FuNGI

A0A1V6S4Q4

Protein Details

Accession

A0A1V6S4Q4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1282-1304	NQEFIARRRIDKPKPKPEDEDED	Acidic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_pero 10.5, pero 7.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035979 RBD_domain_sf IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MAGPDLPSMQHPKSNRLRLFPSDPPVPSGPSVQTAPAQDWITWRSWKTCAVDLLNIPKEMNTHDIYDAFHQYGNLISIDLWEDASGGPDSRARIRFKPPSNEDFWRTGSFGVRLRSGRVAVISLSICCGDSNGVIPSPVRPDVRLPGELELKTVQVDIGVLLGPSTIHSMQSFNNLAYPRCVVDVMRKCLLLYFKVGIRGSDTADVTQHDYRVKITFLQLTQIYQQQDKDTRQRSFLIVLDSAAIWHRKAKDIRSTLTEPLSWREEDSWYRQTSVTHNPNSLKNLPTNLKKSGHIIDLGRWNMFKISFAPDVDPNIRRTGDTSHHLMLVEDIFKDYNILIKDGSHFLENPNRPVPVWHWIDFSQSKSSKASALLQDLGDENYLHLPFRARYQLEVCLSQGYLSEFTMTREFVERAKQLGEDKATRLLEFVATEKKQYLDPMEIFGLKFFKGVTDSRIPNYCCFMHTARVTPTTIYYNTPTVDISNRVVREWSNKGAPGRFLRVRFTDEKTEGRINASLSDSNDEIYTRVKRTLANGITIGDRRYEFLAFGNSQFREHGAYFFAPDAGVSAATIRAWMGQFNHIRNVAKYAARLGQCFSTTRAFTGSSVQTATCADVVRNDFTFSDGVGKISKFLAQMVTSQHKIKTLTGDPPSAFQFRLGGAKGMLVVSPDPLPHQVHLRPSQQKFETNQAGLEIIRWSQYSLATLNRQLILVLSALDISDGVFHSKLNSMLGGFHRAMGNDSKAINLLQKYIDPNQTTLILAQMVSDGFRRNDEPFANTMLELWKSWHLKHLKEKARIAIDQGANLLGVMDETGVLKGFFKSKLPRERATNAEKLAALPEIFVQICRLDGDGEYEVIEGLCILARNPSLHPGDIRVVRAVNRPELHALRDVVVLPQTGDQDIASMCSGGDLDGDDYLIIWDPDLIPKKWFVECMDYKGSKAPDLDHDVTVDEITSFFVTYMKNDCLPRIAHAHLAWADRLPRGVWEDKCIRLAQLHSDAVDYNKSGAHARMARSLDPKFWPHFMEKRFKRASSIYRSKKILGQLYDAVVTPDFVPKLEKPFDSRILESPLAPASETYMEYARELKAEFDMNMRQIMAQYEINTEFEVWSTFVLRHGFVIRDYKMQEDLGRIVGTLRRGFRHQCYDKAGRHGGNIPALVVAMYRVTQEQVAAALDARRKEALQRKDISIVEVNSTELPLISFPWIFPDVLGDVATGRARQALAPEGEGGGDSAKPIGDGVVFTHRQILKIMEDTDEEMKPKTENTKLEANAGANSVPTPPPNQEFIARRRIDKPKPKPEDEDEDAGVCFDEDDDNDGGVEIGEKVEKIEKEEAITEDIVEMEGDVQPSALDALINMINN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.6
3	0.6
4	0.64
5	0.66
6	0.7
7	0.68
8	0.65
9	0.61
10	0.57
11	0.55
12	0.51
13	0.46
14	0.41
15	0.37
16	0.32
17	0.29
18	0.29
19	0.26
20	0.27
21	0.26
22	0.27
23	0.28
24	0.28
25	0.25
26	0.27
27	0.28
28	0.29
29	0.33
30	0.33
31	0.31
32	0.33
33	0.38
34	0.39
35	0.41
36	0.43
37	0.42
38	0.45
39	0.46
40	0.52
41	0.5
42	0.46
43	0.41
44	0.34
45	0.32
46	0.29
47	0.29
48	0.22
49	0.21
50	0.22
51	0.23
52	0.24
53	0.27
54	0.28
55	0.23
56	0.22
57	0.19
58	0.18
59	0.18
60	0.18
61	0.14
62	0.11
63	0.09
64	0.1
65	0.12
66	0.12
67	0.1
68	0.08
69	0.09
70	0.08
71	0.11
72	0.11
73	0.09
74	0.1
75	0.13
76	0.16
77	0.23
78	0.29
79	0.33
80	0.38
81	0.47
82	0.56
83	0.62
84	0.7
85	0.7
86	0.71
87	0.73
88	0.74
89	0.69
90	0.64
91	0.59
92	0.51
93	0.44
94	0.39
95	0.35
96	0.33
97	0.32
98	0.31
99	0.33
100	0.31
101	0.34
102	0.36
103	0.33
104	0.31
105	0.27
106	0.25
107	0.2
108	0.22
109	0.19
110	0.15
111	0.15
112	0.14
113	0.13
114	0.12
115	0.12
116	0.09
117	0.09
118	0.11
119	0.12
120	0.12
121	0.12
122	0.13
123	0.15
124	0.19
125	0.23
126	0.22
127	0.22
128	0.26
129	0.33
130	0.37
131	0.38
132	0.35
133	0.35
134	0.39
135	0.38
136	0.36
