Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EHM4

Protein Details
Accession A0A0C4EHM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-65LHPVQRQNDAHKQRKKKVAHIHRTQTPKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-52KK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPPSVFRGPDAQHYALVHRSQRDPLLNDPDASAHVLHPVQRQNDAHKQRKKKVAHIHRTQTPKLTGRSPPQGLTRHELEASLGDGPATIRPNVGEASMYAIYYDDSEYDYMQHLKPVGLAKDAVLLEKPSTTTTKPGQPIELRAHDGPSQPALRLPDSVQPTPTEQMLSYQDHLTYALPAHSAIPDDGLLPLDDDPALREVLEALDDEAYVDELAAGDEFFGTIVRDGERPPDEPPAWIEQPQQPASQWEAEMARFIPALSSSRNTPLDDAASSAASPRQPTTSSKQPRSSLRSVPPSARGSLAGSAFSMSSSAMYRNQGLTDLDDRFDQVESLPPSPPLSQPPSLTCVQIEKEYESSDTESEGGSEASNATATPGPPVRADFEEIMDDFLGRFELLGGKMKPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.38
4 0.41
5 0.38
6 0.35
7 0.37
8 0.39
9 0.44
10 0.47
11 0.45
12 0.47
13 0.51
14 0.48
15 0.46
16 0.42
17 0.37
18 0.31
19 0.29
20 0.23
21 0.14
22 0.16
23 0.17
24 0.2
25 0.25
26 0.3
27 0.31
28 0.37
29 0.4
30 0.44
31 0.53
32 0.59
33 0.63
34 0.67
35 0.75
36 0.77
37 0.84
38 0.82
39 0.82
40 0.82
41 0.84
42 0.85
43 0.85
44 0.84
45 0.82
46 0.84
47 0.77
48 0.73
49 0.69
50 0.65
51 0.58
52 0.55
53 0.55
54 0.55
55 0.6
56 0.56
57 0.53
58 0.54
59 0.56
60 0.54
61 0.52
62 0.48
63 0.41
64 0.38
65 0.34
66 0.28
67 0.22
68 0.19
69 0.14
70 0.11
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.1
83 0.08
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.16
104 0.19
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.19
110 0.19
111 0.17
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.1
118 0.13
119 0.13
120 0.17
121 0.2
122 0.27
123 0.31
124 0.32
125 0.35
126 0.35
127 0.39
128 0.4
129 0.39
130 0.36
131 0.32
132 0.33
133 0.29
134 0.29
135 0.25
136 0.22
137 0.2
138 0.16
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.19
145 0.24
146 0.24
147 0.23
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.21
152 0.16
153 0.11
154 0.13
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.12
163 0.1
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.2
221 0.2
222 0.2
223 0.22
224 0.23
225 0.23
226 0.24
227 0.25
228 0.23
229 0.29
230 0.3
231 0.28
232 0.23
233 0.23
234 0.24
235 0.22
236 0.18
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.17
252 0.19
253 0.19
254 0.19
255 0.19
256 0.19
257 0.17
258 0.17
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.15
269 0.19
270 0.26
271 0.34
272 0.43
273 0.5
274 0.56
275 0.59
276 0.65
277 0.69
278 0.68
279 0.65
280 0.63
281 0.64
282 0.61
283 0.59
284 0.57
285 0.52
286 0.47
287 0.4
288 0.33
289 0.26
290 0.26
291 0.23
292 0.16
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.09
302 0.11
303 0.13
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.19
310 0.2
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.17
317 0.13
318 0.09
319 0.15
320 0.18
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.22
325 0.24
326 0.25
327 0.25
328 0.28
329 0.3
330 0.32
331 0.34
332 0.36
333 0.36
334 0.34
335 0.29
336 0.27
337 0.26
338 0.27
339 0.26
340 0.25
341 0.26
342 0.26
343 0.26
344 0.24
345 0.24
346 0.2
347 0.19
348 0.16
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.07
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.16
363 0.19
364 0.2
365 0.22
366 0.24
367 0.26
368 0.26
369 0.31
370 0.26
371 0.25
372 0.27
373 0.26
374 0.25
375 0.21
376 0.18
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.1
384 0.12
385 0.2