Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6UFD0

Protein Details
Accession A0A1V6UFD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-25QEQAAGKRKRARTQSCPPPELPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029028  Alpha/beta_knot_MTases  
IPR005304  Rbsml_bgen_MeTrfase_EMG1/NEP1  
IPR029026  tRNA_m1G_MTases_N  
Gene Ontology GO:0070037  F:rRNA (pseudouridine) methyltransferase activity  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03587  EMG1  
CDD cd18088  Nep1-like  
Amino Acid Sequences MSDQEQAAGKRKRARTQSCPPPELPQLVAEQHMPIPAHDKDTQRLIVVLSNASLETYKAVSSGRSGTKDEKFSLLNSDEHIGIMRKMNRDISEARPDITHQCLLTLLDSPVNKAGRLQIFIHTAKGVLIEVNPSVRIPRTFKRFAGLMVQLLHRLSIRSTNSQEKLLKVIKNPITDHLPPNCRKVTMSFEAPVVRTKDYLESLNPNESVAIFVGAMAKGHDDFADSFKDETISISNYSLSASVACSKFCHAAEEVWDIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.74
3 0.78
4 0.83
5 0.84
6 0.81
7 0.74
8 0.7
9 0.66
10 0.59
11 0.5
12 0.41
13 0.34
14 0.3
15 0.3
16 0.24
17 0.2
18 0.18
19 0.2
20 0.17
21 0.14
22 0.19
23 0.18
24 0.23
25 0.26
26 0.29
27 0.29
28 0.34
29 0.35
30 0.3
31 0.29
32 0.25
33 0.23
34 0.21
35 0.18
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.15
50 0.18
51 0.2
52 0.24
53 0.29
54 0.33
55 0.37
56 0.36
57 0.33
58 0.3
59 0.28
60 0.3
61 0.27
62 0.22
63 0.2
64 0.2
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.12
69 0.11
70 0.15
71 0.18
72 0.19
73 0.2
74 0.24
75 0.23
76 0.26
77 0.29
78 0.29
79 0.34
80 0.32
81 0.31
82 0.28
83 0.28
84 0.27
85 0.26
86 0.23
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.12
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.14
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.17
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.17
106 0.21
107 0.21
108 0.22
109 0.17
110 0.16
111 0.13
112 0.12
113 0.09
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.09
124 0.13
125 0.19
126 0.26
127 0.29
128 0.3
129 0.32
130 0.31
131 0.3
132 0.3
133 0.25
134 0.2
135 0.18
136 0.18
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.12
144 0.15
145 0.19
146 0.23
147 0.3
148 0.31
149 0.36
150 0.38
151 0.33
152 0.36
153 0.36
154 0.35
155 0.3
156 0.37
157 0.36
158 0.39
159 0.39
160 0.36
161 0.37
162 0.37
163 0.4
164 0.39
165 0.42
166 0.4
167 0.45
168 0.44
169 0.38
170 0.37
171 0.35
172 0.35
173 0.32
174 0.34
175 0.29
176 0.29
177 0.31
178 0.3
179 0.31
180 0.26
181 0.22
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.21
188 0.24
189 0.26
190 0.29
191 0.28
192 0.24
193 0.22
194 0.2
195 0.18
196 0.12
197 0.1
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.12
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.15
225 0.13
226 0.11
227 0.09
228 0.1
229 0.16
230 0.17
231 0.18
232 0.18
233 0.21
234 0.26
235 0.26
236 0.28
237 0.22
238 0.24
239 0.27