FuNGI

A0A1V6S5P9

Protein Details

Accession

A0A1V6S5P9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-64	LEDHLKREIKKLQRFRDQIKSW	Hydrophilic
147-166	TLHAQMKKGKKDTKKADRMA	Hydrophilic
535-554	ALRNQSWRFHKQYQTWFQRH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038635 CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf IPR012270 CCR4-NOT_su3/5 IPR040168 Not2/3/5 IPR007282 NOT2/3/5_C IPR007207 Not_N
Gene Ontology	GO:0030015 C:CCR4-NOT core complex GO:0005634 C:nucleus GO:0000932 C:P-body GO:0000289 P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04153 NOT2_3_5 PF04065 Not3

Amino Acid Sequences

MAARKTQQEIEKTFKKVSEGIQTFEGIYEKIRQATNPTQRDKLEDHLKREIKKLQRFRDQIKSWAAGNEVKDKAPLMEQRKAIEVCMEQFKAVEKEMKTKAYSKEGLSAASRLDPKEKERVECSEFLSNMVDELQLKIEALEAEEETLHAQMKKGKKDTKKADRMADISHITERHKWHVNKLEFLNRSLQNGNLDVGAVQDLKESIKYYVEEGGSPDYSGEDETLYDDLNIGEEIEAQFGMGGDGDRVSSQDAQSIQDEEPEPKPKAKQEAPATRRPSTQMKSPLPVLATLHPSASSSATPGMKPAPLPTRPPGETLKYASAAAAAAASDKSGVGILPLPPPPGFSPALSVALPISKSSTASPSVAPAQPVAKPIVPPTVAAVTEELAGSARPKIPATSGVSSPAPAKVETSTNGKPETEGTESDESVYHLPPGLQDLLQSFEVTKSRASANPSPSVQRLLATSLTTCPEAGDAEKPRHYKPQNPYSTALYYPQEPLPIFDDPRLYDTGRIDTDTLFYLFYYRQGTYQQYLAAKALRNQSWRFHKQYQTWFQRHEEPKNITEEFEQGTYRFFDYESTWMNRRKADFKFVYKYLEDEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.51
3	0.46
4	0.46
5	0.48
6	0.43
7	0.41
8	0.39
9	0.38
10	0.35
11	0.32
12	0.28
13	0.17
14	0.16
15	0.19
16	0.19
17	0.23
18	0.24
19	0.24
20	0.31
21	0.41
22	0.49
23	0.52
24	0.55
25	0.57
26	0.57
27	0.62
28	0.57
29	0.56
30	0.56
31	0.54
32	0.55
33	0.59
34	0.64
35	0.62
36	0.66
37	0.66
38	0.65
39	0.68
40	0.73
41	0.72
42	0.76
43	0.81
44	0.81
45	0.83
46	0.77
47	0.74
48	0.7
49	0.63
50	0.54
51	0.48
52	0.44
53	0.37
54	0.36
55	0.37
56	0.32
57	0.3
58	0.29
59	0.28
60	0.26
61	0.28
62	0.33
63	0.31
64	0.36
65	0.39
66	0.39
67	0.45
68	0.44
69	0.38
70	0.35
71	0.3
72	0.27
73	0.31
74	0.3
75	0.23
76	0.23
77	0.27
78	0.25
79	0.25
80	0.27
81	0.22
82	0.3
83	0.35
84	0.39
85	0.38
86	0.42
87	0.44
88	0.46
89	0.49
90	0.42
91	0.44
92	0.41
93	0.4
94	0.36
95	0.32
96	0.25
97	0.26
98	0.27
99	0.21
100	0.26
101	0.27
102	0.29
103	0.38
104	0.4
105	0.4
106	0.41
107	0.46
108	0.45
109	0.45
110	0.45
111	0.41
112	0.38
113	0.35
114	0.32
115	0.25
116	0.2
117	0.18
118	0.15
119	0.09
120	0.1
121	0.1
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.07
134	0.08
135	0.09
136	0.08
137	0.1
138	0.16
139	0.23
140	0.3
141	0.38
142	0.46
143	0.53
144	0.63
145	0.72
146	0.77
147	0.81
148	0.79
149	0.78
150	0.74
151	0.68
152	0.6
153	0.54
154	0.44
155	0.36
156	0.32
157	0.27
158	0.24
159	0.27
160	0.28
161	0.28
162	0.36
163	0.36
164	0.42
165	0.5
166	0.51
167	0.52
168	0.53
169	0.56
170	0.49
171	0.49
172	0.48
173	0.39
174	0.39
175	0.34
176	0.31
177	0.24
178	0.23
179	0.22
180	0.14
181	0.13
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.07
186	0.06
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.08
192	0.08
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.15
197	0.15
198	0.14
199	0.14
200	0.16
201	0.15
202	0.14
203	0.13
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.08
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.1
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.14
243	0.13
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.17
248	0.21
249	0.21
250	0.22
251	0.24
252	0.25
253	0.32
254	0.33
255	0.38
256	0.42
257	0.52
258	0.55
259	0.61
260	0.63
261	0.57
262	0.55
263	0.5
264	0.48
265	0.4
266	0.42
267	0.43
268	0.4
269	0.4
270	0.4
271	0.37
272	0.3
273	0.29
274	0.23
275	0.16
276	0.17
277	0.15
278	0.14
279	0.12
280	0.12
281	0.12
282	0.11
283	0.09
284	0.07
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.1
291	0.1
292	0.14
293	0.17
294	0.18
295	0.22
296	0.24
297	0.29
298	0.29
299	0.32
300	0.31
301	0.29
302	0.29
303	0.28
304	0.27
305	0.22
306	0.21
307	0.18
308	0.15
309	0.11
310	0.09
311	0.06
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.03
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.05
323	0.06
324	0.09
325	0.09
326	0.11
327	0.11
328	0.13
329	0.13
330	0.15
331	0.15
332	0.13
333	0.15
334	0.15
335	0.17
336	0.15
337	0.15
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.08
342	0.09
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.11
347	0.12
348	0.13
349	0.13
350	0.14
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.15
355	0.15
356	0.15
357	0.16
358	0.17
359	0.14
360	0.14
361	0.15
362	0.18
363	0.17
364	0.16
365	0.16
366	0.16
367	0.15
368	0.15
369	0.14
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.07
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.07
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.11
382	0.12
383	0.17
384	0.22
385	0.23
386	0.22
387	0.24
388	0.23
389	0.24
390	0.23
391	0.2
392	0.16
393	0.13
394	0.14
395	0.12
396	0.14
397	0.16
398	0.22
399	0.22
400	0.24
401	0.25
402	0.24
403	0.23
404	0.22
405	0.24
406	0.2
407	0.18
408	0.2
409	0.21
410	0.21
411	0.21
412	0.2
413	0.17
414	0.16
415	0.16
416	0.11
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.12
421	0.12
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.14
426	0.14
427	0.14
428	0.11
429	0.12
430	0.14
431	0.14
432	0.14
433	0.12
434	0.15
435	0.18
436	0.24
437	0.28
438	0.32
439	0.37
440	0.39
441	0.41
442	0.39
443	0.4
444	0.33
445	0.27
446	0.23
447	0.2
448	0.2
449	0.17
450	0.16
451	0.15
452	0.16
453	0.16
454	0.15
455	0.12
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.17
460	0.2
461	0.25
462	0.31
463	0.34
464	0.36
465	0.45
466	0.48
467	0.5
468	0.55
469	0.61
470	0.64
471	0.66
472	0.66
473	0.61
474	0.6
475	0.52
476	0.46
477	0.37
478	0.3
479	0.28
480	0.26
481	0.25
482	0.22
483	0.22
484	0.22
485	0.24
486	0.24
487	0.23
488	0.25
489	0.22
490	0.25
491	0.26
492	0.23
493	0.23
494	0.24
495	0.27
496	0.25
497	0.25
498	0.23
499	0.21
500	0.21
501	0.2
502	0.18
503	0.13
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.15
508	0.17
509	0.15
510	0.17
511	0.2
512	0.25
513	0.25
514	0.27
515	0.28
516	0.26
517	0.28
518	0.28
519	0.29
520	0.27
521	0.3
522	0.36
523	0.36
524	0.41
525	0.43
526	0.5
527	0.56
528	0.61
529	0.64
530	0.65
531	0.69
532	0.71
533	0.78
534	0.8
535	0.8
536	0.79
537	0.76
538	0.72
539	0.73
540	0.73
541	0.71
542	0.69
543	0.64
544	0.62
545	0.63
546	0.59
547	0.51
548	0.44
549	0.39
550	0.32
551	0.28
552	0.26
553	0.19
554	0.21
555	0.21
556	0.2
557	0.17
558	0.15
559	0.15
560	0.16
561	0.22
562	0.26
563	0.29
564	0.35
565	0.42
566	0.46
567	0.49
568	0.52
569	0.55
570	0.54
571	0.59
572	0.6
573	0.62
574	0.66
575	0.64
576	0.64
577	0.57

A0A1V6S5P9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer