Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SRN4

Protein Details
Accession A0A1V6SRN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-184ESLSAKPVKPTQKKTKLEKSLDRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-292RRPSKKPPPKTGHF
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 10.333, cyto 7.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd06137  DEDDh_RNase  
Amino Acid Sequences MTSPTVVDRLFVCPGCQRGGFKSIGAVKAHFESKGHKLACGPCDRSFGNVTALLKHSQKHEKPSDGSDLKSLKSAKPAPRSTKQEKFEDASESFVKPSKSAPKPVKSGKLPDLSESFVKPAKPPKATKHEKSQDRSEPLSVNPTNSITKKKQPGKPQELSESLSAKPVKPTQKKTKLEKSLDRSDILPAKPAKPAQKRTLNQAPVRAPLKAEAVEDPWNTTSEEPNLSSPAIQNVNYHAVLEPLEQNLIFRYLSARCHSDTRLVSRGFTFRAGLADVGRRPSKKPPPKTGHFRQVPRSSDGLPKRRAIVLDCEMVQVEGGRRELAFLSAIDFLTGEILIDNYVQPKLKVVNWDSRFSGVTPGAMNKAVKKGTALFSWEGARSKLWEFMDSETVLVGHSLNNDLDVLGIIHWNIVDSSIITSEAVFHTVHAREPLNRTWSLKTLTNELVNYDIQVGKQGHSALEDAHATRDIVIWCLRYPEHLKVWADNARDQEEQRAYERELKRTTEEEVKEQKRKHDMEIKIQMLSRGVTGLDVHDIGLSDDDANDPEYSFVDHDGDVEYEAITIEAAAASFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.32
4 0.31
5 0.31
6 0.36
7 0.35
8 0.3
9 0.34
10 0.36
11 0.38
12 0.37
13 0.33
14 0.31
15 0.34
16 0.35
17 0.29
18 0.25
19 0.25
20 0.3
21 0.38
22 0.36
23 0.33
24 0.37
25 0.43
26 0.5
27 0.53
28 0.51
29 0.46
30 0.51
31 0.5
32 0.48
33 0.44
34 0.38
35 0.33
36 0.31
37 0.29
38 0.27
39 0.3
40 0.29
41 0.29
42 0.29
43 0.33
44 0.4
45 0.44
46 0.5
47 0.56
48 0.59
49 0.61
50 0.63
51 0.66
52 0.58
53 0.54
54 0.51
55 0.46
56 0.39
57 0.41
58 0.39
59 0.31
60 0.37
61 0.44
62 0.45
63 0.53
64 0.61
65 0.64
66 0.71
67 0.78
68 0.78
69 0.79
70 0.77
71 0.73
72 0.7
73 0.65
74 0.58
75 0.55
76 0.46
77 0.42
78 0.38
79 0.32
80 0.28
81 0.27
82 0.25
83 0.2
84 0.26
85 0.31
86 0.34
87 0.43
88 0.51
89 0.56
90 0.64
91 0.71
92 0.74
93 0.69
94 0.71
95 0.69
96 0.68
97 0.61
98 0.57
99 0.51
100 0.45
101 0.41
102 0.35
103 0.3
104 0.24
105 0.24
106 0.24
107 0.31
108 0.36
109 0.41
110 0.47
111 0.54
112 0.62
113 0.71
114 0.73
115 0.75
116 0.77
117 0.79
118 0.78
119 0.78
120 0.76
121 0.73
122 0.69
123 0.61
124 0.53
125 0.45
126 0.48
127 0.39
128 0.31
129 0.27
130 0.27
131 0.29
132 0.3
133 0.36
134 0.32
135 0.4
136 0.49
137 0.56
138 0.6
139 0.66
140 0.74
141 0.76
142 0.78
143 0.74
144 0.71
145 0.65
146 0.6
147 0.53
148 0.44
149 0.34
150 0.33
151 0.3
152 0.24
153 0.26
154 0.3
155 0.37
156 0.43
157 0.53
158 0.58
159 0.68
160 0.76
161 0.8
162 0.84
163 0.84
164 0.84
165 0.83
166 0.79
167 0.78
168 0.72
169 0.64
170 0.54
171 0.49
172 0.46
173 0.37
174 0.36
175 0.29
176 0.28
177 0.31
178 0.34
179 0.39
180 0.42
181 0.49
182 0.52
183 0.6
184 0.6
185 0.65
186 0.7
187 0.68
188 0.61
189 0.61
190 0.54
191 0.5
192 0.5
193 0.41
194 0.32
195 0.26
196 0.26
197 0.2
198 0.19
199 0.14
200 0.15
201 0.19
202 0.18
203 0.18
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.12
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.18
223 0.17
224 0.17
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.16
244 0.19
245 0.2
246 0.24
247 0.25
248 0.27
249 0.31
250 0.29
251 0.28
252 0.27
253 0.28
254 0.23
255 0.21
256 0.17
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.14
265 0.16
266 0.16
267 0.18
268 0.27
269 0.36
270 0.43
271 0.51
272 0.58
273 0.64
274 0.71
275 0.78
276 0.77
277 0.77
278 0.74
279 0.7
280 0.69
281 0.68
282 0.62
283 0.56
284 0.5
285 0.42
286 0.43
287 0.46
288 0.45
289 0.41
290 0.4
291 0.38
292 0.38
293 0.36
294 0.3
295 0.29
296 0.23
297 0.22
298 0.21
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.04
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.11
334 0.13
335 0.19
336 0.21
337 0.3
338 0.32
339 0.35
340 0.34
341 0.34
342 0.32
343 0.26
344 0.27
345 0.17
346 0.15
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.13
353 0.18
354 0.17
355 0.17
356 0.17
357 0.19
358 0.2
359 0.2
360 0.22
361 0.18
362 0.19
363 0.21
364 0.22
365 0.19
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.19
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.19
375 0.23
376 0.2
377 0.19
378 0.14
379 0.13
380 0.11
381 0.1
382 0.08
383 0.05
384 0.05
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.04
394 0.05
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.08
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.12
414 0.13
415 0.14
416 0.16
417 0.18
418 0.2
419 0.25
420 0.29
421 0.3
422 0.31
423 0.33
424 0.33
425 0.36
426 0.36
427 0.37
428 0.34
429 0.34
430 0.36
431 0.36
432 0.33
433 0.29
434 0.28
435 0.22
436 0.21
437 0.17
438 0.14
439 0.11
440 0.17
441 0.17
442 0.15
443 0.18
444 0.18
445 0.17
446 0.17
447 0.18
448 0.12
449 0.13
450 0.14
451 0.12
452 0.13
453 0.14
454 0.12
455 0.12
456 0.15
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.16
461 0.15
462 0.18
463 0.18
464 0.21
465 0.25
466 0.28
467 0.31
468 0.36
469 0.37
470 0.37
471 0.43
472 0.43
473 0.41
474 0.38
475 0.38
476 0.36
477 0.37
478 0.35
479 0.37
480 0.35
481 0.35
482 0.35
483 0.35
484 0.33
485 0.4
486 0.44
487 0.44
488 0.45
489 0.46
490 0.47
491 0.45
492 0.47
493 0.46
494 0.45
495 0.46
496 0.52
497 0.57
498 0.61
499 0.63
500 0.66
501 0.66
502 0.66
503 0.66
504 0.65
505 0.62
506 0.65
507 0.71
508 0.65
509 0.59
510 0.57
511 0.49
512 0.41
513 0.36
514 0.25
515 0.16
516 0.14
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.12
521 0.11
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.1
526 0.11
527 0.1
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.11
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.12
538 0.12
539 0.13
540 0.13
541 0.12
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.13
546 0.12
547 0.11
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.04