FuNGI

A0A1V6V213

Protein Details

Accession

A0A1V6V213

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-104	EPPKPVMKYKPKAVGRRSKQEREE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
84-100	KPVMKYKPKAVGRRSKQ
123-160	IQRGRGGTARRGGFRGRGGPMAMGMSGFGGRGGKRGRG

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKATSRGSARGGPANRGTRTDTTTPTPAGGGTAPNAPTTTGAPGPASRASVQRLQSLNKRTPSGSIAPSTRPPSALAGEPPKPVMKYKPKAVGRRSKQEREEIERLEQERYNERLKEAAAIQRGRGGTARRGGFRGRGGPMAMGMSGFGGRGGKRGRGGYGGGGGGGYGGGSGGAGSGYNRSGLTGGNNRGRAYDSSDDEENALRVSIDHINLDSDDEDWDTPKDFKGKQPSRSSGGLRPVRVERHEHEERVISVNMESSTSRTDDLRKKAEKEKVAKDVGRTPTKVKPEPQDDDTTMQDAIPHADDDDFLPEHNVRVRSAQSMSPTKRSTTELRSTQQTPEPELPDPRSLLNTKEEIDEYDRHMEDLAIIRDLLVPKESKKVTTEAEATEGAAEGITPAVEGQDGDESNEKKEEEVEEDNPLHGQMFLMQFPPMTPYLKVAGSAEQQPAVTTAAPHNEIKREAGEDVEIVEHIKPTEQQESSVFTAGQPWSLPTGRVGKLNVHQSGRVTLDWGGISMELDRGAPVGFVQEAVIMSKPSPESEEETKKNVWSMGQLSGKFTVTPNWDAML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.53
3	0.53
4	0.51
5	0.49
6	0.51
7	0.46
8	0.5
9	0.49
10	0.45
11	0.43
12	0.45
13	0.43
14	0.38
15	0.34
16	0.27
17	0.24
18	0.21
19	0.17
20	0.14
21	0.17
22	0.17
23	0.17
24	0.18
25	0.16
26	0.17
27	0.17
28	0.19
29	0.15
30	0.16
31	0.17
32	0.17
33	0.21
34	0.21
35	0.22
36	0.2
37	0.23
38	0.26
39	0.31
40	0.33
41	0.36
42	0.39
43	0.42
44	0.48
45	0.53
46	0.56
47	0.55
48	0.56
49	0.49
50	0.49
51	0.48
52	0.46
53	0.42
54	0.4
55	0.38
56	0.39
57	0.44
58	0.45
59	0.41
60	0.36
61	0.33
62	0.31
63	0.3
64	0.29
65	0.3
66	0.32
67	0.34
68	0.35
69	0.35
70	0.35
71	0.33
72	0.34
73	0.37
74	0.41
75	0.46
76	0.52
77	0.6
78	0.66
79	0.73
80	0.8
81	0.81
82	0.79
83	0.82
84	0.84
85	0.83
86	0.8
87	0.8
88	0.77
89	0.75
90	0.73
91	0.66
92	0.62
93	0.58
94	0.55
95	0.49
96	0.44
97	0.38
98	0.38
99	0.38
100	0.39
101	0.35
102	0.34
103	0.32
104	0.3
105	0.31
106	0.27
107	0.29
108	0.3
109	0.3
110	0.29
111	0.32
112	0.31
113	0.28
114	0.29
115	0.26
116	0.25
117	0.31
118	0.34
119	0.32
120	0.34
121	0.36
122	0.36
123	0.37
124	0.37
125	0.32
126	0.3
127	0.28
128	0.26
129	0.24
130	0.2
131	0.16
132	0.1
133	0.08
134	0.06
135	0.06
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.06
140	0.12
141	0.14
142	0.17
143	0.2
144	0.21
145	0.22
146	0.23
147	0.24
148	0.2
149	0.2
150	0.17
151	0.13
152	0.12
153	0.1
154	0.07
155	0.06
156	0.05
157	0.02
158	0.02
159	0.02
160	0.02
161	0.02
162	0.02
163	0.02
164	0.02
165	0.03
166	0.04
167	0.05
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.07
173	0.12
174	0.17
175	0.23
176	0.27
177	0.3
178	0.29
179	0.3
180	0.31
181	0.28
182	0.27
183	0.26
184	0.23
185	0.24
186	0.25
187	0.25
188	0.23
189	0.22
190	0.16
191	0.12
192	0.1
193	0.06
194	0.06
195	0.08
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.12
203	0.09
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.15
214	0.15
215	0.21
216	0.31
217	0.38
218	0.45
219	0.53
220	0.55
221	0.55
222	0.58
223	0.56
224	0.5
225	0.53
226	0.48
227	0.4
228	0.39
229	0.38
230	0.37
231	0.36
232	0.36
233	0.28
234	0.33
235	0.36
236	0.33
237	0.31
238	0.29
239	0.28
240	0.27
241	0.24
242	0.16
243	0.12
244	0.13
245	0.12
246	0.11
247	0.1
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.1
252	0.09
253	0.16
254	0.22
255	0.28
256	0.35
257	0.37
258	0.41
259	0.48
260	0.54
261	0.54
262	0.55
263	0.55
264	0.53
265	0.55
266	0.51
267	0.46
268	0.47
269	0.46
270	0.43
271	0.38
272	0.35
273	0.36
274	0.41
275	0.42
276	0.39
277	0.4
278	0.43
279	0.45
280	0.45
281	0.43
282	0.39
283	0.37
284	0.33
285	0.27
286	0.21
287	0.16
288	0.14
289	0.1
290	0.09
291	0.07
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.13
304	0.13
305	0.11
306	0.14
307	0.15
308	0.16
309	0.18
310	0.19
311	0.2
312	0.27
313	0.29
314	0.34
315	0.34
316	0.32
317	0.33
318	0.35
319	0.35
320	0.33
321	0.39
322	0.38
323	0.39
324	0.43
325	0.43
326	0.42
327	0.41
328	0.36
329	0.32
330	0.31
331	0.31
332	0.28
333	0.3
334	0.3
335	0.27
336	0.27
337	0.23
338	0.22
339	0.2
340	0.21
341	0.21
342	0.2
343	0.19
344	0.19
345	0.19
346	0.17
347	0.2
348	0.19
349	0.19
350	0.22
351	0.21
352	0.19
353	0.19
354	0.17
355	0.15
356	0.17
357	0.15
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.12
362	0.13
363	0.12
364	0.1
365	0.11
366	0.12
367	0.19
368	0.2
369	0.19
370	0.21
371	0.24
372	0.24
373	0.27
374	0.28
375	0.22
376	0.24
377	0.22
378	0.2
379	0.17
380	0.15
381	0.1
382	0.07
383	0.06
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.04
393	0.07
394	0.07
395	0.09
396	0.14
397	0.15
398	0.16
399	0.19
400	0.18
401	0.15
402	0.17
403	0.17
404	0.17
405	0.2
406	0.2
407	0.23
408	0.23
409	0.23
410	0.21
411	0.2
412	0.15
413	0.11
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.14
423	0.12
424	0.12
425	0.12
426	0.14
427	0.16
428	0.17
429	0.17
430	0.15
431	0.17
432	0.18
433	0.22
434	0.21
435	0.19
436	0.19
437	0.18
438	0.18
439	0.16
440	0.13
441	0.11
442	0.12
443	0.15
444	0.18
445	0.2
446	0.22
447	0.24
448	0.25
449	0.26
450	0.25
451	0.24
452	0.21
453	0.2
454	0.18
455	0.14
456	0.14
457	0.12
458	0.1
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.11
465	0.15
466	0.22
467	0.21
468	0.23
469	0.24
470	0.29
471	0.3
472	0.29
473	0.25
474	0.18
475	0.23
476	0.21
477	0.21
478	0.16
479	0.15
480	0.18
481	0.19
482	0.19
483	0.18
484	0.25
485	0.25
486	0.29
487	0.3
488	0.31
489	0.36
490	0.44
491	0.46
492	0.41
493	0.41
494	0.39
495	0.41
496	0.38
497	0.32
498	0.26
499	0.21
500	0.21
501	0.19
502	0.18
503	0.14
504	0.11
505	0.11
506	0.1
507	0.1
508	0.07
509	0.08
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.1
522	0.11
523	0.1
524	0.1
525	0.14
526	0.15
527	0.15
528	0.17
529	0.19
530	0.24
531	0.33
532	0.43
533	0.42
534	0.47
535	0.48
536	0.47
537	0.46
538	0.41
539	0.34
540	0.3
541	0.29
542	0.32
543	0.37
544	0.36
545	0.37
546	0.38
547	0.37
548	0.32
549	0.3
550	0.28
551	0.27
552	0.29

A0A1V6V213

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer