FuNGI

A0A0C4ETC1

Protein Details

Accession

A0A0C4ETC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
267-296	YCGKKGQIAKDCPKKVKRKGKTAFRIAKLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
280-287	KKVKRKGK

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF03732 Retrotrans_gag PF17919 RT_RNaseH_2 PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MANDMAALHQRLDELTATVQEGRGLRKRAKADLAASQAGMVAPAIVPVIPDQQQVLAEAVPKGPKIGVPDKYDGTRGAKAVAYVTQIGLYVLSNPGMFPNNRTKVIFSISYLTGQASTWAQPYTTKLFAGQQVPYVKFSTAFQMMYYETKKALFQLKQTKTVAHYTFQFNQYATDTGWEMATLMSQYQQGLKKDIHLSLVLARAHFTELSDLCNLVLKIDNEVNGANLTVADPTPAANPNAMDLSAMRGALLDKEKSNMMKAGQCFYCGKKGQIAKDCPKKVKRKGKTAFRIAKLEEQVQQLKAGSEASGSATTTPRATFLIDSGATHNVMSDQFINEYGLHCRPTANERNVSGFDGLTSRNSREIDLIIDTDLNPTSFIVTKLKDLYDGILGMPWIRQFGQLIDWKDRRLRTRRPELALGHIATAEAVSSMPPKASKDGEEPVRQARQIDEGVRASCARTPPRSTTGKRACPLELFTQQYSMQESPMDVLAAAPAASSLLTTASKDGEEPVRQARQSDEGVRTSSAITPRDHAKQAQGATEDFFATAQAVSSLPTTASTDREEPVRQARQIDEGTGPMLDAAKASWSTSAQLAAKTQQATEVKPVEELVTPRYHRHLDMFWKYEAQRLPPRRKYDFWVDLIPRAMPQSSRIIPLSPVENKALEKLISERLEHGKIRRTTSPWAALVLFTRKKDGNLHPCFDYRKLNAITIKNKYPLPLTMDLLDSLLNADMFTKLNLRNAYGNLRVAKEDKDKLAFVCKAGQFAPLTMPFRPMGGPGLFQYFIQDLLLGRIGKDTAAYLDDIMVYTQKGSDHEDAVNSILDILSKHTLWLKPEKCEFSRQEVEYLGLLIACNRVRMDPTKVKAVTEWPAPTNLTDLQCFIGFTNFYRRFINHFFGTTCPLHDLTKVETKFVWNAECQHAFETLKTVFTTAPVLKIADPYCPFMLECDCSDYVLGAVLSQICKKDGKLHRVAYLLRSLIQAKRNYKIFNKELLAIVASFKEWWHYLEGNPNRLKAIVYTNHQNLESFRTTKQLTRRQARWAETLGCFGFDIVFRPGRQAAKPDALSRRPDLAPSKEDRLTFGQLLRPENITPETFSEVAGVNSWFVDESVDLDDASHWFEVDILGVFGDLKQLEDEEGRRPVLSDTKLISLIRKATGKDSKLTELIKGCQTDKSPRGGKSTGMLVHNGVLYKRGAVRVPENDAIKFEILRSRHDCRLVGHPGRAKMLVLVQRCFNWPGAKKFVNKWVGQLKRFPPVGDPQIPQDCVMDWPTSPIPWIGLVRPIHSEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.14
4	0.15
5	0.15
6	0.15
7	0.17
8	0.19
9	0.24
10	0.31
11	0.36
12	0.4
13	0.47
14	0.51
15	0.55
16	0.6
17	0.59
18	0.55
19	0.57
20	0.58
21	0.51
22	0.46
23	0.39
24	0.32
25	0.26
26	0.21
27	0.13
28	0.07
29	0.05
30	0.06
31	0.06
32	0.05
33	0.06
34	0.07
35	0.12
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.15
40	0.16
41	0.17
42	0.17
43	0.13
44	0.14
45	0.15
46	0.17
47	0.18
48	0.18
49	0.18
50	0.17
51	0.18
52	0.23
53	0.3
54	0.34
55	0.38
56	0.43
57	0.46
58	0.47
59	0.48
60	0.44
61	0.41
62	0.38
63	0.33
64	0.3
65	0.27
66	0.26
67	0.25
68	0.23
69	0.21
70	0.18
71	0.17
72	0.15
73	0.14
74	0.14
75	0.12
76	0.1
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.11
83	0.16
84	0.17
85	0.2
86	0.3
87	0.35
88	0.38
89	0.4
90	0.4
91	0.38
92	0.43
93	0.39
94	0.31
95	0.3
96	0.28
97	0.28
98	0.26
99	0.23
100	0.18
101	0.16
102	0.16
103	0.13
104	0.13
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.15
109	0.2
110	0.24
111	0.23
112	0.22
113	0.22
114	0.26
115	0.31
116	0.33
117	0.3
118	0.31
119	0.35
120	0.37
121	0.37
122	0.35
123	0.3
124	0.26
125	0.26
126	0.26
127	0.23
128	0.21
129	0.19
130	0.19
131	0.21
132	0.25
133	0.27
134	0.22
135	0.2
136	0.21
137	0.21
138	0.23
139	0.3
140	0.28
141	0.35
142	0.45
143	0.49
144	0.55
145	0.56
146	0.55
147	0.5
148	0.55
149	0.48
150	0.41
151	0.4
152	0.39
153	0.44
154	0.44
155	0.42
156	0.33
157	0.33
158	0.32
159	0.29
160	0.22
161	0.18
162	0.16
163	0.15
164	0.15
165	0.12
166	0.1
167	0.08
168	0.09
169	0.07
170	0.06
171	0.07
172	0.08
173	0.09
174	0.15
175	0.2
176	0.22
177	0.25
178	0.26
179	0.3
180	0.34
181	0.34
182	0.31
183	0.26
184	0.25
185	0.25
186	0.3
187	0.25
188	0.21
189	0.2
190	0.18
191	0.2
192	0.18
193	0.15
194	0.15
195	0.14
196	0.17
197	0.17
198	0.16
199	0.14
200	0.18
201	0.18
202	0.13
203	0.17
204	0.15
205	0.18
206	0.2
207	0.2
208	0.18
209	0.18
210	0.17
211	0.13
212	0.13
213	0.09
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.09
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.13
226	0.14
227	0.15
228	0.14
229	0.11
230	0.09
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.1
235	0.09
236	0.1
237	0.14
238	0.17
239	0.16
240	0.15
241	0.17
242	0.2
243	0.21
244	0.23
245	0.22
246	0.21
247	0.24
248	0.25
249	0.3
250	0.28
251	0.3
252	0.3
253	0.3
254	0.36
255	0.33
256	0.33
257	0.34
258	0.39
259	0.44
260	0.51
261	0.57
262	0.59
263	0.67
264	0.73
265	0.75
266	0.79
267	0.81
268	0.82
269	0.84
270	0.83
271	0.84
272	0.87
273	0.88
274	0.89
275	0.9
276	0.88
277	0.82
278	0.79
279	0.7
280	0.67
281	0.59
282	0.53
283	0.46
284	0.42
285	0.4
286	0.34
287	0.33
288	0.27
289	0.24
290	0.21
291	0.17
292	0.11
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.11
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.11
307	0.11
308	0.14
309	0.13
310	0.14
311	0.15
312	0.16
313	0.15
314	0.14
315	0.13
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.11
324	0.1
325	0.12
326	0.14
327	0.15
328	0.15
329	0.15
330	0.15
331	0.16
332	0.24
333	0.32
334	0.35
335	0.37
336	0.38
337	0.42
338	0.42
339	0.42
340	0.34
341	0.24
342	0.19
343	0.16
344	0.15
345	0.15
346	0.16
347	0.15
348	0.19
349	0.2
350	0.2
351	0.19
352	0.19
353	0.17
354	0.16
355	0.16
356	0.12
357	0.12
358	0.11
359	0.11
360	0.11
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.08
365	0.09
366	0.1
367	0.13
368	0.13
369	0.16
370	0.18
371	0.18
372	0.17
373	0.17
374	0.16
375	0.14
376	0.13
377	0.11
378	0.09
379	0.09
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.15
389	0.19
390	0.22
391	0.29
392	0.31
393	0.33
394	0.37
395	0.41
396	0.44
397	0.47
398	0.54
399	0.56
400	0.65
401	0.7
402	0.7
403	0.72
404	0.65
405	0.63
406	0.58
407	0.48
408	0.37
