FuNGI

A0A1V6V9T7

Protein Details

Accession

A0A1V6V9T7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-445	RRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRS

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 7, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSNKYPKIVSPVIEEQAQVVDGEEIPIDITRPNPNGEEQDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPADEQEMMMEIYKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKENDQKKEELHKMLAQQHVTKTGEQLIREEVVQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPGWENLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPNHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSRPRGCRLCGQNGHKAEECLGRPKEKNGEFDEKQNAAPLKPFIWLHVAVLREYLAVELRVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNLPAMGSYLTKDGSVELKNAQIILQGLAKQEDAIFARRRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRSSPQRDLTAGDRSRGEPAPPMELITPGRGHLNKETRELTHSMVINRGAVYRANMENKSAAAVLKSRLMKGSQDEAGNSETSVTDAQEISSEIPEQASPGILGKRKADVAEPDVTEAGTPGRDSPPPVPIVAEKPKQDEVQEDTVKLWEPGYADRYYEQKFGVDPKDLEFRHQVAREYAVGLCWVLRYYFQGCPSWTWYYPRHYAPFAADFVDIADMDVQFEKGTIFKPFEQLMGVLPAASNHALPKVFHPLMENPDSEIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVILLPFIDESRLLNAMAKVYPLLTEEEKIRNSHGQDVLLLSDRNPLYQDLVANFYSKKPGPAQYTLKEDVSDGLAGIVERSDTYIPHSSLVSPLEAHGMPGVDDDRSLTVLYKIPKSSHVHKSMLLRGVKLPTPMLDSNDIRATQNRSQNSGRSFGGAPFQGRGRGGRMNYSSDRPNPFAAHLDPKFNTGPQGGAGGAPMVPPGWVPPGQGYGGYARGPPPPPRGGMSHQYPPQHSYQQPGDYYAHQNNQYNQGGQYNNAHQSGYGSQDHRGGRGGNRGGRGRGGQHRDHYPHNQGGGGYNRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.48
3	0.52
4	0.52
5	0.47
6	0.44
7	0.45
8	0.44
9	0.4
10	0.38
11	0.3
12	0.27
13	0.25
14	0.17
15	0.12
16	0.1
17	0.09
18	0.1
19	0.09
20	0.07
21	0.08
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.11
26	0.17
27	0.19
28	0.22
29	0.24
30	0.28
31	0.33
32	0.34
33	0.36
34	0.32
35	0.35
36	0.33
37	0.33
38	0.29
39	0.24
40	0.22
41	0.18
42	0.15
43	0.1
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.11
48	0.13
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.36
54	0.42
55	0.47
56	0.47
57	0.5
58	0.51
59	0.54
60	0.46
61	0.4
62	0.36
63	0.31
64	0.28
65	0.22
66	0.17
67	0.13
68	0.15
69	0.13
70	0.12
71	0.12
72	0.15
73	0.15
74	0.19
75	0.24
76	0.3
77	0.38
78	0.47
79	0.48
80	0.47
81	0.49
82	0.47
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.36
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.74
103	0.79
104	0.8
105	0.77
106	0.73
107	0.75
108	0.74
109	0.71
110	0.72
111	0.69
112	0.66
113	0.71
114	0.68
115	0.6
116	0.55
117	0.48
118	0.42
119	0.46
120	0.48
121	0.44
122	0.44
123	0.46
124	0.48
125	0.53
126	0.55
127	0.49
128	0.46
129	0.43
130	0.46
131	0.43
132	0.37
133	0.33
134	0.35
135	0.34
136	0.3
137	0.3
138	0.26
139	0.25
140	0.25
141	0.27
142	0.2
143	0.19
144	0.2
145	0.19
146	0.17
147	0.17
148	0.21
149	0.19
150	0.2
151	0.22
152	0.23
153	0.23
154	0.21
155	0.22
156	0.19
157	0.17
158	0.15
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.2
175	0.27
176	0.26
177	0.29
178	0.29
179	0.3
180	0.34
181	0.31
182	0.28
183	0.22
184	0.23
185	0.2
186	0.19
187	0.15
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.28
206	0.29
207	0.31
208	0.35
209	0.41
210	0.48
211	0.52
212	0.59
213	0.59
214	0.64
215	0.65
216	0.62
217	0.64
218	0.56
219	0.48
220	0.38
221	0.31
222	0.26
223	0.25
224	0.2
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.08
240	0.1
