Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6RTN5

Protein Details
Accession A0A1V6RTN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-37DAYFSRFQTKYRRRREGKTDYYARKRLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-297PKKTKEEWKAESKKYKVARLTHAERKARVEEKIRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005485  Rbsml_L5_euk/L18_arc  
IPR025607  Rbsml_L5e_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF14204  Ribosomal_L18_c  
PF17144  Ribosomal_L5e  
CDD cd00432  Ribosomal_L18_L5e  
Amino Acid Sequences MPFTKNPKNDAYFSRFQTKYRRRREGKTDYYARKRLITQAKNKYNAPKYRMVVRFTNRDIVTQIVYSEVTGDKVLAAAYAHELPKYGIDQGLTNWAAAYATGLLLARRVLKKLNLDEQFKGVEEATGEHTLTEAIETDDGERRPFKAFLDVGLVRTSTGNRVFAAMKGASDGGIFIPHSDRRFPGYDIESEELDAETLKNYIHGSHVSEYMENLADEDEERYKSQFIKYIENEIDAGDLEEIYADAHKAIREDPFKADEDAGPKKTKEEWKAESKKYKVARLTHAERKARVEEKIRKLASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.55
3 0.55
4 0.61
5 0.64
6 0.66
7 0.7
8 0.76
9 0.73
10 0.81
11 0.88
12 0.87
13 0.86
14 0.86
15 0.85
16 0.85
17 0.87
18 0.84
19 0.76
20 0.7
21 0.62
22 0.61
23 0.62
24 0.61
25 0.62
26 0.66
27 0.72
28 0.72
29 0.75
30 0.75
31 0.74
32 0.73
33 0.68
34 0.66
35 0.6
36 0.65
37 0.66
38 0.61
39 0.6
40 0.58
41 0.6
42 0.54
43 0.59
44 0.5
45 0.45
46 0.42
47 0.36
48 0.31
49 0.23
50 0.2
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.11
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.1
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.18
98 0.24
99 0.28
100 0.36
101 0.37
102 0.39
103 0.39
104 0.39
105 0.36
106 0.3
107 0.27
108 0.18
109 0.12
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.06
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.21
137 0.2
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.15
152 0.12
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.17
169 0.19
170 0.2
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.24
175 0.25
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.09
191 0.12
192 0.13
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.11
200 0.09
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.14
210 0.16
211 0.18
212 0.22
213 0.22
214 0.3
215 0.31
216 0.37
217 0.36
218 0.35
219 0.34
220 0.28
221 0.25
222 0.16
223 0.15
224 0.08
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.17
238 0.2
239 0.22
240 0.26
241 0.28
242 0.29
243 0.3
244 0.3
245 0.26
246 0.29
247 0.34
248 0.34
249 0.35
250 0.33
251 0.34
252 0.4
253 0.46
254 0.48
255 0.5
256 0.53
257 0.6
258 0.7
259 0.77
260 0.79
261 0.74
262 0.74
263 0.72
264 0.73
265 0.69
266 0.67
267 0.67
268 0.67
269 0.72
270 0.73
271 0.76
272 0.74
273 0.7
274 0.69
275 0.68
276 0.63
277 0.61
278 0.62
279 0.63
280 0.65
281 0.72