Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SC20

Protein Details
Accession A0A1V6SC20    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
437-456FTPPTRPQHRRQRSSIQLSGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MSSQNSFDNASPSSSTPSASTTSTSTIRSRPRRLVSFMDDEADSNNVTNSYQDDPHPFPSRLSTTLALSERGASRSRGATPSPLSSRGASPLPMQHPSRTTESINRGTRSGLTSFPWSGPPKASSSGGAADFLDSSWSSLQSLASSVLGSDAGRVPPNSATNTHTRRKPSRSDVYIKNAPRSTWGPSAPTAPQFGTGTKEERQALVQAKKREALLLADSDPIASRTLPHKRRDSGDISYQAFDPEHDEDALAYIHKVQPTDTITGVTIKYGCQAAVFRKANGFWPNDNIQSRNTVLLPVDACSVKGRPVPKEPVDLLSNNDEDPSDSSITPMAASTDDASTEQDTTATTSGADENHAWKHESWVYMDGFPGPVQIGRVPRRALGFFPRTRRKSISYSDAEPPDFYRETITPPSPTGSPPPPSSFGILPRTRPNGDQFTPPTRPQHRRQRSSIQLSGTGVGTLDPTSTGPGPALDGFTRFFAQHMPNLAPAQPLDNARKASFDSTYTVTSNASTGLENIGGAFEGWVRKVATRAKAGINELQQGSLTQQGSSRGRNMWRMDDLIELDDGMVDGRNSPSPLKGASRRSELQVTSSSSSSNRYNSPSVVAASRSRATGFGSGSGSSAYGDRVKDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.23
5 0.23
6 0.22
7 0.23
8 0.19
9 0.23
10 0.25
11 0.27
12 0.29
13 0.34
14 0.43
15 0.51
16 0.57
17 0.62
18 0.68
19 0.71
20 0.72
21 0.72
22 0.69
23 0.66
24 0.59
25 0.52
26 0.44
27 0.37
28 0.33
29 0.27
30 0.2
31 0.13
32 0.12
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.12
37 0.14
38 0.16
39 0.19
40 0.25
41 0.28
42 0.35
43 0.41
44 0.39
45 0.36
46 0.41
47 0.42
48 0.38
49 0.39
50 0.34
51 0.29
52 0.35
53 0.35
54 0.3
55 0.26
56 0.27
57 0.25
58 0.26
59 0.26
60 0.21
61 0.23
62 0.25
63 0.29
64 0.29
65 0.28
66 0.32
67 0.34
68 0.4
69 0.4
70 0.39
71 0.38
72 0.36
73 0.35
74 0.33
75 0.31
76 0.25
77 0.24
78 0.29
79 0.3
80 0.35
81 0.36
82 0.36
83 0.37
84 0.4
85 0.43
86 0.39
87 0.39
88 0.4
89 0.46
90 0.51
91 0.54
92 0.51
93 0.46
94 0.44
95 0.42
96 0.38
97 0.32
98 0.25
99 0.21
100 0.24
101 0.25
102 0.25
103 0.29
104 0.29
105 0.29
106 0.3
107 0.3
108 0.29
109 0.3
110 0.3
111 0.25
112 0.24
113 0.26
114 0.23
115 0.21
116 0.18
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.12
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.16
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.22
148 0.29
149 0.36
150 0.42
151 0.44
152 0.5
153 0.56
154 0.61
155 0.66
156 0.66
157 0.69
158 0.7
159 0.72
160 0.71
161 0.71
162 0.72
163 0.66
164 0.64
165 0.56
166 0.48
167 0.45
168 0.4
169 0.37
170 0.35
171 0.33
172 0.29
173 0.28
174 0.31
175 0.29
176 0.28
177 0.25
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.18
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.2
186 0.25
187 0.23
188 0.23
189 0.23
190 0.24
191 0.3
192 0.34
193 0.38
194 0.38
195 0.39
196 0.4
197 0.39
198 0.35
199 0.29
200 0.23
201 0.2
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.09
210 0.07
211 0.08
212 0.15
213 0.25
214 0.32
215 0.38
216 0.45
217 0.48
218 0.51
219 0.55
220 0.53
221 0.47
222 0.48
223 0.46
224 0.41
225 0.38
226 0.35
227 0.3
228 0.25
229 0.2
230 0.16
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.14
251 0.16
252 0.15
253 0.12
254 0.1
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.09
261 0.11
262 0.21
263 0.22
264 0.21
265 0.22
266 0.22
267 0.26
268 0.29
269 0.29
270 0.2
271 0.24
272 0.26
273 0.29
274 0.3
275 0.26
276 0.22
277 0.22
278 0.22
279 0.19
280 0.17
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.12
293 0.15
294 0.16
295 0.22
296 0.28
297 0.28
298 0.32
299 0.31
300 0.31
301 0.31
302 0.28
303 0.24
304 0.2
305 0.19
306 0.15
307 0.14
308 0.11
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.08
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.07
341 0.09
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.12
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.16
350 0.18
351 0.18
352 0.17
353 0.17
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.09
362 0.15
363 0.19
364 0.23
365 0.23
366 0.25
367 0.27
368 0.27
369 0.27
370 0.28
371 0.33
372 0.34
373 0.43
374 0.51
375 0.51
376 0.55
377 0.56
378 0.53
379 0.52
380 0.52
381 0.51
382 0.45
383 0.47
384 0.48
385 0.47
386 0.42
387 0.36
388 0.32
389 0.28
390 0.24
391 0.2
392 0.17
393 0.15
394 0.19
395 0.23
396 0.24
397 0.2
398 0.21
399 0.22
400 0.2
401 0.21
402 0.22
403 0.22
404 0.25
405 0.27
406 0.29
407 0.31
408 0.31
409 0.32
410 0.29
411 0.29
412 0.34
413 0.33
414 0.33
415 0.35
416 0.39
417 0.38
418 0.39
419 0.39
420 0.38
421 0.38
422 0.41
423 0.4
424 0.42
425 0.46
426 0.46
427 0.49
428 0.51
429 0.57
430 0.6
431 0.66
432 0.7
433 0.73
434 0.77
435 0.79
436 0.79
437 0.8
438 0.75
439 0.66
440 0.58
441 0.51
442 0.45
443 0.35
444 0.25
445 0.16
446 0.12
447 0.1
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.13
464 0.14
465 0.12
466 0.12
467 0.14
468 0.16
469 0.18
470 0.21
471 0.2
472 0.22
473 0.23
474 0.24
475 0.2
476 0.18
477 0.17
478 0.17
479 0.2
480 0.22
481 0.25
482 0.27
483 0.26
484 0.28
485 0.27
486 0.27
487 0.25
488 0.22
489 0.21
490 0.2
491 0.23
492 0.22
493 0.21
494 0.18
495 0.17
496 0.15
497 0.13
498 0.11
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.08
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.18
516 0.25
517 0.29
518 0.33
519 0.36
520 0.38
521 0.41
522 0.44
523 0.44
524 0.41
525 0.4
526 0.36
527 0.32
528 0.27
529 0.24
530 0.22
531 0.22
532 0.19
533 0.14
534 0.16
535 0.23
536 0.27
537 0.29
538 0.32
539 0.32
540 0.36
541 0.43
542 0.45
543 0.43
544 0.43
545 0.42
546 0.39
547 0.36
548 0.33
549 0.27
550 0.23
551 0.17
552 0.13
553 0.11
554 0.1
555 0.07
556 0.07
557 0.05
558 0.07
559 0.09
560 0.11
561 0.13
562 0.15
563 0.16
564 0.18
565 0.22
566 0.28
567 0.34
568 0.41
569 0.45
570 0.51
571 0.52
572 0.55
573 0.58
574 0.51
575 0.47
576 0.44
577 0.43
578 0.38
579 0.36
580 0.32
581 0.27
582 0.31
583 0.31
584 0.3
585 0.29
586 0.32
587 0.34
588 0.34
589 0.37
590 0.34
591 0.33
592 0.31
593 0.3
594 0.28
595 0.31
596 0.31
597 0.28
598 0.27
599 0.25
600 0.25
601 0.26
602 0.24
603 0.23
604 0.23
605 0.22
606 0.22
607 0.21
608 0.18
609 0.14
610 0.13
611 0.13
612 0.15