Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6TPK1

Protein Details
Accession A0A1V6TPK1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-60NSAVTKPRKAPTKSKKLVKESTKTKLKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-51KPRKAPTKSKKLVK
Subcellular Location(s) mito 22, cyto_mito 13.333, mito_nucl 11.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSLRRSARLGSIPIIKTPLLQSSAPSEATRVENSAVTKPRKAPTKSKKLVKESTKTKLKTGTSYWSPEPAVTEKQETDNQPSTTNPAIFRPQTPPPLDRPVDPHRTNATLITPHGSTVNAYPAHAEDVSPSKTGLPRPTATTGTLLEKATAHLIAMDPRIATVIEQNPCPLFSPAGLAEEIDPFNSLTSSIIGQQVSGAAAKSIRNKFLALFDLPDTVAPDGHRHAKFPTPDQVAKCDIATLRTAGLSQRKAEYIQGLAEKFASGELGARMLARATDEELFEKLIAVRGLGRWSVEMFAMFALKRIDVFSTGDLGVQRGCAAFMGRDVSKLKGKGGGKFKYMAEKDMLELAAKFAPYRSLFMWYMWRIEDVDVAVLGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.35
3 0.31
4 0.3
5 0.3
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.26
10 0.29
11 0.29
12 0.27
13 0.23
14 0.22
15 0.25
16 0.25
17 0.22
18 0.2
19 0.21
20 0.24
21 0.3
22 0.36
23 0.37
24 0.41
25 0.45
26 0.51
27 0.57
28 0.61
29 0.65
30 0.67
31 0.74
32 0.78
33 0.81
34 0.84
35 0.84
36 0.87
37 0.85
38 0.84
39 0.81
40 0.82
41 0.82
42 0.74
43 0.7
44 0.68
45 0.62
46 0.58
47 0.54
48 0.52
49 0.48
50 0.52
51 0.49
52 0.45
53 0.42
54 0.37
55 0.36
56 0.31
57 0.3
58 0.27
59 0.29
60 0.26
61 0.3
62 0.35
63 0.34
64 0.38
65 0.39
66 0.38
67 0.35
68 0.34
69 0.35
70 0.33
71 0.33
72 0.27
73 0.24
74 0.29
75 0.3
76 0.32
77 0.32
78 0.34
79 0.39
80 0.42
81 0.41
82 0.41
83 0.48
84 0.46
85 0.43
86 0.44
87 0.45
88 0.51
89 0.49
90 0.48
91 0.43
92 0.44
93 0.43
94 0.37
95 0.32
96 0.24
97 0.24
98 0.21
99 0.18
100 0.16
101 0.16
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.16
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.09
114 0.13
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.17
120 0.21
121 0.24
122 0.25
123 0.24
124 0.28
125 0.31
126 0.31
127 0.29
128 0.27
129 0.24
130 0.22
131 0.23
132 0.19
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.08
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.14
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.18
157 0.14
158 0.09
159 0.08
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.07
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.2
195 0.21
196 0.22
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.08
205 0.09
206 0.07
207 0.09
208 0.1
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.2
213 0.25
214 0.27
215 0.29
216 0.35
217 0.33
218 0.37
219 0.37
220 0.39
221 0.36
222 0.35
223 0.31
224 0.24
225 0.19
226 0.16
227 0.16
228 0.13
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.12
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.21
238 0.21
239 0.22
240 0.21
241 0.16
242 0.16
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.1
250 0.08
251 0.04
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.08
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.14
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.16
300 0.15
301 0.15
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.14
312 0.13
313 0.17
314 0.19
315 0.22
316 0.28
317 0.29
318 0.29
319 0.32
320 0.35
321 0.39
322 0.47
323 0.49
324 0.45
325 0.48
326 0.48
327 0.51
328 0.49
329 0.45
330 0.38
331 0.34
332 0.32
333 0.32
334 0.3
335 0.21
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.15
341 0.12
342 0.18
343 0.19
344 0.22
345 0.21
346 0.25
347 0.26
348 0.28
349 0.37
350 0.32
351 0.33
352 0.31
353 0.31
354 0.26
355 0.26
356 0.25
357 0.17
358 0.17