Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6RT93

Protein Details
Accession A0A1V6RT93    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-127KEPKIRTTSTGRKPKKNPYGLTHydrophilic
434-458MSSKKKATAKSAAGKRKRMNKDSEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-121KKEPKIRTTSTGRKPKK
425-452GKRKGNGPTMSSKKKATAKSAAGKRKRM
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 11, cyto 8.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MERRITRSAARAAAALIAGEENSTSVPQPPPNPAIKQEKPVLRPALFDELPHNLGPVPPTLSIGTQPAPSIAESDKENQTLKSNQVANLATELQTTVNNATIKLKKEPKIRTTSTGRKPKKNPYGLTPGISPFPELVRPTAEECENVTQLLSSIHGVVTAPATIPEPSLTVTGCGEVPSVLDALIRTLLSGATTGSNAAKAFGGLVQRFGILSEGVGKGSVNWDAVRQATVKDVFEAIKSGGLADIKSKNLKAILEIVHEDNQARRATLLNSESKNDSMSKLVVPEKADKDKQYEIACADQNFLSLNHLHNLTTQEAMADLIKYPGIGPKTAACVILFCLQRPCFAVDTHIFRLCRWLGWIPVSANEVTAFSHLEVRIPDHLKYSLHQLFIRHGKTCPRCRAATGESSAGWQDGCVIDHLLTRDGKRKGNGPTMSSKKKATAKSAAGKRKRMNKDSEEETEESASSLSEEMSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.19
3 0.12
4 0.09
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.08
12 0.11
13 0.16
14 0.21
15 0.24
16 0.31
17 0.36
18 0.42
19 0.45
20 0.48
21 0.54
22 0.54
23 0.58
24 0.6
25 0.61
26 0.59
27 0.63
28 0.63
29 0.54
30 0.51
31 0.48
32 0.49
33 0.41
34 0.38
35 0.33
36 0.3
37 0.32
38 0.3
39 0.26
40 0.17
41 0.18
42 0.19
43 0.17
44 0.16
45 0.14
46 0.16
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.2
51 0.19
52 0.17
53 0.17
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.16
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.2
62 0.23
63 0.24
64 0.26
65 0.24
66 0.29
67 0.3
68 0.31
69 0.33
70 0.33
71 0.32
72 0.36
73 0.36
74 0.31
75 0.3
76 0.28
77 0.21
78 0.18
79 0.17
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.1
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.21
88 0.25
89 0.28
90 0.35
91 0.42
92 0.45
93 0.54
94 0.62
95 0.64
96 0.68
97 0.69
98 0.68
99 0.69
100 0.73
101 0.74
102 0.76
103 0.75
104 0.76
105 0.8
106 0.83
107 0.84
108 0.83
109 0.76
110 0.72
111 0.74
112 0.67
113 0.61
114 0.52
115 0.43
116 0.36
117 0.32
118 0.26
119 0.17
120 0.15
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.2
128 0.2
129 0.17
130 0.18
131 0.21
132 0.19
133 0.17
134 0.15
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.11
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.12
249 0.15
250 0.14
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.16
256 0.19
257 0.2
258 0.21
259 0.23
260 0.24
261 0.23
262 0.23
263 0.2
264 0.17
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.14
269 0.16
270 0.17
271 0.18
272 0.23
273 0.26
274 0.31
275 0.34
276 0.32
277 0.34
278 0.34
279 0.37
280 0.32
281 0.3
282 0.25
283 0.26
284 0.27
285 0.23
286 0.22
287 0.17
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.17
318 0.18
319 0.18
320 0.14
321 0.14
322 0.16
323 0.21
324 0.2
325 0.17
326 0.23
327 0.22
328 0.23
329 0.25
330 0.25
331 0.2
332 0.2
333 0.24
334 0.22
335 0.28
336 0.31
337 0.34
338 0.31
339 0.3
340 0.36
341 0.31
342 0.28
343 0.25
344 0.23
345 0.21
346 0.24
347 0.27
348 0.22
349 0.23
350 0.25
351 0.21
352 0.19
353 0.16
354 0.14
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.08
359 0.13
360 0.12
361 0.14
362 0.14
363 0.17
364 0.23
365 0.24
366 0.24
367 0.23
368 0.26
369 0.25
370 0.25
371 0.32
372 0.29
373 0.3
374 0.31
375 0.29
376 0.35
377 0.42
378 0.44
379 0.37
380 0.36
381 0.42
382 0.5
383 0.58
384 0.61
385 0.58
386 0.57
387 0.58
388 0.63
389 0.58
390 0.56
391 0.5
392 0.43
393 0.37
394 0.36
395 0.34
396 0.27
397 0.21
398 0.13
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.14
406 0.15
407 0.17
408 0.2
409 0.22
410 0.29
411 0.33
412 0.38
413 0.39
414 0.45
415 0.49
416 0.55
417 0.57
418 0.53
419 0.59
420 0.63
421 0.68
422 0.66
423 0.61
424 0.59
425 0.62
426 0.63
427 0.61
428 0.61
429 0.62
430 0.68
431 0.75
432 0.77
433 0.78
434 0.81
435 0.81
436 0.82
437 0.84
438 0.82
439 0.81
440 0.79
441 0.79
442 0.77
443 0.75
444 0.71
445 0.62
446 0.56
447 0.48
448 0.39
449 0.32
450 0.24
451 0.18
452 0.12
453 0.1
454 0.08