Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SHW4

Protein Details
Accession A0A1V6SHW4    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-32AMDAPKQFKQPSRKGKKAWRKNVDITDVQHydrophilic
64-85NEEVRKSIAKKQKKPLKSDEILHydrophilic
271-305YEKSEWLNKKRPERKSKTQRNKANRRKAAERQAKWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-23PSRKGKKAWR
73-77KKQKK
279-311KKRPERKSKTQRNKANRRKAAERQAKWEAARVK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MSTAMDAPKQFKQPSRKGKKAWRKNVDITDVQEGLRDLKEAEITGGLVSEKPSDQLFVLDTVGNEEVRKSIAKKQKKPLKSDEILAQRSMIPALDGRKRGNPNVTDGVIEPKTKKPKSDWVSRKDYLRLKQVAKEGNPLGKKNENEFYDPWAEDNEPSLTYDDPRFDFLQKPKPKVEPVTLKHAPISLAANGKPIPSVKKPHAGTSYNPVFEEWDKLLETHGAKAVEAEKLRLEEEAKEAEKQRLIEEAKNDTGEVKSDDESAWEGFESEYEKSEWLNKKRPERKSKTQRNKANRRKAAERQAKWEAARVKRDAQAEHILKITEEIKQRELERQNQSDADDSEDGDDTTLRRKTFGSKRPVPEQPLELVLPDELQDSLRLLKPEGNLLDDRFRTLIVQGKLESRAPITQARKARRQITEKWTAKDFKTGYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.8
4 0.82
5 0.88
6 0.91
7 0.92
8 0.92
9 0.91
10 0.89
11 0.89
12 0.88
13 0.84
14 0.77
15 0.69
16 0.64
17 0.55
18 0.46
19 0.38
20 0.31
21 0.26
22 0.22
23 0.19
24 0.13
25 0.13
26 0.15
27 0.13
28 0.14
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.15
56 0.15
57 0.23
58 0.33
59 0.44
60 0.53
61 0.63
62 0.71
63 0.76
64 0.82
65 0.82
66 0.82
67 0.75
68 0.7
69 0.68
70 0.67
71 0.61
72 0.53
73 0.44
74 0.34
75 0.32
76 0.27
77 0.19
78 0.11
79 0.11
80 0.16
81 0.21
82 0.24
83 0.26
84 0.34
85 0.38
86 0.42
87 0.47
88 0.43
89 0.44
90 0.45
91 0.43
92 0.36
93 0.33
94 0.34
95 0.28
96 0.29
97 0.25
98 0.28
99 0.37
100 0.38
101 0.41
102 0.4
103 0.49
104 0.54
105 0.62
106 0.64
107 0.62
108 0.7
109 0.69
110 0.68
111 0.65
112 0.65
113 0.6
114 0.59
115 0.58
116 0.52
117 0.54
118 0.56
119 0.55
120 0.49
121 0.5
122 0.43
123 0.43
124 0.44
125 0.4
126 0.39
127 0.38
128 0.38
129 0.36
130 0.4
131 0.36
132 0.37
133 0.36
134 0.35
135 0.33
136 0.31
137 0.27
138 0.22
139 0.2
140 0.16
141 0.17
142 0.14
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.23
155 0.27
156 0.36
157 0.4
158 0.44
159 0.45
160 0.48
161 0.5
162 0.48
163 0.5
164 0.5
165 0.46
166 0.51
167 0.49
168 0.45
169 0.42
170 0.38
171 0.31
172 0.22
173 0.21
174 0.14
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.16
183 0.17
184 0.22
185 0.24
186 0.32
187 0.33
188 0.37
189 0.42
190 0.39
191 0.37
192 0.4
193 0.41
194 0.33
195 0.33
196 0.27
197 0.23
198 0.21
199 0.22
200 0.14
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.1
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.17
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.17
231 0.2
232 0.22
233 0.22
234 0.23
235 0.25
236 0.25
237 0.24
238 0.23
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.17
262 0.25
263 0.3
264 0.39
265 0.44
266 0.55
267 0.64
268 0.74
269 0.77
270 0.78
271 0.83
272 0.85
273 0.9
274 0.9
275 0.92
276 0.92
277 0.91
278 0.93
279 0.93
280 0.93
281 0.89
282 0.85
283 0.83
284 0.82
285 0.82
286 0.81
287 0.73
288 0.7
289 0.69
290 0.66
291 0.58
292 0.55
293 0.52
294 0.48
295 0.51
296 0.47
297 0.45
298 0.45
299 0.48
300 0.43
301 0.4
302 0.43
303 0.39
304 0.37
305 0.34
306 0.29
307 0.25
308 0.26
309 0.22
310 0.17
311 0.22
312 0.23
313 0.24
314 0.28
315 0.29
316 0.36
317 0.41
318 0.45
319 0.48
320 0.48
321 0.49
322 0.47
323 0.47
324 0.42
325 0.36
326 0.32
327 0.24
328 0.21
329 0.19
330 0.18
331 0.17
332 0.13
333 0.13
334 0.09
335 0.15
336 0.19
337 0.17
338 0.18
339 0.2
340 0.29
341 0.39
342 0.47
343 0.51
344 0.56
345 0.63
346 0.7
347 0.76
348 0.72
349 0.66
350 0.61
351 0.53
352 0.47
353 0.4
354 0.33
355 0.26
356 0.2
357 0.16
358 0.13
359 0.11
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.12
365 0.15
366 0.16
367 0.17
368 0.2
369 0.21
370 0.27
371 0.28
372 0.28
373 0.27
374 0.29
375 0.36
376 0.32
377 0.33
378 0.27
379 0.26
380 0.23
381 0.23
382 0.28
383 0.23
384 0.26
385 0.25
386 0.29
387 0.32
388 0.33
389 0.32
390 0.27
391 0.27
392 0.27
393 0.34
394 0.35
395 0.4
396 0.47
397 0.54
398 0.6
399 0.66
400 0.71
401 0.72
402 0.74
403 0.76
404 0.76
405 0.79
406 0.77
407 0.73
408 0.72
409 0.68
410 0.63
411 0.62