEDDDPDPVLTTLKPHTRTISSMMVHPSKPTHLYTASYDSSIRELDLEKTTSVEKYGPESKNIDEAISALDMAADDPHTLYWTTLNGGFGRYDTRTPLSENTVSTWQLSDKKIGGFTLCPSQSHYLSTASLDRFMKVWDLRNLSFDEPTPVAEHENRLSVSHAAFNAAGQIVTSSYDDTLKLYDLGAKGLSSWDKGHTLSEEFRPDTVVRHNCQTGRWVTILRPQWQLNPQSHIQRFCIGNMNRFVDIYSGSGDQLAQLGGDGITAVPAVAVFHRSKNWVAGGTASGKLCLWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.37
4 0.39
5 0.35
6 0.35
7 0.37
8 0.35
9 0.35
10 0.34
11 0.27
12 0.28
13 0.23
14 0.2
15 0.22
16 0.26
17 0.31
18 0.33
19 0.35
20 0.33
21 0.37
22 0.38
23 0.34
24 0.29
25 0.26
26 0.24
27 0.21
28 0.27
29 0.28
30 0.3
31 0.33
32 0.39
33 0.42
34 0.5
35 0.61
36 0.63
37 0.68
38 0.74
39 0.8
40 0.85
41 0.9
42 0.91
43 0.91
44 0.92
45 0.9
46 0.89
47 0.86
48 0.82
49 0.83
50 0.82
51 0.82
52 0.81
53 0.77
54 0.76
55 0.75
56 0.71
57 0.69
58 0.67
59 0.68
60 0.66
61 0.72
62 0.69
63 0.64
64 0.62
65 0.56
66 0.52
67 0.42
68 0.36
69 0.26
70 0.27
71 0.3
72 0.29
73 0.27
74 0.24
75 0.24
76 0.26
77 0.27
78 0.24
79 0.24
80 0.28
81 0.3
82 0.31
83 0.3
84 0.26
85 0.27
86 0.29
87 0.3
88 0.31
89 0.33
90 0.39
91 0.48
92 0.53
93 0.59
94 0.6
95 0.61
96 0.64
97 0.7
98 0.68
99 0.62
100 0.59
101 0.5
102 0.44
103 0.36
104 0.27
105 0.18
106 0.15
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.06
114 0.04
115 0.05
116 0.04
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.14
131 0.14
132 0.16
133 0.17
134 0.19
135 0.27
136 0.27
137 0.27
138 0.26
139 0.28
140 0.28
141 0.27
142 0.32
143 0.3
144 0.3
145 0.34
146 0.37
147 0.41
148 0.43
149 0.44
150 0.38
151 0.32
152 0.33
153 0.27
154 0.22
155 0.18
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.2
164 0.21
165 0.22
166 0.26
167 0.26
168 0.28
169 0.33
170 0.35
171 0.35
172 0.36
173 0.37
174 0.35
175 0.36
176 0.34
177 0.31
178 0.3
179 0.24
180 0.23
181 0.23
182 0.23
183 0.26
184 0.25
185 0.22
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.06
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.1
226 0.15
227 0.18
228 0.19
229 0.21
230 0.22
231 0.24
232 0.26
233 0.28
234 0.23
235 0.23
236 0.26
237 0.26
238 0.25
239 0.24
240 0.21
241 0.17
242 0.19
243 0.17
244 0.15
245 0.14
246 0.16
247 0.17
248 0.21
249 0.2
250 0.18
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.11
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.13
269 0.21
270 0.21
271 0.23
272 0.25
273 0.24
274 0.27
275 0.27
276 0.22
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.09
281 0.09
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.11
304 0.12
305 0.11
306 0.13
307 0.14
308 0.15
309 0.17
310 0.18
311 0.21
312 0.22
313 0.21
314 0.22
315 0.22
316 0.22
317 0.2
318 0.19
319 0.16
320 0.19
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.2
325 0.2
326 0.2
327 0.18
328 0.15
329 0.15
330 0.2
331 0.19
332 0.18
333 0.21
334 0.24
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.17
339 0.17
340 0.19
341 0.19
342 0.17
343 0.21
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.21
349 0.19
350 0.25
351 0.26
352 0.31
353 0.31
354 0.33
355 0.35
356 0.31
357 0.3
358 0.24
359 0.22
360 0.17
361 0.18
362 0.17
363 0.15
364 0.17
365 0.17
366 0.2
367 0.17
368 0.19
369 0.19
370 0.18
371 0.19
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.11
381 0.1
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.11
401 0.11
402 0.14
403 0.15
404 0.13
405 0.14
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.2
410 0.19
411 0.21
412 0.23
413 0.27
414 0.3
415 0.29
416 0.28
417 0.3
418 0.28
419 0.27
420 0.33
421 0.35
422 0.32
423 0.37
424 0.42
425 0.4
426 0.41
427 0.45
428 0.38
429 0.35
430 0.34
431 0.3
432 0.28
433 0.35
434 0.4
435 0.38
436 0.41
437 0.39
438 0.44
439 0.49
440 0.53
441 0.49
442 0.48
443 0.49
444 0.53
445 0.56
446 0.53
447 0.49
448 0.48
449 0.45
450 0.42
451 0.47
452 0.39
453 0.41
454 0.44
455 0.45
456 0.4
457 0.38
458 0.36
459 0.28
460 0.25
461 0.2
462 0.16
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.09
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.04
480 0.03
481 0.04
482 0.05
483 0.06
484 0.11
485 0.12
486 0.16
487 0.19
488 0.23
489 0.25
490 0.29
491 0.31
492 0.29
493 0.28
494 0.27
495 0.27
496 0.27
497 0.29
498 0.25
499 0.22