FuNGI

A0A1V6RA82

Protein Details

Accession

A0A1V6RA82

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-444	RQADERKQANEKRRKEQDAARNEERSQKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 7, cyto 6, plas 1, pero 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSNKYPKIVSPVIEEQAQVIDGEEIPIDITRPNPNGEEQDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPADEQEMMMEIYKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKENDEKKEELHKMLAKQHVTKTGDQLIREEVVQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPGWENLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSRPRGCRLCGQTGHKAEECLGRPKEKNGEFDEKQHAAPLKPFIWLHVAVLREYLAVELRVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNLPAMGSYLTKDGSVELKNAQIILQGLAKQEDAIFARRRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERSQKRRRSSPQHDLTAGDRSRGEPVPPMELITPGRGHLNKETRELTHSMVINRGAVYRANMGNKSAAAVLKSKLMKGNQAGAGDSETPVTDGEDVSSETPEQTSPGVLGKRKADEAEQATEAGTPGRDSPPPVPIVADKPKQDEIQEDTVKLWEPGYADRYYEQKFGVDPKDLEFRHQVAREYAIGLCWVLQYYFQGCPSWTWYYPRHYAPFAADFVDIADLDVKFEKGTIFKPFEQLMGVLPAASNHALPKVFHPLMENPDSEIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVILLPFIDETRLLNAMAKVYPLLTEDEKIRNSHGQDVLLVSDRNPLYQDLVANFYSKKPGPAQYPLKQDVSGGLAGIVERSDTYVPHSSLVSPLEAHGMPGVDDDRSLTVVYKIPKSSHVHKSMLLRGVKLPTPMLDSNDIRATQNRSQNSGRSFGGAPFQGRGRGGRMNYASDRPNPFAAHLDPKFNSGPQGGPGGAPMVPPGWVPPGQGYGGYARGPPPPPRGGMSHQYPPQHPPQHQSQHGYQQPGDYYGQQNNQYNQGGQYNNVHQSGYGSQDYRGGRGGNRGGRGRGGQNRDHYSHNQGGAGYNRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.48
3	0.52
4	0.52
5	0.47
6	0.44
7	0.45
8	0.44
9	0.4
10	0.38
11	0.3
12	0.27
13	0.25
14	0.17
15	0.12
16	0.1
17	0.09
18	0.1
19	0.09
20	0.07
21	0.08
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.11
26	0.17
27	0.19
28	0.22
29	0.24
30	0.28
31	0.33
32	0.34
33	0.36
34	0.32
35	0.35
36	0.33
37	0.33
38	0.29
39	0.24
40	0.22
41	0.18
42	0.15
43	0.1
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.11
48	0.13
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.36
54	0.42
55	0.47
56	0.47
57	0.5
58	0.51
59	0.54
60	0.46
61	0.41
62	0.36
63	0.31
64	0.28
65	0.22
66	0.17
67	0.13
68	0.15
69	0.13
70	0.12
71	0.12
72	0.15
73	0.15
74	0.19
75	0.24
76	0.3
77	0.38
78	0.47
79	0.48
80	0.47
81	0.49
82	0.47
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.8
105	0.77
106	0.73
107	0.75
108	0.74
109	0.71
110	0.72
111	0.67
112	0.64
113	0.69
114	0.65
115	0.56
116	0.51
117	0.44
118	0.36
119	0.43
120	0.41
121	0.35
122	0.4
123	0.43
124	0.43
125	0.5
126	0.55
127	0.5
128	0.51
129	0.53
130	0.54
131	0.53
132	0.5
133	0.49
134	0.5
135	0.48
136	0.43
137	0.41
138	0.35
139	0.32
140	0.3
141	0.28
142	0.2
143	0.19
144	0.2
145	0.19
146	0.17
147	0.17
148	0.21
149	0.19
150	0.2
151	0.22
152	0.23
153	0.23
154	0.21
155	0.22
156	0.19
157	0.17
158	0.15
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.2
175	0.27
176	0.27
177	0.29
178	0.29
179	0.3
180	0.34
181	0.31
182	0.28
183	0.22
184	0.23
185	0.2
186	0.19
187	0.15
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.28
206	0.29
207	0.3
208	0.32
209	0.37
210	0.42
211	0.44
212	0.5
213	0.49
214	0.53
215	0.54
216	0.52
217	0.55
218	0.48
219	0.42
220	0.33
221	0.27
222	0.22
223	0.23
224	0.19
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.05
238	0.06
239	0.08
240	0.1
241	0.11
242	0.15
243	0.15
244	0.16
245	0.18
246	0.19
247	0.18
248	0.2
249	0.2
250	0.18
251	0.21
252	0.23
253	0.24
254	0.25
255	0.27
256	0.25
257	0.27
258	0.34
259	0.36
260	0.42
261	0.46
262	0.49
263	0.55
264	0.57
265	0.59
266	0.52
267	0.46
268	0.39
269	0.39
270	0.36
271	0.35
272	0.34
273	0.35
274	0.36
275	0.4
276	0.48
277	0.45
278	0.47
279	0.45
280	0.52
281	0.47
282	0.51
283	0.53
284	0.46
285	0.42
286	0.4
287	0.36
288	0.28
289	0.3
290	0.29
291	0.22
292	0.24
293	0.24
294	0.21
295	0.23
296	0.22
297	0.2
298	0.18
299	0.19
300	0.15
301	0.16
302	0.14
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.09
310	0.12
311	0.16
312	0.17
313	0.18
314	0.2
315	0.21
316	0.22
317	0.25
318	0.24
319	0.2
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.19
324	0.19
325	0.13
326	0.11
327	0.1
328	0.09
329	0.08
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.08
345	0.12
346	0.15
347	0.16
348	0.15
349	0.16
350	0.16
351	0.15
352	0.15
353	0.1
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.08
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.1
395	0.13
396	0.17
397	0.17
398	0.24
399	0.25
400	0.28
401	0.32
402	0.41
403	0.45
404	0.52
405	0.58
406	0.57
407	0.64
408	0.68
409	0.72
410	0.72
411	0.69
412	0.68
413	0.69
414	0.69
415	0.66
416	0.68
417	0.66
418	0.66
419	0.68
420	0.62
421	0.57
422	0.53
423	0.57
424	0.55
425	0.54
426	0.54
427	0.54
428	0.56
429	0.62
430	0.7
431	0.72
432	0.74
433	0.77
434	0.76
435	0.71
436	0.66
437	0.59
438	0.51
439	0.49
440	0.4
441	0.3
442	0.22
443	0.19
444	0.21
445	0.21
446	0.19
447	0.15
448	0.16
449	0.17
450	0.17
451	0.17
452	0.14
453	0.15
454	0.15
455	0.13
456	0.12
457	0.1
458	0.13
459	0.13
460	0.15
461	0.2
462	0.26
463	0.26
464	0.3
465	0.31
466	0.29
467	0.31
468	0.31
469	0.25
470	0.22
471	0.22
472	0.19
473	0.19
474	0.19
475	0.16
476	0.15
477	0.14
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.1
482	0.12
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.11
490	0.09
491	0.08
492	0.1
493	0.09
494	0.14
495	0.14
496	0.14
497	0.17
498	0.17
499	0.2
500	0.19
501	0.23
502	0.21
503	0.21
504	0.2
505	0.17
506	0.17
507	0.14
508	0.13
509	0.08
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.04
516	0.04
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.08
530	0.11
531	0.12
532	0.15
533	0.17
534	0.18
535	0.19
536	0.19
537	0.17
538	0.19
539	0.21
540	0.21
541	0.19
542	0.17
543	0.17
544	0.16
545	0.15
546	0.1
547	0.07
548	0.05
549	0.06
550	0.08
551	0.08
552	0.1
553	0.12
554	0.15
555	0.15
556	0.15
557	0.15
558	0.14
559	0.2
560	0.25
561	0.27
562	0.25
563	0.28
564	0.3
565	0.3
566	0.3
567	0.26
568	0.24
569	0.28
570	0.28
571	0.25
572	0.23
573	0.23
574	0.22
575	0.2
576	0.15
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.13
581	0.12
582	0.13
583	0.14
584	0.18
585	0.18
586	0.19
587	0.17
588	0.14
589	0.15
590	0.19
591	0.2
592	0.19
593	0.18
594	0.18
595	0.26
596	0.25
597	0.27
598	0.26
599	0.25
600	0.28
601	0.29
602	0.28
603	0.22
604	0.24
605	0.22
606	0.2
607	0.18
608	0.12
609	0.11
610	0.09
611	0.08
612	0.06
613	0.06
614	0.04
615	0.05
616	0.05
617	0.08
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.11
623	0.16
624	0.19
625	0.18
626	0.22
627	0.25
628	0.3
629	0.34
630	0.38
631	0.36
632	0.33
633	0.33
634	0.31
635	0.3
636	0.25
637	0.21
638	0.17
639	0.14
640	0.13
641	0.12
642	0.09
643	0.07
644	0.07
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.07
649	0.06
650	0.07
651	0.08
652	0.08
653	0.1
654	0.16
655	0.2
656	0.2
657	0.24
658	0.24
659	0.24
660	0.22
661	0.2
662	0.15
663	0.12
664	0.11
665	0.08
666	0.08
667	0.07
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.06
672	0.08
673	0.09
674	0.1
675	0.12
676	0.19
677	0.19
678	0.19
679	0.22
680	0.23
681	0.28
682	0.3
683	0.28
684	0.21
685	0.23
686	0.22
687	0.19
688	0.16
689	0.11
690	0.1
691	0.1
692	0.1
693	0.09
694	0.09
695	0.1
696	0.09
697	0.09
698	0.1
699	0.14
700	0.14
701	0.14
702	0.16
703	0.15
704	0.17
705	0.18
706	0.17
707	0.15
708	0.14
709	0.14
710	0.16
711	0.17
712	0.15
713	0.14
714	0.13
715	0.11
716	0.11
717	0.1
718	0.06
719	0.05
720	0.07
721	0.08
722	0.08
723	0.1
724	0.11
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.1
729	0.09
730	0.09
731	0.09
732	0.11
733	0.1
734	0.12
735	0.15
736	0.2
737	0.21
738	0.22
739	0.24
740	0.25
741	0.26
742	0.31
743	0.29
744	0.25
745	0.24
746	0.24
747	0.23
748	0.2
749	0.19
750	0.13
751	0.17
752	0.17
753	0.16
754	0.17
755	0.16
756	0.16
757	0.17
758	0.19
759	0.14
760	0.17
761	0.17
762	0.18
763	0.18
764	0.16
765	0.2
766	0.19
767	0.21
768	0.22
769	0.27
770	0.31
771	0.4
772	0.48
773	0.49
774	0.57
775	0.57
776	0.55
777	0.49
778	0.44
779	0.36
780	0.3
781	0.23
782	0.15
783	0.11
784	0.09
785	0.09
786	0.09
787	0.07
788	0.04
789	0.04
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.12
794	0.17
795	0.18
796	0.19
797	0.19
798	0.18
799	0.2
800	0.21
801	0.17
802	0.12
803	0.12
804	0.14
805	0.14
806	0.13
807	0.12
808	0.1
809	0.09
810	0.1
811	0.11
812	0.07
813	0.07
814	0.08
815	0.08
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.1
820	0.14
821	0.18
822	0.22
823	0.24
824	0.24
825	0.31
826	0.37
827	0.43
828	0.49
829	0.52
830	0.49
831	0.51
832	0.56
833	0.56
834	0.57
835	0.5
836	0.42
837	0.39
838	0.41
839	0.39
840	0.34
841	0.28
842	0.22
843	0.27
844	0.26
845	0.26
846	0.28
847	0.27
848	0.29
849	0.32
850	0.31
851	0.27
852	0.3
853	0.33
854	0.34
855	0.4
856	0.4
857	0.42
858	0.44
859	0.49
860	0.48
861	0.45
862	0.39
863	0.35
864	0.34
865	0.29
866	0.31
867	0.27
868	0.25
869	0.23
870	0.24
871	0.24
872	0.23
873	0.24
874	0.23
875	0.27
876	0.27
877	0.32
878	0.33
879	0.36
880	0.39
881	0.42
882	0.42
883	0.42
884	0.46
885	0.42
886	0.43
887	0.38
888	0.35
889	0.35
890	0.35
891	0.38
892	0.34
893	0.38
894	0.35
895	0.38
896	0.38
897	0.34
898	0.34
899	0.26
900	0.25
901	0.21
902	0.23
903	0.19
904	0.18
905	0.17
906	0.16
907	0.14
908	0.13
909	0.11
910	0.08
911	0.08
912	0.08
913	0.1
914	0.12
915	0.13
916	0.14
917	0.15
918	0.18
919	0.18
920	0.18
921	0.18
922	0.16
923	0.18
924	0.18
925	0.17
926	0.16
927	0.22
928	0.26
929	0.31
930	0.35
931	0.37
932	0.38
933	0.4
934	0.44
935	0.44
936	0.48
937	0.48
938	0.5
939	0.51
940	0.54
941	0.54
942	0.54
943	0.58
944	0.58
945	0.55
946	0.52
947	0.57
948	0.61
949	0.65
950	0.66
951	0.62
952	0.64
953	0.67
954	0.66
955	0.56
956	0.5
957	0.46
958	0.43
959	0.38
960	0.32
961	0.32
962	0.33
963	0.38
964	0.41
965	0.45
966	0.44
967	0.49
968	0.47
969	0.44
970	0.4
971	0.4
972	0.35
973	0.31
974	0.35
975	0.35
976	0.38
977	0.37
978	0.34
979	0.28
980	0.3
981	0.3
982	0.29
983	0.27
984	0.23
985	0.23
986	0.29
987	0.3
988	0.28
989	0.29
990	0.26
991	0.24
992	0.32
993	0.39
994	0.39
995	0.45
996	0.48
997	0.47
998	0.49
999	0.51
1000	0.52
1001	0.52
1002	0.53
1003	0.53
1004	0.58
1005	0.63
1006	0.61
1007	0.63
1008	0.58
1009	0.57
1010	0.57
1011	0.52
1012	0.45
1013	0.38
1014	0.4

A0A1V6RA82

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer