Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6UP88

Protein Details
Accession A0A1V6UP88    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-386GGDRLPRPKSKGKQKQQPAHDPRGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-54KKG
368-374RPKSKGK
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
Gene Ontology GO:0003963  F:RNA-3'-phosphate cyclase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
Amino Acid Sequences MAASRSSSSSHVYLNGRTLEGGGQLVRIAIGLSALTGRPVSIDHVRANRGGKKGLKRSHVAAVKMLAEISGSKISGGEVGSQFLNFFPQSARSKIGPLLNLSQVTVKPEYDIKLTTAGAILLVFQALYPYLLYVGSQASAPFVKVNITGGTNAAWSPSYDYAAQVLIPNFAKLGLPPLSIILHKRGWSAGPVDLGSVTFLIHTLASEHNPESKNQPTGSLEKDQDRTTEPLCSFPRINLMDHERGKVTQIDITILAPDRPAINGDAEESTGSTVRQFMEHTTERTLRHKIRKLDPSIFAELSTLSLPFEEDTFSKSTAKSTPVPIKIHTSEATNHRSHVYILLVAHTSSGFRIGHEILGGVGGDRLPRPKSKGKQKQQPAHDPRGDSQDQIELSAAADLVRRCVEGFIGEISKEEIPIERSIAQPNQKDPSTAKRSCLDPNMRDQIVVFEALGKACHAGVHDTESTDIETLEDERDWTLHTKTAHWVCRKMLNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.3
4 0.28
5 0.27
6 0.21
7 0.19
8 0.18
9 0.13
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.05
17 0.05
18 0.04
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.13
28 0.17
29 0.22
30 0.27
31 0.33
32 0.36
33 0.39
34 0.45
35 0.46
36 0.45
37 0.48
38 0.5
39 0.54
40 0.62
41 0.65
42 0.66
43 0.64
44 0.64
45 0.66
46 0.64
47 0.56
48 0.49
49 0.44
50 0.39
51 0.34
52 0.3
53 0.2
54 0.15
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.15
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.17
76 0.21
77 0.24
78 0.28
79 0.25
80 0.28
81 0.32
82 0.35
83 0.3
84 0.3
85 0.31
86 0.31
87 0.3
88 0.28
89 0.27
90 0.23
91 0.25
92 0.23
93 0.19
94 0.17
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.17
100 0.18
101 0.18
102 0.17
103 0.15
104 0.12
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.1
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.07
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.17
173 0.16
174 0.17
175 0.17
176 0.15
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.07
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.09
194 0.1
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.19
199 0.22
200 0.24
201 0.23
202 0.24
203 0.22
204 0.24
205 0.27
206 0.27
207 0.26
208 0.26
209 0.29
210 0.27
211 0.26
212 0.25
213 0.24
214 0.2
215 0.23
216 0.19
217 0.23
218 0.24
219 0.26
220 0.23
221 0.21
222 0.27
223 0.24
224 0.24
225 0.21
226 0.25
227 0.29
228 0.3
229 0.31
230 0.24
231 0.23
232 0.24
233 0.21
234 0.17
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.14
266 0.16
267 0.18
268 0.21
269 0.24
270 0.25
271 0.29
272 0.35
273 0.36
274 0.44
275 0.49
276 0.52
277 0.57
278 0.64
279 0.66
280 0.65
281 0.62
282 0.57
283 0.55
284 0.47
285 0.38
286 0.3
287 0.24
288 0.19
289 0.14
290 0.1
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.09
299 0.1
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.15
304 0.17
305 0.21
306 0.21
307 0.26
308 0.32
309 0.38
310 0.39
311 0.39
312 0.42
313 0.4
314 0.41
315 0.35
316 0.29
317 0.27
318 0.32
319 0.36
320 0.3
321 0.3
322 0.27
323 0.27
324 0.25
325 0.23
326 0.17
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.09
335 0.07
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.11
353 0.13
354 0.17
355 0.24
356 0.33
357 0.43
358 0.53
359 0.63
360 0.7
361 0.78
362 0.85
363 0.87
364 0.87
365 0.89
366 0.86
367 0.85
368 0.79
369 0.72
370 0.64
371 0.63
372 0.54
373 0.44
374 0.36
375 0.31
376 0.26
377 0.24
378 0.22
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.06
384 0.09
385 0.08
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.15
405 0.17
406 0.17
407 0.18
408 0.24
409 0.3
410 0.35
411 0.37
412 0.4
413 0.44
414 0.42
415 0.43
416 0.41
417 0.46
418 0.48
419 0.47
420 0.46
421 0.44
422 0.48
423 0.51
424 0.58
425 0.57
426 0.51
427 0.57
428 0.61
429 0.56
430 0.53
431 0.46
432 0.4
433 0.32
434 0.29
435 0.19
436 0.13
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.1
445 0.12
446 0.13
447 0.18
448 0.19
449 0.19
450 0.2
451 0.2
452 0.2
453 0.17
454 0.16
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.14
464 0.16
465 0.17
466 0.2
467 0.21
468 0.23
469 0.31
470 0.4
471 0.47
472 0.5
473 0.53
474 0.53