Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R7Z2

Protein Details
Accession C4R7Z2    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGTKTQKKNSKGRLDRYYYLHydrophilic
232-251AKVFNPHKKVRKREGYEEEDBasic
361-389ELVQNERQKQKREKRKKNEQKQDIIRRMQHydrophilic
722-746MEAKGRKKMRALRRFEKMRKKSDLIBasic
760-787QINALMRRLSKKENKKPKVTLIRATGKNHydrophilic
807-828VLKNEQRALRRIEKKSKNKKKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-325RK
369-378KQKREKRKKN
709-742KMRELNARPIKKVMEAKGRKKMRALRRFEKMRKK
766-828RRLSKKENKKPKVTLIRATGKNRGVSGRPKGVKGKYKMVDGVLKNEQRALRRIEKKSKNKKKH
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ppa:PAS_chr4_0464  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGTKTQKKNSKGRLDRYYYLAKEKGYRARSSFKLLQINEKYGHFLEKSRVVIDLCAAPGSWCQVASQVCPVNALIIGVDIVQIKPLPNCLTFQSDITTEDCRSKLRGHMKTWKADTVLHDGAPNVGLGWVQDAFTQSQLTLQALKLAVENLGVGGTFVTKIFRSKDYNNLMWIFQQLFDKVEATKPPASRNVSAEIFVVCKGFKAPKRIDPRLLDPKEVFQEVQSGAANNEAKVFNPHKKVRKREGYEEEDYLQFKTLPLMDWVKQEVDVVNILGTLNQFTIDKEDPDWKQVKKMEQTTKEFLECCKDLKVLGKKDFKHLLKWRKKARLLLELDKVEEKEDALVDVEPLDEEAQITKELDELVQNERQKQKREKRKKNEQKQDIIRRMQMNMLTDMQIGVDAVKADSASLFNLKIAERTGKLDDLASGKRAMVFHSEKDKPKPMVIVEETKEVDSETEIDLLENELNMGYAHELQKKIEKNPRLLAKDKTEGDDEEWEGIVSAEERKSSDDDYSDDDSDFDSDTERVLDSLIANRKIEEHNNDTGLSTTAQSFFSDSVFQALDSDEEEEQQAASKKLQHTQSLQRVEEESENDEELDEAEGSSESEFEIVPPKSQWNEDEMDISDEEEDTNLTKANQKNVDLATVEAMTLAHQVALGRMTKKDLIEEGINKYSFRQTNGLPAWFIDDEKEHSKIVKPITKEASDAIKEKMRELNARPIKKVMEAKGRKKMRALRRFEKMRKKSDLINDDSAKSENDKAEQINALMRRLSKKENKKPKVTLIRATGKNRGVSGRPKGVKGKYKMVDGVLKNEQRALRRIEKKSKNKKKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.8
3 0.76
4 0.75
5 0.67
6 0.65
7 0.59
8 0.51
9 0.5
10 0.54
11 0.57
12 0.54
13 0.57
14 0.55
15 0.59
16 0.6
17 0.62
18 0.61
19 0.6
20 0.62
21 0.58
22 0.62
23 0.6
24 0.62
25 0.55
26 0.49
27 0.46
28 0.38
29 0.41
30 0.32
31 0.3
32 0.31
33 0.34
34 0.35
35 0.32
36 0.33
37 0.29
38 0.28
39 0.27
40 0.24
41 0.18
42 0.16
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.17
47 0.15
48 0.12
49 0.12
50 0.16
51 0.18
52 0.19
53 0.26
54 0.26
55 0.26
56 0.27
57 0.27
58 0.23
59 0.21
60 0.19
61 0.11
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.16
73 0.18
74 0.19
75 0.21
76 0.22
77 0.28
78 0.27
79 0.28
80 0.26
81 0.23
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.2
86 0.23
87 0.23
88 0.23
89 0.24
90 0.26
91 0.33
92 0.4
93 0.46
94 0.5
95 0.59
96 0.64
97 0.7
98 0.71
99 0.67
100 0.58
101 0.54
102 0.49
103 0.47
104 0.42
105 0.34
106 0.3
107 0.26
108 0.25
109 0.22
110 0.18
111 0.09
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.15
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.07
147 0.11
148 0.14
149 0.19
150 0.25
151 0.28
152 0.38
153 0.43
154 0.45
155 0.47
156 0.45
157 0.41
158 0.36
159 0.35
160 0.26
161 0.2
162 0.2
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.16
167 0.14
168 0.17
169 0.18
170 0.21
171 0.26
172 0.26
173 0.29
174 0.36
175 0.4
176 0.4
177 0.4
178 0.41
179 0.36
180 0.35
181 0.32
182 0.25
183 0.2
184 0.18
185 0.16
186 0.1
187 0.09
188 0.11
189 0.18
190 0.21
191 0.29
192 0.34
193 0.42
194 0.52
195 0.58
196 0.63
197 0.61
198 0.65
199 0.67
200 0.65
201 0.6
202 0.51
203 0.5
204 0.45
205 0.42
206 0.33
207 0.22
208 0.24
209 0.2
210 0.21
211 0.17
212 0.14
213 0.12
214 0.17
215 0.18
216 0.13
217 0.16
218 0.14
219 0.14
220 0.2
221 0.25
222 0.27
223 0.35
224 0.43
225 0.5
226 0.59
227 0.68
228 0.72
229 0.78
230 0.78
231 0.79
232 0.8
233 0.78
234 0.73
235 0.66
236 0.57
237 0.48
238 0.42
239 0.33
240 0.25
241 0.17
242 0.13
243 0.13
244 0.11
245 0.1
246 0.13
247 0.16
248 0.17
249 0.19
250 0.21
251 0.19
252 0.19
253 0.18
254 0.15
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.2
273 0.2
274 0.26
275 0.31
276 0.27
277 0.32
278 0.36
279 0.41
280 0.42
281 0.5
282 0.53
283 0.56
284 0.61
285 0.59
286 0.57
287 0.52
288 0.45
289 0.37
290 0.34
291 0.27
292 0.23
293 0.2
294 0.18
295 0.17
296 0.25
297 0.32
298 0.34
299 0.41
300 0.47
301 0.46
302 0.53
303 0.61
304 0.54
305 0.55
306 0.57
307 0.6
308 0.62
309 0.7
310 0.73
311 0.74
312 0.77
313 0.74
314 0.71
315 0.69
316 0.65
317 0.62
318 0.59
319 0.5
320 0.47
321 0.41
322 0.35
323 0.26
324 0.2
325 0.14
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.1
350 0.15
351 0.16
352 0.2
353 0.28
354 0.32
355 0.39
356 0.48
357 0.55
358 0.62
359 0.72
360 0.79
361 0.82
362 0.89
363 0.93
364 0.93
365 0.94
366 0.91
367 0.89
368 0.88
369 0.88
370 0.84
371 0.75
372 0.69
373 0.59
374 0.52
375 0.44
376 0.36
377 0.27
378 0.21
379 0.19
380 0.15
381 0.13
382 0.12
383 0.1
384 0.08
385 0.06
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.1
404 0.1
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.13
409 0.12
410 0.12
411 0.14
412 0.13
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.15
420 0.16
421 0.17
422 0.25
423 0.3
424 0.32
425 0.36
426 0.41
427 0.36
428 0.36
429 0.36
430 0.29
431 0.29
432 0.29
433 0.3
434 0.25
435 0.26
436 0.26
437 0.23
438 0.22
439 0.17
440 0.14
441 0.09
442 0.09
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.06
458 0.09
459 0.12
460 0.13
461 0.14
462 0.2
463 0.23
464 0.29
465 0.35
466 0.37
467 0.38
468 0.45
469 0.51
470 0.5
471 0.51
472 0.49
473 0.47
474 0.49
475 0.45
476 0.4
477 0.34
478 0.3
479 0.28
480 0.26
481 0.21
482 0.15
483 0.14
484 0.12
485 0.1
486 0.09
487 0.07
488 0.05
489 0.07
490 0.06
491 0.07
492 0.08
493 0.09
494 0.1
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.17
500 0.2
501 0.19
502 0.18
503 0.17
504 0.16
505 0.15
506 0.14
507 0.09
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.06
517 0.12
518 0.17
519 0.19
520 0.19
521 0.19
522 0.21
523 0.23
524 0.27
525 0.27
526 0.26
527 0.27
528 0.28
529 0.29
530 0.26
531 0.25
532 0.21
533 0.16
534 0.12
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.07
551 0.09
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.07
557 0.1
558 0.12
559 0.11
560 0.12
561 0.17
562 0.19
563 0.25
564 0.29
565 0.31
566 0.35
567 0.44
568 0.51
569 0.52
570 0.51
571 0.46
572 0.43
573 0.41
574 0.37
575 0.3
576 0.23
577 0.18
578 0.18
579 0.16
580 0.15
581 0.13
582 0.11
583 0.1
584 0.07
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.05
591 0.04
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.14
599 0.18
600 0.19
601 0.21
602 0.22
603 0.2
604 0.22
605 0.21
606 0.22
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.17
611 0.13
612 0.11
613 0.1
614 0.08
615 0.07
616 0.06
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.14
621 0.17
622 0.25
623 0.28
624 0.29
625 0.33
626 0.33
627 0.35
628 0.29
629 0.26
630 0.2
631 0.16
632 0.14
633 0.1
634 0.09
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.05
639 0.05
640 0.06
641 0.06
642 0.09
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.17
647 0.19
648 0.2
649 0.21
650 0.2
651 0.21
652 0.24
653 0.27
654 0.3
655 0.32
656 0.32
657 0.3
658 0.3
659 0.34
660 0.31
661 0.31
662 0.3
663 0.25
664 0.35
665 0.38
666 0.38
667 0.31
668 0.29
669 0.3
670 0.26
671 0.26
672 0.18
673 0.16
674 0.19
675 0.22
676 0.24
677 0.2
678 0.21
679 0.25
680 0.29
681 0.35
682 0.36
683 0.35
684 0.41
685 0.47
686 0.47
687 0.44
688 0.42
689 0.41
690 0.39
691 0.38
692 0.34
693 0.33
694 0.32
695 0.34
696 0.37
697 0.34
698 0.37
699 0.4
700 0.46
701 0.51
702 0.55
703 0.54
704 0.52
705 0.5
706 0.5
707 0.53
708 0.5
709 0.52
710 0.57
711 0.64
712 0.7
713 0.75
714 0.71
715 0.72
716 0.74
717 0.74
718 0.74
719 0.75
720 0.74
721 0.77
722 0.85
723 0.86
724 0.88
725 0.86
726 0.85
727 0.84
728 0.79
729 0.77
730 0.76
731 0.74
732 0.7
733 0.7
734 0.64
735 0.56
736 0.54
737 0.47
738 0.39
739 0.33
740 0.31
741 0.25
742 0.24
743 0.26
744 0.26
745 0.28
746 0.28
747 0.26
748 0.28
749 0.27
750 0.26
751 0.26
752 0.28
753 0.31
754 0.35
755 0.43
756 0.47
757 0.56
758 0.66
759 0.74
760 0.8
761 0.84
762 0.87
763 0.88
764 0.89
765 0.85
766 0.82
767 0.8
768 0.81
769 0.79
770 0.77
771 0.75
772 0.68
773 0.64
774 0.58
775 0.54
776 0.5
777 0.51
778 0.54
779 0.57
780 0.56
781 0.58
782 0.64
783 0.68
784 0.71
785 0.69
786 0.7
787 0.64
788 0.66
789 0.64
790 0.6
791 0.6
792 0.52
793 0.53
794 0.52
795 0.51
796 0.46
797 0.48
798 0.47
799 0.44
800 0.47
801 0.48
802 0.49
803 0.56
804 0.65
805 0.7
806 0.77
807 0.83
808 0.89