409	0.29
410	0.24
411	0.17
412	0.15
413	0.08
414	0.04
415	0.03
416	0.03
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.07
421	0.09
422	0.12
423	0.13
424	0.16
425	0.19
426	0.25
427	0.3
428	0.33
429	0.34
430	0.36
431	0.37
432	0.34
433	0.31
434	0.25
435	0.23
436	0.22
437	0.22
438	0.2
439	0.2
440	0.2
441	0.2
442	0.19
443	0.16
444	0.16
445	0.2
446	0.21
447	0.24
448	0.28
449	0.31
450	0.38
451	0.45
452	0.45
453	0.51
454	0.56
455	0.59
456	0.58
457	0.56
458	0.5
459	0.44
460	0.44
461	0.39
462	0.35
463	0.3
464	0.28
465	0.28
466	0.27
467	0.25
468	0.26
469	0.21
470	0.16
471	0.12
472	0.12
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.09
495	0.11
496	0.12
497	0.14
498	0.19
499	0.22
500	0.22
501	0.22
502	0.22
503	0.22
504	0.24
505	0.26
506	0.24
507	0.22
508	0.23
509	0.22
510	0.21
511	0.18
512	0.19
513	0.18
514	0.18
515	0.17
516	0.18
517	0.21
518	0.24
519	0.25
520	0.24
521	0.23
522	0.24
523	0.25
524	0.25
525	0.23
526	0.19
527	0.18
528	0.18
529	0.15
530	0.11
531	0.09
532	0.07
533	0.06
534	0.05
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.07
544	0.08
545	0.1
546	0.11
547	0.12
548	0.13
549	0.15
550	0.16
551	0.16
552	0.22
553	0.24
554	0.24
555	0.24
556	0.24
557	0.26
558	0.26
559	0.25
560	0.18
561	0.15
562	0.14
563	0.12
564	0.11
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.05
572	0.05
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.07
577	0.1
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.12
582	0.14
583	0.13
584	0.13
585	0.16
586	0.16
587	0.16
588	0.2
589	0.2
590	0.18
591	0.18
592	0.18
593	0.14
594	0.14
595	0.14
596	0.12
597	0.15
598	0.16
599	0.17
600	0.2
601	0.2
602	0.19
603	0.21
604	0.22
605	0.25
606	0.3
607	0.31
608	0.29
609	0.31
610	0.3
611	0.33
612	0.3
613	0.27
614	0.3
615	0.36
616	0.45
617	0.49
618	0.55
619	0.55
620	0.56
621	0.56
622	0.56
623	0.53
624	0.45
625	0.45
626	0.39
627	0.36
628	0.35
629	0.3
630	0.21
631	0.16
632	0.14
633	0.08
634	0.1
635	0.13
636	0.14
637	0.16
638	0.16
639	0.16
640	0.16
641	0.17
642	0.19
643	0.15
644	0.16
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.16
649	0.16
650	0.12
651	0.1
652	0.11
653	0.15
654	0.15
655	0.15
656	0.17
657	0.19
658	0.22
659	0.23
660	0.24
661	0.26
662	0.29
663	0.32
664	0.33
665	0.32
666	0.34
667	0.36
668	0.38
669	0.3
670	0.28
671	0.25
672	0.22
673	0.2
674	0.23
675	0.22
676	0.18
677	0.2
678	0.19
679	0.21
680	0.27
681	0.33
682	0.37
683	0.39
684	0.41
685	0.4
686	0.42
687	0.43
688	0.39
689	0.36
690	0.27
691	0.3
692	0.29
693	0.3
694	0.33
695	0.36
696	0.4
697	0.39
698	0.41
699	0.36
700	0.35
701	0.33
702	0.29
703	0.25
704	0.25
705	0.23
706	0.21
707	0.19
708	0.19
709	0.18
710	0.17
711	0.14
712	0.09
713	0.06
714	0.06
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.05
719	0.05
720	0.06
721	0.09
722	0.09
723	0.14
724	0.14
725	0.15
726	0.16
727	0.18
728	0.22
729	0.2
730	0.23
731	0.21
732	0.21
733	0.21
734	0.2
735	0.22
736	0.24
737	0.24
738	0.23
739	0.24
740	0.24
741	0.23
742	0.28
743	0.25
744	0.2
745	0.24
746	0.22
747	0.22
748	0.21
749	0.23
750	0.17
751	0.16
752	0.18
753	0.15
754	0.17
755	0.15
756	0.17
757	0.15
758	0.15
759	0.15
760	0.13
761	0.13
762	0.12
763	0.12
764	0.11
765	0.14
766	0.13
767	0.13
768	0.14
769	0.11
770	0.1
771	0.09
772	0.09
773	0.06
774	0.07
775	0.1
776	0.09
777	0.08
778	0.09
779	0.09
780	0.08
781	0.08
782	0.07
783	0.05
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.07
797	0.12
798	0.13
799	0.15
800	0.15
801	0.16
802	0.15
803	0.16
804	0.14
805	0.09
806	0.08
807	0.06
808	0.05
809	0.05
810	0.07
811	0.08
812	0.08
813	0.09
814	0.13
815	0.15
816	0.18
817	0.27
818	0.28
819	0.32
820	0.37
821	0.42
822	0.41
823	0.47
824	0.47
825	0.46
826	0.5
827	0.45
828	0.42
829	0.36
830	0.35
831	0.27
832	0.24
833	0.16
834	0.09
835	0.08
836	0.06
837	0.09
838	0.08
839	0.09
840	0.09
841	0.09
842	0.12
843	0.15
844	0.23
845	0.28
846	0.3
847	0.38
848	0.38
849	0.37
850	0.36
851	0.37
852	0.32
853	0.3
854	0.29
855	0.22
856	0.23
857	0.23
858	0.22
859	0.21
860	0.21
861	0.18
862	0.16
863	0.16
864	0.15
865	0.15
866	0.15
867	0.12
868	0.11
869	0.1
870	0.11
871	0.21
872	0.21
873	0.23
874	0.25
875	0.26
876	0.3
877	0.34
878	0.38
879	0.29
880	0.28
881	0.28
882	0.27
883	0.32
884	0.26
885	0.22
886	0.19
887	0.19
888	0.18
889	0.18
890	0.19
891	0.18
892	0.26
893	0.25
894	0.24
895	0.23
896	0.24
897	0.26
898	0.26
899	0.24
900	0.17
901	0.21
902	0.25
903	0.27
904	0.25
905	0.24
906	0.25
907	0.23
908	0.21
909	0.22
910	0.16
911	0.16
912	0.15
913	0.15
914	0.12
915	0.12
916	0.17
917	0.13
918	0.14
919	0.14
920	0.15
921	0.14
922	0.19
923	0.18
924	0.2
925	0.21
926	0.22
927	0.22
928	0.21
929	0.21
930	0.18
931	0.2
932	0.16
933	0.16
934	0.17
935	0.17
936	0.16
937	0.16
938	0.15
939	0.12
940	0.11
941	0.1
942	0.05
943	0.06
944	0.07
945	0.08
946	0.09
947	0.1
948	0.11
949	0.12
950	0.13
951	0.22
952	0.29
953	0.37
954	0.44
955	0.47
956	0.5
957	0.53
958	0.54
959	0.46
960	0.43
961	0.35
962	0.27
963	0.26
964	0.25
965	0.25
966	0.31
967	0.35
968	0.34
969	0.4
970	0.44
971	0.46
972	0.5
973	0.54
974	0.51
975	0.51
976	0.49
977	0.45
978	0.42
979	0.38
980	0.32
981	0.23
982	0.2
983	0.13
984	0.11
985	0.09
986	0.08
987	0.1
988	0.09
989	0.11
990	0.14
991	0.15
992	0.17
993	0.27
994	0.33
995	0.39
996	0.4
997	0.39
998	0.36
999	0.35
1000	0.33
1001	0.25
1002	0.28
1003	0.24
1004	0.27
1005	0.34
1006	0.36
1007	0.38
1008	0.38
1009	0.37
1010	0.3
1011	0.32
1012	0.32
1013	0.27
1014	0.24
1015	0.27
1016	0.29
1017	0.34
1018	0.42
1019	0.45
1020	0.5
1021	0.57
1022	0.61
1023	0.65
1024	0.71
1025	0.7
1026	0.65
1027	0.6
1028	0.55
1029	0.47
1030	0.47
1031	0.37
1032	0.3
1033	0.26
1034	0.21
1035	0.17
1036	0.12
1037	0.14
1038	0.13
1039	0.16
1040	0.15
1041	0.19
1042	0.23
1043	0.26
1044	0.28
1045	0.3
1046	0.32
1047	0.36
1048	0.39
1049	0.43
1050	0.47
1051	0.48
1052	0.51
1053	0.49
1054	0.49
1055	0.42
1056	0.45
1057	0.45
1058	0.42
1059	0.43
1060	0.44
1061	0.47
1062	0.45
1063	0.44
1064	0.43
1065	0.41
1066	0.4
1067	0.36
1068	0.34
1069	0.32
1070	0.33
1071	0.36
1072	0.33
1073	0.31
1074	0.26
1075	0.27
1076	0.27
1077	0.24
1078	0.22
1079	0.21
1080	0.23
1081	0.21
1082	0.21
1083	0.19
1084	0.17
1085	0.16
1086	0.16
1087	0.13
1088	0.09
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.08
1092	0.07
1093	0.07
1094	0.06
1095	0.07
1096	0.09
1097	0.1
1098	0.09
1099	0.1
1100	0.1
1101	0.1
1102	0.12
1103	0.1
1104	0.08
1105	0.07
1106	0.08
1107	0.08
1108	0.08
1109	0.08
1110	0.06
1111	0.05
1112	0.05
1113	0.06
1114	0.05
1115	0.08
1116	0.07
1117	0.07
1118	0.08
1119	0.08
1120	0.1
1121	0.13
1122	0.15
1123	0.18
1124	0.21
1125	0.21
1126	0.21
1127	0.21
1128	0.23
1129	0.27
1130	0.28
1131	0.27
1132	0.26
1133	0.28
1134	0.32
1135	0.31
1136	0.31
1137	0.28
1138	0.3
1139	0.3
1140	0.31
1141	0.3
1142	0.36
1143	0.44
1144	0.44
1145	0.45
1146	0.46
1147	0.45
1148	0.47
1149	0.47
1150	0.43
1151	0.39
1152	0.4
1153	0.4
1154	0.39
1155	0.35
1156	0.35
1157	0.38
1158	0.42
1159	0.42
1160	0.47
1161	0.49
1162	0.49
1163	0.55
1164	0.51
1165	0.49
1166	0.43
1167	0.46
1168	0.42
1169	0.37
1170	0.34
1171	0.28
1172	0.29
1173	0.28
1174	0.26
1175	0.19
1176	0.16
1177	0.15
1178	0.17
1179	0.19
1180	0.2
1181	0.22
1182	0.25
1183	0.32
1184	0.36
1185	0.42
1186	0.45
1187	0.44
1188	0.41
1189	0.4
1190	0.38
1191	0.32
1192	0.27
1193	0.22
1194	0.23
1195	0.22
1196	0.29
1197	0.34
1198	0.37
1199	0.42
1200	0.46
1201	0.46
1202	0.43
1203	0.51
1204	0.54
1205	0.53
1206	0.55
1207	0.55
1208	0.53
1209	0.55
1210	0.52
1211	0.43
1212	0.35
1213	0.37
1214	0.35
1215	0.34
1216	0.33
1217	0.32
1218	0.34
1219	0.37
1220	0.37
1221	0.33
1222	0.36
1223	0.38
1224	0.43
1225	0.5
1226	0.54
1227	0.56
1228	0.6
1229	0.66
1230	0.65
1231	0.59
1232	0.6
1233	0.61
1234	0.64
1235	0.62
1236	0.65
1237	0.6
1238	0.61
1239	0.62
1240	0.54
1241	0.49
1242	0.49
1243	0.54
1244	0.52
1245	0.49
1246	0.48
1247	0.53
1248	0.53
1249	0.49
1250	0.41
1251	0.33
1252	0.29
1253	0.29
1254	0.23
1255	0.16
1256	0.21
1257	0.22
1258	0.21
1259	0.22
1260	0.19
1261	0.18
1262	0.2
1263	0.23
1264	0.19
1265	0.24
1266	0.26
1267	0.27

A0A0C4ETC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer