Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V6VAA8

Protein Details
Accession A0A1V6VAA8    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-45SEDAPPARKKVHRKADKAYDQGQHydrophilic
52-75KGDASKPKVTRKFKDKFAPKPEKEBasic
261-315ITATDTQKEKSKKKEHKETKAVSQKDKLVSKDDKHSTKKEKPARSGRASKKDEAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-37APSKRKTRDGSEDAPPARKKVHRKA
57-73KPKVTRKFKDKFAPKPE
269-311EKSKKKEHKETKAVSQKDKLVSKDDKHSTKKEKPARSGRASKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019310  Efg1  
Gene Ontology GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10153  Efg1  
Amino Acid Sequences MSTDTRSDRDRAAPSKRKTRDGSEDAPPARKKVHRKADKAYDQGQFVDFDSKGDASKPKVTRKFKDKFAPKPEKEYPSINDLKKRIRDVKRLLNKMDLSADARILQERALAGYEQDLADETTRRERSSLIKKYHFVRFLDRKTATKELNRLTRREKEEDLDSKQKARLAAKIHTCQVNLNYAIYYPLTEKYISIYPNGKPDATDPQSELQTEETKSNDSKPPLWPVVEKCMEEKTLDLLRNGKLHINANGEKIRNSSSGTITATDTQKEKSKKKEHKETKAVSQKDKLVSKDDKHSTKKEKPARSGRASKKDEAPQQANAEEQDDSDGGFFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.74
3 0.76
4 0.78
5 0.75
6 0.76
7 0.75
8 0.73
9 0.7
10 0.67
11 0.7
12 0.64
13 0.67
14 0.6
15 0.52
16 0.52
17 0.54
18 0.56
19 0.58
20 0.66
21 0.67
22 0.73
23 0.8
24 0.84
25 0.85
26 0.82
27 0.78
28 0.71
29 0.63
30 0.56
31 0.48
32 0.37
33 0.3
34 0.28
35 0.21
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.29
44 0.35
45 0.43
46 0.53
47 0.61
48 0.67
49 0.74
50 0.76
51 0.77
52 0.81
53 0.8
54 0.8
55 0.82
56 0.85
57 0.77
58 0.79
59 0.78
60 0.73
61 0.67
62 0.62
63 0.53
64 0.51
65 0.56
66 0.51
67 0.5
68 0.49
69 0.54
70 0.54
71 0.59
72 0.6
73 0.61
74 0.67
75 0.68
76 0.73
77 0.75
78 0.76
79 0.71
80 0.68
81 0.6
82 0.52
83 0.46
84 0.37
85 0.29
86 0.23
87 0.21
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.11
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.27
114 0.36
115 0.44
116 0.44
117 0.47
118 0.5
119 0.54
120 0.59
121 0.55
122 0.46
123 0.47
124 0.48
125 0.47
126 0.52
127 0.49
128 0.45
129 0.45
130 0.49
131 0.43
132 0.38
133 0.41
134 0.38
135 0.46
136 0.46
137 0.45
138 0.46
139 0.5
140 0.51
141 0.5
142 0.45
143 0.39
144 0.43
145 0.43
146 0.43
147 0.42
148 0.37
149 0.35
150 0.35
151 0.34
152 0.3
153 0.27
154 0.26
155 0.23
156 0.28
157 0.32
158 0.34
159 0.34
160 0.33
161 0.32
162 0.29
163 0.26
164 0.24
165 0.18
166 0.16
167 0.13
168 0.11
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.14
179 0.13
180 0.15
181 0.17
182 0.17
183 0.23
184 0.24
185 0.21
186 0.19
187 0.2
188 0.27
189 0.26
190 0.26
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.24
195 0.23
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.2
204 0.23
205 0.23
206 0.25
207 0.27
208 0.33
209 0.33
210 0.33
211 0.33
212 0.31
213 0.37
214 0.38
215 0.35
216 0.3
217 0.3
218 0.29
219 0.26
220 0.23
221 0.19
222 0.21
223 0.22
224 0.21
225 0.22
226 0.24
227 0.26
228 0.26
229 0.24
230 0.22
231 0.24
232 0.27
233 0.31
234 0.3
235 0.33
236 0.37
237 0.35
238 0.33
239 0.32
240 0.3
241 0.25
242 0.25
243 0.23
244 0.2
245 0.22
246 0.23
247 0.22
248 0.21
249 0.25
250 0.24
251 0.23
252 0.23
253 0.23
254 0.29
255 0.36
256 0.42
257 0.47
258 0.57
259 0.65
260 0.74
261 0.82
262 0.85
263 0.88
264 0.92
265 0.87
266 0.87
267 0.86
268 0.82
269 0.77
270 0.72
271 0.68
272 0.65
273 0.64
274 0.56
275 0.54
276 0.56
277 0.55
278 0.58
279 0.61
280 0.62
281 0.64
282 0.71
283 0.73
284 0.74
285 0.8
286 0.8
287 0.81
288 0.82
289 0.85
290 0.86
291 0.86
292 0.87
293 0.87
294 0.88
295 0.85
296 0.8
297 0.78
298 0.77
299 0.75
300 0.74
301 0.68
302 0.64
303 0.62
304 0.57
305 0.51
306 0.43
307 0.36
308 0.27
309 0.23
310 0.19
311 0.15
312 0.14