241	0.11
242	0.15
243	0.15
244	0.16
245	0.18
246	0.19
247	0.18
248	0.2
249	0.2
250	0.18
251	0.21
252	0.23
253	0.24
254	0.25
255	0.27
256	0.25
257	0.27
258	0.34
259	0.37
260	0.44
261	0.5
262	0.52
263	0.58
264	0.59
265	0.61
266	0.54
267	0.48
268	0.4
269	0.37
270	0.34
271	0.33
272	0.33
273	0.35
274	0.35
275	0.39
276	0.45
277	0.43
278	0.47
279	0.45
280	0.52
281	0.47
282	0.51
283	0.53
284	0.45
285	0.41
286	0.4
287	0.35
288	0.26
289	0.27
290	0.23
291	0.17
292	0.19
293	0.19
294	0.16
295	0.19
296	0.18
297	0.17
298	0.19
299	0.19
300	0.15
301	0.16
302	0.14
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.09
310	0.12
311	0.16
312	0.17
313	0.18
314	0.2
315	0.21
316	0.22
317	0.25
318	0.24
319	0.2
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.19
324	0.19
325	0.13
326	0.11
327	0.1
328	0.09
329	0.08
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.08
345	0.12
346	0.15
347	0.16
348	0.15
349	0.16
350	0.16
351	0.15
352	0.14
353	0.1
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.1
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.1
395	0.13
396	0.17
397	0.17
398	0.24
399	0.25
400	0.28
401	0.32
402	0.41
403	0.45
404	0.52
405	0.58
406	0.57
407	0.64
408	0.68
409	0.72
410	0.72
411	0.69
412	0.68
413	0.69
414	0.69
415	0.66
416	0.68
417	0.66
418	0.66
419	0.68
420	0.61
421	0.55
422	0.51
423	0.55
424	0.53
425	0.52
426	0.51
427	0.5
428	0.53
429	0.6
430	0.69
431	0.72
432	0.75
433	0.77
434	0.79
435	0.75
436	0.71
437	0.63
438	0.56
439	0.54
440	0.45
441	0.36
442	0.28
443	0.24
444	0.26
445	0.25
446	0.22
447	0.17
448	0.17
449	0.18
450	0.17
451	0.17
452	0.14
453	0.15
454	0.15
455	0.13
456	0.12
457	0.1
458	0.13
459	0.13
460	0.15
461	0.2
462	0.26
463	0.26
464	0.3
465	0.31
466	0.28
467	0.31
468	0.3
469	0.25
470	0.22
471	0.22
472	0.19
473	0.19
474	0.19
475	0.16
476	0.15
477	0.13
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.1
482	0.12
483	0.15
484	0.15
485	0.16
486	0.16
487	0.15
488	0.15
489	0.12
490	0.1
491	0.07
492	0.08
493	0.08
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.14
498	0.14
499	0.15
500	0.16
501	0.18
502	0.16
503	0.16
504	0.15
505	0.16
506	0.16
507	0.15
508	0.12
509	0.09
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.05
527	0.05
528	0.04
529	0.06
530	0.09
531	0.11
532	0.12
533	0.13
534	0.14
535	0.15
536	0.16
537	0.16
538	0.15
539	0.17
540	0.19
541	0.18
542	0.17
543	0.17
544	0.16
545	0.14
546	0.12
547	0.08
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.07
552	0.08
553	0.1
554	0.12
555	0.15
556	0.15
557	0.15
558	0.15
559	0.14
560	0.2
561	0.25
562	0.27
563	0.25
564	0.28
565	0.31
566	0.3
567	0.3
568	0.27
569	0.25
570	0.29
571	0.28
572	0.25
573	0.23
574	0.23
575	0.23
576	0.2
577	0.15
578	0.08
579	0.08
580	0.1
581	0.13
582	0.12
583	0.13
584	0.14
585	0.18
586	0.19
587	0.19
588	0.17
589	0.15
590	0.15
591	0.19
592	0.21
593	0.19
594	0.18
595	0.19
596	0.26
597	0.25
598	0.27
599	0.26
600	0.25
601	0.28
602	0.29
603	0.29
604	0.22
605	0.24
606	0.22
607	0.2
608	0.18
609	0.12
610	0.11
611	0.09
612	0.08
613	0.06
614	0.06
615	0.05
616	0.05
617	0.08
618	0.11
619	0.14
620	0.16
621	0.18
622	0.19
623	0.21
624	0.25
625	0.27
626	0.25
627	0.27
628	0.29
629	0.32
630	0.36
631	0.38
632	0.36
633	0.33
634	0.33
635	0.31
636	0.3
637	0.25
638	0.21
639	0.17
640	0.14
641	0.13
642	0.12
643	0.09
644	0.07
645	0.07
646	0.05
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.06
654	0.07
655	0.09
656	0.11
657	0.12
658	0.15
659	0.16
660	0.16
661	0.16
662	0.15
663	0.13
664	0.12
665	0.12
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.06
673	0.08
674	0.09
675	0.1
676	0.12
677	0.19
678	0.19
679	0.19
680	0.22
681	0.23
682	0.28
683	0.3
684	0.28
685	0.21
686	0.23
687	0.22
688	0.19
689	0.17
690	0.11
691	0.1
692	0.1
693	0.1
694	0.09
695	0.09
696	0.1
697	0.09
698	0.09
699	0.1
700	0.14
701	0.14
702	0.14
703	0.16
704	0.15
705	0.17
706	0.18
707	0.17
708	0.15
709	0.14
710	0.14
711	0.16
712	0.17
713	0.15
714	0.14
715	0.13
716	0.11
717	0.11
718	0.1
719	0.06
720	0.05
721	0.07
722	0.08
723	0.09
724	0.1
725	0.11
726	0.12
727	0.12
728	0.12
729	0.1
730	0.09
731	0.1
732	0.09
733	0.11
734	0.1
735	0.12
736	0.15
737	0.2
738	0.22
739	0.22
740	0.24
741	0.25
742	0.26
743	0.31
744	0.3
745	0.25
746	0.24
747	0.24
748	0.23
749	0.21
750	0.19
751	0.13
752	0.17
753	0.17
754	0.16
755	0.17
756	0.16
757	0.16
758	0.17
759	0.19
760	0.14
761	0.17
762	0.17
763	0.18
764	0.18
765	0.16
766	0.21
767	0.19
768	0.21
769	0.22
770	0.29
771	0.33
772	0.4
773	0.46
774	0.46
775	0.52
776	0.51
777	0.48
778	0.41
779	0.35
780	0.28
781	0.23
782	0.18
783	0.11
784	0.08
785	0.08
786	0.07
787	0.07
788	0.06
789	0.04
790	0.04
791	0.06
792	0.07
793	0.06
794	0.12
795	0.17
796	0.18
797	0.19
798	0.19
799	0.18
800	0.21
801	0.22
802	0.17
803	0.12
804	0.12
805	0.15
806	0.14
807	0.14
808	0.12
809	0.11
810	0.1
811	0.11
812	0.11
813	0.07
814	0.07
815	0.08
816	0.08
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.1
821	0.14
822	0.18
823	0.22
824	0.24
825	0.24
826	0.31
827	0.37
828	0.43
829	0.49
830	0.52
831	0.5
832	0.51
833	0.56
834	0.56
835	0.57
836	0.5
837	0.42
838	0.39
839	0.41
840	0.39
841	0.34
842	0.29
843	0.22
844	0.27
845	0.27
846	0.27
847	0.29
848	0.27
849	0.29
850	0.32
851	0.32
852	0.27
853	0.3
854	0.34
855	0.34
856	0.41
857	0.4
858	0.42
859	0.45
860	0.5
861	0.48
862	0.46
863	0.39
864	0.35
865	0.34
866	0.29
867	0.31
868	0.27
869	0.25
870	0.23
871	0.24
872	0.24
873	0.24
874	0.24
875	0.24
876	0.27
877	0.27
878	0.33
879	0.34
880	0.38
881	0.4
882	0.43
883	0.45
884	0.46
885	0.5
886	0.45
887	0.46
888	0.41
889	0.39
890	0.39
891	0.37
892	0.4
893	0.36
894	0.4
895	0.37
896	0.39
897	0.39
898	0.35
899	0.34
900	0.25
901	0.24
902	0.18
903	0.19
904	0.15
905	0.13
906	0.13
907	0.1
908	0.09
909	0.08
910	0.07
911	0.06
912	0.05
913	0.05
914	0.07
915	0.11
916	0.11
917	0.13
918	0.15
919	0.18
920	0.18
921	0.18
922	0.18
923	0.16
924	0.18
925	0.18
926	0.18
927	0.17
928	0.22
929	0.26
930	0.31
931	0.36
932	0.37
933	0.39
934	0.41
935	0.44
936	0.45
937	0.49
938	0.49
939	0.51
940	0.52
941	0.55
942	0.54
943	0.53
944	0.52
945	0.52
946	0.47
947	0.46
948	0.48
949	0.48
950	0.47
951	0.47
952	0.44
953	0.4
954	0.46
955	0.45
956	0.45
957	0.44
958	0.48
959	0.48
960	0.54
961	0.53
962	0.47
963	0.42
964	0.41
965	0.37
966	0.35
967	0.37
968	0.35
969	0.37
970	0.36
971	0.34
972	0.28
973	0.3
974	0.3
975	0.29
976	0.28
977	0.25
978	0.26
979	0.33
980	0.34
981	0.32
982	0.32
983	0.31
984	0.3
985	0.38
986	0.43
987	0.42
988	0.48
989	0.51
990	0.5
991	0.51
992	0.5
993	0.48
994	0.5
995	0.53
996	0.53
997	0.55
998	0.62
999	0.62
1000	0.66
1001	0.67
1002	0.65
1003	0.63
1004	0.58
1005	0.53
1006	0.44
1007	0.46

A0A1V6V9T7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer