Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4F5W7

Protein Details
Accession A0A0C4F5W7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-68TVSGRPPPKTARRQSKLNNLDRRRICHydrophilic
240-324SRSSRKTSTSSRRRTTRRRKTRTTTRKRTTTTTKKRKRTTRTTKRKRKSETPPTRPSTTNPRPPSRARTRRRPRKTARTGRRISSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-323RKTSTSSRRRTTRRRKTRTTTRKRTTTTTKKRKRTTRTTKRKRKSETPPTRPSTTNPRPPSRARTRRRPRKTARTGRRIS
Subcellular Location(s) nucl 9mito 9mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MLSRPSPSALALQQPPYQHPAPSLMQLDYPHPHPHHRSLSAATVSGRPPPKTARRQSKLNNLDRRRICEYAAAHPKATQEDIAVQWGIDRSSVSKILKYRDKWLSISPTARAAKVIKHRGGRFPQLETEVVRRCKEKSGAGGFLGDRTIKDVALDVSHEMGLAEGAFKASNGWLDAFKERAQIKGGRFLDLNAHSPTHPALSFAADHHHYHHQQHPYPPLLLLLRLRLRLHSSSPRTSTSRSSRKTSTSSRRRTTRRRKTRTTTRKRTTTTTKKRKRTTRTTKRKRKSETPPTRPSTTNPRPPSRARTRRRPRKTARTGRRISSIRNIRNIRNIHNNINIRNIRNIRNNISNTSNNTSNNNINNSSTNSSITSSSNMTRTTPRLSRPLSSPRPTGSGSSRRTAPPTACNSSSPSCAPSPSSLFSLSVACYGLADRWIVDGSWWMAGAAGAPLERLCLDTLSLIALSLIALSLIALSLITLSLITLSLITLCFHPHSLKILIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.41
4 0.4
5 0.34
6 0.31
7 0.32
8 0.31
9 0.35
10 0.34
11 0.29
12 0.3
13 0.3
14 0.33
15 0.3
16 0.31
17 0.34
18 0.34
19 0.41
20 0.45
21 0.53
22 0.56
23 0.56
24 0.56
25 0.51
26 0.56
27 0.49
28 0.45
29 0.38
30 0.33
31 0.31
32 0.35
33 0.37
34 0.31
35 0.33
36 0.41
37 0.49
38 0.56
39 0.66
40 0.69
41 0.7
42 0.79
43 0.84
44 0.86
45 0.86
46 0.85
47 0.85
48 0.8
49 0.84
50 0.78
51 0.76
52 0.71
53 0.63
54 0.54
55 0.5
56 0.46
57 0.46
58 0.52
59 0.47
60 0.41
61 0.41
62 0.42
63 0.38
64 0.37
65 0.27
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.18
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.13
79 0.19
80 0.19
81 0.22
82 0.27
83 0.34
84 0.42
85 0.43
86 0.49
87 0.51
88 0.54
89 0.52
90 0.54
91 0.54
92 0.51
93 0.51
94 0.44
95 0.44
96 0.42
97 0.4
98 0.36
99 0.3
100 0.31
101 0.38
102 0.46
103 0.44
104 0.5
105 0.53
106 0.59
107 0.64
108 0.66
109 0.59
110 0.53
111 0.51
112 0.46
113 0.43
114 0.37
115 0.37
116 0.36
117 0.37
118 0.36
119 0.34
120 0.33
121 0.38
122 0.39
123 0.37
124 0.37
125 0.39
126 0.4
127 0.38
128 0.39
129 0.32
130 0.29
131 0.26
132 0.18
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.19
166 0.18
167 0.19
168 0.22
169 0.25
170 0.25
171 0.32
172 0.32
173 0.28
174 0.28
175 0.27
176 0.29
177 0.26
178 0.28
179 0.2
180 0.2
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.15
185 0.13
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.16
195 0.22
196 0.22
197 0.25
198 0.31
199 0.35
200 0.37
201 0.41
202 0.42
203 0.39
204 0.37
205 0.34
206 0.29
207 0.22
208 0.2
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.21
216 0.21
217 0.25
218 0.29
219 0.32
220 0.33
221 0.36
222 0.38
223 0.37
224 0.37
225 0.4
226 0.41
227 0.46
228 0.45
229 0.47
230 0.47
231 0.48
232 0.52
233 0.54
234 0.56
235 0.56
236 0.62
237 0.65
238 0.7
239 0.75
240 0.8
241 0.83
242 0.83
243 0.84
244 0.84
245 0.86
246 0.87
247 0.9
248 0.9
249 0.9
250 0.9
251 0.87
252 0.86
253 0.8
254 0.77
255 0.76
256 0.76
257 0.76
258 0.76
259 0.78
260 0.79
261 0.85
262 0.87
263 0.86
264 0.86
265 0.87
266 0.87
267 0.88
268 0.9
269 0.92
270 0.93
271 0.93
272 0.89
273 0.88
274 0.87
275 0.87
276 0.87
277 0.86
278 0.85
279 0.81
280 0.77
281 0.68
282 0.61
283 0.6
284 0.58
285 0.58
286 0.56
287 0.56
288 0.58
289 0.61
290 0.67
291 0.67
292 0.69
293 0.68
294 0.72
295 0.78
296 0.83
297 0.89
298 0.9
299 0.89
300 0.89
301 0.92
302 0.92
303 0.91
304 0.91
305 0.86
306 0.79
307 0.77
308 0.68
309 0.61
310 0.6
311 0.59
312 0.53
313 0.57
314 0.58
315 0.52
316 0.58
317 0.57
318 0.52
319 0.53
320 0.52
321 0.48
322 0.52
323 0.53
324 0.46
325 0.52
326 0.51
327 0.42
328 0.46
329 0.45
330 0.44
331 0.48
332 0.51
333 0.47
334 0.51
335 0.52
336 0.48
337 0.49
338 0.46
339 0.43
340 0.43
341 0.42
342 0.35
343 0.35
344 0.35
345 0.35
346 0.35
347 0.34
348 0.3
349 0.28
350 0.29
351 0.3
352 0.29
353 0.25
354 0.22
355 0.2
356 0.19
357 0.2
358 0.18
359 0.17
360 0.17
361 0.18
362 0.19
363 0.19
364 0.2
365 0.23
366 0.25
367 0.3
368 0.32
369 0.34
370 0.4
371 0.42
372 0.43
373 0.46
374 0.53
375 0.55
376 0.56
377 0.55
378 0.49
379 0.5
380 0.48
381 0.45
382 0.43
383 0.43
384 0.42
385 0.43
386 0.44
387 0.43
388 0.45
389 0.46
390 0.41
391 0.4
392 0.44
393 0.46
394 0.44
395 0.43
396 0.45
397 0.43
398 0.43
399 0.35
400 0.31
401 0.26
402 0.26
403 0.27
404 0.26
405 0.27
406 0.26
407 0.27
408 0.25
409 0.24
410 0.23
411 0.23
412 0.19
413 0.16
414 0.14
415 0.11
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.11
478 0.12
479 0.15
480 0.17
481 0.18
482 0.23