FuNGI

A0A0C4F0C4

Protein Details

Accession

A0A0C4F0C4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-68	APGPKRQKGLGSKPNPLRET	Hydrophilic
71-104	SADAEPQQTKPRKLPNRPKRLQPQRKDHPGSERS	Hydrophilic
930-949	APGPKRQKGLGSKPNPLRET	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
80-96	KPRKLPNRPKRLQPQRK

Subcellular Location(s)

cyto 10, cyto_nucl 9, nucl 6, mito 6, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MGMAIVWPLTPLNGWCVPAIKQGLPGSARWPVHTGHQAGAPLCEDSSPAPGPKRQKGLGSKPNPLRETATSADAEPQQTKPRKLPNRPKRLQPQRKDHPGSERSPIHSLYILINQESDFDPLLATTNATSNGTSSDDKESSKCPILEGENYPIWQRKIRTYLRVKKLISCIEDPMPEEPSEDEEDRYARASHIIGSHLTDTIYNHIITEENALDAFTIWAELSEEYASSSILAIYRVWCKWEDVQFNDDIPKYITDLESVLAEFSAMGFNIPAQIVSCAIIARIHKKHPALMETLYKKIRTAGTGLVTTVQQPATDPIIRPSFGYITGPKNSDGSPHMVLDSGASHHMLNSLEHFGQTTPVSISIATGNKSDHQELLATAKGDAILRFTNGATLVLKDALFVPNITRNLVSFVQLLDNSETIMPAQSGFEVKIDNLSAITVDTSNHIFEIVGICDMVSVPIANLTEAKQTSKPNELVKWHTRLGHASRQRIRTALKFAIPTGVTAACDACMKGKVTRLPFSSHFKPATLPLEVVHADLVGPISPATNAGARYFLTLVDQFTGYINTTILKQKSEAPDAILEYRTFFEKQTGHAIRKLISKKPEAFRQEMEAEFKIKYPGEATFLLGMNIEKTADGVQINQSQYIDRKLQEFGFEDLHPATCPLNPKVYLKKATQEERDEFQELGVNYRALVGSLNYLSVFTRPDIAYAVSVLSQYLEHPGILHYHAAKQVFRYLLGTKTYGLIYRKNKDSRLRAYVDSDWGNCPDTRRSTTGYVVLAGEHLLSWKSSKQPTVSLSTAEAKYKALSDLGRELAWYRSLLNEIGTHPSPKEIAVLVDNRGAIDLANSKTSQNSFRTKHVDIRLHFIRELIAEKLITLRYVKSNANTADILTKPTGRVTIRRSLALIGVYGLSSDCSTQTTRSKVGCEDSSPAPGPKRQKGLGSKPNPLRETATSADAEPQQTKPRKLPNSTMAARLIPTIVKAQTAPASEKGSPRLRKETPAQSAAYPSASSDVKALSERTEHSILNDYDKLYQQPNETAQSFFQRFREWQHKAKNYGFHYEASSGFVARLNRGLKDKVKGLVAAERRCGTPLSFDQIVITALEEDQTYRLRTANSITSSSCNNKQPADAAASSTSKRASGSGSKDGGSRSCYNCGKEGHLSSKCPEPRQPSSSNMRLNVALVALALALDLASL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.2
4	0.22
5	0.27
6	0.31
7	0.26
8	0.3
9	0.31
10	0.36
11	0.35
12	0.34
13	0.32
14	0.35
15	0.35
16	0.31
17	0.32
18	0.27
19	0.33
20	0.39
21	0.37
22	0.31
23	0.34
24	0.35
25	0.33
26	0.34
27	0.27
28	0.21
29	0.18
30	0.16
31	0.14
32	0.12
33	0.17
34	0.18
35	0.22
36	0.25
37	0.32
38	0.4
39	0.47
40	0.54
41	0.52
42	0.58
43	0.64
44	0.7
45	0.75
46	0.73
47	0.75
48	0.76
49	0.82
50	0.74
51	0.67
52	0.61
53	0.54
54	0.53
55	0.46
56	0.41
57	0.33
58	0.32
59	0.34
60	0.31
61	0.31
62	0.27
63	0.28
64	0.35
65	0.41
66	0.46
67	0.49
68	0.57
69	0.64
70	0.73
71	0.8
72	0.81
73	0.85
74	0.87
75	0.9
76	0.9
77	0.91
78	0.91
79	0.9
80	0.9
81	0.89
82	0.93
83	0.9
84	0.84
85	0.83
86	0.8
87	0.73
88	0.71
89	0.66
90	0.6
91	0.56
92	0.52
93	0.43
94	0.37
95	0.35
96	0.28
97	0.29
98	0.26
99	0.22
100	0.22
101	0.2
102	0.2
103	0.2
104	0.19
105	0.13
106	0.11
107	0.11
108	0.1
109	0.13
110	0.11
111	0.1
112	0.09
113	0.11
114	0.12
115	0.13
116	0.13
117	0.11
118	0.13
119	0.16
120	0.17
121	0.17
122	0.22
123	0.23
124	0.25
125	0.27
126	0.28
127	0.3
128	0.35
129	0.32
130	0.27
131	0.3
132	0.32
133	0.35
134	0.36
135	0.36
136	0.32
137	0.33
138	0.35
139	0.35
140	0.34
141	0.34
142	0.34
143	0.36
144	0.43
145	0.49
146	0.56
147	0.62
148	0.7
149	0.74
150	0.8
151	0.74
152	0.71
153	0.72
154	0.69
155	0.63
156	0.55
157	0.5
158	0.45
159	0.44
160	0.39
161	0.33
162	0.29
163	0.24
164	0.23
165	0.19
166	0.19
167	0.22
168	0.21
169	0.2
170	0.19
171	0.2
172	0.2
173	0.21
174	0.18
175	0.13
176	0.14
177	0.14
178	0.15
179	0.16
180	0.17
181	0.16
182	0.18
183	0.18
184	0.16
185	0.16
186	0.14
187	0.13
188	0.15
189	0.16
190	0.14
191	0.13
192	0.13
193	0.13
194	0.13
195	0.15
196	0.12
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.05
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.1
222	0.15
223	0.15
224	0.17
225	0.17
226	0.2
227	0.25
228	0.33
229	0.37
230	0.35
231	0.38
232	0.38
233	0.38
234	0.39
235	0.33
236	0.26
237	0.21
238	0.18
239	0.16
240	0.16
241	0.15
242	0.12
243	0.12
244	0.11
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.1
268	0.12
269	0.2
270	0.23
271	0.27
272	0.32
273	0.34
274	0.37
275	0.39
276	0.4
277	0.35
278	0.34
279	0.39
280	0.37
281	0.42
282	0.41
283	0.37
284	0.34
285	0.34
286	0.32
287	0.25
288	0.25
289	0.23
290	0.23
291	0.23
292	0.23
293	0.2
294	0.19
295	0.18
296	0.17
297	0.13
298	0.09
299	0.09
300	0.12
301	0.15
302	0.17
303	0.17
304	0.19
305	0.22
306	0.22
307	0.22
308	0.22
309	0.19
310	0.17
311	0.2
312	0.19
313	0.21
314	0.24
315	0.25
316	0.24
317	0.24
318	0.23
319	0.23
320	0.22
321	0.21
322	0.2
323	0.19
324	0.18
325	0.17
326	0.17
327	0.14
328	0.13
329	0.09
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.13
342	0.11
343	0.13
344	0.13
345	0.12
346	0.09
347	0.09
348	0.1
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.14
356	0.16
357	0.19
358	0.2
359	0.16
360	0.15
361	0.15
362	0.14
363	0.16
364	0.15
365	0.12
366	0.11
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.14
391	0.15
392	0.15
393	0.14
394	0.14
395	0.18
396	0.18
397	0.18
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.13
402	0.15
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.09
407	0.09
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.03
446	0.03
447	0.04
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.1
453	0.11
454	0.13
455	0.15
456	0.18
457	0.21
458	0.26
459	0.29
460	0.29
461	0.32
462	0.34
463	0.38
464	0.41
465	0.43
466	0.4
467	0.38
468	0.35
469	0.37
470	0.38
471	0.4
472	0.4
473	0.44
474	0.48
475	0.5
476	0.49
477	0.47
478	0.45
479	0.4
480	0.4
481	0.34
482	0.31
483	0.27
484	0.27
485	0.27
486	0.24
487	0.2
488	0.16
489	0.14
490	0.11
491	0.1
492	0.1
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.08
498	0.09
499	0.1
500	0.15
501	0.19
502	0.23
503	0.27
504	0.28
505	0.3
506	0.33
507	0.39
508	0.39
509	0.39
510	0.36
511	0.32
512	0.31
513	0.3
514	0.29
515	0.23
516	0.19
517	0.14
518	0.16
519	0.15
520	0.15
521	0.11
522	0.08
523	0.07
524	0.06
525	0.06
526	0.04
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.04
532	0.05
533	0.06
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.09
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.07
547	0.07
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.08
554	0.12
555	0.12
556	0.12
557	0.13
558	0.17
559	0.2
560	0.23
561	0.22
562	0.18
563	0.19
564	0.19
565	0.2
566	0.16
567	0.13
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.11
572	0.1
573	0.12
574	0.12
575	0.14
576	0.23
577	0.26
578	0.26
579	0.28
580	0.29
581	0.27
582	0.33
583	0.35
584	0.3
585	0.31
586	0.35
587	0.38
588	0.42
589	0.47
590	0.45
591	0.44
592	0.4
593	0.39
594	0.36
595	0.31
596	0.3
597	0.23
598	0.2
599	0.18
600	0.17
601	0.15
602	0.12
603	0.12
604	0.1
605	0.1
606	0.12
607	0.12
608	0.12
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.11
613	0.1
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.09
624	0.13
625	0.13
626	0.14
627	0.13
628	0.13
629	0.14
630	0.17
631	0.17
632	0.13
633	0.15
634	0.16
635	0.16
636	0.18
637	0.18
638	0.17
639	0.17
640	0.16
641	0.16
642	0.15
643	0.14
644	0.12
645	0.11
646	0.1
647	0.09
648	0.12
649	0.12
650	0.16
651	0.17
652	0.21
653	0.27
654	0.32
655	0.35
656	0.33
657	0.38
658	0.41
659	0.46
660	0.47
661	0.46
662	0.44
663	0.42
664	0.43
665	0.38
666	0.32
667	0.25
668	0.23
669	0.17
670	0.17
671	0.15
672	0.12
673	0.1
674	0.11
675	0.11
676	0.07
677	0.08
678	0.05
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.07
686	0.08
687	0.06
688	0.1
689	0.09
690	0.1
691	0.11
692	0.11
693	0.1
694	0.09
695	0.1
696	0.06
697	0.06
698	0.06
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.07
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.09
708	0.09
709	0.11
710	0.09
711	0.11
712	0.14
713	0.15
714	0.15
715	0.15
716	0.18
717	0.17
718	0.17
719	0.17
720	0.16
721	0.18
722	0.19
723	0.19
724	0.15
725	0.16
726	0.16
727	0.17
728	0.17
729	0.22
730	0.28
731	0.33
732	0.4
733	0.43
734	0.49
735	0.54
736	0.6
737	0.59
738	0.59
739	0.57
740	0.51
741	0.51
742	0.46
743	0.42
744	0.36
745	0.3
746	0.24
747	0.22
748	0.22
749	0.18
750	0.19
751	0.19
752	0.22
753	0.25
754	0.26
755	0.28
756	0.29
757	0.31
758	0.31
759	0.27
760	0.23
761	0.2
762	0.17
763	0.14
764	0.11
765	0.09
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.05
770	0.06
771	0.08
772	0.13
773	0.16
774	0.19
775	0.21
776	0.25
777	0.28
778	0.33
779	0.31
780	0.27
781	0.27
782	0.29
783	0.29
784	0.25
785	0.23
786	0.17
787	0.17
788	0.17
789	0.15
790	0.12
791	0.11
792	0.12
793	0.15
794	0.16
795	0.15
796	0.15
797	0.15
798	0.14
799	0.15
800	0.13
801	0.1
802	0.1
803	0.11
804	0.11
805	0.11
806	0.12
807	0.12
808	0.16
809	0.17
810	0.17
811	0.16
812	0.16
813	0.16
814	0.14
815	0.14
816	0.1
817	0.1
818	0.13
819	0.14
820	0.15
821	0.16
822	0.16
823	0.14
824	0.14
825	0.13
826	0.09
827	0.08
828	0.12
829	0.11
830	0.13
831	0.14
832	0.14
833	0.16
834	0.18
835	0.22
836	0.23
837	0.31
838	0.32
839	0.38
840	0.44
841	0.45
842	0.51
843	0.54
844	0.56
845	0.48
846	0.53
847	0.52
848	0.48
849	0.45
850	0.38
851	0.3
852	0.24
853	0.25
854	0.18
855	0.14
856	0.11
857	0.11
858	0.13
859	0.13
860	0.12
861	0.11
862	0.12
863	0.14
864	0.18
865	0.21
866	0.2
867	0.27
868	0.26
869	0.29
870	0.27
871	0.24
872	0.25
873	0.23
874	0.24
875	0.19
876	0.19
877	0.16
878	0.17
879	0.21
880	0.19
881	0.25
882	0.27
883	0.35
884	0.36
885	0.36
886	0.36
887	0.32
888	0.32
889	0.26
890	0.21
891	0.12
892	0.1
893	0.09
894	0.08
895	0.07
896	0.06
897	0.06
898	0.06
899	0.06
900	0.08
901	0.09
902	0.13
903	0.19
904	0.23
905	0.27
906	0.29
907	0.31
908	0.32
909	0.36
910	0.34
911	0.3
912	0.31
913	0.27
914	0.31
915	0.3
916	0.31
917	0.3
918	0.34
919	0.41
920	0.44
921	0.51
922	0.49
923	0.57
924	0.64
925	0.7
926	0.75
927	0.73
928	0.75
929	0.76
930	0.82
931	0.74
932	0.67
933	0.61
934	0.54
935	0.53
936	0.46
937	0.41
938	0.33
939	0.32
940	0.34
941	0.31
942	0.31
943	0.27
944	0.28
945	0.35
946	0.41
947	0.46
948	0.49
949	0.56
950	0.61
951	0.64
952	0.69
953	0.66
954	0.68
955	0.65
956	0.61
957	0.53
958	0.46
959	0.4
960	0.33
961	0.26
962	0.17
963	0.16
964	0.16
965	0.14
966	0.14
967	0.14
968	0.16
969	0.18
970	0.21
971	0.22
972	0.22
973	0.26
974	0.28
975	0.31
976	0.36
977	0.42
978	0.46
979	0.49
980	0.54
981	0.52
982	0.56
983	0.62
984	0.64
985	0.62
986	0.6
987	0.56
988	0.48
989	0.48
990	0.43
991	0.36
992	0.26
993	0.19
994	0.18
995	0.16
996	0.15
997	0.13
998	0.13
999	0.13
1000	0.15
1001	0.15
1002	0.14
1003	0.17
1004	0.18
1005	0.23
1006	0.25
1007	0.24
1008	0.24
1009	0.31
1010	0.29
1011	0.32
1012	0.32
1013	0.27
1014	0.28
1015	0.3
1016	0.3
1017	0.26
1018	0.29
1019	0.26
1020	0.29
1021	0.32
1022	0.35
1023	0.34
1024	0.33
1025	0.32
1026	0.37
1027	0.37
1028	0.35
1029	0.33
1030	0.33
1031	0.33
1032	0.4
1033	0.48
1034	0.46
1035	0.52
1036	0.6
1037	0.65
1038	0.68
1039	0.72
1040	0.72
1041	0.66
1042	0.67
1043	0.6
1044	0.51
1045	0.46
1046	0.41
1047	0.36
1048	0.31
1049	0.27
1050	0.19
1051	0.18
1052	0.19
1053	0.17
1054	0.16
1055	0.22
1056	0.21
1057	0.24
1058	0.29
1059	0.35
1060	0.37
1061	0.41
1062	0.44
1063	0.41
1064	0.42
1065	0.4
1066	0.37
1067	0.39
1068	0.42
1069	0.41
1070	0.41
1071	0.4
1072	0.38
1073	0.38
1074	0.37
1075	0.29
1076	0.28
1077	0.28
1078	0.3
1079	0.29
1080	0.28
1081	0.27
1082	0.27
1083	0.26
1084	0.19
1085	0.16
1086	0.09
1087	0.08
1088	0.09
1089	0.08
1090	0.08
1091	0.1
1092	0.13
1093	0.14
1094	0.15
1095	0.17
1096	0.18
1097	0.2
1098	0.24
1099	0.29
1100	0.3
1101	0.31
1102	0.31
1103	0.32
1104	0.36
1105	0.41
1106	0.43
1107	0.42
1108	0.42
1109	0.41
1110	0.41
1111	0.41
1112	0.39
1113	0.38
1114	0.32
1115	0.28
1116	0.29
1117	0.31
1118	0.29
1119	0.29
1120	0.27
1121	0.21
1122	0.21
1123	0.2
1124	0.21
1125	0.26
1126	0.32
1127	0.38
1128	0.39
1129	0.4
1130	0.41
1131	0.43
1132	0.4
1133	0.38
1134	0.37
1135	0.33
1136	0.4
1137	0.44
1138	0.45
1139	0.48
1140	0.48
1141	0.47
1142	0.48
1143	0.51
1144	0.51
1145	0.52
1146	0.52
1147	0.49
1148	0.56
1149	0.57
1150	0.54
1151	0.56
1152	0.55
1153	0.59
1154	0.63
1155	0.64
1156	0.62
1157	0.66
1158	0.69
1159	0.68
1160	0.62
1161	0.57
1162	0.5
1163	0.46
1164	0.4
1165	0.3
1166	0.21
1167	0.14
1168	0.11
1169	0.07
1170	0.06
1171	0.05
1172	0.04

A0A0C4F0C4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer