FuNGI

A0A1V6V946

Protein Details

Accession

A0A1V6V946

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-22	DKIKATMSPRPLKRPRVSYE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MPDKIKATMSPRPLKRPRVSYEDQDEASLAASYERPRQHPLYGQKSAFPGLDDEGDELLYDDPEDGFEYLRMVRSEANSLPVLFSAPIQTADQSNSASNAQRDLKTLDPNNPPLPAGFYEDEAYIAPAGDLYEDNAAHSPSKLDELYPDAQRSYNNLLRHRFLLLRSTLRCSPPAGAINALDNDHPISLPRKAAAAHKTWRRLLVTVEPRMVQLASMDMESVLEVLEILARMVSDVVRGDDTQRVRRIGAWAWGLLGKCREVGQLSTQEVGIIRNLGKRAATILRKVQELENDEYEEEADSSVADPTKEEIQQNNLVEDEKVTKDNVQQGSTIQNEGVPNQETQPEPTAQGEERTKHGYQLETKFLNREENKQEELPDTAEAKDSSMPDALLEQPELEAAKARLRAQLQNSRDPNETPASCEEEEDDWSIQTHALLDMIMTVVGEFFGQRDLLAEREVWD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.8
3	0.81
4	0.78
5	0.77
6	0.76
7	0.74
8	0.73
9	0.69
10	0.61
11	0.52
12	0.46
13	0.37
14	0.31
15	0.22
16	0.14
17	0.09
18	0.11
19	0.13
20	0.21
21	0.25
22	0.28
23	0.35
24	0.38
25	0.42
26	0.48
27	0.56
28	0.58
29	0.61
30	0.59
31	0.56
32	0.55
33	0.52
34	0.43
35	0.34
36	0.27
37	0.2
38	0.21
39	0.18
40	0.16
41	0.14
42	0.13
43	0.12
44	0.11
45	0.09
46	0.08
47	0.07
48	0.06
49	0.06
50	0.07
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.1
56	0.1
57	0.14
58	0.14
59	0.14
60	0.16
61	0.17
62	0.22
63	0.21
64	0.24
65	0.22
66	0.22
67	0.21
68	0.18
69	0.17
70	0.13
71	0.12
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.14
79	0.15
80	0.15
81	0.14
82	0.15
83	0.16
84	0.18
85	0.18
86	0.22
87	0.24
88	0.24
89	0.26
90	0.27
91	0.29
92	0.34
93	0.37
94	0.39
95	0.41
96	0.46
97	0.45
98	0.42
99	0.39
100	0.31
101	0.31
102	0.24
103	0.24
104	0.19
105	0.18
106	0.18
107	0.18
108	0.18
109	0.15
110	0.14
111	0.09
112	0.08
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.07
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.08
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.11
132	0.15
133	0.19
134	0.21
135	0.21
136	0.19
137	0.2
138	0.2
139	0.23
140	0.25
141	0.26
142	0.29
143	0.34
144	0.37
145	0.38
146	0.38
147	0.37
148	0.32
149	0.28
150	0.28
151	0.26
152	0.29
153	0.29
154	0.32
155	0.34
156	0.33
157	0.33
158	0.29
159	0.27
160	0.25
161	0.26
162	0.22
163	0.19
164	0.18
165	0.18
166	0.18
167	0.17
168	0.12
169	0.1
170	0.09
171	0.08
172	0.08
173	0.07
174	0.09
175	0.1
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.13
180	0.19
181	0.22
182	0.25
183	0.31
184	0.36
185	0.41
186	0.42
187	0.44
188	0.39
189	0.36
190	0.32
191	0.34
192	0.35
193	0.33
194	0.33
195	0.3
196	0.28
197	0.28
198	0.25
199	0.16
200	0.09
201	0.07
202	0.06
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.03
210	0.02
211	0.02
212	0.02
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.02
217	0.02
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.06
226	0.07
227	0.11
228	0.14
229	0.19
230	0.22
231	0.22
232	0.22
233	0.23
234	0.25
235	0.22
236	0.23
237	0.19
238	0.16
239	0.16
240	0.17
241	0.16
242	0.15
243	0.14
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.13
251	0.16
252	0.17
253	0.17
254	0.16
255	0.16
256	0.15
257	0.14
258	0.11
259	0.08
260	0.08
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.1
266	0.13
267	0.18
268	0.2
269	0.22
270	0.27
271	0.29
272	0.29
273	0.31
274	0.29
275	0.27
276	0.29
277	0.29
278	0.25
279	0.24
280	0.23
281	0.22
282	0.2
283	0.16
284	0.11
285	0.07
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.08
294	0.12
295	0.14
296	0.16
297	0.16
298	0.21
299	0.26
300	0.27
301	0.26
302	0.23
303	0.21
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.13
308	0.13
309	0.13
310	0.15
311	0.17
312	0.25
313	0.27
314	0.24
315	0.23
316	0.23
317	0.27
318	0.27
319	0.24
320	0.16
321	0.16
322	0.15
323	0.16
324	0.18
325	0.14
326	0.14
327	0.14
328	0.17
329	0.16
330	0.18
331	0.21
332	0.19
333	0.19
334	0.19
335	0.21
336	0.19
337	0.24
338	0.26
339	0.24
340	0.27
341	0.31
342	0.3
343	0.31
344	0.33
345	0.32
346	0.35
347	0.39
348	0.42
349	0.4
350	0.41
351	0.41
352	0.4
353	0.45
354	0.39
355	0.42
356	0.42
357	0.44
358	0.47
359	0.45
360	0.45
361	0.37
362	0.37
363	0.3
364	0.26
365	0.22
366	0.18
367	0.2
368	0.18
369	0.17
370	0.18
371	0.17
372	0.16
373	0.16
374	0.15
375	0.13
376	0.15
377	0.15
378	0.14
379	0.13
380	0.12
381	0.1
382	0.12
383	0.12
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.16
388	0.19
389	0.21
390	0.26
391	0.29
392	0.36
393	0.41
394	0.49
395	0.5
396	0.56
397	0.59
398	0.58
399	0.57
400	0.52
401	0.48
402	0.46
403	0.41
404	0.35
405	0.35
406	0.37
407	0.34
408	0.33
409	0.31
410	0.25
411	0.27
412	0.26
413	0.23
414	0.17
415	0.17
416	0.17
417	0.15
418	0.13
419	0.12
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.04
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.09
438	0.1
439	0.12
440	0.14

A0A1V6V946

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer