Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6RHE4

Protein Details
Accession A0A1V6RHE4    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-131KANANAKTGKPKPKPRARTRRSLIAHHydrophilic
308-330EKEARAVLKKKEKRVRKASAAMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-126RPRAKANANAKTGKPKPKPRARTRR
311-325ARAVLKKKEKRVRKA
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026850  FANCL_C  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF11793  FANCL_C  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MEDSEKPKPIPAYYCCYLLRSTVRHASLYIGSTPNPIRRLPQHNGVAKGGAKRTARDKLRPWEMTLVVEGFTSRVGALQFEWAWQHPERSRHLDSEDDLDPRPRAKANANAKTGKPKPKPRARTRRSLIAHLEDFNSLLRSTYFSSWPLRVRFFCRDVYRVWRAWNDRVDGHLPDNIKVILDGDNLATVPDAKQDNELAPVGSINNLTIDYTRLEDYLEKSMFMLEDPEDLQCTVCQASISPDEEQIVVCPHPNCRGTSHLLCLSTKFLDATNEPDLLVPTQGTCPLCSNTVQWVKMMRELSLRNIAEKEARAVLKKKEKRVRKASAAMEASSGPRSSSIEPRSLLEEPTQDDLGPNWFEGVDIESDSDFESRQKHRSTQPPSKLEIVIEDSDWDDAELIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.44
3 0.43
4 0.39
5 0.37
6 0.39
7 0.35
8 0.4
9 0.42
10 0.43
11 0.42
12 0.42
13 0.39
14 0.35
15 0.34
16 0.31
17 0.24
18 0.23
19 0.27
20 0.31
21 0.33
22 0.33
23 0.32
24 0.34
25 0.41
26 0.48
27 0.49
28 0.54
29 0.57
30 0.61
31 0.64
32 0.59
33 0.54
34 0.49
35 0.48
36 0.42
37 0.4
38 0.35
39 0.35
40 0.41
41 0.47
42 0.51
43 0.53
44 0.6
45 0.62
46 0.71
47 0.69
48 0.66
49 0.63
50 0.57
51 0.5
52 0.43
53 0.34
54 0.24
55 0.21
56 0.17
57 0.11
58 0.09
59 0.08
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.14
70 0.18
71 0.19
72 0.25
73 0.25
74 0.31
75 0.36
76 0.42
77 0.45
78 0.43
79 0.45
80 0.41
81 0.38
82 0.37
83 0.33
84 0.28
85 0.25
86 0.25
87 0.24
88 0.22
89 0.23
90 0.2
91 0.2
92 0.23
93 0.32
94 0.4
95 0.47
96 0.52
97 0.54
98 0.54
99 0.61
100 0.63
101 0.64
102 0.63
103 0.65
104 0.69
105 0.76
106 0.85
107 0.86
108 0.9
109 0.85
110 0.87
111 0.82
112 0.82
113 0.75
114 0.71
115 0.65
116 0.59
117 0.55
118 0.46
119 0.41
120 0.31
121 0.28
122 0.21
123 0.17
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.14
131 0.15
132 0.18
133 0.22
134 0.27
135 0.28
136 0.29
137 0.3
138 0.34
139 0.38
140 0.38
141 0.41
142 0.39
143 0.38
144 0.37
145 0.42
146 0.41
147 0.37
148 0.37
149 0.37
150 0.38
151 0.41
152 0.42
153 0.37
154 0.32
155 0.33
156 0.32
157 0.27
158 0.24
159 0.21
160 0.18
161 0.16
162 0.17
163 0.14
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.12
184 0.12
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.09
226 0.11
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.18
240 0.19
241 0.2
242 0.21
243 0.25
244 0.29
245 0.3
246 0.33
247 0.3
248 0.3
249 0.29
250 0.28
251 0.26
252 0.2
253 0.18
254 0.14
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.17
259 0.17
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.14
265 0.14
266 0.09
267 0.07
268 0.08
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.15
274 0.17
275 0.17
276 0.18
277 0.23
278 0.28
279 0.27
280 0.26
281 0.3
282 0.3
283 0.34
284 0.33
285 0.26
286 0.26
287 0.27
288 0.3
289 0.33
290 0.32
291 0.29
292 0.29
293 0.3
294 0.28
295 0.27
296 0.25
297 0.22
298 0.23
299 0.26
300 0.3
301 0.38
302 0.45
303 0.52
304 0.59
305 0.64
306 0.72
307 0.78
308 0.83
309 0.84
310 0.82
311 0.84
312 0.78
313 0.77
314 0.7
315 0.6
316 0.5
317 0.42
318 0.34
319 0.28
320 0.23
321 0.14
322 0.13
323 0.15
324 0.17
325 0.25
326 0.27
327 0.31
328 0.32
329 0.33
330 0.37
331 0.36
332 0.34
333 0.28
334 0.27
335 0.25
336 0.28
337 0.27
338 0.21
339 0.21
340 0.2
341 0.21
342 0.19
343 0.16
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.12
355 0.11
356 0.1
357 0.12
358 0.18
359 0.22
360 0.3
361 0.35
362 0.41
363 0.49
364 0.59
365 0.67
366 0.71
367 0.76
368 0.75
369 0.74
370 0.72
371 0.64
372 0.55
373 0.49
374 0.44
375 0.35
376 0.29
377 0.26
378 0.21
379 0.2
380 0.19
381 0.15