137	0.29
138	0.24
139	0.22
140	0.2
141	0.15
142	0.09
143	0.09
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.05
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.1
153	0.09
154	0.1
155	0.11
156	0.13
157	0.14
158	0.21
159	0.22
160	0.18
161	0.23
162	0.23
163	0.24
164	0.25
165	0.25
166	0.19
167	0.19
168	0.2
169	0.16
170	0.24
171	0.33
172	0.36
173	0.37
174	0.36
175	0.35
176	0.38
177	0.4
178	0.31
179	0.26
180	0.24
181	0.23
182	0.3
183	0.3
184	0.27
185	0.28
186	0.27
187	0.25
188	0.26
189	0.25
190	0.19
191	0.2
192	0.21
193	0.22
194	0.22
195	0.22
196	0.2
197	0.2
198	0.21
199	0.22
200	0.22
201	0.2
202	0.22
203	0.25
204	0.23
205	0.28
206	0.26
207	0.26
208	0.27
209	0.3
210	0.29
211	0.26
212	0.27
213	0.28
214	0.34
215	0.39
216	0.46
217	0.49
218	0.49
219	0.5
220	0.51
221	0.47
222	0.43
223	0.4
224	0.34
225	0.26
226	0.24
227	0.21
228	0.18
229	0.17
230	0.16
231	0.15
232	0.11
233	0.16
234	0.17
235	0.24
236	0.29
237	0.35
238	0.42
239	0.47
240	0.5
241	0.52
242	0.55
243	0.51
244	0.49
245	0.44
246	0.36
247	0.34
248	0.34
249	0.27
250	0.25
251	0.23
252	0.25
253	0.26
254	0.31
255	0.34
256	0.32
257	0.34
258	0.33
259	0.33
260	0.34
261	0.41
262	0.43
263	0.39
264	0.43
265	0.45
266	0.48
267	0.52
268	0.51
269	0.43
270	0.37
271	0.4
272	0.42
273	0.47
274	0.47
275	0.48
276	0.47
277	0.45
278	0.47
279	0.44
280	0.39
281	0.35
282	0.32
283	0.3
284	0.35
285	0.35
286	0.31
287	0.27
288	0.26
289	0.24
290	0.22
291	0.18
292	0.13
293	0.17
294	0.19
295	0.2
296	0.22
297	0.21
298	0.26
299	0.3
300	0.3
301	0.27
302	0.28
303	0.27
304	0.25
305	0.25
306	0.26
307	0.26
308	0.28
309	0.3
310	0.28
311	0.28
312	0.28
313	0.26
314	0.22
315	0.19
316	0.16
317	0.11
318	0.11
319	0.1
320	0.09
321	0.1
322	0.09
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.14
329	0.16
330	0.17
331	0.14
332	0.13
333	0.16
334	0.25
335	0.27
336	0.29
337	0.3
338	0.29
339	0.28
340	0.3
341	0.29
342	0.29
343	0.31
344	0.28
345	0.29
346	0.29
347	0.35
348	0.35
349	0.35
350	0.34
351	0.31
352	0.31
353	0.3
354	0.3
355	0.26
356	0.26
357	0.29
358	0.24
359	0.26
360	0.26
361	0.24
362	0.24
363	0.22
364	0.2
365	0.15
366	0.12
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.11
373	0.11
374	0.16
375	0.22
376	0.19
377	0.22
378	0.25
379	0.3
380	0.3
381	0.31
382	0.27
383	0.22
384	0.21
385	0.18
386	0.17
387	0.12
388	0.11
389	0.1
390	0.11
391	0.1
392	0.12
393	0.13
394	0.13
395	0.12
396	0.14
397	0.15
398	0.15
399	0.21
400	0.2
401	0.2
402	0.21
403	0.21
404	0.2
405	0.24
406	0.26
407	0.22
408	0.22
409	0.27
410	0.27
411	0.25
412	0.23
413	0.19
414	0.16
415	0.15
416	0.15
417	0.16
418	0.16
419	0.17
420	0.18
421	0.18
422	0.18
423	0.19
424	0.19
425	0.18
426	0.18
427	0.19
428	0.2
429	0.2
430	0.19
431	0.18
432	0.17
433	0.11
434	0.11
435	0.09
436	0.08
437	0.1
438	0.11
439	0.15
440	0.21
441	0.23
442	0.26
443	0.32
444	0.33
445	0.31
446	0.34
447	0.29
448	0.23
449	0.25
450	0.24
451	0.24
452	0.24
453	0.26
454	0.25
455	0.27
456	0.27
457	0.24
458	0.24
459	0.21
460	0.21
461	0.19
462	0.19
463	0.18
464	0.18
465	0.18
466	0.16
467	0.14
468	0.15
469	0.15
470	0.15
471	0.18
472	0.18
473	0.18
474	0.19
475	0.18
476	0.22
477	0.24
478	0.25
479	0.23
480	0.26
481	0.29
482	0.29
483	0.33
484	0.3
485	0.33
486	0.34
487	0.33
488	0.34
489	0.33
490	0.37
491	0.36
492	0.37
493	0.37
494	0.35
495	0.36
496	0.36
497	0.36
498	0.31
499	0.29
500	0.27
501	0.21
502	0.19
503	0.19
504	0.17
505	0.15
506	0.16
507	0.14
508	0.13
509	0.13
510	0.11
511	0.1
512	0.12
513	0.14
514	0.13
515	0.15
516	0.16
517	0.17
518	0.2
519	0.28
520	0.26
521	0.25
522	0.24
523	0.23
524	0.24
525	0.24
526	0.21
527	0.14
528	0.13
529	0.12
530	0.12
531	0.12
532	0.1
533	0.1
534	0.14
535	0.13
536	0.14
537	0.18
538	0.17
539	0.17
540	0.17
541	0.16
542	0.16
543	0.15
544	0.14
545	0.12
546	0.12
547	0.12
548	0.12
549	0.11
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.05
554	0.05
555	0.04
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.07
565	0.14
566	0.18
567	0.19
568	0.22
569	0.23
570	0.24
571	0.23
572	0.26
573	0.22
574	0.19
575	0.19
576	0.18
577	0.21
578	0.21
579	0.21
580	0.18
581	0.17
582	0.17
583	0.18
584	0.18
585	0.16
586	0.15
587	0.15
588	0.16
589	0.14
590	0.14
591	0.17
592	0.16
593	0.13
594	0.13
595	0.13
596	0.12
597	0.11
598	0.11
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.09
603	0.11
604	0.12
605	0.12
606	0.12
607	0.11
608	0.12
609	0.12
610	0.09
611	0.11
612	0.1
613	0.1
614	0.11
615	0.11
616	0.1
617	0.11
618	0.12
619	0.08
620	0.09
621	0.1
622	0.09
623	0.11
624	0.14
625	0.17
626	0.17
627	0.19
628	0.19
629	0.2
630	0.21
631	0.2
632	0.21
633	0.2
634	0.24
635	0.25
636	0.27
637	0.25
638	0.25
639	0.27
640	0.23
641	0.2
642	0.14
643	0.12
644	0.11
645	0.13
646	0.12
647	0.1
648	0.09
649	0.08
650	0.09
651	0.08
652	0.07
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.08
660	0.09
661	0.09
662	0.13
663	0.14
664	0.19
665	0.24
666	0.31
667	0.36
668	0.37
669	0.42
670	0.4
671	0.43
672	0.4
673	0.42
674	0.38
675	0.31
676	0.29
677	0.23
678	0.22
679	0.17
680	0.16
681	0.1
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.07
688	0.07
689	0.08
690	0.1
691	0.11
692	0.12
693	0.14
694	0.13
695	0.13
696	0.12
697	0.1
698	0.09
699	0.07
700	0.06
701	0.05
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.04
710	0.04
711	0.05
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.06
718	0.09
719	0.1
720	0.12
721	0.11
722	0.12
723	0.12
724	0.12
725	0.14
726	0.13
727	0.13
728	0.11
729	0.11
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.12
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.11
738	0.14
739	0.17
740	0.21
741	0.19
742	0.2
743	0.19
744	0.2
745	0.18
746	0.16
747	0.13
748	0.08
749	0.07
750	0.06
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.06
755	0.07
756	0.07
757	0.09
758	0.1
759	0.11
760	0.15
761	0.15
762	0.17
763	0.16
764	0.19
765	0.18
766	0.16
767	0.15
768	0.13
769	0.13
770	0.11
771	0.11
772	0.14
773	0.15
774	0.16
775	0.22
776	0.25
777	0.29
778	0.38
779	0.47
780	0.5
781	0.55
782	0.58
783	0.56
784	0.56
785	0.52
786	0.45
787	0.42
788	0.34
789	0.27
790	0.24
791	0.19
792	0.15
793	0.14
794	0.11
795	0.04
796	0.03
797	0.03
798	0.02
799	0.02
800	0.03
801	0.03
802	0.03
803	0.04
804	0.04
805	0.05
806	0.08
807	0.08
808	0.12
809	0.19
810	0.27
811	0.37
812	0.42
813	0.46
814	0.49
815	0.53
816	0.56
817	0.56
818	0.52
819	0.43
820	0.39
821	0.35
822	0.29
823	0.26
824	0.2
825	0.13
826	0.09
827	0.08
828	0.08
829	0.08
830	0.08
831	0.07
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.07
836	0.06
837	0.06
838	0.09
839	0.09
840	0.09
841	0.09
842	0.08
843	0.08
844	0.07
845	0.07
846	0.04
847	0.03
848	0.03
849	0.03
850	0.03
851	0.05
852	0.06
853	0.08
854	0.09
855	0.14
856	0.15
857	0.15
858	0.16
859	0.17
860	0.21
861	0.22
862	0.22
863	0.19
864	0.18
865	0.2
866	0.25
867	0.25
868	0.26
869	0.24
870	0.25
871	0.28
872	0.28
873	0.28
874	0.25
875	0.24
876	0.19
877	0.19
878	0.18
879	0.14
880	0.14
881	0.12
882	0.09
883	0.1
884	0.09
885	0.09
886	0.09
887	0.08
888	0.08
889	0.07
890	0.08
891	0.06
892	0.06
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.04
897	0.05
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.04
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.05
906	0.04
907	0.04
908	0.04
909	0.04
910	0.1
911	0.14
912	0.15
913	0.15
914	0.18
915	0.2
916	0.21
917	0.23
918	0.2
919	0.25
920	0.26
921	0.3
922	0.36
923	0.33
924	0.33
925	0.36
926	0.34
927	0.28
928	0.27
929	0.23
930	0.21
931	0.29
932	0.31
933	0.26
934	0.26
935	0.24
936	0.23
937	0.21
938	0.16
939	0.08
940	0.05
941	0.06
942	0.06
943	0.05
944	0.05
945	0.07
946	0.07
947	0.09
948	0.13
949	0.14
950	0.18
951	0.19
952	0.19
953	0.21
954	0.22
955	0.23
956	0.23
957	0.23
958	0.22
959	0.21
960	0.25
961	0.24
962	0.24
963	0.22
964	0.19
965	0.2
966	0.16
967	0.17
968	0.14
969	0.13
970	0.16
971	0.22
972	0.21
973	0.26
974	0.3
975	0.32
976	0.34
977	0.33
978	0.29
979	0.25
980	0.25
981	0.24
982	0.25
983	0.24
984	0.22
985	0.22
986	0.22
987	0.2
988	0.2
989	0.15
990	0.1
991	0.1
992	0.11
993	0.12
994	0.12
995	0.17
996	0.2
997	0.21
998	0.27
999	0.29
1000	0.31
1001	0.35
1002	0.36
1003	0.34
1004	0.33
1005	0.36
1006	0.33
1007	0.33
1008	0.33
1009	0.34
1010	0.4
1011	0.42
1012	0.49
1013	0.49
1014	0.56
1015	0.59
1016	0.57
1017	0.55
1018	0.55
1019	0.58
1020	0.58
1021	0.64
1022	0.63
1023	0.65
1024	0.67
1025	0.64
1026	0.6
1027	0.58
1028	0.54
1029	0.46
1030	0.41
1031	0.37
1032	0.35
1033	0.34
1034	0.3
1035	0.24
1036	0.17
1037	0.15
1038	0.11
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.1
1042	0.14
1043	0.15
1044	0.22
1045	0.25
1046	0.26
1047	0.28
1048	0.34
1049	0.41
1050	0.41
1051	0.42
1052	0.39
1053	0.41
1054	0.41
1055	0.35
1056	0.31
1057	0.25
1058	0.22
1059	0.19
1060	0.16
1061	0.12
1062	0.13
1063	0.13
1064	0.13
1065	0.13
1066	0.13
1067	0.14
1068	0.16
1069	0.14
1070	0.14
1071	0.13
1072	0.13
1073	0.13
1074	0.15
1075	0.14
1076	0.16
1077	0.19
1078	0.19
1079	0.19
1080	0.18
1081	0.16
1082	0.15
1083	0.16
1084	0.15
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.16
1088	0.17
1089	0.18
1090	0.17
1091	0.16
1092	0.13
1093	0.12
1094	0.12
1095	0.09
1096	0.08
1097	0.09
1098	0.09
1099	0.12
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.14
1103	0.16
1104	0.17
1105	0.18
1106	0.24
1107	0.23
1108	0.26
1109	0.27
1110	0.27
1111	0.27
1112	0.27
1113	0.26
1114	0.23
1115	0.23
1116	0.2
1117	0.19
1118	0.17
1119	0.17
1120	0.18
1121	0.2
1122	0.22
1123	0.23
1124	0.24
1125	0.29
1126	0.35
1127	0.4
1128	0.49
1129	0.49
1130	0.51
1131	0.56
1132	0.61
1133	0.61
1134	0.64
1135	0.64
1136	0.54
1137	0.52
1138	0.51
1139	0.46
1140	0.41
1141	0.36
1142	0.28
1143	0.22
1144	0.2
1145	0.17
1146	0.12
1147	0.08
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.07
1152	0.08
1153	0.08
1154	0.09
1155	0.08
1156	0.09
1157	0.09
1158	0.08
1159	0.09
1160	0.12
1161	0.15
1162	0.16
1163	0.18
1164	0.18
1165	0.18
1166	0.26
1167	0.35
1168	0.4
1169	0.45
1170	0.49
1171	0.5
1172	0.55
1173	0.55
1174	0.51
1175	0.47
1176	0.39
1177	0.33
1178	0.29
1179	0.27
1180	0.21
1181	0.21
1182	0.16
1183	0.11
1184	0.1
1185	0.07
1186	0.08
1187	0.09
1188	0.09
1189	0.09
1190	0.14
1191	0.15
1192	0.15
1193	0.14
1194	0.16
1195	0.14
1196	0.15
1197	0.15
1198	0.1
1199	0.09
1200	0.11
1201	0.12
1202	0.1
1203	0.09
1204	0.1
1205	0.11
1206	0.11
1207	0.14
1208	0.18
1209	0.19
1210	0.2
1211	0.2
1212	0.18
1213	0.18
1214	0.17
1215	0.14
1216	0.09
1217	0.08
1218	0.07
1219	0.07
1220	0.06
1221	0.06
1222	0.06
1223	0.07
1224	0.06
1225	0.07
1226	0.09
1227	0.17
1228	0.18
1229	0.18
1230	0.26
1231	0.26
1232	0.27
1233	0.28
1234	0.28
1235	0.24
1236	0.28
1237	0.29
1238	0.23
1239	0.23
1240	0.25
1241	0.27
1242	0.26
1243	0.24
1244	0.2
1245	0.2
1246	0.2
1247	0.22
1248	0.26
1249	0.29
1250	0.32
1251	0.35
1252	0.43
1253	0.43
1254	0.46
1255	0.45
1256	0.39
1257	0.34
1258	0.31
1259	0.26
1260	0.18
1261	0.17
1262	0.16
1263	0.14
1264	0.15
1265	0.16
1266	0.2
1267	0.24
1268	0.27
1269	0.29
1270	0.34
1271	0.4
1272	0.44
1273	0.52
1274	0.5
1275	0.51
1276	0.56
1277	0.64
1278	0.67
1279	0.71
1280	0.75
1281	0.76
1282	0.83
1283	0.85
1284	0.83
1285	0.81
1286	0.8
1287	0.75
1288	0.69
1289	0.59
1290	0.51
1291	0.44
1292	0.37
1293	0.29
1294	0.19
1295	0.13
1296	0.08
1297	0.08
1298	0.07
1299	0.11
1300	0.12
1301	0.12
1302	0.12
1303	0.12
1304	0.11
1305	0.1
1306	0.1
1307	0.06
1308	0.07
1309	0.07
1310	0.07
1311	0.09
1312	0.15
1313	0.16
1314	0.21
1315	0.25
1316	0.26
1317	0.28
1318	0.31
1319	0.31
1320	0.29
1321	0.28
1322	0.23
1323	0.18
1324	0.17
1325	0.15
1326	0.11
1327	0.09
1328	0.07
1329	0.08
1330	0.08
1331	0.08
1332	0.08
1333	0.07
1334	0.08
1335	0.08
1336	0.07
1337	0.05
1338	0.05
1339	0.08

A0A1V6S4Q4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer