FuNGI

A0A1V6SBM6

Protein Details

Accession

A0A1V6SBM6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
932-951	VDCPRLRELRRKLRREVGDA	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 14, cyto 4, plas 3, cyto_nucl 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MRYTRNFQSPSMLETNLRILQLNIMKSGPRMEALINDHQSQDLDILLIQEPSITTYRTRVNHSAWRLYQPTVETDATRFRSLIYVNRRVPTASHRQVPCDHPDVAAVKIWTPDSQILLFSVYLPSVPLYSGDNTSAEPTLTAIQNTITPTLQGNRRTTNSSKMPATLSPSSKTTVSMAVFLVEPQLYWTLNDPELWSHLKGIITSVFTASLNLTYHPKQWRTAKIVVLRKPAKPDYSIPGAYRPISLLNTLGKLLEAVVARRLSFLAENHRLLPNSQFGGRPGRTTEQALLVLSNAIDQAWYKHKVVTLVSFDLKGAFNGVNKISLESSLLARRIPTTARKWIASFMSDRHASIGFDDFRTLMKPLANAGLAQGSPLSPILFAFFNADLVDQRVDHQGGASAFIDDYFRWRIGSSAEANLAKIQSEDIPRIEDWARRSGSSFAAEKTELIHLARKKTEHLVGQIVVNDTVVRPSTTAKLLGVVFDQELRWKDHVQQAIKRATKTNIALCGLRHLRPEQMRQLYQACVTPVVDYASTVWHDPLRDKTHLRHLTTVQRTALIRILSAFRTVATATLEVEAHILPTHLRLRHRAQRTITRLHTLPRDHPIWTTLLRAQKRRNNVGSYARLPLAEALKTMDLDRLNELETIDPQPLPPWRGDAFAEIEIESDRETARERAEAATSTSDVSVYSDASGREDHLGAAVVALDENQEVMGSEQVQVGPMNRWSVHVAELIGIFYAISMVFRLAHQCPTDTCEGPMTATILCDSKSALQSIQNARNKSGQPIVHAILSAATEVQARNIALRLQWIPGHCDDPGNDAADRLAREAARPGKTHPFRPLLTRENAHIRGKIRAQWEHEWKSSAKGGHLRKIDNTLPAAHTRKLYGNLPRNRAYLFTQLRTGHNWLCTYAKTFDFREDDQCVCGAQETVTHVLVDCPRLRELRRKLRREVGDAFNSVSSLLGGSAEGEKGKPDTVSRAKTVNAVLDFAEASQRFCSRAPRGQPNNGSGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.38
3	0.31
4	0.3
5	0.24
6	0.2
7	0.26
8	0.3
9	0.3
10	0.26
11	0.24
12	0.25
13	0.26
14	0.29
15	0.23
16	0.19
17	0.19
18	0.18
19	0.22
20	0.27
21	0.35
22	0.35
23	0.35
24	0.34
25	0.33
26	0.32
27	0.27
28	0.22
29	0.13
30	0.1
31	0.08
32	0.1
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.09
37	0.09
38	0.11
39	0.13
40	0.12
41	0.13
42	0.18
43	0.26
44	0.29
45	0.36
46	0.39
47	0.44
48	0.52
49	0.57
50	0.62
51	0.57
52	0.62
53	0.57
54	0.53
55	0.5
56	0.42
57	0.39
58	0.36
59	0.34
60	0.28
61	0.27
62	0.34
63	0.35
64	0.34
65	0.3
66	0.25
67	0.28
68	0.29
69	0.35
70	0.36
71	0.42
72	0.46
73	0.48
74	0.48
75	0.45
76	0.45
77	0.44
78	0.46
79	0.43
80	0.47
81	0.47
82	0.51
83	0.55
84	0.58
85	0.57
86	0.5
87	0.43
88	0.35
89	0.37
90	0.34
91	0.3
92	0.28
93	0.22
94	0.19
95	0.2
96	0.21
97	0.17
98	0.19
99	0.19
100	0.19
101	0.19
102	0.18
103	0.16
104	0.17
105	0.16
106	0.13
107	0.12
108	0.1
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.1
116	0.12
117	0.14
118	0.15
119	0.15
120	0.15
121	0.17
122	0.17
123	0.14
124	0.12
125	0.11
126	0.13
127	0.14
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.14
132	0.16
133	0.16
134	0.13
135	0.13
136	0.15
137	0.21
138	0.27
139	0.31
140	0.35
141	0.39
142	0.42
143	0.48
144	0.48
145	0.51
146	0.52
147	0.51
148	0.48
149	0.44
150	0.44
151	0.4
152	0.43
153	0.41
154	0.37
155	0.34
156	0.34
157	0.34
158	0.31
159	0.3
160	0.25
161	0.24
162	0.21
163	0.2
164	0.18
165	0.17
166	0.16
167	0.15
168	0.15
169	0.1
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.14
176	0.15
177	0.16
178	0.17
179	0.16
180	0.16
181	0.19
182	0.21
183	0.18
184	0.16
185	0.18
186	0.18
187	0.17
188	0.18
189	0.17
190	0.15
191	0.15
192	0.14
193	0.13
194	0.12
195	0.13
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.16
201	0.16
202	0.23
203	0.3
204	0.31
205	0.36
206	0.43
207	0.5
208	0.52
209	0.56
210	0.57
211	0.58
212	0.64
213	0.63
214	0.66
215	0.62
216	0.58
217	0.61
218	0.59
219	0.53
220	0.48
221	0.46
222	0.42
223	0.44
224	0.44
225	0.37
226	0.37
227	0.37
228	0.33
229	0.3
230	0.25
231	0.2
232	0.18
233	0.18
234	0.16
235	0.15
236	0.15
237	0.15
238	0.14
239	0.12
240	0.1
241	0.1
242	0.11
243	0.09
244	0.09
245	0.13
246	0.14
247	0.14
248	0.15
249	0.15
250	0.13
251	0.14
252	0.16
253	0.21
254	0.26
255	0.27
256	0.29
257	0.31
258	0.3
259	0.29
260	0.3
261	0.25
262	0.21
263	0.21
264	0.2
265	0.2
266	0.28
267	0.28
268	0.26
269	0.26
270	0.27
271	0.28
272	0.29
273	0.29
274	0.23
275	0.23
276	0.22
277	0.18
278	0.15
279	0.13
280	0.1
281	0.08
282	0.06
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.07
287	0.13
288	0.16
289	0.17
290	0.18
291	0.2
292	0.22
293	0.24
294	0.25
295	0.24
296	0.24
297	0.24
298	0.23
299	0.21
300	0.21
301	0.19
302	0.14
303	0.12
304	0.1
305	0.1
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.13
310	0.15
311	0.13
312	0.12
313	0.12
314	0.11
315	0.13
316	0.13
317	0.14
318	0.13
319	0.13
320	0.14
321	0.14
322	0.17
323	0.22
324	0.24
325	0.32
326	0.35
327	0.36
328	0.36
329	0.37
330	0.36
331	0.31
332	0.27
333	0.21
334	0.23
335	0.22
336	0.21
337	0.2
338	0.19
339	0.16
340	0.15
341	0.18
342	0.14
343	0.14
344	0.14
345	0.13
346	0.13
347	0.14
348	0.14
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.13
354	0.12
355	0.11
356	0.11
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.04
366	0.04
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.07
376	0.09
377	0.09
378	0.07
379	0.08
380	0.1
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.1
386	0.12
387	0.11
388	0.09
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.06
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.15
401	0.13
402	0.13
403	0.16
404	0.16
405	0.16
406	0.16
407	0.15
408	0.12
409	0.1
410	0.09
411	0.09
412	0.11
413	0.12
414	0.11
415	0.14
416	0.13
417	0.16
418	0.17
419	0.17
420	0.18
421	0.23
422	0.23
423	0.21
424	0.23
425	0.22
426	0.22
427	0.22
428	0.21
429	0.15
430	0.17
431	0.16
432	0.15
433	0.14
434	0.13
435	0.11
436	0.1
437	0.15
438	0.15
439	0.19
440	0.21
441	0.2
442	0.21
443	0.24
444	0.27
445	0.24
446	0.24
447	0.23
448	0.21
449	0.21
450	0.21
451	0.18
452	0.14
453	0.12
454	0.09
455	0.07
456	0.07
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.07
461	0.09
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.11
466	0.11
467	0.11
468	0.1
469	0.09
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.1
475	0.12
476	0.13
477	0.14
478	0.17
479	0.21
480	0.27
481	0.28
482	0.31
483	0.35
484	0.41
485	0.42
486	0.4
487	0.38
488	0.34
489	0.34
490	0.33
491	0.29
492	0.24
493	0.23
494	0.23
495	0.2
496	0.25
497	0.23
498	0.22
499	0.21
500	0.19
501	0.23
502	0.26
503	0.3
504	0.31
505	0.34
506	0.33
507	0.33
508	0.35
509	0.3
510	0.27
511	0.24
512	0.17
513	0.13
514	0.12
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.06
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.1
528	0.16
529	0.2
530	0.23
531	0.25
532	0.27
533	0.37
534	0.43
535	0.43
536	0.4
537	0.39
538	0.45
539	0.46
540	0.46
541	0.36
542	0.32
543	0.31
544	0.28
545	0.27
546	0.18
547	0.14
548	0.12
549	0.14
550	0.11
551	0.12
552	0.11
553	0.07
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.08
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.04
569	0.08
570	0.12
571	0.14
572	0.16
573	0.21
574	0.29
575	0.37
576	0.43
577	0.46
578	0.47
579	0.53
580	0.57
581	0.6
582	0.54
583	0.5
584	0.45
585	0.43
586	0.44
587	0.37
588	0.35
589	0.33
590	0.32
591	0.29
592	0.28
593	0.26
594	0.23
595	0.21
596	0.2
597	0.19
598	0.25
599	0.29
600	0.35
601	0.41
602	0.44
603	0.51
604	0.56
605	0.57
606	0.53
607	0.54
608	0.55
609	0.52
610	0.5
611	0.45
612	0.37
613	0.31
614	0.28
615	0.25
616	0.19
617	0.14
618	0.12
619	0.1
620	0.1
621	0.11
622	0.11
623	0.12
624	0.11
625	0.12
626	0.13
627	0.12
628	0.12
629	0.13
630	0.13
631	0.1
632	0.11
633	0.12
634	0.11
635	0.1
636	0.09
637	0.12
638	0.14
639	0.15
640	0.13
641	0.16
642	0.16
643	0.18
644	0.19
645	0.18
646	0.18
647	0.18
648	0.18
649	0.14
650	0.13
651	0.11
652	0.11
653	0.09
654	0.07
655	0.06
656	0.06
657	0.08
658	0.1
659	0.11
660	0.12
661	0.13
662	0.14
663	0.15
664	0.15
665	0.15
666	0.14
667	0.14
668	0.13
669	0.12
670	0.1
671	0.09
672	0.09
673	0.08
674	0.07
675	0.07
676	0.08
677	0.08
678	0.1
679	0.1
680	0.1
681	0.11
682	0.11
683	0.1
684	0.09
685	0.09
686	0.08
687	0.07
688	0.06
689	0.04
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.03
694	0.03
695	0.03
696	0.03
697	0.03
698	0.04
699	0.05
700	0.05
701	0.06
702	0.07
703	0.07
704	0.08
705	0.08
706	0.09
707	0.1
708	0.11
709	0.13
710	0.13
711	0.15
712	0.16
713	0.16
714	0.17
715	0.16
716	0.14
717	0.13
718	0.13
719	0.11
720	0.09
721	0.08
722	0.06
723	0.04
724	0.05
725	0.03
726	0.03
727	0.03
728	0.04
729	0.05
730	0.05
731	0.09
732	0.11
733	0.15
734	0.16
735	0.17
736	0.17
737	0.21
738	0.25
739	0.22
740	0.21
741	0.19
742	0.19
743	0.18
744	0.18
745	0.15
746	0.11
747	0.1
748	0.1
749	0.09
750	0.09
751	0.09
752	0.09
753	0.12
754	0.13
755	0.14
756	0.15
757	0.17
758	0.24
759	0.32
760	0.4
761	0.42
762	0.42
763	0.43
764	0.49
765	0.46
766	0.43
767	0.42
768	0.34
769	0.32
770	0.36
771	0.35
772	0.29
773	0.27
774	0.23
775	0.17
776	0.16
777	0.12
778	0.07
779	0.06
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.09
784	0.09
785	0.1
786	0.11
787	0.12
788	0.11
789	0.15
790	0.15
791	0.15
792	0.18
793	0.18
794	0.21
795	0.22
796	0.24
797	0.2
798	0.21
799	0.19
800	0.22
801	0.22
802	0.2
803	0.18
804	0.17
805	0.17
806	0.18
807	0.18
808	0.14
809	0.16
810	0.13
811	0.15
812	0.22
813	0.28
814	0.3
815	0.31
816	0.34
817	0.42
818	0.47
819	0.51
820	0.52
821	0.51
822	0.48
823	0.54
824	0.57
825	0.53
826	0.55
827	0.52
828	0.49
829	0.51
830	0.56
831	0.52
832	0.49
833	0.44
834	0.44
835	0.46
836	0.47
837	0.45
838	0.45
839	0.48
840	0.52
841	0.6
842	0.6
843	0.58
844	0.56
845	0.5
846	0.48
847	0.47
848	0.39
849	0.35
850	0.37
851	0.41
852	0.45
853	0.5
854	0.49
855	0.47
856	0.52
857	0.49
858	0.45
859	0.41
860	0.36
861	0.34
862	0.39
863	0.4
864	0.36
865	0.34
866	0.32
867	0.35
868	0.36
869	0.39
870	0.42
871	0.47
872	0.53
873	0.59
874	0.6
875	0.58
876	0.54
877	0.51
878	0.45
879	0.45
880	0.43
881	0.39
882	0.41
883	0.42
884	0.44
885	0.46
886	0.47
887	0.4
888	0.38
889	0.37
890	0.32
891	0.32
892	0.31
893	0.31
894	0.29
895	0.29
896	0.29
897	0.3
898	0.34
899	0.37
900	0.38
901	0.39
902	0.4
903	0.37
904	0.34
905	0.33
906	0.26
907	0.21
908	0.2
909	0.14
910	0.1
911	0.11
912	0.14
913	0.16
914	0.16
915	0.16
916	0.15
917	0.19
918	0.21
919	0.25
920	0.24
921	0.24
922	0.28
923	0.33
924	0.38
925	0.44
926	0.52
927	0.58
928	0.65
929	0.7
930	0.75
931	0.79
932	0.82
933	0.78
934	0.75
935	0.73
936	0.68
937	0.62
938	0.56
939	0.46
940	0.39
941	0.31
942	0.24
943	0.15
944	0.09
945	0.07
946	0.06
947	0.05
948	0.07
949	0.08
950	0.09
951	0.1
952	0.1
953	0.12
954	0.13
955	0.15
956	0.15
957	0.16
958	0.25
959	0.33
960	0.38
961	0.4
962	0.42
963	0.41
964	0.44
965	0.44
966	0.42
967	0.34
968	0.29
969	0.26
970	0.24
971	0.23
972	0.19
973	0.24
974	0.17
975	0.18
976	0.2
977	0.21
978	0.22
979	0.24
980	0.33
981	0.33
982	0.42
983	0.5
984	0.57
985	0.65
986	0.73
987	0.78

A0A1V6SBM6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer