Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4F067

Protein Details
Accession A0A0C4F067    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-127GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
449-453LARKR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 9, mito 3, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKVVEQVIEDVPAQNAVEGGTEEVPIDMSQRNPNGIEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKKPPETEAEMMIEVFKYTERVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKVKEEEKQALIEEYIQQGKELPEDYKTNKKAWDSNAITPGTPFMTLLTESLRYWIVYKMNTDKGWSQIQVILSDASVPGEGEHKIMDFVRRQRTQPSYDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFADQKKGKGCYTCGQLGHHSSQCQGKPKEKVDEHDTQQKPVERKPFIFLDVGILREYLAIELNIGGLPFPFDLERAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKTNLGRMGGFLTDCGALNLKRTEIILEGLAAREDEIFRRRREAEERQDQSAKRLSTSLPPMKATPNPQLAPKAKLLARKRRIYYSRARRHQLIYDETANMDAAAMLKAELSGTLELPTPAASGDNAVTPMETLDVTKPTSNVLLQAQDSSDVIQPVPTTSQGKPSDSVNDGSADATNANDSCHEPVTGPPNADTDPTIKPNTPGQKRKADELESADPEIGATEDSAVLSEDDDEDEAPGDVSVFVPGEPSRPAPLKMLGNNMVEQDDTVKLWEPGYRERYFRQKFGIELNDEVEKRKIVKHYVEGLAWVLAYYYQGCQSWQWFYPYHYSPFASDFTNLQEFEIKFDLGQPFKPYEQLMGVFPAASRCHIPEVYHELMMNDDSPIKDFYPEDFEIDMNGKKMLWQGIALLPFIEQDRLLNNMKDCENNLKAEDKIRNEPGHVVMFCGEAHPQYENFCKIYQKRDNKEAVTLDPAHANGVFGSALPDPDCIPGSTFYSPLPTVGLPDISNDKSIFARFFVPSQLVPHRSLLLSGVTLERPTLNNHDRDLTRRGGNQAHGGNQHYGNDGFHQQRRDFGDGPGIMTHYPNHNSNSGGGGGYWNSNRGPGNHSQYQQPPHQGYANDYRNPGPPATNHRGYANGPAHHHPNSYPQGGHYAQRAQHALPTSFGSTNARGGGGYRPPYGAPQPAYYNAPMNHNNGGHVPPVRYGGTGVGGLPQHTPAASFPNPYPPPTQSATHYSRAGYRPPGITPAVTRTVPNYPPRAAQQPSRPPYNHSSGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.68
4 0.7
5 0.66
6 0.61
7 0.58
8 0.5
9 0.43
10 0.38
11 0.3
12 0.24
13 0.2
14 0.15
15 0.1
16 0.1
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.14
30 0.21
31 0.24
32 0.26
33 0.27
34 0.28
35 0.3
36 0.29
37 0.29
38 0.25
39 0.24
40 0.23
41 0.22
42 0.22
43 0.17
44 0.16
45 0.13
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.13
53 0.17
54 0.23
55 0.25
56 0.32
57 0.42
58 0.49
59 0.57
60 0.56
61 0.57
62 0.57
63 0.59
64 0.53
65 0.47
66 0.42
67 0.34
68 0.32
69 0.27
70 0.2
71 0.15
72 0.13
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.13
77 0.14
78 0.17
79 0.2
80 0.28
81 0.37
82 0.44
83 0.47
84 0.45
85 0.46
86 0.45
87 0.44
88 0.39
89 0.32
90 0.29
91 0.27
92 0.25
93 0.24
94 0.21
95 0.21
96 0.18
97 0.15
98 0.1
99 0.13
100 0.19
101 0.26
102 0.37
103 0.46
104 0.55
105 0.66
106 0.74
107 0.8
108 0.81
109 0.78
110 0.74
111 0.76
112 0.75
113 0.73
114 0.75
115 0.7
116 0.65
117 0.67
118 0.61
119 0.53
120 0.52
121 0.47
122 0.38
123 0.35
124 0.33
125 0.28
126 0.28
127 0.25
128 0.2
129 0.2
130 0.21
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.2
136 0.2
137 0.17
138 0.18
139 0.23
140 0.29
141 0.36
142 0.39
143 0.4
144 0.43
145 0.47
146 0.5
147 0.49
148 0.55
149 0.5
150 0.54
151 0.57
152 0.52
153 0.47
154 0.41
155 0.37
156 0.28
157 0.22
158 0.15
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.14
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.24
174 0.29
175 0.34
176 0.35
177 0.37
178 0.35
179 0.35
180 0.38
181 0.34
182 0.29
183 0.26
184 0.27
185 0.24
186 0.23
187 0.19
188 0.14
189 0.13
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.16
203 0.2
204 0.28
205 0.37
206 0.4
207 0.42
208 0.49
209 0.54
210 0.56
211 0.57
212 0.59
213 0.59
214 0.64
215 0.65
216 0.6
217 0.6
218 0.54
219 0.46
220 0.38
221 0.31
222 0.23
223 0.23
224 0.2
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.04
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.16
241 0.17
242 0.2
243 0.24
244 0.26
245 0.27
246 0.28
247 0.27
248 0.35
249 0.35
250 0.35
251 0.33
252 0.34
253 0.35
254 0.35
255 0.35
256 0.29
257 0.32
258 0.34
259 0.38
260 0.4
261 0.38
262 0.38
263 0.39
264 0.4
265 0.41
266 0.37
267 0.32
268 0.3
269 0.35
270 0.36
271 0.41
272 0.41
273 0.43
274 0.49
275 0.54
276 0.61
277 0.57
278 0.59
279 0.57
280 0.6
281 0.57
282 0.6
283 0.55
284 0.48
285 0.5
286 0.49
287 0.46
288 0.44
289 0.48
290 0.42
291 0.43
292 0.45
293 0.42
294 0.39
295 0.36
296 0.3
297 0.27
298 0.24
299 0.23
300 0.19
301 0.16
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.03
337 0.04
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.07
354 0.06
355 0.08
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.16
361 0.17
362 0.21
363 0.23
364 0.24
365 0.24
366 0.24
367 0.25
368 0.19
369 0.17
370 0.14
371 0.1
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.08
377 0.11
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.11
384 0.12
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.08
395 0.14
396 0.19
397 0.2
398 0.25
399 0.26
400 0.31
401 0.38
402 0.45
403 0.49
404 0.54
405 0.57
406 0.56
407 0.6
408 0.56
409 0.52
410 0.48
411 0.39
412 0.29
413 0.27
414 0.24
415 0.24
416 0.33
417 0.35
418 0.31
419 0.32
420 0.32
421 0.34
422 0.36
423 0.35
424 0.33
425 0.34
426 0.33
427 0.34
428 0.4
429 0.39
430 0.39
431 0.36
432 0.34
433 0.3
434 0.37
435 0.43
436 0.47
437 0.53
438 0.57
439 0.58
440 0.63
441 0.65
442 0.63
443 0.65
444 0.65
445 0.67
446 0.68
447 0.69
448 0.63
449 0.62
450 0.61
451 0.56
452 0.49
453 0.42
454 0.36
455 0.32
456 0.29
457 0.26
458 0.2
459 0.15
460 0.1
461 0.06
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.1
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.1
505 0.11
506 0.1
507 0.1
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.11
519 0.11
520 0.2
521 0.21
522 0.22
523 0.23
524 0.23
525 0.25
526 0.23
527 0.24
528 0.16
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.12
533 0.09
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.1
546 0.14
547 0.15
548 0.15
549 0.14
550 0.15
551 0.15
552 0.15
553 0.14
554 0.12
555 0.13
556 0.15
557 0.16
558 0.15
559 0.16
560 0.21
561 0.3
562 0.35
563 0.41
564 0.43
565 0.51
566 0.51
567 0.55
568 0.54
569 0.47
570 0.42
571 0.4
572 0.38
573 0.3
574 0.29
575 0.25
576 0.2
577 0.17
578 0.14
579 0.08
580 0.04
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.03
599 0.04
600 0.03
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.05
606 0.05
607 0.06
608 0.07
609 0.08
610 0.1
611 0.12
612 0.13
613 0.14
614 0.17
615 0.19
616 0.2
617 0.24
618 0.25
619 0.25
620 0.24
621 0.23
622 0.19
623 0.16
624 0.14
625 0.11
626 0.08
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.08
632 0.1
633 0.11
634 0.16
635 0.23
636 0.24
637 0.26
638 0.29
639 0.39
640 0.4
641 0.4
642 0.38
643 0.33
644 0.33
645 0.36
646 0.37
647 0.28
648 0.26
649 0.25
650 0.24
651 0.23
652 0.23
653 0.19
654 0.15
655 0.15
656 0.17
657 0.19
658 0.2
659 0.24
660 0.27
661 0.32
662 0.33
663 0.32
664 0.29
665 0.26
666 0.21
667 0.17
668 0.12
669 0.06
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.08
678 0.1
679 0.13
680 0.14
681 0.16
682 0.16
683 0.18
684 0.24
685 0.26
686 0.27
687 0.25
688 0.25
689 0.23
690 0.24
691 0.23
692 0.18
693 0.16
694 0.14
695 0.15
696 0.17
697 0.16
698 0.14
699 0.18
700 0.17
701 0.18
702 0.19
703 0.16
704 0.13
705 0.17
706 0.2
707 0.16
708 0.17
709 0.17
710 0.18
711 0.19
712 0.2
713 0.17
714 0.15
715 0.16
716 0.15
717 0.13
718 0.13
719 0.12
720 0.11
721 0.1
722 0.12
723 0.1
724 0.1
725 0.11
726 0.1
727 0.13
728 0.14
729 0.14
730 0.16
731 0.23
732 0.24
733 0.24
734 0.23
735 0.2
736 0.19
737 0.19
738 0.15
739 0.08
740 0.08
741 0.07
742 0.09
743 0.1
744 0.1
745 0.11
746 0.11
747 0.12
748 0.18
749 0.18
750 0.18
751 0.18
752 0.17
753 0.17
754 0.19
755 0.18
756 0.12
757 0.12
758 0.09
759 0.1
760 0.12
761 0.13
762 0.11
763 0.1
764 0.11
765 0.14
766 0.15
767 0.14
768 0.12
769 0.1
770 0.1
771 0.11
772 0.09
773 0.06
774 0.06
775 0.07
776 0.12
777 0.14
778 0.15
779 0.16
780 0.19
781 0.2
782 0.21
783 0.22
784 0.25
785 0.25
786 0.24
787 0.25
788 0.24
789 0.24
790 0.29
791 0.33
792 0.3
793 0.34
794 0.38
795 0.37
796 0.36
797 0.37
798 0.34
799 0.33
800 0.28
801 0.23
802 0.18
803 0.18
804 0.16
805 0.15
806 0.12
807 0.08
808 0.09
809 0.1
810 0.1
811 0.12
812 0.16
813 0.18
814 0.19
815 0.2
816 0.26
817 0.28
818 0.38
819 0.45
820 0.51
821 0.55
822 0.62
823 0.66
824 0.61
825 0.63
826 0.55
827 0.47
828 0.43
829 0.37
830 0.3
831 0.25
832 0.23
833 0.19
834 0.16
835 0.14
836 0.08
837 0.08
838 0.07
839 0.06
840 0.08
841 0.07
842 0.08
843 0.08
844 0.09
845 0.09
846 0.11
847 0.12
848 0.1
849 0.11
850 0.12
851 0.15
852 0.15
853 0.16
854 0.14
855 0.17
856 0.17
857 0.16
858 0.16
859 0.12
860 0.13
861 0.13
862 0.15
863 0.11
864 0.13
865 0.17
866 0.16
867 0.18
868 0.17
869 0.17
870 0.17
871 0.18
872 0.17
873 0.14
874 0.17
875 0.16
876 0.17
877 0.17
878 0.18
879 0.17
880 0.22
881 0.27
882 0.27
883 0.28
884 0.29
885 0.28
886 0.26
887 0.26
888 0.22
889 0.16
890 0.13
891 0.12
892 0.12
893 0.11
894 0.11
895 0.11
896 0.11
897 0.11
898 0.15
899 0.22
900 0.26
901 0.29
902 0.3
903 0.36
904 0.36
905 0.4
906 0.41
907 0.37
908 0.35
909 0.36
910 0.39
911 0.37
912 0.38
913 0.4
914 0.38
915 0.38
916 0.37
917 0.36
918 0.35
919 0.32
920 0.3
921 0.26
922 0.24
923 0.2
924 0.19
925 0.23
926 0.25
927 0.28
928 0.33
929 0.31
930 0.36
931 0.41
932 0.44
933 0.4
934 0.35
935 0.39
936 0.33
937 0.35
938 0.29
939 0.25
940 0.2
941 0.19
942 0.2
943 0.18
944 0.21
945 0.23
946 0.25
947 0.25
948 0.26
949 0.26
950 0.26
951 0.21
952 0.18
953 0.15
954 0.13
955 0.12
956 0.15
957 0.14
958 0.14
959 0.14
960 0.17
961 0.18
962 0.19
963 0.24
964 0.28
965 0.36
966 0.4
967 0.42
968 0.45
969 0.5
970 0.54
971 0.55
972 0.55
973 0.49
974 0.46
975 0.49
976 0.43
977 0.42
978 0.46
979 0.48
980 0.43
981 0.43
982 0.42
983 0.42
984 0.44
985 0.4
986 0.32
987 0.3
988 0.37
989 0.43
990 0.45
991 0.42
992 0.41
993 0.43
994 0.41
995 0.45
996 0.42
997 0.38
998 0.37
999 0.4
1000 0.44
1001 0.43
1002 0.43
1003 0.35
1004 0.37
1005 0.39
1006 0.39
1007 0.35
1008 0.31
1009 0.36
1010 0.36
1011 0.37
1012 0.33
1013 0.33
1014 0.32
1015 0.37
1016 0.38
1017 0.32
1018 0.34
1019 0.37
1020 0.33
1021 0.28
1022 0.29
1023 0.27
1024 0.25
1025 0.26
1026 0.26
1027 0.22
1028 0.24
1029 0.23
1030 0.2
1031 0.17
1032 0.18
1033 0.22
1034 0.25
1035 0.27
1036 0.26
1037 0.27
1038 0.27
1039 0.32
1040 0.34
1041 0.35
1042 0.31
1043 0.31
1044 0.34
1045 0.36
1046 0.39
1047 0.36
1048 0.39
1049 0.34
1050 0.38
1051 0.38
1052 0.38
1053 0.4
1054 0.37
1055 0.37
1056 0.32
1057 0.32
1058 0.3
1059 0.29
1060 0.27
1061 0.23
1062 0.26
1063 0.25
1064 0.23
1065 0.22
1066 0.19
1067 0.18
1068 0.17
1069 0.15
1070 0.15
1071 0.15
1072 0.15
1073 0.15
1074 0.15
1075 0.13
1076 0.13
1077 0.14
1078 0.11
1079 0.18
1080 0.19
1081 0.22
1082 0.22
1083 0.32
1084 0.34
1085 0.36
1086 0.4
1087 0.35
1088 0.39
1089 0.39
1090 0.41
1091 0.35
1092 0.42
1093 0.45
1094 0.46
1095 0.45
1096 0.41
1097 0.45
1098 0.46
1099 0.47
1100 0.44
1101 0.44
1102 0.41
1103 0.41
1104 0.44
1105 0.39
1106 0.37
1107 0.35
1108 0.34
1109 0.34
1110 0.32
1111 0.31
1112 0.3
1113 0.36
1114 0.4
1115 0.44
1116 0.44
1117 0.41
1118 0.45
1119 0.5
1120 0.54
1121 0.52
1122 0.54
1123 0.57
1124 0.62
1125 0.65
1126 0.7
1127 0.65
1128 0.64
1129 0.67