Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6NFD0

Protein Details
Accession A0A1V6NFD0    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-37NAYFSRFQTKYRRRREGKTDYYARKRLIHydrophilic
271-290KAESKKYKVNRLTHAERKARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-298KTKEEWKAESKKYKVNRLTHAERKARVEEKIRKL
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005485  Rbsml_L5_euk/L18_arc  
IPR025607  Rbsml_L5e_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF14204  Ribosomal_L18_c  
PF17144  Ribosomal_L5e  
CDD cd00432  Ribosomal_L18_L5e  
Amino Acid Sequences MPFTKTVKSNAYFSRFQTKYRRRREGKTDYYARKRLITQAKNKYNAPKYRMVVRFTNRDIVTQIVYSEVTGDKVLAAAYAHELPKYGIDQGLTNWAAAYATGLLLARRVLKKLNLDEQFKGVEEATGEHTLTEAIETDDGERRPFKAFLDVGLVRTSTGNRVFAAMKGASDGGIFIPHSDRRFPGYDIESEELDAETLKNYIHGSHVSEYMETLADEDEERYKSQFTKYIENEIDAGDLEEIYADAHKAIREDPFKADEDAGSKKTKEEWKAESKKYKVNRLTHAERKARVEEKIRKLAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.49
3 0.52
4 0.57
5 0.6
6 0.64
7 0.71
8 0.79
9 0.75
10 0.84
11 0.88
12 0.87
13 0.86
14 0.86
15 0.85
16 0.85
17 0.87
18 0.84
19 0.76
20 0.7
21 0.62
22 0.61
23 0.62
24 0.61
25 0.61
26 0.66
27 0.72
28 0.72
29 0.74
30 0.75
31 0.74
32 0.73
33 0.68
34 0.66
35 0.6
36 0.65
37 0.66
38 0.61
39 0.6
40 0.58
41 0.6
42 0.54
43 0.59
44 0.5
45 0.45
46 0.42
47 0.36
48 0.31
49 0.23
50 0.2
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.11
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.1
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.18
98 0.24
99 0.28
100 0.35
101 0.37
102 0.39
103 0.39
104 0.38
105 0.36
106 0.3
107 0.27
108 0.18
109 0.12
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.06
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.2
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.15
152 0.12
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.08
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.17
169 0.2
170 0.2
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.24
175 0.25
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.09
191 0.12
192 0.13
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.09
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.14
210 0.15
211 0.18
212 0.23
213 0.23
214 0.31
215 0.33
216 0.41
217 0.4
218 0.39
219 0.37
220 0.31
221 0.28
222 0.19
223 0.17
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.17
238 0.2
239 0.22
240 0.26
241 0.28
242 0.29
243 0.3
244 0.29
245 0.24
246 0.25
247 0.27
248 0.27
249 0.27
250 0.25
251 0.25
252 0.32
253 0.38
254 0.41
255 0.44
256 0.49
257 0.56
258 0.65
259 0.74
260 0.76
261 0.73
262 0.75
263 0.76
264 0.78
265 0.76
266 0.75
267 0.75
268 0.74
269 0.79
270 0.79
271 0.81
272 0.79
273 0.75
274 0.73
275 0.72
276 0.67
277 0.64
278 0.65
279 0.65
280 0.67