FuNGI

A0A1V6V635

Protein Details

Accession

A0A1V6V635

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-49	LMRMRRPKAADPLVRPKRRPVPKPAGATP	Hydrophilic
134-156	ESQFTRPVRLHRRDPRSRTHDPN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-44	RMRRPKAADPLVRPKRRPVPKP
405-427	EKREREARRVLGKGVRKALKKRE
460-470	RKKAEEEKAQK
476-477	KG
479-499	NTPSGRPKHTDALKKPSRKRL

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSTPTNPSNARTPTGPNGAPLMRMRRPKAADPLVRPKRRPVPKPAGATPAGNGTATKTLPSRPQTSNPQTIFQSDRPMLELSNNNMSANGFSGPLLSDKYFDYPVVTTKRALMEGLKHHIARFASKKSVDPRDESQFTRPVRLHRRDPRSRTHDPNSGRSEIDGQPMDEAEREAFDARKAAREKERAENLSQIAPALGSTSKRPNAPKQKTQQVFKSDMTPEEIARARIKYEEALPWHLEDFDNQHTWVGNYEAALSETHAVFILDNGKMRMIPVEKWYKFNAKSNFKALTIDEAEKFMAKRVKDPRWFMEKQQQLEQEKELETYAKQRKVYAGKQGTAAKGAGLEAGEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKDAEKRIKEDQLKANVFDLKDEKEYDAEEMREKREREARRVLGKGVRKALKKRERNFDYSSGSDVNPYTDEESSDDSETERAKEEERKKAEEEKAQKEANSSKGTNTPSGRPKHTDALKKPSRKRLGSPNASDASGTDTSRKKAKGMHLSTSQPPSRPISPSALQTGKKRVRNIPGGAGSGSDVDTVGSGAEMTEGGKIKKLKLNPVASRGGTPQGSRAASPLPRLPGSRANSPDVPRGQRVSTPISGNQTFPTAGEIHAAIPASGILSSDLLKVFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVSVYGKEDRMLRPGPWKGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.46
3	0.39
4	0.4
5	0.38
6	0.39
7	0.39
8	0.4
9	0.4
10	0.48
11	0.5
12	0.54
13	0.58
14	0.61
15	0.66
16	0.67
17	0.69
18	0.69
19	0.76
20	0.78
21	0.81
22	0.77
23	0.77
24	0.77
25	0.79
26	0.78
27	0.77
28	0.77
29	0.77
30	0.82
31	0.78
32	0.75
33	0.67
34	0.6
35	0.5
36	0.44
37	0.37
38	0.29
39	0.23
40	0.19
41	0.21
42	0.2
43	0.21
44	0.18
45	0.21
46	0.29
47	0.35
48	0.39
49	0.4
50	0.48
51	0.56
52	0.63
53	0.68
54	0.62
55	0.61
56	0.56
57	0.55
58	0.53
59	0.45
60	0.45
61	0.37
62	0.35
63	0.33
64	0.33
65	0.29
66	0.28
67	0.31
68	0.27
69	0.33
70	0.33
71	0.3
72	0.3
73	0.29
74	0.24
75	0.21
76	0.17
77	0.1
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.11
82	0.13
83	0.12
84	0.12
85	0.13
86	0.16
87	0.17
88	0.17
89	0.17
90	0.16
91	0.22
92	0.27
93	0.27
94	0.25
95	0.27
96	0.29
97	0.27
98	0.27
99	0.24
100	0.25
101	0.29
102	0.35
103	0.36
104	0.34
105	0.33
106	0.37
107	0.34
108	0.35
109	0.36
110	0.35
111	0.38
112	0.39
113	0.45
114	0.49
115	0.58
116	0.54
117	0.53
118	0.53
119	0.55
120	0.57
121	0.54
122	0.5
123	0.48
124	0.45
125	0.47
126	0.44
127	0.45
128	0.52
129	0.57
130	0.62
131	0.65
132	0.74
133	0.77
134	0.81
135	0.82
136	0.8
137	0.81
138	0.79
139	0.77
140	0.74
141	0.69
142	0.72
143	0.67
144	0.61
145	0.52
146	0.44
147	0.42
148	0.35
149	0.36
150	0.28
151	0.22
152	0.2
153	0.2
154	0.2
155	0.15
156	0.14
157	0.08
158	0.08
159	0.09
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.14
164	0.14
165	0.21
166	0.23
167	0.28
168	0.35
169	0.41
170	0.45
171	0.5
172	0.58
173	0.53
174	0.53
175	0.52
176	0.45
177	0.4
178	0.35
179	0.26
180	0.18
181	0.14
182	0.12
183	0.09
184	0.09
185	0.08
186	0.11
187	0.18
188	0.21
189	0.26
190	0.31
191	0.4
192	0.5
193	0.57
194	0.63
195	0.65
196	0.73
197	0.75
198	0.76
199	0.73
200	0.68
201	0.65
202	0.57
203	0.54
204	0.45
205	0.4
206	0.38
207	0.31
208	0.25
209	0.24
210	0.25
211	0.21
212	0.22
213	0.21
214	0.17
215	0.17
216	0.18
217	0.15
218	0.17
219	0.19
220	0.19
221	0.22
222	0.22
223	0.22
224	0.21
225	0.2
226	0.18
227	0.14
228	0.15
229	0.15
230	0.16
231	0.15
232	0.15
233	0.15
234	0.15
235	0.15
236	0.12
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.09
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.09
257	0.1
258	0.12
259	0.11
260	0.12
261	0.18
262	0.28
263	0.28
264	0.31
265	0.34
266	0.38
267	0.39
268	0.45
269	0.48
270	0.46
271	0.48
272	0.5
273	0.49
274	0.42
275	0.41
276	0.33
277	0.29
278	0.24
279	0.23
280	0.18
281	0.17
282	0.17
283	0.16
284	0.16
285	0.15
286	0.16
287	0.14
288	0.21
289	0.29
290	0.38
291	0.43
292	0.47
293	0.49
294	0.54
295	0.55
296	0.52
297	0.53
298	0.49
299	0.45
300	0.46
301	0.47
302	0.4
303	0.4
304	0.38
305	0.31
306	0.26
307	0.24
308	0.18
309	0.13
310	0.11
311	0.18
312	0.24
313	0.26
314	0.26
315	0.26
316	0.32
317	0.37
318	0.4
319	0.41
320	0.39
321	0.36
322	0.4
323	0.41
324	0.36
325	0.31
326	0.28
327	0.17
328	0.13
329	0.12
330	0.08
331	0.05
332	0.05
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.07
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.05
357	0.04
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.09
363	0.12
364	0.14
365	0.17
366	0.19
367	0.26
368	0.3
369	0.35
370	0.41
371	0.46
372	0.45
373	0.43
374	0.42
375	0.38
376	0.33
377	0.29
378	0.24
379	0.17
380	0.17
381	0.17
382	0.16
383	0.13
384	0.14
385	0.14
386	0.14
387	0.13
388	0.16
389	0.17
390	0.19
391	0.25
392	0.25
393	0.27
394	0.33
395	0.37
396	0.4
397	0.47
398	0.5
399	0.51
400	0.52
401	0.52
402	0.5
403	0.51
404	0.49
405	0.47
406	0.47
407	0.45
408	0.51
409	0.58
410	0.62
411	0.66
412	0.69
413	0.72
414	0.72
415	0.73
416	0.71
417	0.66
418	0.61
419	0.52
420	0.47
421	0.38
422	0.32
423	0.27
424	0.22
425	0.17
426	0.13
427	0.13
428	0.12
429	0.1
430	0.11
431	0.11
432	0.14
433	0.15
434	0.14
435	0.14
436	0.12
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.12
442	0.14
443	0.23
444	0.3
445	0.37
446	0.41
447	0.44
448	0.45
449	0.53
450	0.56
451	0.55
452	0.57
453	0.54
454	0.55
455	0.53
456	0.5
457	0.46
458	0.44
459	0.42
460	0.38
461	0.33
462	0.29
463	0.33
464	0.35
465	0.37
466	0.35
467	0.36
468	0.39
469	0.44
470	0.46
471	0.46
472	0.48
473	0.5
474	0.55
475	0.58
476	0.56
477	0.62
478	0.66
479	0.71
480	0.74
481	0.76
482	0.78
483	0.72
484	0.72
485	0.72
486	0.74
487	0.74
488	0.71
489	0.67
490	0.6
491	0.55
492	0.49
493	0.38
494	0.33
495	0.26
496	0.22
497	0.21
498	0.22
499	0.24
500	0.31
501	0.31
502	0.28
503	0.32
504	0.41
505	0.46
506	0.48
507	0.53
508	0.52
509	0.56
510	0.59
511	0.6
512	0.54
513	0.44
514	0.42
515	0.4
516	0.38
517	0.37
518	0.35
519	0.34
520	0.34
521	0.35
522	0.39
523	0.4
524	0.4
525	0.42
526	0.49
527	0.51
528	0.54
529	0.57
530	0.58
531	0.6
532	0.65
533	0.64
534	0.61
535	0.56
536	0.52
537	0.46
538	0.39
539	0.31
540	0.23
541	0.19
542	0.11
543	0.08
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.03
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.07
555	0.1
556	0.1
557	0.16
558	0.18
559	0.22
560	0.28
561	0.32
562	0.39
563	0.46
564	0.55
565	0.56
566	0.6
567	0.62
568	0.57
569	0.55
570	0.48
571	0.44
572	0.36
573	0.31
574	0.28
575	0.28
576	0.29
577	0.26
578	0.26
579	0.27
580	0.27
581	0.31
582	0.32
583	0.31
584	0.32
585	0.34
586	0.37
587	0.39
588	0.42
589	0.46
590	0.45
591	0.46
592	0.49
593	0.51
594	0.54
595	0.53
596	0.53
597	0.49
598	0.49
599	0.46
600	0.43
601	0.44
602	0.43
603	0.4
604	0.39
605	0.38
606	0.42
607	0.41
608	0.39
609	0.36
610	0.32
611	0.27
612	0.23
613	0.22
614	0.16
615	0.15
616	0.15
617	0.14
618	0.12
619	0.14
620	0.14
621	0.1
622	0.09
623	0.09
624	0.08
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.07
629	0.08
630	0.1
631	0.11
632	0.11
633	0.14
634	0.19
635	0.21
636	0.23
637	0.26
638	0.28
639	0.36
640	0.43
641	0.48
642	0.47
643	0.56
644	0.64
645	0.65
646	0.64
647	0.56
648	0.5
649	0.45
650	0.49
651	0.45
652	0.41
653	0.38
654	0.37
655	0.37
656	0.36
657	0.35
658	0.29
659	0.24
660	0.2
661	0.21
662	0.22
663	0.26
664	0.28
665	0.33
666	0.35
667	0.35
668	0.41

A0A1V6V635

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer